Free software as a democratic principle

Software forms an important part of the interface between citizens and their government. An increasing amount of government functions are being performed, controlled, or delivered electronically. This software, like all language, is never value-neutral, but must, to some extent, reflect the values of the coder and proprietor. The move that many governments are making towards e-governance, and the increasing reliance that is being placed upon software in government, necessitates a rethinking of the relationships of power and control that are embodied in software.

Free software and the law. Out of the frying pan and into the fire: How shaking up intellectual property suits competition law just fine

Free software is viewed as a revolutionary and subversive practice, and in particular has dealt a strong blow to the traditional conception of intellectual property law (although in its current form could be considered a 'hack' of IP rights). However, other (capitalist) areas of law have been swift to embrace free software, or at least incorporate it into its own tenets. One area in particular is that of competition (antitrust) law, which itself has long been in theoretical conflict with intellectual property, due to the restriction on competition inherent in the grant of ‘monopoly’ rights by copyrights, patents and trademarks. This contribution will examine how competition law has approached free software by examining instances in which courts have had to deal with such initiatives, for instance in the Oracle Sun Systems merger, and the implications that these decisions have on free software initiatives. The presence or absence of corporate involvement in initiatives will be an important factor in this investigation, with it being posited that true instances of ‘commons-based peer production’ can still subvert the capitalist system, including perplexing its laws beyond intellectual property.

Extracting Three Dimensional Surface Model of Human Kidney from the Visible Human Data Set using Free Software

Three dimensional digital model of a representative human kidney is needed for a surgical simulator that is capable of simulating a laparoscopic surgery involving kidney. Buying a three dimensional computer model of a representative human kidney, or reconstructing a human kidney from an image sequence using commercial software, both involve (sometimes significant amount of) money. In this paper, author has shown that one can obtain a three dimensional surface model of human kidney by making use of images from the Visible Human Data Set and a few free software packages (ImageJ, ITK-SNAP, and MeshLab in particular). Images from the Visible Human Data Set, and the software packages used here, both do not cost anything. Hence, the practice of extracting the geometry of a representative human kidney for free, as illustrated in the present work, could be a free alternative to the use of expensive commercial software or to the purchase of a digital model.

Quality practices and problems in free software projects

Free software and open source projects are often perceived to be of high quality. It has been suggested that the high level of quality found in some free software projects is related to the open development model which promotes peer review. While the quality of some free software projects is comparable to, if not better than, that of closed source software, not all free software projects are successful and of high quality. Even mature and successful projects face quality problems; some of these are related to the unique characteristics of free software and open source as a distributed development model led primarily by volunteers. In exploratory interviews performed with free software and open source developers, several common quality practices as well as actual quality problems have been identified. The results of these interviews are presented in this paper in order to take stock of the current status of quality in free software projects and to act as a starting point for the implementation of quality process improvement strategies.

From free software to free culture: the emergence of open business

This paper provides an examination of the emergence of open business models — entrepreneurial strategies that take advantage of the ease of digital reproduction to distribute free content, while earning money from the sale of related products and services. Locating the origins of open business in the open source software phenomenon, the authors suggest that the business strategies innovated there have broader economic relevance. Through a case study of the tecnobrega music scene in Belém, the paper illustrates how open business models can be applied to the production of cultural materials more generally

An interactive environment for solid modeling based on free software

This paper describes an interactive environment built entirely upon public domain or free software, intended to be used as the preprocessor of a finite element package for the simulation of three-dimensional electromagnetic problems.

Free software: an alternative to automate information units

The document begins by describing the problem of budget information units and the high cost of commercial software that specializes in library automation. Describes the origins of free software and its meaning. Mentioned the three levels of automation in library: catalog automation, generation of repositories and full automation. Mentioned the various free software applications for each of the levels and offers a number of advantages and disadvantages in the use of these products. Concludes that the automation project is hard but full of satisfaction, emphasizing that there is no cost-free project, because if it is true that free software is free, there are other costs related to implementation, training and commissioning project progress.

Free software and free culture in Higher Education: pipelines and workflows for creative purposes

OpenLab ESEV is a project of the School of Education of the Polytechnic Institute of Viseu (ESEV), Portugal, that aims to promote, foster and support the use of Free/Libre Software and Open Source Software, Open Educational Resources, Free Culture, Free file formats and more flexible copyright licenses for creative and educational purposes in the ESEV's domains of activity (education, arts, media). Most of the OpenLab ESEV activities are related to the teacher education and arts and multimedia programs, with a special focus on the later. In this paper, the project and some activities are presented, starting with its origins and its conceptual framework. The presented overview is intended as background for the examination of the use of Free/Libre Software and Free Culture in educational settings, specially at the higher education level, and for creative purposes. The activities developed with students and professionals generated pipelines and workflows implemented for different creative purposes, software packages used for different tasks, choices for file formats and copyright licenses. Finished and ongoing multimedia and arts projects will be presented as real case scenarios.

Free/Open Source Software in CUSAT: A Success Story

Free/Open Source Software (FOSS) concept is very important in the academic community. The open philosophy of FOSS is consistent with academic freedom and the open dissemination of knowledge and information in academia. FOSS can lower the barriers to access of ICTs by reducing the cost of the software. This article discusses the success story of CUSAT's adoption of Free/Open Source Software

PAnalyzer: A software tool for protein inference in shotgun proteomics

Background Protein inference from peptide identifications in shotgun proteomics must deal with ambiguities that arise due to the presence of peptides shared between different proteins, which is common in higher eukaryotes. Recently data independent acquisition (DIA) approaches have emerged as an alternative to the traditional data dependent acquisition (DDA) in shotgun proteomics experiments. MSE is the term used to name one of the DIA approaches used in QTOF instruments. MSE data require specialized software to process acquired spectra and to perform peptide and protein identifications. However the software available at the moment does not group the identified proteins in a transparent way by taking into account peptide evidence categories. Furthermore the inspection, comparison and report of the obtained results require tedious manual intervention. Here we report a software tool to address these limitations for MSE data. Results In this paper we present PAnalyzer, a software tool focused on the protein inference process of shotgun proteomics. Our approach considers all the identified proteins and groups them when necessary indicating their confidence using different evidence categories. PAnalyzer can read protein identification files in the XML output format of the ProteinLynx Global Server (PLGS) software provided by Waters Corporation for their MSE data, and also in the mzIdentML format recently standardized by HUPO-PSI. Multiple files can also be read simultaneously and are considered as technical replicates. Results are saved to CSV, HTML and mzIdentML (in the case of a single mzIdentML input file) files. An MSE analysis of a real sample is presented to compare the results of PAnalyzer and ProteinLynx Global Server. Conclusions We present a software tool to deal with the ambiguities that arise in the protein inference process. Key contributions are support for MSE data analysis by ProteinLynx Global Server and technical replicates integration. PAnalyzer is an easy to use multiplatform and free software tool.

Disseminação de dados estatísticos georeferenciados através de WEB services e software livre.

Diferentes organizações públicas e privadas coletam e disponibilizam uma massa de dados sobre a realidade sócio-econômica das diferentes nações. Há hoje, da parte do governo brasileiro, um interesse manifesto de divulgar uma gama diferenciada de informações para os mais diversos perfis de usuários. Persiste, contudo, uma série de limitações para uma divulgação mais massiva e democrática, entre elas, a heterogeneidade das fontes de dados, sua dispersão e formato de apresentação pouco amigável. Devido à complexidade inerente à informação geográfica envolvida, que produz incompatibilidade em vários níveis, o intercâmbio de dados em sistemas de informação geográfica não é problema trivial. Para aplicações desenvolvidas para a Web, uma solução são os Web Services que permitem que novas aplicações possam interagir com aquelas que já existem e que sistemas desenvolvidos em plataformas diferentes sejam compatíveis. Neste sentido, o objetivo do trabalho é mostrar as possibilidades de construção de portais usando software livre, a tecnologia dos Web Services e os padrões do Open Geospatial Consortium (OGC) para a disseminação de dados espaciais. Visando avaliar e testar as tecnologias selecionadas e comprovar sua efetividade foi desenvolvido um exemplo de portal de dados sócio-econômicos, compreendendo informações de um servidor local e de servidores remotos. As contribuições do trabalho são a disponibilização de mapas dinâmicos, a geração de mapas através da composição de mapas disponibilizados em servidores remotos e local e o uso do padrão OGC WMC. Analisando o protótipo de portal construído, verifica-se, contudo, que a localização e requisição de Web Services não são tarefas fáceis para um usuário típico da Internet. Nesta direção, os trabalhos futuros no domínio dos portais de informação geográfica poderiam adotar a tecnologia Representational State Transfer (REST).

SAQUA - sistema baseado em software livre para análise do comportamento da qualidade das águas fluviais: aplicado à bacia do rio Paraíba do Sul.

Nesta dissertação foi desenvolvido o sistema SAQUA (Sistema para Análise da Qualidade das Águas Fluviais), que permite o acompanhamento dos dados de séries históricas de parâmetros físico-químicos para análise da qualidade de águas fluviais. A alimentação do sistema SAQUA se dá a partir do arquivo tipo texto gerado no Hidroweb, sistema de banco de dados hidrológicos da ANA (Agência Nacional de Águas), disponibilizado na internet. O SAQUA constitui uma interface que permite a análise espaço-temporal de parâmetros de qualidade da água específicos definidos pelo usuário. A interface foi construída utilizando o servidor de mapas Mapserver, as linguagens HTML e PHP, além de consultas SQL e o uso do servidor Web Apache. A utilização de uma linguagem dinâmica como o PHP permitiu usar recursos internos do Mapserver por meio de funções que interagem de forma mais flexível com códigos presentes e futuros, além de interagir com o código HTML. O Sistema apresenta como resultado a representação gráfica da série histórica por parâmetro e, em mapa, a localização das estações em análise também definidas pelo usuário, geralmente associadas a uma determinada região hidrográfica. Tanto na representação gráfica da série temporal quanto em mapa, são destacados a partir de código de cores a estação de monitoramento e a observação em que os limites estabelecidos na resolução CONAMA 357/05 não foi atendido. A classe de uso da resolução CONAMA que será usada na análise também pode ser definida pelo usuário. Como caso de estudo e demonstração das funções do SAQUA foi escolhida a bacia hidrográfica do rio Paraíba do Sul, localizada na região hidrográfica Atlântico Sudeste do Brasil. A aplicação do sistema demonstrou ótimos resultados e o potencial da ferramenta computacional como apoio ao planejamento e à gestão dos recursos hídricos. Ressalta-se ainda, que todo o sistema foi desenvolvido a partir de softwares disponibilizados segundo a licença GPL de software livre, ou seja, sem custo na aquisição de licenças, demonstrando o potencial da aplicação destas ferramentas no campo dos recursos hídricos.

Avaliação da qualidade das medições fotogramétricas da versão integrada do software livre E-FOTO.

Na década de 90 com o aumento da capacidade de processamento e memória dos computadores, surgiu a fotogrametria digital, que tem como objetivo principal o mapeamento automático das feições naturais e artificiais do terreno, utilizando a imagem fotogramétrica digital como fonte primária de dados. As soluções fotogramétricas se tornaram mais compactas e versáteis. A estação fotogramétrica digital educacional E-FOTO é um projeto multidisciplinar, em desenvolvimento no laboratório de Fotogrametria Digital da Universidade do Estado do Rio de Janeiro, que se baseia em dois pilares: autoaprendizado e gratuidade. Este trabalho tem o objetivo geral de avaliar a qualidade das medições fotogramétricas utilizando a versão integrada 1.0β do E-FOTO. Para isso foram utilizados dois blocos de fotografias de regiões distintas do planeta: um bloco de fotografias (2005) do município de Seropédica-RJ e um bloco de fotografias antigas (1953) da região de Santiago de Compostela, na Espanha. Os resultados obtidos com o E-FOTO foram comparados com os resultados do software comercial de fotogrametria digital Leica Photogrammetry Suite (LPS 2010) e com as coordenadas no espaço-objeto de pontos medidos com posicionamento global por satélite (verdade de campo). Sendo possível avaliar as metodologias dos softwares na obtenção dos parâmetros das orientações interior e exterior e na determinação da exatidão das coordenadas no espaço-objeto dos pontos de verificação obtidas no módulo estereoplotter versão 1.64 do E-FOTO. Os resultados obtidos com a versão integrada 1.0β do E-FOTO na determinação dos parâmetros das orientações interior e exterior e no cálculo das coordenadas dos pontos de verificação, sem a inclusão dos parâmetros adicionais e a autocalibração são compatíveis com o processamento realizado com o software LPS. As diferenças dos parâmetros X0 e Y0 obtidos na orientação exterior com o E-FOTO, quando comparados com os obtidos com o LPS, incluindo os parâmetros adicionais e a autocalibração da câmara fotogramétrica, não são significativas. Em função da qualidade dos resultados obtidos e de acordo com o Padrão de Exatidão Cartográfica, seria possível obter um documento cartográfico Classe A em relação à planimetria e Classe B em relação à altimetria na escala 1/10.000, com o projeto Rural e Classe A em relação à planimetria e Classe C em relação à altimetria na escala 1/25.000, com o Projeto Santiago de Compostela. As coordenadas tridimensionais (E, N e H) dos pontos de verificação obtidas fotogrametricamente no módulo estereoplotter versão 1.64 do E-FOTO, podem ser consideradas equivalentes as medidas com tecnologia de posicionamento por satélites.