A methodology for the adaptation of a PMP at the determination of a PMF

This paper presents a new type of very fine grid hydrological model based on the spatiotemporal repartition of a PMP (Probable Maximum Precipitation) and on the topography. The goal is to estimate the influence of this rain on a PMF (Probable Maximum Flood) on a catchment area in Switzerland. The spatiotemporal distribution of the PMP was realized using six clouds modeled by the advection-diffusion equation. The equation shows the movement of the clouds over the terrain and also gives the evolution of the rain intensity in time. This hydrological modeling is followed by a hydraulic modeling of the surface and subterranean flow, done considering the factors that contribute to the hydrological cycle, such as the infiltration, the resurgence and the snowmelt. These added factors make the developed model closer to reality and also offer flexibility in the initial condition that is added to the factors concerning the PMP, such as the duration of the rain, the speed and direction of the wind. All these initial conditions taken together offer a complete image of the PMF.

Effet des précipitations maximales probables (PMP) et de la fonte des neiges sur la crue maximale probable (PMF) dans un bassin versant alpin suisse

Cet article contribue au modèle d'estimation des crues extrêmes, utilisant une pluie distribuée dans le temps et dans l'espace, à laide des nuages et de la direction du vent. Une méthode de distribution spatio-temporelle de la pluie a d'abord été réalisée. Le modèle utilisant des événements de crue réelle mesurée sur un bassin test de la Suisse a ensuite été calibré. Enfin, la modélisation de la fonte des neiges, basée sur le transfert de chaleur est décrite en tenant compte de l'hypothèse que toutes les sources de chaleur (rayonnement solaire, chaleur du sol et de l'air) agissent lentement sauf la pluie, qui, même très faible, peut provoquer des inondations considérables. Ces facteurs ajoutés rendent le modèle développé plus proche de la réalité. Ils offrent une flexibilité dans les conditions initiales auxquelles s'ajoutent la durée de la pluie, la vitesse et la direction du vent et fournissent ainsi une image complète sur l'hydrogramme de crue.

The estimation of PMP and PMF on alpine basins in Switzerland

This paper presents a very fine grid hydrological model based on the spatiotemporal repartition of precipitation and on the topography. The goal is to estimate the flood on a catchment area, using a Probable Maximum Precipitation (PMP) leading to a Probable Maximum Flood (PMF). The spatiotemporal distribution of the precipitation was realized using six clouds modeled by the advection-diffusion equation. The equation shows the movement of the clouds over the terrain and also gives the evolution of the rain intensity in time. This hydrological modeling is followed by a hydraulic modeling of the surface and subterranean flows, done considering the factors that contribute to the hydrological cycle, such as the infiltration, the exfiltration and the snowmelt. This model was applied to several Swiss basins using measured rain, with results showing a good correlation between the simulated and observed flows. This good correlation proves that the model is valid and gives us the confidence that the results can be extrapolated to phenomena of extreme rainfall of PMP type. In this article we present some results obtained using a PMP rainfall and the developed model.

Relato de experiência: Métodos de captação de pacientes hipertensos na PMF Vila Ipiranga

A hipertensão arterial sistêmica (HAS) é um dos principais fatores de risco para as doenças cardiovasculares, tendo uma importante relação com a ocorrência de acidente vascular cerebral (AVC) e doença coronariana. Os avanços no conhecimento sobre a HAS permitem conceituá-la como uma doença sistêmica, fazendo-se acompanhar de alterações na função endotelial, na elasticidade arterial, na estrutura da parede arterial e no miocárdio. O Ministério da Saúde (Brasil, 2006) indica que a atenção básica desenvolva atividades de promoção, prevenção, diagnóstico precoce e tratamento adequado da HAS. Recomenda que a equipe de saúde reúna os saberes de todos os profissionais envolvidos (médico, enfermeiro, auxiliar de enfermagem e agente de saúde, NASF: nutricionista, psicólogos, professores de educação física), bem como conduza rotinas e procedimentos que ordenem as ações de saúde da equipe, em particular dos serviços organizados segundo a Estratégia de Saúde da Família. A magnitude da Hipertensão Arterial, associado ao seu crescimento exponencial, obriga a Saúde Pública a ter um olhar diferenciado para essa patologia. Além disso, sua característica, em várias ocasiões, assintomática pode acarretar em um diagnóstico tardio e associado a suas complicações, comprometedoras da qualidade de vida do paciente. Portanto é primordial que se faça rastreamento da hipertensão arterial, buscando diagnóstico e intervenção precoce, minimizando assim os efeitos que podem ocorrer em decorrência da falta de controle da pressão arterial.

Sources of carbonaceous aerosol in the Amazon basin

The quantification of sources of carbonaceous aerosol is important to understand their atmospheric concentrations and regulating processes and to study possible effects on climate and air quality, in addition to develop mitigation strategies. In the framework of the European Integrated Project on Aerosol Cloud Climate Interactions (EUCAARI) fine (D(p) < 2.5 mu m) and coarse (2.5 mu m < Dp < 10 mu m) aerosol particles were sampled from February to June (wet season) and from August to September (dry season) 2008 in the central Amazon basin. The mass of fine particles averaged 2.4 mu g m(-3) during the wet season and 4.2 mu g m(-3) during the dry season. The average coarse aerosol mass concentration during wet and dry periods was 7.9 and 7.6 mu g m(-3), respectively. The overall chemical composition of fine and coarse mass did not show any seasonality with the largest fraction of fine and coarse aerosol mass explained by organic carbon (OC); the average OC to mass ratio was 0.4 and 0.6 in fine and coarse aerosol modes, respectively. The mass absorbing cross section of soot was determined by comparison of elemental carbon and light absorption coefficient measurements and it was equal to 4.7 m(2) g(-1) at 637 nm. Carbon aerosol sources were identified by Positive Matrix Factorization (PMF) analysis of thermograms: 44% of fine total carbon mass was assigned to biomass burning, 43% to secondary organic aerosol (SOA), and 13% to volatile species that are difficult to apportion. In the coarse mode, primary biogenic aerosol particles (PBAP) dominated the carbonaceous aerosol mass. The results confirmed the importance of PBAP in forested areas. The source apportionment results were employed to evaluate the ability of global chemistry transport models to simulate carbonaceous aerosol sources in a regional tropical background site. The comparison showed an overestimation of elemental carbon (EC) by the TM5 model during the dry season and OC both during the dry and wet periods. The overestimation was likely due to the overestimation of biomass burning emission inventories and SOA production over tropical areas.

Purification of the keratan sulfate proteoglycan expressed in prostatic secretory cells and its identification as lumican

BACKGROUND. Secretory epithelial cells of human prostate contain a keratan sulfate proteoglycan (KSPG) associated with the prostatic secretory granules (PSGs). The proteoglycan has not been identified, but like the PSGs, it is lost in the early stages of malignant transformation. METHODS. Anion exchange and affinity chromatography were used to purify KSPG from human prostate tissue. Enzymatic deglycosylation was used to remove keratan sulfate (KS). The core protein was isolated using 2D gel electrophoresis, digested in-gel with trypsin, and identified by peptide mass fingerprinting (PMF). RESULTS. The purified proteoglycan was detected as a broad smear on Western blots with an apparent molecular weight of 65-95 kDa. The KS moiety was susceptible to digestion with keratanase 11 and peptide N-glycosidase F defining it as highly sulfated and N-linked to the core protein. The core protein was identified, following deglycosylation and PMF, as lumican and subsequently confirmed by Western blotting using an anti-lumican antibody. CONCLUSIONS. The KSPG associated with PSGs in normal prostate epithelium is lumican. While the role of lumican in extracellular matrix is well established, its function in the prostate secretory process is not known. It's potential to facilitate packaging of polyamines in PSGs, to act as a tumor suppressor and to mark the early stages of malignant transformation warrant further investigation. (C) 2003 Wiley-Liss, Inc.

Coeficiente de cultura da alface hidropônica baseado no conceito de graus-dia

O objetivo principal deste trabalho foi propor a adoção de um coeficiente de cultura térmico, com a aplicação do conceito de graus-dia acumulados após o transplantio, para estimativa da evapotranspiração diária (ETc) dos cultivares de alface Grand Rapids, Regina e Great Lakes em sistema hidropônico do tipo NFT ("nutrient film technique"), em ambiente protegido. Posteriormente, o modelo matemático ajustado ãos valores observados de Kc (coeficiente de cultura) foi utilizado para a estimativa de ETc no período pós-transplantio por meio dos métodos: Penman-Monteith parametrizado pela FÃO, em 1998 (PMF); Penman-Monteith modificado para condições aerodinâmicas, características de ambientes protegidos (PMAP); Penman-Monteith para ambiente protegido simplificado (PMAPS); Priestley-Taylor (PT); Radiação solar (RS); e Radiação solar simplificado (RSS). Verificou-se que o modelo sigmoidal com quatro parâmetros ajustou-se bem aos valores observados de Kc, proporcionando coeficientes de determinação ajustados de 0,99, 0,98 e 0,98 para os cultivares Grand Rapids, Regina e Great Lakes, respectivamente. No que se refere às estimativas diárias de ETc, os métodos PMF, PMAP e RS apresentaram melhor desempenho estatístico em relagão aos métodos PMAPS, PT e RSS, independentemente do cultivar avaliado. No entanto, o método PMF subestimou sistematicamente a ETc no período inicial de crescimento da alface.

Development of new methodologies in sample treatment for proteomics workflow based on enzymatic probe sonication technology and mass spectrometry

Thesis submitted to the Universidade Nova de Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia, for the degree of Doctor of Philosophy in Biochemistry

Analysis of the chemical components of hydatid fluid from Echinococcus granulosus

Introduction The aim of this study was to explore the environment of Echinococcus granulosus (E. granulosus) protoscolices and their relationship with their host. Methods Proteins from the hydatid-cyst fluid (HCF) from E. granulosus were identified by proteomics. An inductively coupled plasma atomic emission spectrometer (ICP-AES) was used to determine the elements, an automatic biochemical analyzer was used to detect the types and levels of biochemical indices, and an automatic amino acid analyzer was used to detect the types and levels of amino acids in the E. granulosus HCF. Results I) Approximately 30 protein spots and 21 peptide mass fingerprints (PMF) were acquired in the two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) pattern of hydatid fluid; II) We detected 10 chemical elements in the cyst fluid, including sodium, potassium, calcium, magnesium, copper, and zinc; III) We measured 19 biochemical metabolites in the cyst fluid, and the amount of most of these metabolites was lower than that in normal human serum; IV) We detected 17 free amino acids and measured some of these, including alanine, glycine, and valine. Conclusions We identified and measured many chemical components of the cyst fluid, providing a theoretical basis for developing new drugs to prevent and treat hydatid disease by inhibiting or blocking nutrition, metabolism, and other functions of the pathogen.

SELEÇÃO DE CARACTERES CORRELACIONADOS EM CUBIU (Solatium sessiliflorum Dunal) EMPREGANDO A ANÁLISE DE TRILHA

Vinte e nove populações naturais de cubiu (Solatium sessiliflorum Dunal) da coleção do Programa de Melhoramento Genético de Hortaliças do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia-INPA, foram avaliadas na região Nordeste do Brasil. O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Empresa Pernambucana de Pesquisa Agropecuária-IPA, em Vitória de Santo Antão, Estado de Pernambuco. Adotou-se o delineamento experimental em blocos casualizados com 4 repetições. A unidade experimental foi constituída de uma área de 7,5m2 contendo 5 plantas úteis. Coletaram-se dados referentes ao diâmetro do caule (DC), altura da planta (AP), área da folha (AF), largura do fruto (LF), comprimento do fruto (CF), número de lóculos (NL), espessura da polpa (EP),número total médio de frutos por planta (NMF), peso médio dos frutos (PMF), peso total de frutos (PEF) e teor de sólidos solúveis totais (BRIX). Empregou-se a Analise de Trilha para desdobrar os coeficientes de correlação genotíptea, e observar a inlfuência dos efeitos destes caracteres, na produção de frutos de cubiu. Verificou-se que o maior número de associações positiva e significativa entre os pares de caracteres avaliados ocorreu com a espessura da polpa (EP). A Análise de Trilha desenvolvida sobre os dez caracteres, mostrou que o número total médio de frutos por planta (NMF) e a espessura da polpa (EP) foram os caracteres que mais influenciaram direta e positivamente sobre a produção estimada de frutos de cubiu.

Produção e qualidade de frutos de híbridos de pimentão (Capsicum annuum) em ambiente protegido em Manaus-AM

Na avaliação de cultivares de hortaliças, os rendimentos médios mais elevados nos ensaios de competição, associados aos fatores de qualidade, são utilizados como critérios de recomendação para plantio. O objetivo do trabalho foi avaliar nas condições climáticas de Manaus, AM, sob cultivo protegido, cinco híbridos comerciais de pimentão. O experimento foi conduzido em casa de vegetação do tipo arco, medindo 50,4m de comprimento com 7m de largura e coberta com plástico de 100 micras. Foi utilizado o delineamento experimental blocos ao acaso, com quatro repetições e parcelas de 20 plantas e avaliadas as características: peso (PF) e número (NF) de frutos produzidos por planta, peso médio de fruto (PMF), comprimento (CF) e diâmetro (DF) médio do fruto e relação CF/DF (RCD). Os dados foram submetidos a análises de variância e comparação de médias (Tukey). Foram verificadas diferenças estatisticamente significativas para todas as características avaliadas, com excessão para PF. Os híbridos Magali R e Nathalie apresentaram frutos mais alongados, formato preferido pelo consumidor local. Os frutos do híbrido Safari R, embora menos alongados que os de Magali R e Nathalie, apresentam maior peso médio e satisfazem a exigência do mercado local, sendo esse híbrido uma boa alternativa para diversificação dos híbridos cultivados.

Modélisation hydrologique des précipitations et des crues extrêmes dans les bassins versants alpins

Cet article présente un nouveau type de modèle hydrologique distribué à maille très fine intégrant le calcul de la distribution spatio-temporelle d'une PMP (Précipitation Maximale Probable). Le but est de déterminer les hydrogrammes de crue extrêmes correspondent à la PMF (Probable Maximum Flood) d'un bassin versant alpin. Un modèle de type distribué est indispensable pour transférer la distribution de la pluie dans l'espace et dans le temps, ainsi que pour tenir compte des caractéristiques très variables de ces bassins versants. Le modèle développé comprend trois parties importantes. Dans la première partie une distribution de la précipitation extrême, calculée a méso-échelle (1 à 2 km), est répartie dans l'espace et dans le temps à l'échelle de la maille (environ 30 m). La deuxième partie concerne la modélisation de l'écoulement de l'eau en surface et dans le sous-sol en incluant l'infiltration et l'exfiltration. La troisième partie inclut la modélisation de la fonte des neiges, basée sur un calcul de transfert de chaleur. Les débits simulés montrent une bonne corrélation avec ceux mesurés, validé à l'aide du critère de Nash.

Estudio de marcadores moleculares en neoplasias mieloproliferativas

Las neoplasias mieloproliferativas (NM) son un grupo de enfermedades clonales de la célula hematopoyética madre. Entre las NM clásicas se encuentran la policitemia vera (PV), la trombocitemia esencial (TE) y la mielofibrosis primaria (MFP). Durante muchos años el diagnóstico de estas patologías se hacía por exclusión utilizando biomarcadores de clonalidad poco específicos. En el año 2005, la descripción de la mutación JAK2V617F supuso un avance importante en el diagnóstico de estas patologías. Posteriormente, se han descrito mutaciones en otros genes como mutaciones en MPL, TET2, ASXL1, IDH1, IDH2, c-CBL, EZH2, IKZF1 y LNK, en distintas neoplasias mieloides y en porcentaje variable. Aun así, ninguno de estos genes son marcadores específicos de ninguna NM y todavía existe un porcentaje elevado de pacientes con TE y MFP sin un marcador de clonalidad conocido. Además, todos estos genes se han descrito como eventos genéticos implicados en la transformación de una NM a leucemia mieloide aguda. El objetivo de este proyecto fue estudiar varios marcadores moleculares en neoplasias mieloproliferativas Philadelphia negativas. En primer lugar, se estudió la modulación de la carga alélica JAK2V617F en pacientes con PV o TE que recibieron tratamiento citoreductor y a su vez se analizó la dinámica natural de la carga alélica en pacientes que no recibieron tratamiento. Posteriormente, se analizaron la presencia de alteraciones en los genes previamente mencionados, en distintos grupos de pacientes. En primer lugar, se analizó la presencia de mutaciones en TET2, ASXL1, IDH1, IDH2 y CBL en un grupo de pacientes JAK2 y MPL negativos, para determinar la frecuencia de alteraciones de estos genes en este grupo de pacientes y determinar su valor en el diagnóstico de estas patologías. En segundo lugar, se estudió la presencia de mutaciones en estos genes incluyendo EZH2, IKZF1 y LNK para estudiar la incidencia y el valor pronóstico de estas alteraciones en las NM que progresan a mielofibrosis.

Determination of extreme floods using a distributed hydrological model

Hydrological models developed for extreme precipitation of PMP type are difficult to calibrate because of the scarcity of available data for these events. This article presents the process and results of calibration for a distributed hydrological model at fine scale developed for the estimation of probable maximal floods in the case of a PMP. This calibration is done on two Swiss catchments for two events of summer storms. The calculation done is concentrated on the estimation of the parameters of the model, divided in two parts. The first is necessary for the computation of flow speeds while the second is required for the determination of the initial and final infiltration capacities for each terrain type. The results, validated with the Nash equation show a good correlation between the simulated and observed flows. We also apply this model on two Romanian catchments, showing the river network and estimated flow.