Microsatellite Markers For Urochloa Humidicola (poaceae) And Their Transferability To Other Urochloa Species.

Urochloa humidicola is a warm-season grass commonly used as forage in the tropics and is recognized for its tolerance to seasonal flooding. This grass is an important forage species for the Cerrado and Amazon regions of Brazil. U. humidicola is a polyploid species with variable ploidy (6X-9X) and facultative apomixis with high phenotypic plasticity. However, this apomixis and ploidy, as well as the limited knowledge of the genetic basis of the germplasm collection, have constrained genetic breeding activities, yet microsatellite markers may enable a better understanding of the species' genetic composition. This study aimed to develop and characterize new polymorphic microsatellite molecular markers in U. humidicola and to evaluate their transferability to other Urochloa species. A set of microsatellite markers for U. humidicola was identified from two new enriched genomic DNA libraries: the first library was constructed from a single sexual genotype and the second from a pool of eight apomictic genotypes selected on the basis of previous results. Of the 114 loci developed, 72 primer pairs presented a good amplification product, and 64 were polymorphic among the 34 genotypes tested. The number of bands per simple sequence repeat (SSR) locus ranged from 1 to 29, with a mean of 9.6 bands per locus. The mean polymorphism information content (PIC) of all loci was 0.77, and the mean discrimination power (DP) was 0.87. STRUCTURE analysis revealed differences among U. humidicola accessions, hybrids, and other Urochloa accessions. The transferability of these microsatellites was evaluated in four species of the genus, U. brizantha, U. decumbens, U. ruziziensis, and U. dictyoneura, and the percentage of transferability ranged from 58.33% to 69.44% depending on the species. This work reports new polymorphic microsatellite markers for U. humidicola that can be used for breeding programs of this and other Urochloa species, including genetic linkage mapping, quantitative trait loci identification, and marker-assisted selection.

A contribution to the phytogeography of Brazilian campos: an analysis based on Poaceae

Twenty areas from eight Brazilian states were compared according to a list of 224 species of Poaceae. In order to determinate affinity patterns between the areas, a binary matrix was submitted to cluster and ordination analysis. The patterns found were then faced to climate and geographic position. The scores corresponding to the areas obtained from the cluster analysis showed a strong correlation to temperature. The scores corresponding to the species suggest a gradient that associates distribution patterns to the photosynthetic pathway (C3 or C4). The current results suggest that the traditional classification of the Southern American grasslands might require some modification in order to be broadly applicable in the Brazilian context.

DEVELOPMENT OF MICROSATELLITE MARKERS FOR AULONEMIA ARISTULATA (POACEAE) AND CROSS-AMPLIFICATION IN OTHER BAMBOO SPECIES

Premise of the study: Microsatellite primers were developed for Aulonemia aristulata, an endangered species of economic interest, to further describe its genetic variability and population structure. We also tested cross-amplification in 18 other bamboo species. Methods and Results: Using an enrichment genomic library, 13 microsatellite loci were isolated and characterized in A. aristulata. Seven of these loci were polymorphic. Twelve markers were cross-amplified in at least ten of the tested bamboo species. Conclusions: These markers will be useful for studies on the genetic diversity and structure of A. aristulata, which are important for future conservation, management and breeding programs of this species.

NOMENCLATURAL AND CRITICAL NOTES ON SOME BRAZILIAN SPECIES OF Paspalum (POACEAE: PANICEAE)

A critical analysis of the type collections of 39 species names of Paspalum L. (Poaceae: Paniceae) from Brazil described by Swallen is presented along with comments based on more recent gatherings of the species. Eighteen new synonyms are proposed.

Ciclo de vida e ecologia de Paspalum fasciculatum Willd. ex. Fluegge (Poaceae), na várzea da Amazônia central

Paspalum fasciculatum é uma robusta gramínea C4, perene, de ocorrência nas várzeas da Amazônia Central. Para estabelecer a ecologia e o ciclo de vida da espécie em relação as flutuações anuais do nível do rio, vinte plantas foram marcadas ao acaso e acompanhadas mensalmente, de setembro/95 a agosto /96, em duas áreas entre 23 e 27 m (s.n.m.). Registrou-se o comprimento do talo, o número de folhas verdes e mortas, brotos, e a presença de inflorescências. Paspalum fasciculatum sincroniza seu crescimento com a fase terrestre do ciclo hidrológico, tendo atingido no período de estudo o comprimento máximo de 4,53 m. A dormência e grande tolerância dos talos a anos subsequentes de inundação e a capacidade de suportar mudanças bruscas do ambiente físico, permitem classificar a espécie como estrategista "r", altamente adaptada e representativa dos primeiros estágios de colonização das margens sedimentares de rios e lagos de várzea.

Estabelecimento de Echinochloa polystachya (H.B.K.) Hitchcock (Poaceae) em solo de várzea contaminado com petróleo de Urucu

A utilização de plantas para fitorremediação do solo requer que a concentração do poluente esteja dentro dos limites de tolerância da planta para que o tratamento seja eficaz. O rebrotamento e crescimento da herbácea aquática Echinochloa polystachya em solo de várzea contaminado por petróleo de Urucu foram estudados por meio do plantio de propágulos em frascos com 2 L de solo contaminado pela mistura de 7 dosagens de petróleo, distribuídas entre 0 e 0,46 L m-2. O experimento foi realizado em Casa de Vegetação e as plantas foram monitoradas durante 70 dias. Em resposta ao aumento da dosagem do petróleo, houve diminuição da biomassa aérea, da proporção de biomassa aérea viva/aérea total, do comprimento da folha e do número de folhas. A interação entre dosagem e tempo de exposição levou à diminuição do número de folhas, comprimento da folha, altura de inserção da primeira folha e aumento do número de folhas com comprometimento fitossanitário. A utilização de E. polystachya para fitorremediação pode estar limitada a solos com baixas dosagens de petróleo de Urucu.

Checklist das Poaceae de áreas inundáveis e inundadas do nordeste do estado do Pará

É apresentada uma relação de Poaceae coletadas em áreas inundáveis e inundadas do nordeste do Estado do Pará. São registrados 31 gêneros, compreendendo 83 espécies. Os grupos mais bem representados são os gêneros Paspalum e Panicum (17 e 18 taxa, respectivamente) e a tribo Paniceae (57 taxa). São fornecidos posição sistemática, comentários sobre afinidades taxonômicas, distribuição geográfica, ciclo de vida, coleções botânicas e ilustração da espigueta das espécies.

Impactos do agrupamento do bambu Actinocladum verticillatum (Nees) McClure ex Soderstr. (POACEAE) sobre a vegetação lenhosa de duas fitofisionomias de Cerrado na transição Cerrado-Floresta Amazônica

Este estudo analisou os efeitos do agrupamento de uma espécie de bambu nativa do Cerrado (Actinocladum verticillatum) sobre a composição florística, diversidade e estrutura da vegetação lenhosa de um cerradão e de um cerrado típico adjacentes no Parque Municipal do Bacaba, Nova Xavantina-MT. Foram instaladas 60 parcelas de 10x10 m, sendo 30 no cerradão e 30 no cerrado típico. Em cada fitofisionomia, foram instaladas 15 parcelas em um sítio sem bambu (SB) e 15 em um sítio com cobertura estimada de folhagem de bambu superior a 90% (CB). Foram amostrados todos os indivíduos arbustivo-arbóreos com diâmetro a 30 centímetros do solo (DAS) ≥ 3 cm. Foi avaliada a riqueza, a diversidade de espécies, a similaridade florística, a distribuição de diâmetros e alturas e o índice de valor de importância das espécies (VI). De forma geral, os sítios CB das duas fitofisionomias apresentaram menores valores quanto ao número de indivíduos, espécies, gêneros, famílias, densidades e áreas basais em relação aos sítios SB, com redução mais acentuada nestes parâmetros no cerrado típico em relação ao cerradão. Os resultados sugerem que a ocupação do espaço e a redução da incidência luminosa causada pelas touceiras do bambu dificultam a germinação das sementes e o estabelecimento das plântulas de espécies arbustivo-arbóreas, selecionando as espécies mais tolerantes ao sombreamento modificando a composição florística e a estrutura da vegetação.

Ocorrência e controle de lesmas do gênero Omalonyx (Gastropoda, Succineidae), pragas de capim-elefante Pennisetum purpureum (Poaceae) em Rio Preto da Eva, Amazonas

Lesmas do gênero Omalonyx d'Orbigny, 1837 são hermafroditas, herbívoras, de distribuição neotropical e vivem em plantas aquáticas, nas demais vegetações adjacentes e em solo úmido próximo a ambientes de água doce. No presente trabalho reporta-se a ocorrência atípica de O. pattersonae Tillier, 1981 e de Omalonyx sp. em área de terra firme, distante de ambiente aquático. Estas espécies aqui reportadas são simpátricas e devido à alta densidade populacional e prejuízos causados às folhas do capim-elefante Pennisetum purpureum Schumach, são caracterizadas como pragas agrícolas. No período da noite as lesmas se alimentavam das folhas do capim elefante e durante o dia permaneciam escondidas na base do caule, próximo a superfície úmida do solo. A aplicação de cal hidratada sobre agregados de indivíduos de Omalonyx spp foi um método efetivo para o controle das populações. As alterações ambientais dos ecossistemas amazônicos para uso agrícola e/ou urbanização tem promovido o aumento populacional de espécies que se adaptam a novos habitats e geralmente se tornam pragas de difícil controle.

Nova ocorrência de Poaceae para a América do Sul: alloteropsis (Panicoideae/Poaceae)

Registra-se, pela primeira vez, a ocorrência de Alloteropsis J. Presl (Panicoideae/Paniceae s.l.) no Brasil (Alloteropsis cimina(L.) Stapf), no Estado do Amapá. Este é também o primeiro registro do gênero e da espécie na América do Sul. A espécie é descrita e ilustrada. Chaves de identificação, comentários taxonômicos, observações ecológicas e conservacionistas são também apresentados.

Composição florística e chave de identificação das Poaceae ocorrentes nas savanas costeiras amazônicas, Brasil

As savanas da região costeira da bacia amazônica estão situadas no complexo contato entre a floresta e a costa atlântica. Nestas formações as Poaceae se destacam como um dos grupos vegetais mais importantes. O presente trabalho objetivou o levantamento da Família Poaceae nas savanas costeiras amazônicas, a elaboração de uma lista de espécies acrescida de ilustrações e chave para a identificação dos táxons confirmados. Foram registradas quatro subfamílias, 58 espécies, distribuídas em 29 gêneros, sendo Axonopus e Paspalum os mais ricos. As amostras encontram-se depositadas nos herbários do Museu Paraense Emílio Goeldi (MG) e do Instituto de Pesquisas Científicas e Tecnológicas do Estado do Amapá (HAMAB). As savanas costeiras amazônicas apresentam espécies de Poaceae de ampla distribuição, baixo endemismo e reduzido número de espécies exóticas, com influência florística das savanas das Guianas e do Bioma Cerrado.

Large multi-gene phylogenetic trees of the grasses (Poaceae): progress towards complete tribal and generic level sampling.

In this paper we included a very broad representation of grass family diversity (84% of tribes and 42% of genera). Phylogenetic inference was based on three plastid DNA regions rbcL, matK and trnL-F, using maximum parsimony and Bayesian methods. Our results resolved most of the subfamily relationships within the major clades (BEP and PACCMAD), which had previously been unclear, such as, among others the: (i) BEP and PACCMAD sister relationship, (ii) composition of clades and the sister-relationship of Ehrhartoideae and Bambusoideae + Pooideae, (iii) paraphyly of tribe Bambuseae, (iv) position of Gynerium as sister to Panicoideae, (v) phylogenetic position of Micrairoideae. With the presence of a relatively large amount of missing data, we were able to increase taxon sampling substantially in our analyses from 107 to 295 taxa. However, bootstrap support and to a lesser extent Bayesian inference posterior probabilities were generally lower in analyses involving missing data than those not including them. We produced a fully resolved phylogenetic summary tree for the grass family at subfamily level and indicated the most likely relationships of all included tribes in our analysis.

Development and testing of novel chloroplast microsatellite markers for Lolium perenne and other grasses (Poaceae) from de novo sequencing and in silico sequences

Twelve primers to amplify microsatellite markers from the chloroplast genome of Lolium perenne were designed and optimized using de novo sequencing and in silico sequences. With one exception, each locus was polymorphic with a range from two to nine alleles in L. perenne. The newly developed primer pairs cross-amplified in different species of Lolium and in 50 other grass species representing nine grass subfamilies.

On the cellular site of two-pore channel TPC1 action in the Poaceae.

The slow vacuolar (SV) channel has been characterized in different dicots by patch-clamp recordings. This channel represents the major cation conductance of the largest organelle in most plant cells. Studies with the tpc1-2 mutant of the model dicot plant Arabidopsis thaliana identified the SV channel as the product of the TPC1 gene. By contrast, research on rice and wheat TPC1 suggested that the monocot gene encodes a plasma membrane calcium-permeable channel. To explore the site of action of grass TPC1 channels, we expressed OsTPC1 from rice (Oryza sativa) and TaTPC1 from wheat (Triticum aestivum) in the background of the Arabidopsis tpc1-2 mutant. Cross-species tpc1 complementation and patch-clamping of vacuoles using Arabidopsis and rice tpc1 null mutants documented that both monocot TPC1 genes were capable of rescuing the SV channel deficit. Vacuoles from wild-type rice but not the tpc1 loss-of-function mutant harbor SV channels exhibiting the hallmark properties of dicot TPC1/SV channels. When expressed in human embryonic kidney (HEK293) cells OsTPC1 was targeted to Lysotracker-Red-positive organelles. The finding that the rice TPC1, just like those from the model plant Arabidopsis and even animal cells, is localized and active in lyso-vacuolar membranes associates this cation channel species with endomembrane function.

Correlation between the infestation level of Sitophilus zeamais Motschulsky, 1855 (Coleoptera, Curculionidae) and the quality factors of stored corn, Zea mays L. (Poaceae)

This experiment was carried out in order to evaluate the effect of Sitophilus zeamais on physical, physiological and sanitary quality of stored corn. Samples of 500 g of the hybrid OC-705, in three replicates, were conditioned in glasses covered with a screened lid, and kept in chamber at 25±2ºC, 70±5% RH and 12 h of photophase, for 150 days. The infestation levels were 0, 5, 15 and 50 adults/replicate, for the storage periods of 30, 60, 90, 120 and 150 days. The moisture content, classification, weight loss, germination and internal infestation were evaluated monthly. Significant inverse correlations were verified between the number of insects and both the germination and the weight loss; also between the internal infestation and the germination and the standard type. The presence of S. zeamais showed a positive correlation with the weight loss, what means that the internal and external infestations contribute to the reduction of physiological and physical quality of corn seeds. The mean dry matter loss was 0,36%/day, corresponding to a consumption of 0,0001%/insect/month. As the result of those damages, the product suffered reduction of the commercial grade in 30 days, with significant loss in all quality factors.