Sim-xl: A Powerful And User-friendly Tool For Peptide Cross-linking Analysis.

Chemical cross-linking has emerged as a powerful approach for the structural characterization of proteins and protein complexes. However, the correct identification of covalently linked (cross-linked or XL) peptides analyzed by tandem mass spectrometry is still an open challenge. Here we present SIM-XL, a software tool that can analyze data generated through commonly used cross-linkers (e.g., BS3/DSS). Our software introduces a new paradigm for search-space reduction, which ultimately accounts for its increase in speed and sensitivity. Moreover, our search engine is the first to capitalize on reporter ions for selecting tandem mass spectra derived from cross-linked peptides. It also makes available a 2D interaction map and a spectrum-annotation tool unmatched by any of its kind. We show SIM-XL to be more sensitive and faster than a competing tool when analyzing a data set obtained from the human HSP90. The software is freely available for academic use at http://patternlabforproteomics.org/sim-xl. A video demonstrating the tool is available at http://patternlabforproteomics.org/sim-xl/video. SIM-XL is the first tool to support XL data in the mzIdentML format; all data are thus available from the ProteomeXchange consortium (identifier PXD001677).

Análise dos esforços de alta intensidade de jogadores de futebol profissional

Universidade Estadual de Campinas . Faculdade de Educação Física

Emoções no basquetebol : primeiras aproximações a partir da psicologia cultural

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Metodologia para a suavização de dados biomecanicos por função não parametrica ponderada local robusta

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Auto-organização no comportamento de crianças no jogo

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As atividades ludicas e a criança com paralisia cerebral : o jogo, o brinquedo e a brincadeira no cotidiano da criança e da familia

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Futebol : Analises qualitativas e quantitativas para verificação e modulação de padrões e sistemas complexos de jogo

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Metodo de sincronização de cameras de video utilizando a banda de audio

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As relações de gênero em uma escola de futebol : quando o jogo é possível? = Genders relations at a football school : when the game happen?

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Aspectos motores da Paralisia Cerebral Espástica diparética : o Nintendo WII 'MARCA REGISTRADA' como atividade motora complementar = Motor aspects of Spastic Cerebral Palsy : the Nintendo WII 'TRADEMARK' as a supplementary motor activity

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Metodologia para descrição tridimensional do movimento humano a partir de cameras de video não sincronizadas

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Explorando a intensidade de esforço em atletas de basquetebol, segundo tipos de fundamentos e posições : estudo a partir de equipe infanto-juvenil do Campeonato Paulista de 1996

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Rastreamento automatico de trajetorias de jogadores de futebol por videogrametria : validação do metodo e analise dos resultados

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O uso de videogames, jogos de computador e internet por uma amostra de universitários da Universidade de São Paulo

OBJETIVO: Avaliar uso de jogos eletrônicos (videogames, jogos de computador e internet) em uma amostra de universitários. MÉTODO: Um questionário a respeito de comportamentos relacionados ao uso de jogos eletrônicos, contendo a escala Problem Videogame Playing (PVP), foi aplicado em 100 alunos da Universidade de São Paulo (USP). RESULTADOS: A maioria (83%) relatou ter jogado no último ano, dentre a qual 81,9% eram homens, 51,8% jogavam de 1 a 2 horas por sessão; 74,4% afirmaram que jogar não interfere em seus relacionamentos sociais e 60,5%, que o uso de jogos violentos não influencia sua agressividade. Os estudantes dividiram-se entre jogadores ocasionais e frequentes, diferenciando-se por duração de cada sessão, jogo preferido, motivação para jogar, e influência do jogo na vida social. Cerca de 5% relataram só parar de jogar quando interrompidos, normalmente jogar mais de 4 horas por sessão e se relacionar mais com amigos virtuais, sugerindo maior envolvimento com a atividade. Na escala PVP, 15,8% da amostra preencheu mais da metade dos itens, indicando consequências adversas associadas ao uso dos jogos eletrônicos. CONCLUSÃO: Observou-se que o uso de jogos eletrônicos é comum entre os estudantes da USP e que uma parcela apresenta problemas relacionados ao excesso de jogo.

A binary engine fuelling HD 87643's complex circumstellar environment Determined using AMBER/VLTI imaging

Context. The star HD 87643, exhibiting the ""B[e] phenomenon"", has one of the most extreme infrared excesses for this object class. It harbours a large amount of both hot and cold dust, and is surrounded by an extended reflection nebula. Aims. One of our major goals was to investigate the presence of a companion in HD87643. In addition, the presence of close dusty material was tested through a combination of multi-wavelength high spatial resolution observations. Methods. We observed HD 87643 with high spatial resolution techniques, using the near-IR AMBER/VLTI interferometer with baselines ranging from 60 m to 130 m and the mid-IR MIDI/VLTI interferometer with baselines ranging from 25 m to 65 m. These observations are complemented by NACO/VLT adaptive-optics-corrected images in the K and L-bands, and ESO-2.2m optical Wide-Field Imager large-scale images in the B, V and R-bands. Results. We report the direct detection of a companion to HD 87643 by means of image synthesis using the AMBER/VLTI instrument. The presence of the companion is confirmed by the MIDI and NACO data, although with a lower confidence. The companion is separated by similar to 34 mas with a roughly north-south orientation. The period must be large (several tens of years) and hence the orbital parameters are not determined yet. Binarity with high eccentricity might be the key to interpreting the extreme characteristics of this system, namely a dusty circumstellar envelope around the primary, a compact dust nebulosity around the binary system and a complex extended nebula suggesting past violent ejections.