Characterization of the variable cow's age at last calving as a measurement of longevity by using the Kaplan-Meier estimator and the Cox model

In most studies on beef cattle longevity, only the cows reaching a given number of calvings by a specific age are considered in the analyses. With the aim of evaluating all cows with productive life in herds, taking into consideration the different forms of management on each farm, it was proposed to measure cow longevity from age at last calving (ALC), that is, the most recent calving registered in the files. The objective was to characterize this trait in order to study the longevity of Nellore cattle, using the Kaplan-Meier estimators and the Cox model. The covariables and class effects considered in the models were age at first calving (AFC), year and season of birth of the cow and farm. The variable studied (ALC) was classified as presenting complete information (uncensored = 1) or incomplete information (censored = 0), using the criterion of the difference between the date of each cow's last calving and the date of the latest calving at each farm. If this difference was >36 months, the cow was considered to have failed. If not, this cow was censored, thus indicating that future calving remained possible for this cow. The records of 11 791 animals from 22 farms within the Nellore Breed Genetic Improvement Program ('Nellore Brazil') were used. In the estimation process using the Kaplan-Meier model, the variable of AFC was classified into three age groups. In individual analyses, the log-rank test and the Wilcoxon test in the Kaplan-Meier model showed that all covariables and class effects had significant effects (P < 0.05) on ALC. In the analysis considering all covariables and class effects, using the Wald test in the Cox model, only the season of birth of the cow was not significant for ALC (P > 0.05). This analysis indicated that each month added to AFC diminished the risk of the cow's failure in the herd by 2%. Nonetheless, this does not imply that animals with younger AFC had less profitability. Cows with greater numbers of calvings were more precocious than those with fewer calvings. Copyright © The Animal Consortium 2012.

Genetic associations between weight at maturity and maturation rate with ages and weights at first and second calving in Canchim beef cattle

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Female fertility in a Guzerat dairy subpopulation: Heterogeneity of variance components for calving intervals

The objectives of the present study were to determine if variance components of calving intervals varied with age at calving and if considering calving intervals as a longitudinal trait would be a useful approach for fertility analysis of Zebu dairy herds. With these purposes, calving records from females born from 1940 to 2006 in a Guzerat dairy subpopulation in Brazil were analyzed. The fixed effects of contemporary groups, formed by year and farm at birth or at calving, and the regressions of age at calving, equivalent inbreeding coefficient and day of the year on the studied traits were considered in the statistical models. In one approach, calving intervals (Cl) were analyzed as a single trait, by fitting a statistical model on which both animal and permanent environment effects were adjusted for the effect of age at calving by random regression. In a second approach, a four-trait analysis was conducted, including age at first calving (AFC) and three different female categories for the calving intervals: first calving females; young females (less than 80 months old, but not first calving); or mature females (80 months old or more). Finally, a two-trait analysis was performed, also including AFC and Cl, but calving intervals were regarded as a single trait in a repeatability model. Additionally, the ranking of sires was compared among approaches. Calving intervals decreased with age until females were about 80 months old, remaining nearly constant after that age. A quasi-linear increase of 11.5 days on the calving intervals was observed for each 10% increase in the female's equivalent inbreeding coefficient. The heritability of AFC was 0.37. For Cl. the genetic-phenotypic variance ratios ranged from 0.064 to 0.141, depending on the approach and on ages at calving. Differences among genetic variance components for calving intervals were observed along the animal's lifetime. Those differences confirmed the longitudinal aspect of that trait, indicating the importance of such consideration when accessing fertility of Zebu dairy females, especially in situations where the available information relies on their calving intervals. Spearman rank correlations among approaches ranged from 0.90 to 0.95, and changes observed in the ranking of sires suggested that the genetic progress of the population could be affected by the approach chosen for the analysis of calving intervals. (C) 2012 Elsevier ay. All rights reserved.

Covariance functions for body weight from birth to maturity in Nellore cows

The objective of this study was to estimate (co)variance functions using random regression models on Legendre polynomials for the analysis of repeated measures of BW from birth to adult age. A total of 82,064 records from 8,145 females were analyzed. Different models were compared. The models included additive direct and maternal effects, and animal and maternal permanent environmental effects as random terms. Contemporary group and dam age at calving (linear and quadratic effect) were included as fixed effects, and orthogonal Legendre polynomials of animal age (cubic regression) were considered as random co-variables. Eight models with polynomials of third to sixth order were used to describe additive direct and maternal effects, and animal and maternal permanent environmental effects. Residual effects were modeled using 1 (i.e., assuming homogeneity of variances across all ages) or 5 age classes. The model with 5 classes was the best to describe the trajectory of residuals along the growth curve. The model including fourth- and sixth-order polynomials for additive direct and animal permanent environmental effects, respectively, and third-order polynomials for maternal genetic and maternal permanent environmental effects were the best. Estimates of (co) variance obtained with the multi-trait and random regression models were similar. Direct heritability estimates obtained with the random regression models followed a trend similar to that obtained with the multi-trait model. The largest estimates of maternal heritability were those of BW taken close to 240 d of age. In general, estimates of correlation between BW from birth to 8 yr of age decreased with increasing distance between ages.

Impact d’une infection intra-mammaire causée par Staphylococcus aureus ou un staphylocoque coagulase-négative présente en début de lactation chez les taures laitières

L’objectif de cette étude était de déterminer l’impact d’une infection intra-mammaire (IIM) subclinique causée par staphylocoque coagulase-négative (SCN) ou Staphylococcus aureus diagnostiquée durant le premier mois de lactation chez les taures sur le comptage de cellules somatiques (CCS), la production laitière et le risque de réforme durant la lactation en cours. Des données bactériologiques provenant d’échantillons de lait composites de 2 273 taures Holstein parmi 50 troupeaux ont été interprétées selon les recommandations du National Mastitis Council. Parmi 1 691 taures rencontrant les critères de sélection, 90 (5%) étaient positives à S. aureus, 168 (10%) étaient positives à SCN et 153 (9%) étaient négatives (aucun agent pathogène isolé). Le CCS transformé en logarithme népérien (lnCCS) a été modélisé via une régression linéaire avec le troupeau comme effet aléatoire. Le lnCCS chez les groupes S. aureus et SCN était significativement plus élevé que dans le groupe témoin de 40 à 300 jours en lait (JEL) (P < 0.0001 pour tous les contrastes). La valeur journalière du lnSCC chez les groupes S. aureus et SCN était en moyenne 1.2 et 0.6 plus élevé que le groupe témoin respectivement. Un modèle similaire a été réalisé pour la production laitière avec l’âge au vêlage, le trait génétique lié aux parents pour la production laitière et le logarithme népérien du JEL de la pesée inclus. La production laitière n’était pas statistiquement différente entre les 3 groupes de culture de 40 à 300 JEL (P ≥ 0.12). Les modèles de survie de Cox ont révélé que le risque de réforme n’était pas statistiquement différent entre le groupe S. aureus ou SCN et le groupe témoin (P ≥ 0.16). La prévention des IIM causées par SCN et S. aureus en début de lactation demeure importante étant donné leur association avec le CCS durant la lactation en cours.

Fatores genéticos e ambientais sobre a probabilidade de prenhez precoce em bovinos Caracu

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise da variabilidade genética aditiva de características de crescimento na raça Nelore

Foram utilizados dados de cinqüenta e um rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN), distribuídos nos estados de Goiás (GO), Mato Grosso do Sul (MS), Mato Grosso (MT), Minas Gerais (MG), São Paulo (SP), Maranhão (MA) e Bahia (BA). Foram obtidas estimativas de parâmetros genéticos para os pesos padronizados aos 120 (P120), 455 (P455) e 550 (P550) dias de idade. Análises unicaráter e bicaráter foram realizadas por modelo animal usando o aplicativo MTDFREML. Para P120 foi utilizado um modelo que incluiu como efeitos fixos, grupo de contemporâneos e classe de idade da vaca ao parto, e como aleatórios, os efeitos genéticos direto, materno e de ambiente permanente da vaca. Para P455 e P550, o modelo utilizado incluiu os mesmos efeitos fixos e o efeito genético direto do animal. ANas análises unicaráter, as estimativas de herdabilidade direta foram 0,29, 0,51 e 0,47 para P120, P455 e P550, respectivamente. Nas análises bicaráter, observaram-se coeficientes de herdabilidade direta de 0,50 e 0,58 para P120, 0,50 e 0,53 para P455 e 0,44 e 0,49 para P550. As correlações genéticas estimadas entre P120 e P455, P120 e P550 e P455 e P550, foram 0,92, 0,93 e 0,96, respectivamente. As estimativas de herdabilidade obtidas para P455 e as correlações genéticas deste peso com P120 e P550 sugerem que a avaliação genética pode ser feita aos 15 meses de idade em substituição aos 18 meses.

Genetic parameters and environmental effects on temperament score and reproductive traits of Nellore cattle

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Genetic parameter estimates for buffalo milk yield, milk quality and mozzarella production and Bayesian inference analysis of their relationships

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Covariance functions for body weight from birth to maturity in Nellore cows

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Relação entre características morfológicas e produção de leite em vacas da raça Gir

O objetivo deste trabalho foi determinar parâmetros genéticos relacionados a características morfológicas e suas correlações genéticas com a produção de leite, em vacas da raça Gir. Utilizaram-se 3.805 registros provenientes de 2.142 vacas. O modelo utilizado na análise de características morfológicas continha os efeitos fixos de rebanho, ano e estação de classificação, estádio da lactação e idade da vaca à classificação, além da identificação do classificador. Quanto à produção de leite, foram incluídos no modelo os efeitos fixos de rebanho, ano e estação de parição e idade da vaca ao parto. Os parâmetros genéticos foram obtidos por meio do aplicativo REMLF90. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,09 a 0,54. A variabilidade genética aditiva da maioria das características é suficiente para que ganhos genéticos anuais significativos possam ser alcançados com o processo de seleção. As correlações genéticas entre as características morfológicas variaram de baixas a altas e, entre elas e a produção de leite, de baixas a moderadas. Altas correlações genéticas entre algumas características morfológicas implicam a possibilidade de exclusão de algumas delas do programa de melhoramento genético da raça Gir, no Brasil. As correlações genéticas entre produção de leite e algumas características morfológicas indicam que estas podem ser utilizadas na formação de índices de seleção.

Parâmetros genéticos para características de crescimento e reprodução de bovinos da raça Canchim

O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos para idades ao primeiro (IPP) e segundo partos (ISP), idades ao primeiro (IPP PEN) e segundo partos penalizadas (ISP PEN), e a ocorrência de parto até os 38 meses de idade (PP38), em bovinos da raça Canchim, bem como estimar as relações genéticas entre essas características e o peso (PE420) de machos e femêas e a circunferência escrotal (CE420) de novilhos, medidos aos 420 dias de idade. Foram estimados parâmetros genéticos em análises bicaracterísticas, por meio de inferência bayesiana. As análises foram realizadas entre CE420 e PE420 e as características reprodutivas medidas em fêmeas. As características reprodutivas das fêmeas devem apresentar baixa resposta à seleção, e mudanças no manejo e nas condições ambientais melhoram tais características. A seleção quanto ao maior peso aos 420 dias de idade não deve provocar mudanças nas características reprodutivas em fêmeas, enquanto a seleção para o aumento da circunferência escrotal, na mesma idade, contribui para melhorar tais características.

Estimativas de parâmetros genéticos e de ganhos direto e indireto à seleção para características de crescimento de machos e fêmeas da raça Canchim

Neste trabalho, objetivou-se estimar as herdabilidades e as correlações genéticas entre os pesos ao nascimento (PN), à desmama (P240), ao ano (P365) e ao sobreano (P550), os ganhos de peso do nascimento à desmama (GND) e do nascimento ao sobreano (GN18), o número de dias para ganhar 175 kg do nascimento à desmama (D175) e para ganhar 450 kg do nascimento ao abate (D450) de machos e fêmeas, o peso adulto (PAD) de fêmeas em um rebanho da raça Canchim visando à definição de critérios de seleção. Foram realizadas análises unicaracteres e bicaracteres pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas utilizando-se modelos estatísticos que incluíram os efeitos fixos de ano e mês de nascimento, sexo do animal, ano e mês do parto, idade do animal ao parto e idade da mãe como covariável (efeitos linear e quadrático), além dos efeitos aleatórios aditivo direto e materno, de ambiente permanente e residual, dependendo da característica. As estimativas de herdabilidade obtidas pelas análises unicaracteres foram iguais a 0,41 (PN), 0,28 (P240), 0,38 (P365), 0,28 (P550), 0,26 (GND), 0,30 (GN18), 0,23 (D175), 0,23 (D450) e 0,48 (PAD), enquanto as estimativas de correlação genética obtidas por análises bicaracteres variaram de 0,28 a 0,97 entre os pesos, de 0,11 a 0,97 entre pesos e ganhos de peso, de 0,00 a -0,98 entre pesos e dias para atingir determinado peso, e de -0,63 a -0,98 entre os ganhos de peso e dias para atingir determinado peso e iguais a 0,69 para GND e GN18 e 0,76 para D175 e D450. Estas estimativas sugerem a possibilidade de se obter progresso genético pela seleção para todas as características estudadas e que a seleção para qualquer uma delas deverá provocar mudanças nas outras.

Genetic parameters for milk yield analyzed by test-day models in Murrah buffaloes in Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Milk fatty acid characterization and genetic parameter estimates for milk conjugated linoleic acid in buffaloes

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)