Candida golubevii sp nov., an asexual yeast related to Metschnikowia lunata

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Fungal community associated with marine macroalgae from Antarctica

Filamentous fungi and yeasts associated with the marine algae Adenocystis utricularis, Desmarestia anceps, and Palmaria decipiens from Antarctica were studied. A total of 75 fungal isolates, represented by 27 filamentous fungi and 48 yeasts, were isolated from the three algal species and identified by morphological, physiological, and sequence analyses of the internal transcribed spacer region and D1/D2 variable domains of the large-subunit rRNA gene. The filamentous fungi and yeasts obtained were identified as belonging to the genera Geomyces, Antarctomyces, Oidiodendron, Penicillium, Phaeosphaeria, Aureobasidium, Cryptococcus, Leucosporidium, Metschnikowia, and Rhodotorula. The prevalent species were the filamentous fungus Geomyces pannorum and the yeast Metschnikowia australis. Two fungal species isolated in our study, Antarctomyces psychrotrophicus and M. australis, are endemic to Antarctica. This work is the first study of fungi associated with Antarctic marine macroalgae, and contributes to the taxonomy and ecology of the marine fungi living in polar environments. These fungal species may have an important role in the ecosystem and in organic matter recycling.

Isolamento e seleção de leveduras fermentadoras de xilose

Pós-graduação em Microbiologia - IBILCE

Ocorrência de leveduras em espécies vegetais nativas da mata atlântica, Parque Estadual da Serra do Mar - Núcleo Picinguaba, São Paulo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Produção de ácidos orgânicos por cepas leveduras assimiladoras de xilose

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Fungal Planet description sheets: 320-370

Novel species of fungi described in the present study include the following from Malaysia: Castanediella eucalypti from Eucalyptus pellita, Codinaea acacia from Acacia mangium, Emarcea eucalyptigena from Eucalyptus brassiana, Myrtapenidiella eucalyptorum from Eucalyptus pellita, Pilidiella eucalyptigena from Eucalyptus brassiana and Strelitziana malaysiana from Acacia mangium. Furthermore, Stachybotrys sansevieriicola is described from Sansevieria ehrenbergii (Tanzania), Phacidium grevilleae from Grevillea robusta (Uganda), Graphium jumulu from Adansonia gregorii and Ophiostoma eucalyptigena from Eucalyptus marginata (Australia), Pleurophoma ossicola from bone and Plectosphaerella populi from Populus nigra (Germany), Colletotrichum neosansevieriae from Sansevieria trifasciata, Elsinoë othonnae from Othonna quinquedentata and Zeloasperisporium cliviae (Zeloasperisporiaceae fam. nov.) from Clivia sp. (South Africa), Neodevriesia pakbiae, Phaeophleospora hymenocallidis and Phaeophleospora hymenocallidicola on leaves of a fern (Thailand), Melanconium elaeidicola from Elaeis guineensis (Indonesia), Hormonema viticola from Vitis vinifera (Canary Islands), Chlorophyllum pseudoglobossum from a grassland (India), Triadelphia disseminata from an immunocompromised patient (Saudi Arabia), Colletotrichum abscissum from Citrus (Brazil), Polyschema sclerotigenum and Phialemonium limoniforme from human patients (USA), Cadophora vitícola from Vitis vinifera (Spain), Entoloma flavovelutinum and Bolbitius aurantiorugosus from soil (Vietnam), Rhizopogon granuloflavus from soil (Cape Verde Islands), Tulasnella eremophila from Euphorbia officinarum subsp. echinus (Morocco), Verrucostoma martinicensis from Danaea elliptica (French West Indies), Metschnikowia colchici from Colchicum autumnale (Bulgaria), Thelebolus microcarpus from soil (Argentina) and Ceratocystis adelpha from Theobroma cacao (Ecuador). Myrmecridium iridis (Myrmecridiales ord. nov., Myrmecridiaceae fam. nov.) is also described from Iris sp. (The Netherlands). Novel genera include (Ascomycetes): Budhanggurabania from Cynodon dactylon (Australia), Soloacrosporiella, Xenocamarosporium, Neostrelitziana and Castanediella from Acacia mangium and Sabahriopsis from Eucalyptus brassiana (Malaysia), Readerielliopsis from basidiomata of Fuscoporia wahlbergii (French Guyana), Neoplatysporoides from Aloe ferox (Tanzania), Wojnowiciella, Chrysofolia and Neoeriomycopsis from Eucalyptus (Colombia), Neophaeomoniella from Eucalyptus globulus (USA), Pseudophaeomoniella from Olea europaea (Italy), Paraphaeomoniella from Encephalartos altensteinii, Aequabiliella, Celerioriella and Minutiella from Prunus (South Africa). Tephrocybella (Basidiomycetes) represents a novel genus from wood (Italy). Morphological and culture characteristics along with ITS DNA barcodes are provided for all taxa.

Determinación de la contaminación con Zygosaccharomyces rouxii durante la elaboración de jugos de uva concentrados

El jugo de uva concentrado (JUC) es un commodity y por su carácter natural se utiliza para elaborar jugos mezclas, golosinas, dulces, mermeladas, jaleas, galletitas, pan, como edulcorante de bebidas gaseosas, y también en la industria farmacéutica. La producción de JUC constituye una parte importante de la industria vitivinícola argentina, siendo nuestro país el mayor exportador mundial de JUC durante el año 2014. El comercio internacional del JUC forma parte de mercados con una demanda que crece en forma sostenida. La industrialización de la uva para la obtención de jugos concentrados presenta varias etapas de procesamiento que incluyen tratamientos térmicos que afectan la microbiota presente en la materia prima. A pesar de esto, los productos no están exentos de presentar problemas microbiológicos que deterioran la calidad del mismo. El JUC es un alimento de humedad intermedia (aw 0,7-0,8), con elevada concentración de azúcares y bajo pH. La alteración de estos sustratos es causada por levaduras osmófilas, dentro de este grupo el género que se aísla con mayor frecuencia es Zygosaccharomyces sp. El objetivo del presente trabajo fue la identificación de puntos críticos de contaminación con levaduras osmófilas en plantas elaboradoras, identificando las especies presentes en los jugos de uva y las superficies asociadas a su concentrado. El conocimiento de los puntos críticos de contaminación permitiría la aplicación de medidas preventivas para aumentar la estabilidad microbiana de los JUC. Para ello se eligieron tres plantas concentradoras de jugo de uva y se muestrearon los jugos de uva pre-concentrados y concentrados y las superficies asociadas a su elaboración. Se realizó el recuento de levaduras osmófilas en el medio MY50G y la posterior identificación molecular de las levaduras presentes en todas las muestras mediante secuenciación del fragmento amplificado ITS1-5.8S-ITS2. Los resultados mostraron que Z. rouxii fue la especie encontrada en todas las muestras de jugo de uva pre-concentrado y concentrado y en la mayoría de los casos representó el 100% de las levaduras aisladas. También se evidenció que los períodos de almacenamiento del jugo de uva pre-concentrado y concentrado fueron claves para que la población de Z. rouxii aumentara. Por lo cual constituyen puntos críticos en la elaboración y deberán ser cuidadosamente controlados para evitar el deterioro del producto. Por otro lado, se concluyó que en las superficies limpias, antes que entren en contacto con los jugos de uva pre-concentrados o concentrados, no hubo incidencia de Z. rouxii. Este hecho sugiere que las prácticas sanitarias utilizadas en las tres plantas serían capaces de eliminar las poblaciones de Z. rouxii de las superficies, siempre y cuando los restos de mosto sean completamente removidos de todas las áreas en contacto con el producto. Siete especies de levaduras fueron identificadas en las superficies: Wickerhamomyces anomalus, Torulaspora delbrueckii, Citeromyces matritensis, Lachancea thermotolerans, Metschnikowia pulcherrima, Candida orthopsilosis y Candida apícola. El hallazgo de estas especies osmotolerantes, sugiere que las mismas presentan características que les permitieron persistir en las superficies higienizadas, los recuentos obtenidos fueron en muchos casos muy elevados. Estas especies han sido descritas como asociadas a los ambientes de las plantas elaboradoras de productos azucarados pero no han sido clasificadas como alterantes del producto per se.

In vitro application of biocontrol agents to improve the safety and quality of grapevine products

Pathogenic fungi are responsible for vine diseases affecting the grapevine yield and the organoleptic quality of the final wine products. Using of biocontrol agents can represent a sustainable alternative to the use of synthetic fungicides whose intense use can have negative effects on the ecosystem and cause increase resistant pathogen population to synthetic agents. The principal aim of my PhD thesis was the isolation and characterization of new yeast strains and Bacillus subtilis SV108 as biocontrol agent and the comprehension of the mechanism of their antimicrobial action. Accordingly, twenty wild yeast and one selected bacterium isolated among 62 samples, isolated from different Italian and Malaysian regions and molecularly identified, were evaluated in a preliminary screening test on agar. Results showed the highest effects on inhibiting mycelial growth by Starmerella bacillaris FE08.05, Metschnikowia pulcherrima GP8 and Hanseniaspora uvarum GM19. On the other side, Bacillus subtilis SV108 showed the ability of inhibit the mycelial growth of selected fungi by producing antimicrobial compounds on Malt Extract Broth medium recovered by sodium dodecyl sulphate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and identified by electrospray ionization (ESI) tandem mass spectrometer Triple TOF 5600. Moreover, in order to analyze the volatile fraction of compounds, the quantitative analysis of the VOCs profiles was performed by GC/MS/SPME. The analysis highlighted the presence of isoamyl and phenylethyl alcohols and an overall higher presence of low-chain fatty acids and volatile ethyl esters. All the data collected suggest that the tested yeasts, found among the epiphytic microbiota associated with grape berries, can be potentially effective for the biological control of pathogenic moulds. On the other hand, the proteomic study conducted on B. subtilis SV108 revealed that there are two cyclic antifungal peptides which can explain the antimicrobial effect of Bacillus subtilis SV108 acting as biocontrol agent against fungal pathogens in grapevine.