Spatial distribution of vectors of Ross River virus and Barmah Forest virus on Russell Island, Moreton Bay, Queensland

We used a network of 20 carbon dioxide- and octenol-supplemented light traps to sample adult mosquitoes throughout Russell Island in southern Moreton Bay, south-east Queensland. Between February and April 2001, an estimated 1365 564 adult female mosquitoes were collected. In contrast to an average catch of 9754 female mosquitoes per trap night on Russell Island, reference traps set on Macleay Island and on the mainland returned average catches of 3172 and 222, respectively. On Russell Island, Ochlerotatus vigilax (Skuse), Coquillettidia linealis (Skuse), Culex annulirostris Skuse and Verrallina funerea (Theobald), known or suspected vectors of Ross River (RR) and/or Barmah Forest (BF) viruses, comprised 89.6% of the 25 taxa collected. When the spatial distributions of the above species were mapped and analysed using local spatial statistics, all were found to be present in highest numbers towards the southern end of the island during most of the 7 weeks. This indicated the presence of more suitable adult harbourage sites and/or suboptimal larval control efficacy. As immature stages and the breeding habitat of Cq. linealis are as yet undescribed, this species in particular presents a considerable impediment to proposed development scenarios. The method presented here of mapping the numbers of mosquitoes throughout a local government area allows specific areas that have high vector numbers to be defined.

Vector competence of Coquillettidia linealis (Skuse) (Diptera : Culicidae) for Ross River and Barmah Forest viruses

Coquillettidia linealis is a severe pest on some of the Moreton Bay islands in Queensland, Australia, but little is known of its breeding habitats and biology. Because of its high abundance and its association with Ross River (RR) and Barmah Forest (BF) viruses by field isolation, its vector competence was evaluated in the laboratory by feeding dilutions of both viruses in blood. For RR, Cq. linealis was of comparable efficiency to Ochlerotatus vigilax (Skuse), recognised as being a major vector. Results were as follows for Cq. linealis and Oc. vigilax , respectively: dose to infect 50%, 10(2.2) and

Enhancement or modulation of the vector competence of ochlerotatus vigilax (Diptera : Culicidae) for Ross River virus by temperature

Two different doses of Ross River virus (1111) were fed to Ochlerotatus vigilax (Skuse), the primary coastal vector in Australia; and blood engorged females were held at different temperatures up to 35 d. After ingesting 10(4.3) CCID50/Mosquito, mosquitoes reared at 18 and 25degreesC (and held at the same temperature) had higher body remnant and head and salivary gland titers than those held at 32degreesC, although infection rates were comparable. At 18, 25, and 32degreesC, respectively, virus was first detected in the salivary glands on days 3, 2, and 3. Based on a previously demonstrated 98.7% concordance between salivary gland infection and transmission, the extrinsic incubation periods were estimated as 5, 4, and 3 d, respectively, for these three temperatures. When Oc. vigilax reared at 18, 25, or 32degreesC were fed a lower dosage of 10(3.3) CCID50 RR/mosquito, and assayed after 7 d extrinsic incubation at these (or combinations of these) temperatures, infection rates and titers were similar. However, by 14 d, infection rates and titers of those reared and held at 18 and 32degreesC were significantly higher and lower, respectively. However, this process was reversible when the moderate 25degreesC was involved, and intermediate infection rates and titers resulted. These data indicate that for the strains of RR and Oc. vigilax used, rearing temperature is unimportant to vector competence in the field, and that ambient temperature variations will modulate or enhance detectable infection rates only after 7 d: extrinsic incubation. Because of the short duration of extrinsic incubation, however, this will do little to influence RR epidemiology, because by this time some Oc. vigilax could be seeking their third blood meal, the latter two being infectious.

Polymerase chain reaction tests for the identification of Ross River, Kunjin and Murray Valley encephalitis virus infections in horses

Objective To develop and validate specific, sensitive and rapid diagnostic tests using RT-PCR for the detection of Ross River virus (RRV), Kunjin virus (KV) and Murray Valley encephalitis virus (MVEV) infections in horses. Methods Primer sets based on nucleotide sequence encoding the envelope glycoprotein E2 of RRV and on the nonstructural protein 5 (NS5) of KV and MVEV were designed and used in single round PCRs to test for the respective viruses in infected cell cultures and, in the case of RRV, in samples of horse blood and synovial fluid. Results The primer pairs designed for each of the three viruses amplified a product of expected size from prototype viruses that were grown in cell culture. The identity of each of the products was confirmed by nucleotide sequencing indicating that in the context used the RT-PCRs were specific. RRV was detected in serums from 8 horses for which there were clinical signs consistent with RRV infection such that an acute-phase serum sample was taken and submitted for RRV serology testing. The RRV RT-PCR was analytically sensitive in that it was estimated to detect as little as 50 TCID50 of RRV per mL of serum and was specific in that the primer pairs did not amplify other products from the 8 serum samples. The RRV primers also detected virus in three independent mosquito pools known to contain RRV by virus isolation in cell culture. Samples from horses suspected to be infected with KV and MVEV were not available. Conclusion Despite much anecdotal and serological evidence for infection of horses with RRV actual infection and associated clinical disease are infrequently confirmed. The availability of a specific and analytically sensitive RT-PCR for the detection of RRV provides additional opportunities to confirm the presence of this virus in clinical samples. The RTPCR primers for the diagnosis of KV and MVEV infections were shown to be specific for cell culture grown viruses but the further validation of these tests requires the availability of appropriate clinical samples from infected horses.

O mar não está para peixe : uma etnografia dos conflitos socioambientais em torno da Zona de Proteção Marinha e da comunidade pesqueira do Bugigão – RESEXMAR do Corumbau/Bahia.

A Reserva Extrativista Marinha (RESEXMAR) do Corumbau foi criada no ano de 2000, a partir de uma ação coletiva, iniciada em 1997 por meio das lideranças de pescadores locais, na busca de instrumento jurídico que garantisse o acesso exclusivo dos recursos pesqueiros contra a atividade da pesca comercial de camarão sete-barbas que se instalou na década de 1980. Durante o processo de criação da RESEXMAR do Corumbau, os pescadores obtiveram apoio de órgãos governamentais, como a Coordenação Nacional de Populações Tradicionais (CNPT) e de entidades ambientalistas do terceiro setor – Associação Pradense de Proteção Ambiental (APPA), e posteriormente a Conservation International do Brasil (CI-Brasil). Entretanto, após a criação da RESEXMAR do Corumbau – entre os anos 2000 e 2002 – foi elaborado o Plano de Manejo que orientaria a gestão da Unidade de Conservação (UC). O documento foi capitaneado pela equipe técnica e científica vinculada à CI-Brasil, tendo como ponto de destaque a criação de áreas de exclusão total da atividade da pesca, por meio da Zona de Proteção Marinha (ZPM). A ideia de uma ZPM, para a CI-Brasil, era que de forma indireta e em médio e longo prazo, os pescadores se beneficiariam com o possível aumento de produção de pescado, contanto que 30% de cobertura de recifes tivesse algum tipo de proteção dos processos ecológicos, tais como reprodução e crescimento de espécies. Durante as discussões do Plano de Manejo e atualmente uma parcela de pescadores locais contestaram os limites da ZPM, pois iria restringir o acesso aos recursos pesqueiros. No entanto, tal contestação foi suprimida pelas relações não formais que os membros da CI-Brasil possuíam com o núcleo familiar principal da Vila do Corumbau, forçando os demais em um acordo formal temporário. Tal questionamento evidenciou um conflito de conjunto de normas distintas entre pescadores artesanais em relação à CI-Brasil e IBAMA: a pesca artesanal ‒ um tipo de ação que segue normas específicas das quais elementos humanos e não humanos interagem conjuntamente, evidenciando um conhecimento prático e corporizado constituindo um modelo compreensivo de mundo e de natureza; conceitos modernos e globalizantes de uma natureza totalmente desvinculada das práticas locais artesanais, com forte articulação de uma entidade ambientalista de alcance internacional, guiada pela emergência das questões ambientais, imprimindo no local (o lugar da prática da pesca tradicional) a ideia de um espaço (Áreas Marinhas Protegidas), desencaixado de formas específicas de natureza/culturas.

Evidenciação de vírus patogênicos humanos em filés de peixe

Foi desenvolvido método para a evidenciação de vírus em filés de peixe. Amostras de 50 gramas foram submetidas à agitação mecânica durante 5 min em 200 ml de água bidestilada esterilizada, em pH 7,3-7,5. As substâncias em suspensão foram removidas mediante uma filtração de clarificação. A suspensão clarificada foi em seguida submetida à ultrafiltração através de membrana de alginato de sódio, sendo esta posteriormente dissolvida em 2 ml de citrato de sódio a 3,8%. A suspensão obtida foi, a seguir, centrifugada a 10.000 rpm durante 20 min, a 4°C, adicionando-se ao sobrenadante penicilina, estreptomicina e anfotericina B. O isolamento de vírus foi feito em culturas primárias de células de rim de macaco rhesus, células HeLa e por inoculação em camundongos recém-nascidos. A identificação sorológica levou aos seguintes resultados: de 51 filés de peixe foram isoladas duas estirpes de poliovírus tipo 1, duas de poliovírus tipo 3 e uma de coxsackievírus B4, o que corresponde a uma percentagem de positividade de 9,8%*. A identificação intratípica das quatro estirpes de poliovírus isoladas revelou ser uma delas semelhante e as demais diferentes das estirpes vacinais.

Ampliação do porto de pesca de Rabo de Peixe

O presente relatório de estágio enquadra-se no âmbito do Trabalho Final de Mestrado inserido no curso em Engenharia Civil, do perfil de Estruturas, do Instituto Superior de Engenharia de Lisboa. Como tal, foi realizado um estágio na empresa Consulmar – Consultores e Projectistas, Lda. com o objectivo de realizar o acompanhamento do projecto que consiste na Ampliação do Porto de Pesca de Rabo de Peixe, na Ilha dos Açores. O estudo dividiu-se em três partes: a primeira parte consistiu no acompanhamento da fase de Estudo prévio, onde a empresa Consulmar, Lda. apresenta o estudo de várias soluções ao cliente; a segunda parte consistiu no acompanhamento da fase de Projecto Base, em que o cliente escolhe as soluções que acha mais convenientes para se elaborar um estudo mais profundo para o desenrolar da obra; por fim, a terceira parte consistiu no dimensionamento de uma ponte-cais contemplada no projecto em questão. Para tal, a ponte-cais foi modelada através do programa de cálculo automático SAP 2000, sendo a partir dos valores obtidos feito o dimensionamento. Por fim, o trabalho desenvolvido foi muito enriquecedor, pois permitiu o estudo das fases mais relevantes de um Projecto de Estruturas e desta forma ter algum conhecimento da vida profissional esperada no futuro.

Ampliação do porto de pesca de Rabo de Peixe, Ilha de São Miguel, Açores

Refere-se o presente trabalho ao Estudo Prévio de Ampliação do Porto de Pesca de Rabo de Peixe, situado na costa norte da ilha de São Miguel, no arquipélago dos Açores. Trata-se de um estudo que se reveste de alguma complexidade, não só pelas condições de agitação severas que assolam frequentemente toda a costa norte da ilha, como pelas particularidades das infra-estruturas existentes e programa de necessidades a satisfazer. A sua realização envolveu o uso de várias ferramentas de cálculo, designadamente de um programa matemático de Refracção Espectral, para transferência da agitação do largo para o local, modelação matemática da propagação da agitação para o interior do porto, e formulações várias para predimensionamento estrutural dos mantos de protecção, muros-cortina e verificação da estabilidade do molhe em estrutura mista. O Estudo Prévio inicia com a descrição das infra-estruturas portuárias existentes e historial do porto, passa depois para a caracterização das condições naturais locais, procedendo-se posteriormente à definição do programa de necessidades. Por ter envolvido o estudo de um grande número de soluções (cerca de onze), antes da descrição das soluções preseleccionadas e posteriormente analisadas mais detalhadamente (apenas três), procede-se à descrição de todas as soluções alternativas e variantes inicialmente consideradas, enumeram-se as suas principais características, vantagens e desvantagens, bem como as razões que levaram à sua exclusão. Para cada uma das três soluções alternativas preseleccionadas apresenta-se: • Descrição e justificação do Arranjo Geral; • Caracterização do comportamento hidráulico e estrutural esperado das obras de abrigo; • Descrição das obras interiores propostas; • Interferência nas condições actuais de entrada no porto; • Processo construtivo; • Estimativa de custo. Finalmente, procede-se à análise comparativa das soluções propostas e à recomendação da que se considera técnica e economicamente mais vantajosa.

Biologia (idade e crescimento), reprodução e caracterização da pesca do peixe-espada branco, Lepidopus caudatus (Euphrasen, 1788) no arquipélago dos Açores

Dissertação de Mestrado, Estudos Integrados dos Oceanos, 3 de Maio 2012, Universidade dos Açores.

Caracterização da pescaria do peixe-espada preto nos Açores de 2008 a 2012

Dissertação de Mestrado, Estudos Integrados dos Oceanos, 13 de Fevereiro de 2014, Universidade dos Açores.

Development of a simple analytical method for the simultaneousdetermination of paracetamol, paracetamol-glucuronide andp-aminophenol in river water

Paracetamol is among the most worldwide consumed pharmaceuticals. Although its occurrence in the environment is well documented, data about the presence of its metabolites and transformation products is very scarce. The present work describes the development of an analytical method for the simultaneous determination of paracetamol, its principal metabolite (paracetamol-glucuronide) and its main transformation product (p-aminophenol) based on solid phase extraction (SPE) and high performance liquid chromatography coupled to diode array detection (HPLC-DAD). The method was applied to analysis of river waters, showing to be suitable to be used in routine analysis. Different SPE sorbents were compared and the use of two Oasis WAX cartridges in tandem proved to be the most adequate approach for sample clean up and pre-concentration. Under optimized conditions, limits of detection in the range 40–67 ng/L were obtained, as well as mean recoveries between 60 and 110% with relative standard deviations (RSD) below 6%. Finally, the developed SPE-HPLC/DAD method was successfully applied to the analysis of the selected compounds in samples from seven rivers located in the north of Portugal. Nevertheless all the compounds were detected, it was the first time that paracetamol-glucuronide was found in river water at concentrations up to 3.57 μg/L.