Étude numérique des premières étapes d'agrégation du peptide amyloïde GNNQQNY, impliqué dans une maladie à prion.

Les protéines amyloïdes sont impliquées dans les maladies neurodégénératives comme Alzheimer, Parkinson et les maladies à prions et forment des structures complexes, les fibres amyloïdes. Le mécanisme de formation de ces fibres est un processus complexe qui implique plusieurs espèces d’agrégats intermédiaires. Parmi ces espèces, des petits agrégats, les oligomères, sont reconnus comme étant l’espèce amyloïde toxique, mais leur mécanisme de toxicité et d’agrégation sont mal compris. Cette thèse présente les résultats d’une étude numérique des premières étapes d’oligomérisation d’un peptide modèle GNNQQNY, issu d’une protéine prion, pour des systèmes allant du trimère au 50-mère, par le biais de simulations de dynamique moléculaire couplée au potentiel gros-grain OPEP. Nous trouvons que le mécanisme d’agrégation du peptide GNNQQNY suit un processus complexe de nucléation, tel qu’observé expérimentalement pour plusieurs protéines amyloïdes. Nous observons aussi que plusieurs chemins de formation sont accessibles à l’échelle du 20-mère et du 50-mère, ce qui confère aux structures un certain degré de polymorphisme et nous sommes capable de reproduire, dans nos simulations, des oligomères protofibrillaires qui présentent des caractéristiques structurelles observées expérimentalement chez les fibres amyloïdes.

Documenter les façons de faire d'enseignants de la 6e année du primaire dans toutes les étapes de la démarche d'évaluation

Le changement de paradigme amené par l'approche par compétences dans le système éducatif québécois au début des années 2000 devait conduire les enseignants à adopter de nouvelles façons de faire prescrites par la Politique en évaluation des apprentissages (MEQ, 2003) qui s’inscrivent dans une évaluation au service de l’apprentissage. Brookhart (2004) pour sa part, considère que la recherche en ce qui concerne les apprentissages et l'évaluation au primaire sont limitées et Boutin (2007) se questionne sur le changement effectif des pratiques considérant les vives critiques suscitées quant à l'implantation de l'approche par compétences dans les écoles québécoises. Cette recherche vise à apporter un éclairage quant aux façons de faire d'enseignants de la 6e année du primaire à toutes les étapes de la démarche d'évaluation en lecture, écriture et mathématique en les situant dans des perspectives nouvelles ou traditionnelles de l'évaluation et en observant si la fréquence des énoncés reliés aux façons de faire diffère selon les caractéristiques personnelles des enseignants. Suivant une méthodologie de type simultanée imbriquée, 55 enseignants ont rempli un questionnaire et 14 d'entre eux ont participé à des entrevues semi-dirigées. L’analyse des données montre que tout au long de la démarche d'évaluation, les façons de faire des enseignants varient, et ce, dans les trois matières: ils utilisent des façons de faire qui sont situées tantôt dans un continuum allant des perspectives traditionnelles aux perspectives nouvelles de l'évaluation comme dans la planification, la collecte de données, l'interprétation et la communication et tantôt dans les nouvelles perspectives de l'évaluation comme dans l'étape du jugement, et ce, selon leurs caractéristiques sociodémographiques. Nous avons ainsi pu catégoriser les enseignants selon le modèle de Schwartz, Bransford et Sears (2005) en distinguant ceux qui sont efficients de ceux qui ne le sont pas, même s'ils innovent. Afin d’améliorer les pratiques des enseignants à chaque étape de la démarche d’évaluation, nous pensons qu'il serait intéressant de valider un tableau synthèse inspiré de Scallon (2004) et l'OCDE (2005) afin de créer une métagrille pour analyser la pertinence et la cohérence des façons de faire des enseignants en cours de cycle dans une optique d’évaluation intégrée à l’apprentissage.

Études des premières étapes d’oligomérisation de la région Non-Aβ Component de l’a-synucléine et de Aβ1-40

Les protéines amyloïdes sont retrouvées sous forme de fibres dans de nombreuses maladies neurodégénératives. En tentant d’élucider le mécanisme de fibrillation, les chercheurs ont découvert que cette réaction se fait par un phénomène de nucléation passant par des oligomères. Il semblerait que ces espèces soient la principale cause de la toxicité observée dans les cellules des patients atteints d’amyloïdose. C’est pourquoi un intérêt particulier est donc porté aux premières étapes d’oligomérisation. Dans ce mémoire, nous nous intéressons à une séquence d’acide aminé fortement hydrophobe de l’α-synucléine appelée composante non β -amyloïde (Non-Amyloid β Component ou NAC). Cette dernière est retrouvée sous forme de fibres dans les corps et les neurites de Lewy des patients atteints de la maladie de Parkinson. De plus, elle constitue une composante minoritaire des fibres impliquées dans la maladie d’Alzheimer. Nous avons observé les changements structuraux qui ont lieu pour le monomère, le dimère et le trimère de la séquence NAC de l’α-synucléine. Nous nous sommes aussi intéressés aux conséquences structurelles observées dans des oligomères hétérogènes qui impliqueraient, Aβ1−40. Pour cela nous utilisons des dynamiques moléculaires, d’échange de répliques couplées au potentiel gros-grain, OPEP. Nous constatons une disparition des hélices α au profit des feuillets β , ainsi que le polymorphisme caractéristique des fibres amyloïdes. Certaines régions se sont démarquées par leurs capacités à former des feuillets β . La disparition de ces régions lorsque NAC est combinée à Aβ laisse entrevoir l’importance de l’emplacement des résidus hydrophobes dans des structures susceptibles de former des fibres amyloïdes.

Thermal characterization of ceramic tapes using photoacoustic effect

Thermal characterization of alumina–zirconia and zirconia ceramic tapes using a photoacoustic technique is presented. A transmission-mode geometry is employed for the measurement of thermal diffusivity while a reflection-mode geometry is used for the measurement of thermal effusivity. In both these geometries, the same open photoacoustic cell is used. From the measured values of thermal diffusivity and thermal effusivity, the thermal conductivity value has also been evaluated.

An investigation on the effects of Ag addition in the powder — in tube processing of long multifilamentary (Bi,Pb) - 2223/Ag superconducting tapes

It is important that long superconducting tape must have desired strain tolerance (less reduction of Jc with applied strains) and stress tolerance (less reduction of JC in applied stresses) for its use as coils and magnets. Ag addition to the BPSCCO system has many advantages with its physical and chemical inertness to the system, reduces the processing temperature, and promotes the grain growth, grain alignment and connectivity. All these not only enhance the critical current density of the tapes but also improve the mechanical properties. But the published results show very much scattering on the type of Ag additive to be selected, method of addition and its optimum percentage. Also there are some negative reports in this regard. The present work has been undertaken to study the effect of silver addition in different forms (Ag powder, Ag2O, AgNO3) on the superconducting and mechanical properties of (Bi,Pb)-2223/Ag tapes and to find out a suitable form of Ag additive and its optimum percentage to have better superconducting and mechanical properties. Also it is the aim of the present work is to optimise the process parameters needed to prepare (Bi,Pb)-2223/Ag multifilamentary tapes of length ~ 12 m in solenoid and pancake coil forms with good critical current density and homogeneity of J C along the length of the tapes.

Studies On Preparation And Characterization Of Hts Current Leads Using Multifilamentary Ag And Ag-Alloy Sheathed (Bi,Pb)-2223 Superconducting Tapes

The application vistas of superconductors have widened very much since the discovery of high TC superconductors (HTS) as many of the applications can be realised at 77 K rather than going down to 4.2 K, the liquid He temperature. One such application is the HTS current lead which is used to connect a superconducting system with a room temperature power source. Minimising heat leak to the cryogenic environment is the main advantage of introducing current leads into superconducting systems. The properties of HTSS likes zero resistance (avoiding joule heating) and very low thermal conductivity (minimized conductive heat transfer) make them ideal candidates to be used as current leads. There are two forms of HTS current leads. (i) bulk form (tube or rod) prepared either from YBCO or BSCCO and (ii) tape form prepared from Bi-2223 multifilamentary tapes. The tape form of current leads has many advantages with respect to the mechanical and thermal stability related criteria. Crucial information on various aspects of HTS current lead development are not available in the literature as those are kept proprietary by various companies around the world. The present work has been undertaken to tailor the properties of multifilamentary tapes for the current lead application and to optimise the processing parameters of the same for enhanced critical current density and field tolerance. Also it is the aim of the present investigation is to prepare prototype current leads engineered for operation in conduction cooled mode and test them for operational stability

Decadal-scale rainfall variability in Ethiopia recorded in an annually laminated, Holocene-age, stalagmite

An annually laminated, uranium-series dated, Holocene stalagmite from southeast Ethiopia has been analysed for growth rate and δ13C and δ18O variations at annual to biennial resolution, in order to provide the first long duration proxy record of decadal-scale rainfall variability in this climatically sensitive region. Our study site (10°N) is climatically influenced by both summer (June—August) and spring (March—May) rainfall caused by the annual movement of the Inter-Tropical Convergence Zone (ITCZ) and modulated by large-scale anomalies in the atmospheric circulation and in ocean temperatures. Here we show that stalagmite growth, episodic throughout the last 7800 years, demonstrates decadal-scale (8—25 yr) variability in both growth rate and δ 18O. A hydrological model was employed and indicates that this decadal variability is due to variations in the relative amounts of rainfall in the two rain seasons. Our record, unique in its combination of length (a total of ~1000 years), annual chronology and high resolution δ18O, shows for the first time that such decadal-scale variability in rainfall in this region has occurred through the Holocene, which implies persistent decadal-scale variability for the large-scale atmospheric and oceanic driving factors.

A case study to investigate the life cycle carbon emissions and carbon storage capacity of a cross laminated timber, multi-storey residential building

Forests are a store of carbon and an eco-system that continually removes carbon dioxide from the atmosphere. If they are sustainably managed, the carbon store can be maintained at a constant level, while the trees removed and converted to timber products can form an additional long term carbon store. The total carbon store in the forest and associated ‘wood chain’ therefore increases over time, given appropriate management. This increasing carbon store can be further enhanced with afforestation. The UK’s forest area has increased continually since the early 1900s, although the rate of increase has declined since its peak in the late 1980s, and it is a similar picture in the rest of Europe. The increased sustainable use of timber in construction is a key market incentive for afforestation, which can make a significant contribution to reducing carbon emissions. The case study presented in this paper demonstrates the carbon benefits of a Cross Laminated Timber (CLT) solution for a multi-storey residential building in comparison with a more conventional reinforced concrete solution. The embodied carbon of the building up to completion of construction is considered, together with the stored carbon during the life of the building and the impact of different end of life scenarios. The results of the study show that the total stored carbon in the CLT structural frame is 1215tCO2 (30tCO2 per housing unit). The choice of treatment at end of life has a significant effect on the whole life embodied carbon of the CLT frame, which ranges from -1017 tCO2e for re-use to +153tCO2e for incinerate without energy recovery. All end of life scenarios considered result in lower total CO2e emissions for the CLT frame building compared with the reinforced concrete frame solution.

A laminated polymer film formulation for enteric delivery of live vaccine and probiotic bacteria

Live bacterial cells (LBC) are administered orally as attenuated vaccines, to deliver biopharmaceutical agents, and as probiotics to improve gastrointestinal health. However, LBC present unique formulation challenges and must survive gastrointestinal antimicrobial defenses including gastric acid after administration. We present a simple new formulation concept, termed Polymer Film Laminate (PFL). LBC are ambient dried onto cast acid-resistant enteric polymer films that are then laminated together to produce a solid oral dosage form. LBC of a model live bacterial vaccine and a probiotic were dried directly onto a cast film of enteric polymer. The effectiveness at protecting dried cells in a simulated gastric fluid (pH 2.0) depended on the composition of enteric polymer film used, with a blend of ethylcellulose plus Eudragit L100 55 providing greater protection from acid than Eudragit alone. However, although PFL made from blended polymers films completely released low molecular weight dye into intestinal conditions (pH 7.0), they failed to release LBC. In contrast, PFL made from Eudragit alone successfully protected dried probiotic or vaccine LBC from simulated gastric fluid for 2h, and subsequently released all viable cells within 60min of transfer into simulated intestinal fluid. Release kinetics could be controlled by modifying the lamination method.

A instalação dos bosques de pinus e suas conseqüências nas dunas do Pontal de Tapes - RS

o Pontal de Tapes está inserido dentro da Planície Costeira do Rio Grande do Sul e localiza-se ao noroeste da Laguna dos Patos. Até a década de 70, a área caracterizava-se por uma dinâmica regida pela ação dos ventos, das ondas e da corrente lagunar, compondo um ambiente caracterizado pela existência de banhados, dunas, bancos de areia, entre outras feições. Com a introdução de bosques de pinus, o Pontal passou por uma drástica alteração nos seus padrões eólicos de transporte e acumulação de areia. Este fato levou a área a uma nova dinâmica eólica e, por sua vez, morfológica. Neste estudo passamos a avaliar as conseqüências deste novo cenário. Para tal, monitoramos durante aproximadamente um ano (05.06.02 a 04.06.03) os parâmetros climáticos, bem como algumas dunas da área. A partir daí detectou-se a existência de quatro processos atuantes no ambiente: translado, bloqueio, captura e carreamento, sendo que os três últimos passaram a dominar o modelado do ambiente pós-pinus. A atuação desta nova dinâmica causou profundas alterações ao Pontal, como o desaparecimento de banhados e a descaracterização do sistema dunário.

Evaluation of Electrical Properties of Lap Joints for BSCCO and YBCO Tapes

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Test of a Modular Fault Current Limiter for 220 V Line Using YBCO Coated Conductor Tapes With Shunt Protection

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)