New Fefe-hydrogenase Genes Identified In A Metagenomic Fosmid Library From A Municipal Wastewater Treatment Plant As Revealed By High-throughput Sequencing.

A fosmid metagenomic library was constructed with total community DNA obtained from a municipal wastewater treatment plant (MWWTP), with the aim of identifying new FeFe-hydrogenase genes encoding the enzymes most important for hydrogen metabolism. The dataset generated by pyrosequencing of a fosmid library was mined to identify environmental gene tags (EGTs) assigned to FeFe-hydrogenase. The majority of EGTs representing FeFe-hydrogenase genes were affiliated with the class Clostridia, suggesting that this group is the main hydrogen producer in the MWWTP analyzed. Based on assembled sequences, three FeFe-hydrogenase genes were predicted based on detection of the L2 motif (MPCxxKxxE) in the encoded gene product, confirming true FeFe-hydrogenase sequences. These sequences were used to design specific primers to detect fosmids encoding FeFe-hydrogenase genes predicted from the dataset. Three identified fosmids were completely sequenced. The cloned genomic fragments within these fosmids are closely related to members of the Spirochaetaceae, Bacteroidales and Firmicutes, and their FeFe-hydrogenase sequences are characterized by the structure type M3, which is common to clostridial enzymes. FeFe-hydrogenase sequences found in this study represent hitherto undetected sequences, indicating the high genetic diversity regarding these enzymes in MWWTP. Results suggest that MWWTP have to be considered as reservoirs for new FeFe-hydrogenase genes.

VARIATION IN STOMATAL NUMBERS OF GLOSSOPTERIS LEAVES FROM THE LOWER PERMIAN OF PARANA BASIN, BRAZIL

The stomatal density and index in compressed leaves of Glossopteris communis from two different roof shales from the Lower Permian in Parana Basin, Brazil (Western Gondwana) have been investigated to test the possible relationship with modeled global changes in atmospheric CO(2) during the Phanerozoic. The obtained parameters show that the genus Glossopteris from the Cool Temperate biome can be used as CO(2) -proxy, despite the impossibility of being compared with living relatives or equivalents. When confronted with already published data for the Tropical Summer Wet biome, the present results confirm the detection of low levels of atmospheric CO(2) during the Early Permian, as predicted by the modeled curve. Nevertheless, the lower stomatal numbers detected at the climax of the coal interval (Faxinal Coalfield, Sakmarian) when compared to the higher ones obtained in leaves from a younger interval (Figueira Coalfield, Artinskian) could be attributed to temporarily high levels of atmospheric CO(2). Therefore, the occurrence of an extensive peat generating event at the southern part of the basin and subsequent greenhouse gases emissions from this environment may have been enough to reverse regionally and temporarily the reduction trend in atmospheric CO(2). Additionally, the Faxinal flora is preserved in a tonstein layer, which is a record of volcanic activity that could also cause a rise in atmospheric CO(2). During the Artinskian, the scarce generation of peat mires, as revealed by the occurrence of thin and discontinuous coal layers, and the lack of volcanism evidence would be insufficient to affect the general low CO(2) trend.

Hemólise produzida por Candida tropicalis isoladas de amostras clínicas

INTRODUÇÃO: Leveduras do gênero Candida são responsáveis pela maioria das infecções fúngicas em humanos. Candida tropicalis tem sido uma das mais comumente isoladas dentre as espécies não-albicans. O objetivo foi analisar a hemólise in vitro promovida por isolados clínicos de C. tropicalis provenientes de sangue e outras amostras clínicas de pacientes internados no Hospital Universitário da UEL, PR-Brasil. MÉTODOS: Foi avaliada a hemólise promovida por 28 isolados clínicos de C. tropicalis, sendo os isolados agrupados em classes de acordo com os níveis de hemólise. RESULTADOS: A maioria dos isolados de sangue apresentou hemólise fraca (+), enquanto as classes de hemólise forte (+++) e muito forte (++++) foram as predominantes nos isolados de outras amostras clínicas como urina, lesão de unha e secreção traqueal, embora não tenham sido detectadas diferenças estatísticas (p>0,05). CONCLUSÕES: Isolados de C. tropicalis, obtidos de diferentes amostras clínicas, apresentam capacidade de promover hemólise in vitro.

Morfologia da plântula em desenvolvimento de Astrocaryum aculeatum Meyer (Arecaceae)

Astrocaryum aculeatum (tucumã) é uma palmeira amazônica, cuja polpa dos frutos, rica em vitamina A, pode ser consumida ao natural ou na forma de sorvete, suco, licor e doce. Sua propagação é demorada, existindo pouco conhecimento sobre a germinação das sementes e o desenvolvimento das plântulas. O presente trabalho teve como objetivo descrever o processo germinativo das sementes dessa espécie, submetidas ou não ao pré-tratamento de embebição, e caracterizar cronologicamente os estádios morfológicos da plântula. A germinação das sementes é do tipo adjacente ligulada, criptocotiledonar e hipógea. O tempo para alcançar cada estádio foi menor para as sementes embebidas, indicando efeito benéfico da embebição sobre a velocidade do processo germinativo, com média de emergência do pecíolo cotiledonar de 99 dias e de completa expansão da primeira folha bífida de 253 dias.

Extração, embebição e germinação de sementes de tucumã (Astrocaryum aculeatum)

A pesquisa teve como objetivo avaliar a influência da extração e da embebição das sementes sobre a germinação de tucumã (Astrocaryum aculeatum Meyer, Arecaceae). Após limpeza e secagem dos pirênios, o endocarpo foi quebrado e removido para liberação das sementes que, antes da semeadura, foram submetidas à embebição em água por 0, 3, 6, 9, 12 e 15 dias. A germinação foi superior a 58%, independentemente do período de embebição, confirmando a possibilidade de retirar o endocarpo sem agravar prejuízos à viabilidade das sementes. As sementes submetidas a nove dias de embebição, com 30% de água, tiveram maior germinação (70%) e índice de velocidade de germinação, com tempo médio de germinação de 104 dias. A remoção do endocarpo e a embebição das sementes aceleram e aumentam a germinação.

Emergência de plântulas de tucumã (Astrocaryum aculeatum) em função da posição de semeadura

O trabalho avaliou a influência da posição da semente no substrato sobre a emergência de plântulas de tucumã (Astrocaryum aculeatum). Após extração e embebição, as sementes foram semeadas obedecendo as seguintes posições: a) 0º - poro germinativo voltado para cima, formando um ângulo de 0º em relação a um eixo imaginário perpendicular ao nível do substrato; b) 45º - poro germinativo inclinado, formando um ângulo de 45º em relação ao eixo imaginário; c) 90º - poro germinativo voltado para o lado, formando um ângulo de 90º em relação ao eixo imaginário. As sementes da posição de 90º apresentaram superioridade na emergência, com 45% de plântulas no estádio "emissão da segunda bainha" e apenas 35% de sementes dormentes, após 270 dias de observação. A emergência é influenciada pela posição de semeadura, sendo que o aumento da profundidade do poro germinativo no substrato proporcionou o aumento da emergência e a diminuição da porcentagem de sementes que permaneceram dormentes.

Common mental disorders among medical students

OBJECTIVE: Common mental disorders (CMD) have a high impact on interpersonal relationships and quality of life and are potential underlying causes for the development of more serious disorders. Medical students have been indicated as a risk population for the development of CMD. The aim of this study was to determine the frequency of CMD in undergraduate medical students and to identify related factors. METHODS: A cross-sectional study was performed in a sample population of medical students. CMD was identified according to the 20-item Self-Report Questionnaire. RESULTS: Two hundred and twenty-three students completed the questionnaire. The overall prevalence of CMD was 29.6% and its presence was independently associated with sleep disorders, not owning a car, not working and sedentary lifestyle. CONCLUSIONS: These findings indicate a high prevalence of CMD in the sample studied and are important for supporting actions to prevent mental disorders in future doctors and for reflecting on the curricula currently in use in medical schools.

A study of risk-aware program transformation

In the trend towards tolerating hardware unreliability, accuracy is exchanged for cost savings. Running on less reliable machines, functionally correct code becomes risky and one needs to know how risk propagates so as to mitigate it. Risk estimation, however, seems to live outside the average programmer’s technical competence and core practice. In this paper we propose that program design by source-to-source transformation be risk-aware in the sense of making probabilistic faults visible and supporting equational reasoning on the probabilistic behaviour of programs caused by faults. This reasoning is carried out in a linear algebra extension to the standard, `a la Bird-Moor algebra of programming. This paper studies, in particular, the propagation of faults across standard program transformation techniques known as tupling and fusion, enabling the fault of the whole to be expressed in terms of the faults of its parts.

Frequency of Strongyloides stercoralis Infection in Alcoholics

Several studies have shown that chronic alcoholics have increased susceptibility to infections due to higher exposure to infectious agents as well as breakdown in their immune defenses. As Strongyloides stercoralis infection is usually more relevant in immunocompromised patients, the aim of this study was to evaluate the frequency of S. stercoralis infection in alcoholics. Thus, coproparasitological examination was carried out in 145 subjects, from which 45 were chronic alcoholics (mean age of 45.7 ± 11.0 years), 10 were nonalcoholic cirrhotic patients (mean age of 50.2 ± 13.1 years), and 90 were asymptomatic nonalcoholic subjects (mean age of 46.7 ± 10.1 years), which served as controls. From the alcoholics, 9 had hepatic cirrhosis, 9 had chronic pancreatitis and 27 had neither cirrhosis nor pancreatitis. For the diagnosis of strongyloidiasis, the Baermann-Moraes and Lutz methods were used in three fecal samples from each subject. Samples were collected at alternated days, and three slides of each sample were analyzed for each method, thus totalizing 2,610 slides examined. The frequency of strongyloidiasis in the total alcoholic group (33.3%) and in the subgroups of alcoholics, i.e., patients with hepatic cirrhosis (44.4%), with chronic pancreatitis (33.3%), and those with no cirrhosis or pancreatitis (29.6%) was statistically higher than that found in the control group (5.5%). None of the individuals with nonalcoholic hepatic cirrhosis had S. stercoralis infection. Our results showed that the chronic alcoholism itself is an important factor that predisposes to strongyloidiasis.

The stepwise selection for ketoconazole resistance induces upregulation of C14-demethylase (CYP51) in Leishmania amazonensis

Ketoconazole is a clinically safe antifungal agent that also inhibits the growth of Leishmania spp. A study was undertaken to determine whether Leishmania parasites are prone to becoming resistant to ketoconazole by upregulating C14-demethylase after stepwise pharmacological pressure. Leishmania amazonensis promastigotes [inhibitory concentration (IC)50 = 2 µM] were subjected to stepwise selection with ketoconazole and two resistant lines were obtained, La8 (IC50 = 8 µM) and La10 (IC50 = 10 µM). As a result, we found that the resistance level was directly proportional to the C14-demethylase mRNA expression level; we also observed that expression levels were six and 12 times higher in La8 and La10, respectively. This is the first demonstration that L. amazonensis can up-regulate C14-demethylase in response to drug pressure and this report contributes to the understanding of the mechanisms of parasite resistance.

Armazenamento de sementes de camu-camu (Myrciaria dubia) com diferentes graus de umidade e temperaturas

O objetivo do presente trabalho foi avaliar a qualidade fisiológica das sementes de camu-camu (Myrciaria dubia (H.B.K.) McVaugh), com diferentes graus de umidade (46 e 40%), submetidas a diferentes condições (temperatura ambiente - média de 26,5°C, câmara a 20°C e câmara a 10°C) e períodos de armazenamento (30, 60, 90, 120 e 150 dias). Após cada período, foram retiradas amostras dos tratamentos para as avaliações do grau de umidade e da qualidade fisiológica das sementes. A redução do grau de umidade afetou negativamente a viabilidade e o vigor das sementes, e a temperatura de 10°C não foi favorável ao armazenamento das sementes. Assim, as sementes de camu-camu devem ser armazenadas com grau de umidade elevado (próximo a 46%) e, preferencialmente, sob temperatura de 20°C, para manter a viabilidade e o vigor por maior período de tempo.

Danos de Conotrachelus dubiae (Coleoptera: curculionidae) em frutos de camu-camu (Myrciaria dubia) na Amazônia Central

No Brasil, a ocorrência de Conotrachelus dubiae O'Brien, 1995 (Coleoptera: Curculionidae) em camu-camu [Myrciaria dubia (H.B.K.) McVaugh, Myrtaceae] tinha sido constatada somente em populações naturais. Relata-se sua ocorrência em um cultivo experimental, onde se avaliou os danos de C. dubiae em frutos de camu-camu, em diferentes graus de amadurecimento, entre 1999 e 2003. Os danos causados pela larva aumentaram com o amadurecimento dos frutos, havendo maior comprometimento da polpa do fruto (30 a 90%) do que das sementes (7%). A incidência desse inseto pode implicar em perdas quantitativas significativas na produção de camu-camu.

Caracterização física de frutos e sementes de goiaba-da-costa-rica, produzidos em Manaus, Amazonas

A goiaba-da-costa-rica (Psidium friedrichsthalianum) é uma espécie frutífera nativa da América Central, cultivada em pomares domésticos. Visando a contribuir para o estabelecimento de técnicas de implantação e condução de plantios comerciais, foi realizada a caracterização física de frutos e sementes dessa espécie. Assim, foi verificado que o valor médio da massa fresca dos frutos foi 42,19 g, da polpa foi 39,72 g e das sementes foi 2,47g, com número em torno de 72,8 sementes por fruto. As sementes apresentam formato irregular, com valores médios de comprimento, largura e espessura de 4,29 mm, 4,11 mm e 2,68 mm, respectivamente. O fruto apresenta atributos favoráveis ao aproveitamento industrial, como o elevado rendimento em polpa (94%) e o formato globoso, levemente achatado nos pólos (valor da relação diâmetro longitudinal/diâmetro transversal = 0,83). O número elevado de sementes por fruto representa uma característica facilitadora à propagação e produção de mudas.

Toxicidade diferencial de produtos à base de abamectina ao ácaro Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939) (Acari: Tenuipalpidae) em citros

O ácaro Brevipalpus phoenicis é uma das principais pragas dos citros por ser vetor do "Citrus Leprosis Virus" (CiLV), agente causal da leprose, uma das mais graves doenças da citricultura. Objetivou-se avaliar o efeito tóxico de produtos à base de abamectina sobre o ácaro B. phoenicis. Foram realizados um experimento de ação direta e três de ação residual no Laboratório de Acarologia do Departamento de Proteção de Plantas (Fitossanidade) da FCAV - UNESP, Jaboticabal-SP. O delineamento adotado nos bioensaios foi o inteiramente casualizado, onde 10 tratamentos foram repetidos 7 vezes, sendo cada repetição composta por um fruto de laranja. Os tratamentos estudados (mL p.c./100 L de água) foram: Acaramik a 20; 30; 40 e 50 mL; Vertimec a 30 e 40 mL; Abamectin Nortox a 30 e 40 mL; Tricofol a 77 mL e uma testemunha sem aplicação. Utilizaram-se frutos com presença de verrugose, que foram lavados e parcialmente parafinados, deixando-se uma área sem parafina, que foi circundada com cola entomológica para contenção dos ácaros. Transferiram-se 20 ácaros adultos B. phoenicis para cada fruto. No bioensaio de ação direta, a transferência foi realizada antes das aplicações e, nos bioensaios de ação residual, aos 5; 10 e 15 dias após a aplicação dos produtos. A aplicação dos produtos sobre os frutos foi realizada em Torre de Potter. Os resultados obtidos nos bioensaios evidenciaram que os melhores tratamentos foram: Tricofol a 77 mL, Acaramik a 40 e 50 mL e Vertimec a 40 mL. De forma geral, os produtos testados podem ser utilizados no controle do ácaro B. phoenicis.