Letter of recommendation for Jacques Judah Lyons from Isaac Leeser

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Early biomarkers to predict grade of encephalopathy following hypoxic ischaemic injury

The standard early markers for identifying and grading HIE severity, are not sufficient to ensure all children who would benefit from treatment are identified in a timely fashion. The aim of this thesis was to explore potential early biomarkers of HIE. Methods: To achieve this a cohort of infants with perinatal depression was prospectively recruited. All infants had cord blood samples drawn and biobanked, and were assessed with standardised neurological examination, and early continuous multi-channel EEG. Cord samples from a control cohort of healthy infants were used for comparison. Biomarkers studied included; multiple inflammatory proteins using multiplex assay; the metabolomics profile using LC/MS; and the miRNA profile using microarray. Results: Eighty five infants with perinatal depression were recruited. Analysis of inflammatory proteins consisted of exploratory analysis of 37 analytes conducted in a sub-population, followed by validation of all significantly altered analytes in the remaining population. IL-6 and IL-6 differed significantly in infants with a moderate/severely abnormal vs. a normal-mildly abnormal EEG in both cohorts (Exploratory: p=0.016, p=0.005: Validation: p=0.024, p=0.039; respectively). Metabolomic analysis demonstrated a perturbation in 29 metabolites. A Cross- validated Partial Least Square Discriminant Analysis model was developed, which accurately predicted HIE with an AUC of 0.92 (95% CI: 0.84-0.97). Analysis of the miRNA profile found 70 miRNA significantly altered between moderate/severely encephalopathic infants and controls. miRNA target prediction databases identified potential targets for the altered miRNA in pathways involved in cellular metabolism, cell cycle and apoptosis, cell signaling, and the inflammatory cascade. Conclusion: This thesis has demonstrated that the recruitment of a large cohortof asphyxiated infants, with cord blood carefully biobanked, and detailed early neurophysiological and clinical assessment recorded, is feasible. Additionally the results described, provide potential alternate and novel blood based biomarkers for the identification and assessment of HIE.

Grade of membership (GoM) por algoritmos genéticos

Muitas vezes é necessário trabalhar com variáveis categóricas, porem há um número restrito de análisesque as abordam. Uma boa técnica de segmentação é a grade of membership (GoM), muito utilizada na área médica, em psicologia e em sociologia. Essa metodologia possui uma interpretação interessante baseada em perfis extremos (segmentos) e grau de pertencimento. Porém o modelo possui grande complexidade de estimação dos parâmetros pormáxima verossimilhança. Assim, neste trabalho propõe-se o uso de algoritmos genéticos para diminuir a complexidade e o tempo de cálculo, e aumentar a acurácia. A técnica é nomeada de Genetics Algorithms grade of membership (GA-GoM). Para averiguar a efetividade, o modelo foi primeiramente abordado por simulação – foi executado um experimento fatorial levando em conta o número de segmentos e variáveis trabalhadas. Em seguida, foi abordado um caso prático de segmentação de engajamento em redes sociais. Os resultados são superiores para modelos de maior complexidade. Conclui-se, assim, que é útil a abordagem para grandes bases de dados que contenham dados categóricos.

Grade of esophageal cancer and nutritional status impact on postsurgery outcomes

CONTEXTO: A desnutrição protéico-energética constitui causa previsível para o desenvolvimento de complicações pós-operatórias e pior prognóstico de pacientes cirúrgicos. OBJETIVO: Estudar a associação de indicadores de estado nutricional com estádio da doença e as principais complicações e mortalidade pós-operatória de pacientes com câncer de esôfago. MÉTODO: Foram avaliados retrospectivamente 100 prontuários de pacientes com câncer de esôfago (38-81 anos) de ambos os sexos (85% masculino e 15% feminino) submetidos a esofagectomia (n = 25) e gastrojejunostomia (n = 75), no período de 1995 a 2004. Os dados coletados foram: história clínica, exame endoscópico, estádio (TNM-UICC), estado nutricional (índice de massa corporal, percentual de perda de peso - %PP, albuminemia e contagem de linfócitos total) e evolução clínica pós-operatória. Houve composição dos grupos de acordo com o porte da cirurgia (grande x pequeno). Foi realizada a associação entre as complicações pós-operatórias e a mortalidade (após pós-operatório de 30 dias). As comparações entre médias dos dois grupos foram feitas pelo teste t de Student e a existência de associações entre variáveis testadas pelos testes de χ2 ou exato de Fisher com P = 0,05. RESULTADOS: Houve predomínio dos tumores avançados (estádio III e IV), com a presença de disfagia em 95% dos pacientes e perda ponderal >10%, anterior ao diagnóstico, em 78%. A obstrução esofágica, presente em 77 pacientes, foi associada (P = 0,0021) com o baixo índice de massa corporal (desnutrição protéico-energética). A %PP e a hipoalbuminemia associaram-se estatisticamente (P<0,05) com o estádio avançado da doença. As complicações pós-operatórias precoces ocorreram em 69,2% e 30,7% dos pacientes submetidos a esofagectomia e ostomias, respectivamente, com predomínio das infecciosas nas ostomias (80%) e as pleuropulmonares nas esofagectomias (61%). A albuminemia foi menor nos pacientes submetidos as ostomias, tendo sido a hipoalbuminemia associada (P<0,05) com a ocorrência de complicações pós-operatórias e mortalidade. A %PP e a contagem de linfócitos total associaram-se com as complicações pós-operatórias precoces e infeccionas nas ostomias e a contagem de linfócitos total, com a mortalidade operatória nas esofagectomias. CONCLUSÕES: O estado de DPE esteve associado às complicações pós-operatórias apenas nos pacientes submetidos a ostomias, sem presença destas associações nas esofagectomias.

Guidelines for the management and treatment of periodic fever syndromes Familial Mediterranean Fever

To establish guidelines based on scientific evidence for the management of familial Mediterranean fever. The Guideline was prepared from 5 clinical questions that were structured through PICO (Patient, Intervention or indicator, Comparison and Outcome), to search in key primary scientific information databases. After defining the potential studies to support the recommendations, these were graduated considering their strength of evidence and grade of recommendation. 10,341 articles were retrieved and evaluated by title and abstract; from these, 46 articles were selected to support the recommendations. 1. The diagnosis of FMF is based on clinical manifestations, characterized by recurrent febrile episodes associated with abdominal pain, chest or arthritis of large joints; 2. FMF is a genetic disease presenting an autosomal recessive trait, caused by mutation in the MEFV gene; 3. Laboratory tests are not specific, demonstrating high serum levels of inflammatory proteins in the acute phase of the disease, but also often showing high levels even between attacks. SAA serum levels may be especially useful in monitoring the effectiveness of treatment; 4. The therapy of choice is colchicine; this drug has proven effectiveness in preventing acute inflammatory episodes and progression towards amyloidosis in adults; 5. Based on the available information, the use of biological drugs appears to be an alternative for patients with FMF who do not respond or are intolerant to therapy with colchicine.