Meta-analysis of gene-level associations for rare variants based on single-variant statistics.

Meta-analysis of genome-wide association studies (GWASs) has led to the discoveries of many common variants associated with complex human diseases. There is a growing recognition that identifying "causal" rare variants also requires large-scale meta-analysis. The fact that association tests with rare variants are performed at the gene level rather than at the variant level poses unprecedented challenges in the meta-analysis. First, different studies may adopt different gene-level tests, so the results are not compatible. Second, gene-level tests require multivariate statistics (i.e., components of the test statistic and their covariance matrix), which are difficult to obtain. To overcome these challenges, we propose to perform gene-level tests for rare variants by combining the results of single-variant analysis (i.e., p values of association tests and effect estimates) from participating studies. This simple strategy is possible because of an insight that multivariate statistics can be recovered from single-variant statistics, together with the correlation matrix of the single-variant test statistics, which can be estimated from one of the participating studies or from a publicly available database. We show both theoretically and numerically that the proposed meta-analysis approach provides accurate control of the type I error and is as powerful as joint analysis of individual participant data. This approach accommodates any disease phenotype and any study design and produces all commonly used gene-level tests. An application to the GWAS summary results of the Genetic Investigation of ANthropometric Traits (GIANT) consortium reveals rare and low-frequency variants associated with human height. The relevant software is freely available.

Partitioning of reproduction in mother-daughter versus sibling associations : a test of optimal skew theory

A critical feature of cooperative animal societies is the reproductive skew, a shorthand term for the degree to which a dominant individual monopolizes overall reproduction in the group. Our theoretical analysis of the evolutionarily stable skew in matrifilial (i.e., mother-daughter) societies, in which relatednesses to offspring are asymmetrical, predicts that reproductive skews in such societies should tend to be greater than those of semisocial societies (i.e., societies composed of individuals of the same generation, such as siblings), in which relatednesses to offspring are symmetrical. Quantitative data on reproductive skews in semisocial and matrifilial associations within the same species for 17 eusocial Hymenoptera support this prediction. Likewise, a survey of reproductive partitioning within 20 vertebrate societies demonstrates that complete reproductive monopoly is more likely to occur in matrifilial than in semisocial societies, also as predicted by the optimal skew model.

Expression of neutral endopeptidase, endothelin-1, and nuclear factor kappa B in prostate cancer: interrelations and associations with prostate-specific antigen recurrence after radical prostatectomy.

Objective. To study the impact of the neutral endopeptidase (NEP)/neuropeptides (NPs) axis and nuclear factor kappa B (NFκB) as predictors of prostate-specific antigen (PSA) recurrence after radical prostatectomy (RP). Patients and Methods. 70 patients with early-stage PC were treated with RP and their tumor samples were evaluated for expression of NEP, endothelin-1 (ET-1) and NFκB (p65). Time to PSA recurrence was correlated with the examined parameters and combined with preoperative PSA level, Gleason score, pathological TNM (pT) stage, and surgical margin (SM) assessment. Results and Limitations. Membranous expression of NEP (P < 0.001), cytoplasmic ET-1 (P = 0.002), and cytoplasmic NFκB (P < 0.001) were correlated with time to PSA relapse. NEP was associated with ET-1 (P < 0.001) and NFκB (P < 0.001). ET-1 was also correlated with NFκB (P < 0.001). NEP expression (P = 0.017), pT stage (P = 0.013), and SMs (P = 0.036) were independent predictors of time to PSA recurrence. Conclusions. There seems to be a clinical model of NEP/NPs and NFκB pathways interconnection, with their constituents following inverse patterns of expression in accordance with their biological roles and molecular interrelations.

Bowling for fascism: Social capital and the rise of the Nazi Party in Weimar Germany, 1919-33

Social capital a dense network of associations facilitating cooperation within a community typically leads to positive political and economic outcomes, as demonstrated by a large literature following Putnam. A growing literature emphasizes the potentially "dark side" of social capital. This paper examines the role of social capital in the downfall of democracy in interwar Germany by analyzing Nazi party entry rates in a cross-section of towns and cities. Before the Nazi Party's triumphs at the ballot box, it built an extensive organizational structure, becoming a mass movement with nearly a million members by early 1933. We show that dense networks of civic associations such as bowling clubs, animal breeder associations, or choirs facilitated the rise of the Nazi Party. The effects are large: Towns with one standard deviation higher association density saw at least one-third faster growth in the strength of the Nazi Party. IV results based on 19th century measures of social capital reinforce our conclusions. In addition, all types of associations veteran associations and non-military clubs, "bridging" and "bonding" associations positively predict NS party entry. These results suggest that social capital in Weimar Germany aided the rise of the Nazi movement that ultimately destroyed Germany's first democracy.

Sexual associations for two species of mutillid wasps (Hymenoptera, Mutillidae), with the description of a new species of Anomophotopsis

The sexes of Pseudometocha melanocephala (Perty, 1833) and of a new species of Anomophotopsis are associated based on mating pairs found in the field and also in laboratory mating trials. The previously unknown male of Pseudomethoca melanocephala (Perty, 1833) and both sexes of Anomophotopsis quinteroi Cambra, sp. nov., are described. We present the first distribution record of P. melanocephala from Argentina. Anecdotal data on their mating behavior are also discussed.

Testing for convergence clubs in income per-capita: A predictive density approach

The paper proposes a technique to jointly test for groupings of unknown size in the cross sectional dimension of a panel and estimates the parameters of each group, and applies it to identifying convergence clubs in income per-capita. The approach uses the predictive density of the data, conditional on the parameters of the model. The steady state distribution of European regional data clusters around four poles of attraction with different economic features. The distribution of incomeper-capita of OECD countries has two poles of attraction and each grouphas clearly identifiable economic characteristics.

Aphid parasitoids (Hymenoptera, Braconidae, Aphidiinae) and their associations related to biological control in Brazil

This study evaluated the parasitoid-aphid-plant associations in Brazil with the objective of developing a useful research database for further studies of aphid parasitoid ecology and aphid management. The original material was obtained from collections made in Paraná, Rio Grande do Sul, Minas Gerais, and São Paulo states. The published information on the Aphidiinae in Brazil is revised. The general features of the target parasitoid fauna of Central and South America is summarized and promising biological control programs of some aphid species in Brazil is discussed.

S'intégrer balle au pied: Le rôle des clubs de foot de migrants en Suisse

L'existence de clubs de foot de migrants favorise-t-elle ou empêche-t-elle le développement de liens sociaux avec les membres de clubs "autochtones" et plus largement avec les autres acteurs du tissu associatif régional ? Les auteurs de l'article portent particulièrement leur attention sur les relations crées et entretenues sur le terrain de jeu, à partir d'une recherche effectuée entre 2009 et 2011 auprès de douze clubs en Suisse. Ils s'intéressent tant à la composition de leurs effectifs, en terme d'origine nationale et culturelle, qu'au rôle de socialisation qu'ils peuvent jouer vis-à-vis de leurs membres et de passeur vers un processus dynamique d'intégration à construire et à assumer.

Parent-of-origin-specific allelic associations among 106 genomic loci for age at menarche.

Age at menarche is a marker of timing of puberty in females. It varies widely between individuals, is a heritable trait and is associated with risks for obesity, type 2 diabetes, cardiovascular disease, breast cancer and all-cause mortality. Studies of rare human disorders of puberty and animal models point to a complex hypothalamic-pituitary-hormonal regulation, but the mechanisms that determine pubertal timing and underlie its links to disease risk remain unclear. Here, using genome-wide and custom-genotyping arrays in up to 182,416 women of European descent from 57 studies, we found robust evidence (P < 5 × 10(-8)) for 123 signals at 106 genomic loci associated with age at menarche. Many loci were associated with other pubertal traits in both sexes, and there was substantial overlap with genes implicated in body mass index and various diseases, including rare disorders of puberty. Menarche signals were enriched in imprinted regions, with three loci (DLK1-WDR25, MKRN3-MAGEL2 and KCNK9) demonstrating parent-of-origin-specific associations concordant with known parental expression patterns. Pathway analyses implicated nuclear hormone receptors, particularly retinoic acid and γ-aminobutyric acid-B2 receptor signalling, among novel mechanisms that regulate pubertal timing in humans. Our findings suggest a genetic architecture involving at least hundreds of common variants in the coordinated timing of the pubertal transition.

Prévention de la violence commise par les spectateurs lors de manifestations sportives : étude des mesures préventives et de la responsabilité de l'organisateur à la lumière du droit comparé, du droit suisse et du droit associatif

Introduction 1. Généralités : Le sport occupe une place importante dans notre société, de manière active par la pratique d'une ou de plusieurs activités sportives, ou de manière passive, au travers de la presse, de la radio et de la télévision. Le sport est ainsi un acte de participation, d'appartenance, de revendication et d'intégration à la société en général ou à un groupe. Il stimule l'imagination et permet de rêver aux héros sportifs. Enfin, non seulement il améliore la santé de ceux qui le pratique, mais il a une dimension éducative et joue un rôle social, culturel et récréatif. Toutefois, le sport est également un spectacle qui provoque des passions et engendre des émotions de la part des supporters, dont certains s'exaltent pour leur équipe fétiche. Il arrive que ce supportérisme soit à tel point exacerbé qu'il mène à des dérives pouvant aboutir à des actes de violence dans et en dehors des stades, ceci tant avant, pendant qu'après le match. A titre d'exemple tragique, les téléspectateurs garderont longtemps en mémoire les scènes auxquelles ils ont assisté le 29 mai 1985, en direct, lorsque, avant le début de la rencontre, des hooligans anglais ont attaqué des supporters italiens dans les gradins du bloc Z du stade du Heysel à Bruxelles, lors de la finale de la Coupe d'Europe des champions, opposant le FC Liverpool à la Juventus de Turin; 39 personnes en sont mortes et 600 ont été blessées. La Suisse, longtemps épargnée par le phénomène, en regard de la situation qui a prévalu dans d'autres Etats européens, ne peut échapper, depuis quelques années, au triste constat selon lequel les stades constituent désormais des environnements propices à des actions de violence, de racisme et, plus rarement, d'extrémisme. Le cas le plus révélateur a eu lieu le 13 mai 2006, lorsque des fauteurs de trouble ont envahi le terrain du Parc Saint-Jacques de Bâle après le coup de sifflet final du match de championnat opposant le FC Bâle au FC Zurich, match dont l'enjeu était la première place du classement du championnat de Super League, pour attaquer à coups de pied et à coups de poing des joueurs, des accompagnants et des personnes chargées de la sécurité. Les affrontements ont continué dans la rue jusque tard dans la soirée. Il s'en est suivi une centaine de blessés et des dégâts d'un demi million de francs. De tels débordements mettent en danger la sécurité du public, des équipes et des arbitres. Il s'agit de tout mettre en oeuvre afin que les spectateurs qui assistent à une manifestation sportive puissent prendre du plaisir aux performances des sportifs sans devoir craindre pour leur sécurité. De même, les acteurs sur le terrain doivent pouvoir exercer leur sport sans craindre un envahissement de l'aire de jeu. Ainsi, les Etats et les associations sportives ont élaboré des textes juridiques afin d'éviter des débordements ou tout autre événement qui pourraient mettre en danger des personnes ou des biens matériels lors de manifestations sportives. Sous l'angle du droit étatique helvétique, cela s'est traduit, notamment en vue du déroulement en Suisse du Championnat d'Europe de football de l'UEFA en 2008 (EURO 2008) et du Championnat du monde de hockey sur glace en 2009, par l'adoption de mesures préventives permettant de lutter contre les actes de violence lors de manifestations sportives, introduites dans la Loi fédérale du 21 mars 1997 instituant des mesures visant au maintien de la sûreté intérieure (LMSI). Elles se concrétisent par l'inscription d'individus ayant commis des actes de violence dans une banque de données nationale, ainsi que par le recours au périmètre d'exclusion, à l'interdiction de sortie du territoire, à l'obligation de s'annoncer à la police et, en dernier ressort, à la garde à vue; enfin, il est également possible de saisir, séquestrer ou confisquer du matériel de propagande5. La mise en place de telles mesures relève de l'Etat, garant de la sécurité et de l'ordre publics à l'extérieur des enceintes sportives. L'organisateur, chargé quant à lui d'assurer la sécurité à l'intérieur du stade, n'est toutefois pas en marge, puisque les fédérations et associations sportives ont édicté des règlements dont il est le destinataire. Ces textes prévoient, à sa charge, notamment les mesures suivantes: le prononcé d'interdictions de stade à l'encontre de supporters violents, la fouille accrue des spectateurs, l'engagement d'un service de sécurité privé, l'obligation de désigner un responsable de la sécurité, la séparation des différents groupes de supporters, etc.. Il appartient ainsi aux associations sportives, aux organisateurs, aux chargés de la sécurité au sein des clubs et aux forces de l'ordre public d'appliquer de la meilleure façon que ce soit les mesures proposées et de collaborer afin de combattre les débordements des spectateurs de manière effective. Prévenir et supprimer la violence dans les manifestations sportives exige ainsi la mobilisation et la collaboration de tous les protagonistes concernés.