961 resultados para Genética de populações Teses
Resumo:
A batata-da-serra, Ipomoea serrana Sim.-Bianch. & L.V. Vasconcelos, uma liana endmica da Chapada Diamantina, Bahia, cuja raiz tuberosa e consumida por populações humanas ha muitos anos. Apesar da espcie, classificada como vulnervel pela IUCN (Unio Internacional para a Conservao da Natureza), estar submetida presso antrpica devido explorao de razes tuberosas, para uso na alimentao, so raros os estudos com a espcie, razo pela qual e de grande importncia conhecer a diversidade e estrutura genética da espcie. Estudos sobre diversidade e estrutura genética a partir de marcadores moleculares so importantes por fornecerem dados sobre impactos da explorao antrpica sobre as populações, podendo oferecer subsdio para planos de manejo e conservao de espcie. Cinco populações da Chapada Diamantina, constituindo um total de 142 indivduos, foram investigados com quatro iniciadores Inter Simple Sequence Repeats (ISSR), resultando em 34 bandas, das quais 25 foram polimrficas. A analise dos parmetros genticos mostrou que as populações apresentam variabilidade moderada, com 73,8% de bandas polimrficas, 0,264 de ndice de diversidade de Nei e 0,389 de ndice de Shannon (valores mdios). A maior parte da variao ocorreu dentro das populações (77%), estimado pela analise de varincia molecular (AMOVA), enquanto que a variao entre populações foi de 23%, o que corroborou os resultados de estruturao obtidos pelo programa Structure, analise de coordenadas principais (PCoA) e agrupamento estimado pelo mtodo Neighbor-Joining, a partir do coeficiente de dissimilaridade de Jaccard. A analise Bayesiana separou os indivduos em quatro grupos, sendo que as populações Andara e Capo foram alocadas em grupos distintos, enquanto as outras trs populações compartilharam indivduos distribudos em outros dois grupos. Este estudo, por seu carter pioneiro com relao aos marcadores moleculares, constituiu o primeiro passo para o conhecimento da diversidade genética da espcie. Estudos futuros podero ampliar o conhecimento sobre a espcie podendo oferecer subsidio para a elaborao de um plano de manejo para esta espcie que tem sido explorada na regio.
Resumo:
O uso de marcadores do tipo STR e SNP tem se revelado de grande importncia na discriminao entre indivduos de uma mesma populao, assim como para estudos evolutivos. A utilizao de um conjunto de 17 STRs e 46 SNPs especficos de cromossomo Y permitiu a caracterizao de um conjunto de amostras representativas das populações do Rio de Janeiro e do oeste africano, com uma avaliao mais ampla sobre a ancestralidade de origem paterna. Na primeira parte deste estudo foram analisados 605 indivduos do sexo masculino do estado do Rio de Janeiro. Como resultado, no foram observadas diferenas significativas entre as populações do sudeste e do Rio de Janeiro, que apresentou uma alta diversidade de hapltipos (0,9999 0,0001) e de haplogrupos (0,7589 0,0171). A comparao da populao miscigenada do Rio de Janeiro com diferentes grupos tnicos ou populacionais mostrou que a frequncia de indivduos com marcadores tipicamente Europeus de 77%, africanos de 14,87% e em amerndios de 2,31%. A segunda parte do estudo revelou uma grande diversidade haplotpica (1,0000 0,0018) numa amostra do Oeste africano. Quanto ao valor da diversidade de haplogrupos (0,6895 0,0200), este foi similar aos observados em populações de origem Bantu do oeste e centro africanos, principalmente de Benin, Nigria e Costa do Marfim. A terceira parte deste estudo mostrou que no existem diferenas significativas entre o componente africano da amostra do Rio de Janeiro e as populações africanas do sudeste, oeste e centro oeste. Por outro lado, observamos diferenas significativas quando comparamos o componente africano do Rio de Janeiro e o oeste africano com populações de Uganda, Qunia e frica do Sul. A ampliao de estudos genticos nas populações da frica se fazem necessrios para o entendimento da diversidade genética no mundo. Este trabalho contribuiu para fornecer mais alguns dados genticos, que podem ser somados aos estudos mundiais que esto sendo realizados, ampliando os nossos conhecimentos sobre a formao das populações que tambm foram influenciadas pelo fenmeno da Dispora Africana.
Resumo:
Os projetos com espcies nativas dependem da disponibilidade de sementes e mudas nas quantidades requeridas e com a qualidade apropriada. O mercado, contudo, no oferece sementes de inmeras espcies, e para a maioria inexistem estudos visando conhecer a distribuio espacial dos gentipos nas populações naturais, informao indispensvel para formao de lotes de sementes com qualidade genética, entre as quais o vassouro-branco (Piptocarpha angustifolia Dsen ex Malme). O vassouro-branco comum nas clareiras, capoeires e no estrato secundrio da Floresta com Araucria. Alm das aptides madeireiras e para recuperao ambiental, apresenta potencial para compor sistemas silvipastoris. O objetivo deste trabalho foi quantificar a diversidade genética intra e inter-populacional. As rvores amostradas de vassouro-branco, das quais foram coletadas folhas para extrao do DNA genmico, esto localizadas em fragmentos florestais em Curitiba e So Jos dos Pinhais, PR, e Rio Negrinho, SC. Para extrao do DNA genmico, foram utilizadas duas folhas com tecido jovem, pesando aproximadamente dois gramas, que foram maceradas em almofariz aps adio de nitrognio lquido. A extrao do DNA genmico das folhas do vassouro-branco foi eficiente com qualidade e nas quantidades requeridas para execuo da metodologia da PCR-RAPD. As diversidades genéticas entre as populações de Rio Negrinho, e Curitiba e entre So Jos dos Pinhais, e Rio Negrinho, foi moderada, contudo, entre Curitiba e So Jos dos Pinhais foi grande. A correlao entre a distncia geogrfica e dissimilaridade genética entre as populações foi baixa. No houve correlao entre a distncia fsica e a similaridade genética entre as rvores amostradas nas trs populações. A maior parte da diversidade genética encontra-se dentro das populações.
Resumo:
Glossina palpalis gambiensis o principal vector de Tripanossomose Humana Africana (THA) na frica Ocidental e a mosca ts-ts mais comum na Guin-Bissau. Apesar da sua ampla distribuio, nenhum caso de THA tem sido reportado no pas desde finais dos anos 70 do sculo XX. Populações naturais do Grupo palpalis demonstraram diferentes nveis de variao intraespecfica que podem influenciar a sua capacidade vectorial. Portanto, o conhecimento exacto acerca da identidade das espcies e estrutura populacional essencial para prever o possvel restabelecimento e propagao da transmisso de THA na Guin-Bissau. A variao genética foi analisada em amostras de Glossina palpalis gambiensis de cinco regies da Guin-Bissau, com recurso a microssatlites. Trs das regies pertencem parte continental e duas representam a parte insular do pas. No total, 261 moscas ts-ts do sexo feminino foram genotipadas para 11 loci microssatlites. Baixos nveis de diferenciao genética foram observados entre as populações de G. p. gambiensis da Guin-Bissau (FST = 0,006, P = 0,002). Este resultado est de acordo com a anlise de agrupamentos, que revelou a presena de um nico cluster agrupando todas as amostras, independentemente da origem geogrfica. De um modo geral, estes resultados sugerem uma baixa subestruturao populacional em G. p. gambiensis nesta regio. Anlises de equilbrio mutao-deriva sugerem ainda a ocorrncia de expanso populacional recente. As evidncias genéticas sugerem considerveis nveis de fluxo gentico entre as populações continentais e entre as populações insulares e continentais da Guin-Bissau. No caso do restabelecimento de focos de transmisso de THA, a possibilidade de disseminao do protozorio Trypanosoma, atravs da disperso activa das moscas ts-ts, deve ser tida em conta no planeamento de estratgias de controlo vectorial na Guin-Bissau. PALAVRAS-CHAVE: Glossina, Tripanossomose Humana Africana, microssatlites, diferenciao genética.
Resumo:
Um estudo envolvendo populações asiticas e amerndias foi realizado para avaliar os relacionamentos histricos e genticos entre eles atravs de polimorfismos moleculares autossmicos. Um deles uma seqncia polimrfica localizada na regio 16p13.3. Um total de 1558 pares de base foram investigados em 98 indivduos da Monglia, Beringia e das Amricas. Estes resultados foram comparados com aqueles obtidos em uma prvia investigao por outros autores. Cinqenta e cinco stios polimrficos foram classificados em trinta e cinco hapltipos. Uma rvore de hapltipos (median joining network) baseada neles, revelou dois grupos distintos, um mais compacto com hapltipos derivados das cinco categorias etno-geogrficas estabelecidas; enquanto o outro, com hapltipos mais divergentes, era composto principalmente por africanos e amerndios. Quase todos os parmetro de neutralidade apresentaram valores negativos. Simulaes realizadas para interpretar estes resultados foram executadas com dois conjuntos de dados: um composto exclusivamente de amerndios e outro com populações mundiais. O primeiro, sugerindo crescimento e declnio populacional, rejeitou os cenrios com crescimento abaixo de cinco vezes e anteriores a ~18 mil anos atrs; enquanto que o segundo, sugerindo crescimento populacional, no rejeitou cenrios nos quais a magnitude de crescimento foi maior que dez vezes e anteriores a ~21 mil anos atrs, provavelmente refletindo um crescimento antigo fora da frica. Doze polimorfismos de inseres Alu foram tambm estudados em 170 indivduos pertencentes a 7 grupos nativos sul-americanos, 60 a dois siberianos, e 91 a dois mongis. Estes dados foram integrados com aqueles de 488 indivduos associados a outros 13 grupos, para determinar as relaes entre asiticos, Beringianos e amerndios. Nestes trs grupos, foi observado um decrscimo da heterozigosidade e da quantidade de fluxo gnico, na mesma ordem indicada acima. A solidez destas subdivises foi demonstrada nas distncias genéticas, nas anlises de componentes principais, de varincia molecular, no teste de Mantel, e numa abordagem Bayesiana de atribuio genética. Entretanto, no pode ser observada uma clara estrutura entre os nativos Sul-americanos, indicando a importncia dos fatores dispersivos (deriva genética, efeito fundador) na sua diferenciao. A congruncia dos resultados obtidos com os dois marcadores so: (a) no foi confirmada uma histria de declnio populacional forte associado com a chegada do homem pr-histrico nas Amricas; (b) os amerndios no apresentaram estruturao clara dentro do continente e no se diferenciaram dos asiticos do nordeste da sia (beringianos); e (c) o povo Ach foi o grupo mais divergente.
Resumo:
Os microsatlites, tambm chamados STRs (Short Tandem Repeat), so pequenas sequncias de DNA que consistem numa sequncia de repeties de um motivo que varia de um a seis pares de bases. Existem em quase todos os cromossomas humanos e podem situar-se nos exes ou nos intres. Estes ltimos so altamente polimrficos e so por isso utilizados na identificao de indivduos em testes de paternidade e tambm em estudos de genética de populações. A combinao dos vrios gentipos possveis faz com que cada indivduo possua um perfil nico, que permite a sua identificao. Existem tambm microsatlites associados a exes ou a regies promotoras dos genes, normalmente repeties trinucleotdicas CGG/CCG ou CAG/CTG, associados a doenas neurodegenerativas como a sndrome do X-frgil e a doena de Huntington. Neste trabalho caracterizaram-se geneticamente vrias populações humanas dos arquiplagos da Madeira, Aores e Cabo Verde. A partir do estudo dos microsatlites do cromossoma Y, foram definidas idades de coalescncia que permitiram concluir que as cpias do gene DAZ situado no cromossoma Y so o resultado de um processo evolutivo estando a sua evoluo associada a alguns haplogrupos. Verificou-se tambm a ocorrncia de possveis mutaes nos SNPs que definem os haplogrupos, atravs da comparao dos microsatlites do cromossoma Y dentro de cada haplogrupo, especialmente no haplogrupo E3b. Verificou-se existir uma associao entre o nmero de repeties CAG e GGC do gene Receptor de Andrognios (AR), situado no cromossoma X, e a infertilidade especialmente quando combinados os dois polimorfismos, parecendo haver um efeito protector dos alelos maiores e alguma susceptibilidade para os alelos menores. Quando se estudou o nmero de repeties GGC do gene FMR1 em doentes com suspeita de sndrome de X-frgil observaram-se diferenas significativas quando comparadas com a populao em geral e com um grupo de sobredotados. Essa diferena deveu-se principalmente presena do alelo 29 em quase todos os indivduos do primeiro grupo o que por si s no constitui um factor de risco mas poder ser uma indicao da associao deste alelo com outra mutao no mesmo gene que possa ser responsvel por este fentipo.
Resumo:
O Pinus caribaea var. hondurensis Barret & Golfari tem elevada importncia como espcie comercialmente plantada; aproximadamente 1,8 milhes de hectares esto ocupados por plantios desta espcie no Brasil. O trabalho teve como objetivo verificar por meio de marcadores microssatlites a variabilidade genética em Pinus caribaea var. hondurensis, bem como sua manuteno durante o processo de melhoramento gentico, dentro de uma populao- base de melhoramento, uma populao de matrizes selecionadas e uma populao melhorada F1. Para a realizao das anlises foi necessria a transferncia de primers desenvolvidos para locos microssatlites de outras espcies do gnero. Dos 20 pares de primers testados, 8 foram transferidos para a espcie (RPS 25b, RPS 150, PSM 2, PR 4.6, PtTX 2037, PtTX 3029, RPTest 01 e RPTest 09). Verificou-se a existncia de endogamia entre e dentro das populações estudadas, e o maior valor observado entre as populações foi F ST = 0,0213 (populao base e F1). A heterozigosidade mdia observada e a heterozigosidade esperada na populao-base foram, respectivamente, H0 = 0,2469 e He = 0,2489. A maior distncia genética (D = 0,0119) foi observada entre as populações-base e a populao melhorada F1. Atravs da distncia genética entre as matrizes, foram indicados 10 cruzamentos potenciais entre as matrizes mais contrastantes, almejando a obteno de vigor de hbrido nas prognies obtidas a partir destes cruzamentos.
Resumo:
A Egeria najas uma espcie aqutica submersa nativa da bacia hidrogrfica do rio Paran. Com o represamento das guas do rio para gerao de energia eltrica a espcie tem mudado seu comportamento de colonizao dos leitos dos rios e ocorrido em grandes macios dentro da represa de Jupi e rios afluentes. Essa planta tem causado problemas por obstruir a passagem de gua para as turbinas de gerao de energia eltrica. Coletas de material vegetativo foram realizadas na represa e afluentes do rio Paran para anlise da variabilidade isoenzimtica e de DNA. A anlise isoenzimtica mostrou haver somente quatro classes de diferentes biotipos. No entanto, utilizando-se os procedimentos de RAPD, observou-se que a espcie possui grande variabilidade genética. O represamento das guas tambm est permitindo o acumulo de variabilidade no local e promovendo um aumento de variabilidade por meio de possveis cruzamentos entre gentipos diferentes. Os resultados tambm possibilitaram inferir sobre as possveis rotas de migrao de material gentico para colonizao da represa e rios afluentes.
Resumo:
O manejo de plantas daninhas em ambientes aquticos requer cuidado diferencial e especfico, a fim de evitar a contaminao ou alterao nas funes dos corpos hdricos e otimizao do custo-benefcio das operaes. O estudo das caractersticas genéticas de populações de plantas daninhas aquticas fornece informaes que podem auxiliar no seu controle e manejo. A alface-d'gua uma planta aqutica flutuante livre amplamente distribuda em todo o Brasil, mas em ambientes aquticos eutrofizados que essa e outras espcies de rpido desenvolvimento causam problemas sociais e econmicos, devido grande massa vegetal produzida. Este estudo caracterizou geneticamente populações de alface-d'gua coletadas em 15 reservatrios de hidreltricas (Barra Bonita-BAB, Bariri-BAR, Ibitinga-IBI, Chavantes-CHA, Salto Grande-SAG, Jurumirim-JUR, Promisso-PRO Jaguari-JAG, Nova Avanhandava-NAV, Mogi-Guau-MOG, Limoeiro-LIM, Trs Irmos-TRI, Ilha Solteira-ILS, Jupi-JUP e Porto Primavera-PPR) do Estado de So Paulo. As anlises foram realizadas no NUPAM (Ncleo de Pesquisas Avanadas em Matologia), ligado FCA/UNESP, campus de Botucatu-SP. A tcnica utilizada no estudo da diversidade genética foi o RAPD. Os materiais amostrados nos reservatrios do Estado foram muito similares em sua maioria. As populações de NAV, MOG, IBI, JUR, PRO e CHA foram idnticas geneticamente. BAB e SAG, LIM e TRI tambm foram muito parecidas, apresentando ndice de distncia genética de 0,0093 e 0,0178, respectivamente. A grande maioria dos reservatrios estudados (93%) apresentou distncias inferiores a 0,30, formando um grupo definido. No entanto, a populao de Jupi, em mdia, foi a que apresentou maior diversidade genética (0,45).
Resumo:
No melhoramento gentico de espcies florestais, uma populao base ou indivduos superiores pr-selecionados tem importncia fundamental para a manuteno do programa. Indivduos de melhores procedncias e de ampla base genética propiciam a obteno de ganhos de forma contnua. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética em duas populações-ncleo de Eucalyptus grandis. Foram avaliados 39 indivduos, sendo 19 pertencentes populao 1 e 20, populao 2, utilizando-se 14 primers microssatlite. Os fragmentos foram identificados e analisados a partir dos programas GeneScan e Genotyper, utilizando-se um sequenciador automtico ABI Prism 3100. O nmero de alelos encontrados para cada primer variou de cinco a 15 para a populao 1 e, de 8 a 18 para a populao 2. A heterozigosidade estimada foi maior na populao 2, 0,869, contra 0,843 na populao 1. A mdia da distncia genética entre os indivduos da populao 1 foi 0,6220 e na populao 2 foi 0,6112. Com a caracterizao molecular dos indivduos destas populações foi construdo um banco de dados que permitir, a partir dos parmetros de genética de populações, monitorar esses programas de melhoramento em diferentes ciclos de seleo.
Resumo:
Gossypium mustelinum Miers ex Watt is the only cotton species native from Brazil. It is endemic of the semi-arid region from North-east of the country, where it occur near from resilient water sources. The threats to the in situ conservation of the populations are caused by human interference in its habitat, mainly by excessive cattle graze and deforestation. Establish efficient strategies of in situ conservation depend on the accomplishment of a diagnosis of how the specie is found in its natural environment, and the knowledge about the genetic structure of the populations. The objectives of this work were i) to determine the in situ conditions of two populations present in rivers from basin of Rio Paraguau at the Bahia State, ii) to evaluate the structure and genetic variability presented in both populations, iii) to establish in situ and ex situ conservation strategies. It were realized collection in november 2007, when was realized in situ characterization of G. mustelinum. SSR markers were used for analyze 218 genotypes deriving from two populations of the G. mustelinum, localized at Toc river and the Capivara river. The allelic frequencies, the heterozigosity and the F statics were estimated. All the plants were classified as wild and natives, and there was no evidence of the use the plants or its parts. The populations showed different conservation conditions in situ. Few plantlets were found in sites with excessive cattle feed, an indication that the damages in young plants should be high enough to compromise the renovation of the populations. On the other hand, populations were well preserved when the anthropic damages was low or inexistent. The 14 SSR primer pairs amplified 17 loci with a medium number of 5 alleles per locus (a total of 85 alleles). The high level of endogamy estimated (FIS=0,808) and the low observed heterozygosity (H0=0,093) were indicatives that the populations reproduce mainly by selfing, geitonogamy and crosses between related individuals. The genetic diversity was high (HE=0,482) and the differentiation between the populations was very high (FST=0,328). At least two sites from both populations of G. mustelinum must be preserved to achieve suitable in situ conservation. Actions that preserve the gallery forest and keep the cattle away should implemented, and could be as simple as erecting a fence. It is not possible anticipated if the in situ preservation will be possible. Therefore collections and ex situ preservation of representative specimens are essential to conserve the genetic diversity of native G. mustelinum
Resumo:
The gray mold, causal organism Amphobotrys ricini, is one of the major diseases of castor bean. Difficulties in managing plant disease arises form the limited understanding of the genetic structure of A. ricini, their complexity and variability make it difficult to control. Genetic structure can be used to infer the relative impact of different forces that influence the evolution of pathogen populations, that allow to predict the potencial for pathogen populations to envolve in agricultural ecosystems. Growers protect their crop by applying fungicides, but there aren t fungicides to provide significant control of gray mold of castor bean. The objectives of this work were use RAPD to determine the genetic structure of A. ricini subpopulations in Paraba and assay the sensitivity of A. ricini isolates to azoxystrobin and carbendazim. To determine the genetic structure of A. ricini subpopulations in Paraba, 23 isolates were colleted from two different geographic location (subpopulation). These isolates were analysed by RAPD using 22 random decamer primers, purchased from OPERON, produced a total of 80 markers polimorphics. The resulting matrixes were analysed using PopGene version 1.32. Sensitivity to azoxystrobin and carbendazim of 30 isolates, colleted form Paraba and Alagoas, was estimated based on spore germination and colony growth inhibition. The stock solutions were added toV8 medium after sterilization to produce final concentrations of 0, 0.01, 0.1, 1, 10, and 100 g/ml of carbendazim and 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1, and 10 g/ml of azoxystrobin. All statistical analyses were performed using SAS to estimate the dose that inhibited fungal growth by 50% (ED50 values). The genetic diversity within subpopulations (Hs=0,271) accounted for 92% of the total genetic diversity (Ht=0,293), while genetic diversity between subpopulations (Gst = 0,075) represented only 7,5%. The estimated number of migrants per generation (NM ) was 6,15. Nei s average gene identity across 80 RAPD loci was 0,9468. Individual ED50 values, for the 30 isolates screened for their sensitivity to azoxystrobin, ranged From a maximum of 0,168 g/ml to a minimum of 0,0036 g/ml. The ED50 values for carbendazim varied within the range of 0,026 to 0,316 g/ml
Resumo:
Coordenao de Aperfeioamento de Pessoal de Nvel Superior (CAPES)
Diversidade genética de populações naturais de pariparoba [Pothomorphe umbellata (L.) Miq.] por RAPD
Resumo:
O objetivo desse trabalho foi analisar a estrutura genética de populações de Pothomorphe umbellata (L.) Miq. com base em polimorfismos moleculares do tipo RAPD. Foram analisadas quatro populações naturais do estado de So Paulo (Jacare, Jundia, Piquete e Ubatuba) e uma populao do Paran (Adrianpolis). Foram identificados 25 locos polimrficos (96,15%). Elevados ndices de diversidade genética foram observados dentro das populações (Hs = 0,2220). Verificou-se que 65,33% da variabilidade genética total encontra-se dentro das populações e 34,67% entre as populações; ndices estes, obtidos a partir do clculo da divergncia genética (G ST = 0,3467). Os resultados sugerem que essas populações possuem nveis elevados de variabilidade genética, a qual pode ser fortemente impactada pela ao humana.
Resumo:
Trichilia pallida Swartz is an Atlantic Forest shady climax tree of Meliaceae family that presents insecticide properties against chewing insects like as some family trees, making it interesting for forestry uses. Forty plants of Oito Pontas Farm population were collected in Bofete County, Santa Genebra Ecological Station in Campinas County, and Caetetus Ecological Station in Glia County, all in the Sao Paulo State, Brazil. Leaf DNA analysis was used by RAPD method, that showed 10 highly polymorphic primers, with 72 dominant markers, used to estimate genetic diversity within and among populations. The polymorphism within populations varied from 90.3 to 97.2%, and the effective allele number varied from 1.46 0.33 to 1.57 0.33, while the average of genetic differentiation of populations varied from 0.27 0.18 to 0, 33 0.15. The gene diversity in the total population (H T) was 0.334 0.02, while the average gene diversity within populations (H s) was 0.292 0.017, and the coefficient of gene differentiation (G ST) was 0.125, Bofete and Campinas populations had the smallest Nei's genetic distance (0.049) and the distances of both with Glia were 0.117 and 0.107, respectively.
