Thiolytic screening method for exploring condensed tannin variation in a unique sainfoin germplasm bank

This EU funded 'HealthyHay'project stablished a sainfoin (Onobrychis vicifolia) germplasm bank at NIAB, Cambridge, with 306 accessions from around the world. A screening method was developed to characterise tannins by thiolytic degradation [1] directly in green plants for the first time. the method was validated by separate analysis of unextractable, extractable and purified tannins using thiolysis, HPLC-GPC and MALDI-TOF MS. Most tannins (58 to 73% of the total) could be recovered after Toyopearl HW50 fractionation with water, aqueous methanol and acetone. the greatest losses during purification occurred amongst larger molecular weight tannins with mean degree of polymerisation (mDP) > 18. The composition of water-,aqueous methanol- and acetone-soluble tannins differed considerably in their mDP and trans/cis ratios, but not in their prodelphinidin/orocyanidin (PD/PC) ratios.

The Gracilariaceae Germplasm Bank of the University of So Paulo, Brazil-a DNA barcoding approach

The University of So Paulo Gracilariaceae Germplasm Bank has 50 strains collected mostly in Brazil, but also elsewhere in the world. This bank has been used as a source of material for research developed locally and abroad. With over 200 species, some of which have high economic value, the family Gracilariaceae has been extensively studied. Nonetheless, taxonomic problems still persist by the existence of cryptic species, phenotypic plasticity, and broad geographic distribution. In the case of algae kept in culture for long periods of time, the identification is even more problematic as a consequence of considerable morphological modification. Thus, the use of molecular markers has been shown to be an efficient tool to elucidate taxonomic issues in the group. In this work, we sequenced the 5'-end of the cox1 gene for 41 strains and the universal plastid amplicon (UPA) plastid region for 45 strains, covering all 50 strains in the bank. In addition, the rbcL for representatives of the cox1/UPA clusters was sequenced for 14 strains. The original species identification based on morphology was compared with the molecular data obtained in this work, resulting in the identification of 13 different species. Our analyses indicate that cox1 and UPA are suitable markers for the delineation of species of Gracilariales in the germplasm bank. The addition of DNA barcode tags to the samples in the Gracilariaceae germplasm bank and the molecular identification of the species will make this bank even more useful for future research as the species can be easily traced and confirmed.

Molecular characterization of 'sweet' cassavas (Manihot esculenta) from a germplasm bank in Brazilian Eastern Amazonia.

2016

Genetic analysis of 'Moscato branco' and other muscat grapes held by the grape germplasm bank in Brazil.

2012

Influência da época do ano no sucesso da enxertia nas variedades de abacateiro Hass e Fortuna

O objetivo do trabalho foi avaliar a influência da época no pegamento da enxertia em abacateiro das variedades Hass e Fortuna, mensalmente, no período de doze meses. As plantas utilizadas pertencem ao Banco de Germoplasma do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias - UNESP, Câmpus de Jaboticabal-SP. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, em esquema fatorial 2 x 12 ('Hass' e 'Fortuna' e os períodos de enxertia), no intervalo de março de 2005 a fevereiro de 2006, com 10 unidades por parcela, repetidas por quatro vezes. O método utilizado foi a enxertia por garfagem de topo em fenda cheia. As avaliações, 90 dias após a instalação do experimento, foram quanto à porcentagem de pegamento, desenvolvimento total das combinações (porta-enxerto/ enxerto), número de brotações do enxerto, diâmetros acima, abaixo e no local de união do enxerto. O período mais indicado para o sucesso da enxertia está compreendido entre os meses de novembro e dezembro para ambas as variedades de abacateiro.

Chemical and biochemical characterization of guava and araçá fruits from different regions of Brazil

Guava and araçá, species of the Psidium genus, are important options for Brazilian agribusiness, especially the former species, due to their fruit characteristics, such as appearance, taste and richness in minerals and phenolic compounds. These fruits can be consumed in natura or in several processed forms. The active germplasm bank is an important tool for genetic resource characterization and plant breeding studies. Sixty guava and ten araçá accessions of the Psidium active germplasm, sampled in 44 different Brazilian regions and grown at Embrapa Semiarid, were chemically and biochemically characterized in order to support breeding programs. The accessions were grown in a randomized block design, with two replications and three plants/plot. The sugar, proteins, soluble solids, titratable acidity, calcium, magnesium, iron and phosphorus contents were determined. Large variations were observed in the analyzed compounds, which could be attributed to the diversity of genotypes and also to the environmental conditions, which affect the plant metabolism. The high variability observed in most parameters of the accessions is an important factor for the improvement of these species. Most guava accessions showed higher titratable acidity and soluble solids than those found in commercial cultivars and, in araçá, these levels were even higher, which makes them promising for commercial exploitation. Moreover, fruits of the guava and araçá accessions present good sources of sugars and minerals. Special attention should be given to some guava and araçá accessions from Maranhão and Pernambuco States, respectively, which showed high levels for titratable acidity, soluble solids, SS/TA ratio, total soluble sugars, calcium, magnesium and iron, should be targets of breeding programs for new Psidium cultivars. © ISHS.

Similaridade genética em acessos de goiabeiras e araçazeiros: análises químicas e bioquímicas dos frutos

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Botânica) - IBB

Avaliação de progênies de longan

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Variação genética para caracteres silviculturais em banco ativo de germoplasma de espécies arbóreas do cerrado e da floresta estacional semidecidual

Pós-graduação em Agronomia - FEIS

Caracterização biométrica e germinação de mabolo (Diospyros blancoi Willd)

Pós-graduação em Agronomia (Produção Vegetal) - FCAV

Enraizamento de estacas de espécies de maracujazeiro (Passiflora spp.) no inverno e no verão

O maracujazeiro está entre as principais frutíferas cultivadas no País, mas apresenta limitações no cultivo, ocasionando baixa produtividade, que pode ser superada através do uso da estaquia, clonando as melhores matrizes de alta produtividade. Com isso, o objetivo desta pesquisa foi avaliar o potencial de enraizamento de estacas no inverno e no verão, utilizando as espécies comerciais (P. edulis Sims f. flavicarpa Degener e P. alata Dryander) e os porta-enxertos (P. giberti N.E.Brown, P. nitida H.B.K. e P. setacea D.C.). Este experimento foi realizado no período de julho de 2001 a março de 2002, em câmara de nebulização intermitente, sob condições de telado (50% de sombreamento). As estacas foram coletadas de plantas adultas oriundas do Banco de Germoplasma Ativo (BAG) do Departamento de Produção Vegetal da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da Universidade Estadual Paulista, Jaboticabal-SP (FCAV/UNESP) e de pomares comerciais, em julho de 2001 e em janeiro de 2002. A estaquia foi feita com a coleta da parte intermediária de ramos em estádio de crescimento vegetativo, no inverno e no verão. As estacas herbáceas tinham aproximadamente 15cm de comprimento, três nós e duas meias - folhas. As estacas foram tratadas com ácido indolbutírico (AIB) nas concentrações de 0; 500; 1.000 e 2.000mg.L-1, por cinco segundos, e plantadas em bandejas plásticas (40x30x10cm) com vermiculita de textura média, onde permaneceram por 60 dias. Houve influência do AIB e da época do ano no enraizamento, variando de acordo com a espécie. Sendo assim, P. giberti obteve o melhor desempenho em relação às demais espécies, com 73% de enraizamento no verão. A percentagem de enraizamento foi melhor para P. alata (58%) e para P. nitida (40%) no inverno e sem AIB. P. edulis f. flavicarpa enraizou apenas 23% no inverno, e P. setacea não enraizou. O número e o comprimento de raízes foram maiores no inverno. A sobrevivência de plantas não se diferenciou significativamente entre os tratamentos.

Antioxidant content in guava (Psidium guajava) and araca (Psidium spp.) germplasm from different Brazilian regions

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Caracterización genética de germoplasma de maní cultivado (Arachis hypogaea L.) mediante el empleo de marcadores microsatélites

El maní cultivado (Arachis hypogaea L.), es una especie de gran importancia económica, nativo de América del Sur. Se divide en dos subespecies y seis variedades botánicas. Genéticamente es alotetraploide, constituido por dos juegos genómicos duplicados. El empleo de marcadores microsatélites resulta más apropiado para realizar la caracterización genética de esta especie, puesto que permiten detectar un elevado nivel de polimorfismo. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar la diversidad genética existente en las entradas de germoplasma de maní cultivado pertenecientes al Banco Activo de Germoplasma de Maní del Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Veinticinco entradas fueron genotipificadas con 23 marcadores microsatélites, de los cuales, 17 resultaron polimórficos. Se observaron 75 fragmentos polimórficos amplificados, con un promedio de 4,41 alelos por locus y un rango de 1 a 9 alelos. El contenido de información polimórfica osciló entre 0,15 y 0,58. El valor de la diversidad genética promedio fue de 0,165. Tanto el análisis de conglomerados como el de coordenadas principales evidenciaron dos grupos, uno formado por los materiales representantes de la subespecie fastigiata y otro por los de la subespecie hypogaea. Los resultados del análisis molecular de la varianza mostraron varianza tanto dentro como entre, las subespecies analizadas.

An improved PCR method for direct identification of Porphyra (Bangiales, Rhodophyta) using conchocelis based on a RUBISCO intergenic spacer

An improved method of PCR in which the small segment of conchocelis is amplified directly without DNA extraction was used to amplify a RUBISCO intergenic spacer DNA fragment from nine species of red algal genus Porphyra (Bangiales, Rhodophyta), including Porphyra yezoensis (Jiangsu, China), P. haitanensis (Fujian, China), P. oligospermatangia (Qingdao, China), P. katadai (Qingdao, China), P. tenera (Qingdao, China), P. suborboculata (Fujian, China), P. pseudolinearis (Kogendo, Korea), P. linearis (Devon, England), and P. fallax (Seattle, USA). Standard PCR and the method developed here were both conducted using primers specific for the RUBISCO spacer region, after which the two PCR products were sequenced. The sequencing data of the amplicons obtained using both methods were identical, suggesting that the improved PCR method was functional. These findings indicate that the method developed here may be useful for the rapid identification of species of Porphyra in a germplasm bank. In addition, a phylogenetic tree was constructed using the RUBISCO spacer and partial rbcS sequence, and the results were in concordant with possible alternative phylogenies based on traditional morphological taxonomic characteristics, indicating that the RUBISCO spacer is a useful region for phylogenetic studies.