Étude de l'intégrité du génome chloroplastique de l'orge (Hordeum vulgare) en culture de microspores isolées

Un enjeu actuel en biotechnologie est d’obtenir des plantes haploïdes doublées par la technique de la culture de microspores isolées (CMI). Pourtant, la CMI génère parfois une proportion importante de plantes albinos, laquelle peut atteindre 100 % chez certains cultivars. Des travaux antérieurs ont indiqué que des remaniements du génome chloroplastique seraient à l’origine de cet albinisme. Afin de mieux comprendre ce processus menant à l’albinisme, nous avons entrepris d’étudier l’intégrité du génome chloroplastique au sein de microspores d’orge et de plantes albinos via une approche de séquençage à grande échelle. L’ADN total extrait de microspores à un stade précoce de la CMI, d’une feuille de la plante-mère (témoin), et de feuilles albinos, a été séquencé et les séquences chloroplastiques ont été analysées. Ceci nous a permis de documenter pour la première fois une diminution de l’ADN chloroplastique chez les microspores. De plus une étude de variations structurales a démontré un abaissement généralisé de la quantité de génomes chloroplastiques chez les microspores. Enfin, d’importants remaniements du génome chloroplastique ont été observés chez les plantes albinos, révélant une forte abondance de génomes chloroplastiques altérés de forme linéaire.

Spot Form of Net Blotch Resistance in a Diverse Set of Barley Lines in Australia and Canada.

The responses of 95 barley lines and cultivars to spot form of net blotch (SFNB) caused by Pyrenophora teres f. maculata were analyzed as seedlings and adults in Australia and Canada. Cluster analyses revealed complex reaction responses. Only 2 lines (Esperance Orge 289 and TR3189) were resistant to all isolates at the seedling stage, whereas 15 lines and cultivars (81-82/033, Arimont, BYDV-018, CBSS97M00855T-B2-M1-Y1-M2-Y-1M-0Y, C19776, Keel, Sloop, Torrens, TR326, VB0111, Yarra, VB0229, WI-2477, WI2553, and Wisconsin Pedigree) were resistant toward the two Canadian isolates and mixture of Australian isolates at the adult stages. In Australian field experiments, the effectiveness of SFNB resistance in three barley cultivars (Barque. Cowabbie, and Schooner) and one breeding line (VB9104) with a different source of resistance was tested. Barque, which possessed a resistance gene that provided complete resistance to SFNB, was the most effective and showed no effect on grain yield or quality in the presence of inoculum. Generally, cultivars with seedling or adult resistance had less disease and better grain quality than the susceptible control. Dash, but they were not as effective as Barque. A preliminary differential set of 19 barley lines and cultivars for P teres I. maculata is proposed.

Validation of a new spot form of net blotch differential set and evidence for hybridisation between the spot and net forms of net blotch in Australia

A recently developed spot form of blotch differential set of 16 barley lines was tested for reaction response to 60 Pyrenophora teres f. maculata isolates from geographically disperse barley crops of Australia. Twelve barley lines (Arimont, Barque, Chebec, CI5286, CI5791, CI9214, CII6150, Dairokkaku, Esperance Orge 289, Galleon, Keel, Skiff, Torrens and TR250) provided differential response between the isolates. The susceptible controls Gairdner and Kombar provided indication of isolate virulence or avirulence. Abundant pathogenic diversity was revealed with 33 designated pathotypes, some of which related to geographic region. AFLP analysis also revealed abundant diversity with each of the isolates representing a unique genotype and one isolate that contained both AFLP bands unique to P. teres f. maculata and P. teres f. teres, the cause of spot form and net form of net blotch respectively, suggesting that sexual recombination between the net form and spot form isolates may have occurred naturally in the field.

Catálogo ilustrado de las compuestas (=Asteraceae) de la provincia de Buenos Aires, Argentina: Sistemática, Ecología y Usos.

La familia de la Compuestas (=Asteraceae) es la más numerosa de todas las fanerógamas con aproximadamente 23000 especies y más de 1500 géneros ampliamente distribuidos en todos los continentes excepto en la Antártida. En la República Argentina es la familia más abundante con 222 géneros nativos y 1490 especies, en tanto que en la provincia de Buenos Aires, las compuestas representan la sexta parte de la flora de plantas vasculares con 113 géneros y 356 especies, de las cuales 55 son adventicias y el resto indígenas. Muchas de las especies de esta familia son utilizadas por el hombre como plantas alimenticias o medicinales. Algunas especies son tóxicas para el ganado. Otras son utilizadas como repelentes de insectos o son perjudiciales por ser malezas invasoras en los campos y competir con las plantas cultivadas.

Hablando de Ictiólogos Argentinos… Hugo Luis López.

Este es un homenaje realizado bajo mi entera responsabilidad. En mi opinión no puede cerrarse la edición de ProBiota sin publicar un número sobre quien fue su alma mater. En lo personal, hacedor de un humor irónico increíble, aunque melancólico, con tendencia al abatimiento y a hacerse responsable por todo. Mediador, proclive a “poner la oreja”, con actitud democrática hacia sus laderos, otorgando una prudente libertad de acción a quienes trabajaron o trabajan bajo su jefatura. Fiel simpatizante de River Plate, fan de Clint Eastwood y admirador incondicional de Raúl A. Ringuelet a quien estará eternamente agradecido. Si tuviera que definirlo profesionalmente, al margen de su labor académica formal, diría que es un promotor, un luchador y un historiador innato. Generador de ideas, siempre intentó reunir a aquellos científicos de trayectoria con los jóvenes iniciados en el camino de las ciencias, impulsando el trabajo en equipo. Además de su producción a nivel de su especialidad, promocionó el rescate de trabajos ya editados digitalizándolos con el fin de ponerlos a disposición de todo interesado y despertar el interés de quienes no los conocían, especialmente las publicaciones “incunables” como él las denomina. Poseedor de un espíritu inquieto y motivador, en su camino quedaron algunos intentos frustrados por circunstancias ajenas, pero a su vez, muchísimos logros con aire renovador e integrador y con una marcada originalidad. Sería interesante y necesario que alguien más con parecida inquietud, continuara gran parte de esos logros para que no quedaran truncos desperdiciando en parte tanto esfuerzo y constancia. Sólo resta comentar que aunque a veces estuvimos en veredas opuestas siempre nos tendimos la mano en apoyo mutuo. Fuiste mi mejor jefe. Gracias Hugo! Justina Ponte Gómez

Prédiction de la digestibilité des acides aminés des ingrédients utilisés en alimentation porcine : approche par méta-analyse

En alimentation animale, l’utilisation adéquate des aliments nécessite une connaissance précise des valeurs nutritionnelles de leurs composantes, dont celle en acides aminés. Cependant, ces valeurs nutritionnelles dépendent de la teneur en acides aminés essentiels (AAE) totaux et de la digestibilité iléale standardisée (DIS) de ces AAE. Cette dernière varie en fonction de plusieurs facteurs, dont l’origine botanique des graines, les conditions de culture des récoltes, le stockage des aliments, les traitements physico-chimiques appliqués aux grains, les facteurs antinutritionnels (FANs) et les techniques expérimentales utilisées pour le dosage et l’estimation de la digestibilité des AAE. Une approche par méta-analyse a permis d’établir des modèles de prédiction de la valeur nutritionnelle en AAE des ingrédients à partir de leur composition chimique en considérant la protéine brute (PB), les AAE totaux, la teneur en fibre (Acid Detergent Fiber (ADF), Neutral Detergent Fiber (NDF) et Fibre Brute (FB)) et les FANs comme les inhibiteurs de la trypsine. En se référant à l’analyse graphique et statistique, les données ont été réparties en 4 groupes : 1) les tourteaux (tourteau de soja, colza/canola et coton); 2) les légumineuses (féveroles, lupins, pois et soja); 3) les céréales (blé, orge, avoine, sorgho et maïs); 4) les drêches de distilleries (blé et maïs). Ainsi, un modèle général ajusté en fonction du type d’ingrédients a été généré et les facteurs de variation de la digestibilité en AAE ont été identifiés. Pour les tourteaux, la DIS des AAE est réduite par un accroissement de la teneur en NDF, tandis que la DIS des AAE de la féverole, pois et lupin est principalement influencée par la teneur en PB et en FANs. Concernant les graines de soja la DIS des AAE est réduite par une hausse de la teneur en fibre (FB et ADF). Enfin pour les céréales et les sous- produit de céréales telles que les drêches, la PB et les fibres (ADF ou NDF) étaient les meilleurs nutriments pour prédire la DIS des AAE. Ces résultats démontrent que la DIS des AAE peut être prédite avec précision à partir de la composition chimique pour la plupart des ingrédients.

Dynamic cost indexing

This paper describes the development of a generic tool for dynamic cost indexing (DCI), which encompasses the ability to manage flight delay costs on a dynamic basis, trading accelerated fuel burn against ‘cost of time’. Many airlines have significant barriers to identifying which costs should be included in ‘cost of time’ calculations and how to quantify them. The need is highlighted to integrate historical passenger delay and policy data with real-time passenger connections data. The absence of industry standards for defining and interfacing necessary tools is recognised. Delay recovery decision windows and ATC cooperation are key constraints. DCI tools could also be used in the pre-departure phase, and may offer environmental decision support functionality: which could be used as a differentiating technology required for access to designated, future ‘green’ airspace. Short-term opportunities for saving fuel and/or reducing emissions are also identified.

Aeronautical Information Geoservices

Aeronautical charts underlie the representation of aeronautic geographic information that supports pilots in flight. Nevertheless, charts become complex due to the high density of data and the different kinds that support each phase of flight. These features make difficult using them on board. After conducting a study that aims to understand and to evaluate pilot’s needs related to Geographic Information, it is proposed a solution to implement a platform based on geographic information standards (OGC, ISO) and supported by a distributed Web architecture. This platform facilitates the use, retrieval, updating of information and its exchange among different institutions through private and public users. As a first element to ensure interoperability and the harmonisation of information, we propose an aeronautical metadata profile that sets guidelines and elements for its description. This profile meets the standards set by ICAO, Eurocontrol and ISO. The platform offers three levels of access to data through different types of devices and user profiles. This paper suggests an alternative and reliable way for distributing aeronautical geoinformation, focusing on specific functions or displaying and querying.

Aeronautical Metadata Profile based on Geographic International Standards

The aeronautical information plays an essential rolein air safety, chief objective of the aeronautical industry. Community policies and projects are being currently developed for the adequate management of a single European air space. To make this possible, an appropriate information management and a set of tools that allow sharing and exchanging this information, ensuring its interoperability and integrity, are necessary. This paper presents the development and implementation of a metadata profile for description of the aeronautical information based on international regulations and recommendations applied within the geographic scope. The elements taken into account for its development are described, as well as the implementation process and the results obtained.

Évolution des systèmes d'élevage dans les steppes du Maghreb : enjeux et perspectives

L’objectif de cet essai est d’analyser les forces, faiblesses, menaces et opportunités des systèmes d’élevage du Maghreb en territoire steppique, afin de proposer des pistes d’évolution vers un système durable. Le pastoralisme en steppe, comme ailleurs, repose sur la disponibilité fourragère des pâturages, qui permet de nourrir les animaux. Or, le Maroc, l’Algérie et la Tunisie rencontrent actuellement des difficultés pour exercer cette pratique : les ressources naturelles des parcours diminuent à la fois en surface et en productivité, tandis que le cheptel augmente pour répondre à la demande alimentaire des populations grandissantes. La pâture ne permet plus de satisfaire les besoins des troupeaux. Les éleveurs sont donc obligés d’apporter des complémentations alimentaires au cheptel, notamment de l’orge en grain. De ce fait, les systèmes d’élevage sont devenus dépendants du marché des compléments. Dans ces conditions, comment assurer une activité d’élevage en steppe sur le long terme ? Les pratiques de restauration et de réhabilitation des parcours dégradés, comme la mise en défens, le pâturage différé ou les plantations pastorales, ainsi que d’autres modes de conduite des animaux peuvent limiter la diminution du couvert végétal. Aussi, les sous-produits agro-industriels tels que les grignons d’olives ou la pulpe de tomates semblent offrir une certaine alternative pour nourrir les animaux. Ils peuvent remplacer les apports en orge et différentes techniques permettent leur conservation. Il est également important de renforcer la synergie entre les acteurs pour amener à une gestion durable du territoire steppique. Diverses actions de lutte contre la pauvreté, la désertification, la contrebande et la course à l’appropriation foncière vont également dans le sens de la préservation de l’environnement et du bien-être des sociétés de ces territoires d’élevage. Il s’agit d’un défi de taille, dont les enjeux sont primordiaux pour les populations du Maghreb. Les systèmes pastoraux s’intensifient et les inégalités foncières issues des jeux de pouvoir sociaux creusent la pauvreté en steppe. La complémentation animale est telle qu’on ne peut d’ailleurs plus vraiment parler de pastoralisme. De nos jours, les produits des terres cultivées du monde servent en grande partie à nourrir les animaux d’élevage au lieu d’utiliser les ressources naturelles disponibles de manière raisonnée. Il y a là une incohérence flagrante dans les chaînes de production de viande et les habitudes de consommation. Il serait donc intéressant pour l’avenir des populations de repenser ces mécanismes afin d’aller vers une solidarité socioécologique, au niveau du Maghreb comme au niveau mondial.