Using a Bayesian network to model colonisation with Vancomycin Resistant Enterococcus (VRE)

Objective: Effective management of multi-resistant organisms is an important issue for hospitals both in Australia and overseas. This study investigates the utility of using Bayesian Network (BN) analysis to examine relationships between risk factors and colonization with Vancomycin Resistant Enterococcus (VRE). Design: Bayesian Network Analysis was performed using infection control data collected over a period of 36 months (2008-2010). Setting: Princess Alexandra Hospital (PAH), Brisbane. Outcome of interest: Number of new VRE Isolates Methods: A BN is a probabilistic graphical model that represents a set of random variables and their conditional dependencies via a directed acyclic graph (DAG). BN enables multiple interacting agents to be studied simultaneously. The initial BN model was constructed based on the infectious disease physician‟s expert knowledge and current literature. Continuous variables were dichotomised by using third quartile values of year 2008 data. BN was used to examine the probabilistic relationships between VRE isolates and risk factors; and to establish which factors were associated with an increased probability of a high number of VRE isolates. Software: Netica (version 4.16). Results: Preliminary analysis revealed that VRE transmission and VRE prevalence were the most influential factors in predicting a high number of VRE isolates. Interestingly, several factors (hand hygiene and cleaning) known through literature to be associated with VRE prevalence, did not appear to be as influential as expected in this BN model. Conclusions: This preliminary work has shown that Bayesian Network Analysis is a useful tool in examining clinical infection prevention issues, where there is often a web of factors that influence outcomes. This BN model can be restructured easily enabling various combinations of agents to be studied.

Inactivation of a 25.5 µm Enterococcus faecalis biofilm by a room-temperature, battery-operated, handheld air plasma jet

Effective biofilm inactivation using a handheld, mobile plasma jet powered by a 12 V dc battery and operated in open air without any external gas supply is reported. This cold, room-temperature plasma is produced in self-repetitive nanosecond discharges with current pulses of ~100 ns duration, current peak amplitude of ~6 mA and repetition rate of ~20 kHz. It is shown that the reactive plasma species penetrate to the bottom layer of a 25.5 µm-thick Enterococcus faecalis biofilm and produce a strong bactericidal effect. This is the thickest reported biofilm inactivated using room-temperature air plasmas.

Capacidade de selamento de três materiais retrobturadores frente à infiltração microbiana por Enterococcus faecalis

O objetivo deste estudo foi comparar a capacidade de selamento apical de três materiais retrobturadores em dentes submetidos à infiltração microbiana por Enterococcus faecalis. Além de analisar a ocorrência da infiltração microbiana em relação à variável tempo. Para tal, foram utilizados 80 caninos superiores permanentes humanos extraídos, instrumentados com o sistema rotatório ProTaper Universal (MAILLEFER) e obturados pela técnica de compactação lateral, com dois tipos de cimento endodôntico: Endofill (DENTSPLY) e AH Plus (DENTSPLY). A apicetomia foi realizada com a remoção de 3mm do terço apical e o retropreparo confeccionado com pontas ultrasônicas. As amostras foram subdivididas, aleatoriamente, em 6 grupos com 10 dentes cada, e 2 grupos controles. Os materiais utilizados para a retrobturação foram MTA branco (ANGELUS), IBC BioAggregate (INNOVATIVE BIOCERAMIX INC.) e Acroseal (SEPTODONT). Foram confeccionados dispositivos para fixação dos dentes aos tubos Eppendorfs. As amostras foram inoculadas com cepas de E. faecalis e incubadas a 37C, por um período de 90 dias, para análise da presença de turvação do meio Enterococcosel. Para a realização da análise estatística foram utilizados os seguintes testes: Qui-quadrado com Prova Exata de Fisher e Kruskal-Wallis. Os resultados mostraram que todos os grupos nos quais foi realizada a obturação e a posterior retrobturação apresentaram infiltração. Comparando todos os grupos, não houve diferença significativa entre os materiais testados. Em relação apenas aos materiais retrobturadores, o Acroseal obteve a menor infiltração, seguido do MTA branco e do IBC BioAggregate. As amostras obturadas com o cimento Endofill não apresentaram diferença estatística em relação à variável tempo. Porém, nas amostras obturadas com o cimento AH Plus, houve maior ocorrência de infiltração nas amostras retrobturadas com o IBC BioAggregate e menor infiltração nas amostras retrobturadas com Acroseal, com diferença estatisticamente significante ao nível de 10%.

Resistência de três materiais retrobturadores frente à infiltração microbiana por Enterococcus faecalis

O objetivo deste estudo foi comparar a capacidade de selamento apical de três materiais retrobturadores em dentes submetidos à infiltração microbiana por Enterococcus faecalis. Além de analisar a ocorrência da infiltração microbiana em relação à variável tempo. Para tal, foram utilizados 45 incisivos superiores permanentes humanos extraídos, instrumentados com o sistema rotatório ProTaper Universal (MAILLEFER) e obturados pela técnica Híbrida de Tagger, com cimento endodôntico: AH Plus (DENTSPLY). A apicetomia foi realizada com a remoção de 3mm do terço apical e o retropreparo confeccionado com pontas ultrasônicas. As amostras foram subdivididas, aleatoriamente, em três grupos com 15 dentes cada, e dois grupos controles. Os materiais utilizados para a retrobturação foram MTA branco (ANGELUS), Sealer 26 (Dentsply), Palacos-R (HERAEUS KULZER). Foram confeccionados dispositivos para fixação dos dentes aos tubos Eppendorfs. As amostras foram inoculadas com cepas de E. faecalis e incubadas a 37C, por um período de 60 dias, para análise da presença de turvação do meio Enterococosel. Para a realização da análise estatística foram utilizados os seguintes testes: Quiquadrado pela correção de Yates, Prova Exata de Fisher e pela curva de sobrevivência com os testes Mantel-Cox e o Gehan-Breslow-Wilcoxon. Os resultados mostraram que todos os grupos nos quais foi realizada a obturação e a posterior retrobturação apresentaram infiltração. Comparando todos os grupos, houve diferença significativa entre o Palacos-R e o Sealer 26. Mas não houve diferença significativa entre o Palacos-R e o MTA e nem do MTA com o Sealer 26. Em relação aos materiais retrobturadores, o Palacos-R obteve a menor infiltração, seguido do MTA branco e do Sealer 26.

Infiltração microbiana por Enterococcus faecalis em canais retrobturados com MTA, iRoot SP e Endo CPM Sealer

O objetivo deste trabalho consistiu na análise da infiltração apical em dentes retrobturados por três materiais: MTA, iROOT SP e Endo CPM Sealer. Para tal, foram utilizados 51 dentes humanos extraídos, incisivos centrais superiores, que foram instrumentados manualmente com limas tipo K, pela técnica Crown-down, obturados com compactação lateral e, após serem apicectomizados a 3mm aquém do ápice foram submetidos à retrobturação, com os três materiais propostos. As amostras foram divididas, randomicamente, em três grupos: GI MTA, GII iROOT SP e GIII Endo CPM Sealer, cada grupo com 15 amostras. Os dentes foram inseridos em tubos de eppendorfs, e feitos a impermeabilização do remanescente radicular utilizando duas camadas de cianocrilato, epóxi, e outra camada de esmalte. Em cada eppendorf foi adicionado caldo TSB estéril e uma suspensão de Enterococcos faecalis e adaptado ao frasco de vidro com meio de cultura enterococcosel. A infiltração bacteriana foi verificada pela turvação do meio de cultura. Após a análise no período de 60 dias, podemos concluir que durante esse tempo ocorreram infiltrações no Grupo I, 43,75 % das amostras apresentaram turvamento do meio de cultura demonstrando persistência da infecção. Já no Grupo II, 31,25 % das amostras tiveram crescimento bacteriano. Por fim no Grupo III, 25,00 % houve a infiltração. Grupos controle positivo e negativo para crescimento bacteriano foram realizados (n=3, cada). Os cimentos testados comportaram-se de maneira semelhante frente à infiltração bacteriana durante o período testado.

Enterococcus faecalis: fatores de virulência relacionados aos processos de natureza endodôntica

O objetivo principal deste estudo foi investigar a interação de 24 cepas de E. faecalis isoladas de infecções endodônticas primárias às proteínas de matriz dentinária, como também a moléculas de matriz presentes em lesões de endocardites. A análise desta interação foi feita através de técnica enzimática, com confirmação pela técnica de fluorescência. Além disto, foi realizada a confirmação do isolamento da espécie E. faecalis, através da técnica de PCR para o gene 16SrRNA e a análise da presença de genes de virulência da referida espécie microbiana para aderência às supostas proteínas de matriz incluindo às de ligação ao colágeno (ace, gelE, esp, agg e efaA). O maior padrão de interação das cepas ocorreu com a fibronectina (83,4%), seguido pelo fibrinogênio (62,5%) e colágeno humano tipo I (52%). Curiosamente, a aderência observada para o colágeno do tipo I, foi de pequena magnitude, quando comparado com a amostra padrão da ATCC 29212. As cepas ATCC 29212, A1, A43 e A68 interagiram com todas as proteínas de matriz utilizadas neste estudo. Um percentual expressivo das cepas testadas apresentou amplificação para efaA (86,9%) e para ace (73,9%). Paralelamente, todas as cepas apresentaram amplificação para gelE e foram negativas para os genes agg e esp. Adicionalmente, não houve correlação entre a detecção dos genes de virulência e a interação às proteínas de matriz, evidenciando que, mesmo com a detecção dos genes nas amostras, se faz necessário avaliar a expressão gênica por qPCR.

Relationship between differential retention of Escherichia coli and Enterococcus faecalis and variations in enzyme activity in the scallop Patinopecten yessoensis

Uptake of Escherichia coli and Enterococcus faecalis and variations of trypsin amylase activity acid phosphatase and superoxide dismutase in tissue of the scallop Patinopecten yessoensis were detected. The results showed that P. yessoensis accumulated E. faecalis in larger numbers and more rapidly than E. coli, both with the highest concentration in the digestive tract and lowest in hemolymph. Compared to E. coil, all scallops exposed to E. faecalis showed significantly higher trypsin and AMS activity. SOD activity in hemocytes and ACP activity in hemolymph was significantly higher in the treatments with 5 log(10)CFU/ml E. colt than with E. faecalis. But no significant differences in ACP activity of P. yessoensis exposed to a 3 log(10)CFU/ml inoculum of both bacteria were recorded. In conclusion, the mass retention of gut microflora in P. yessoensis is positively correlated with digestive enzymes activity and negatively correlated with ACP activity in the hemocyte. (C) 2010 Published by Elsevier Ltd.

Enterococcus sp. considerações clínicas e microbiológicas em endodontia

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Ciências Farmacêuticas

Comparação dos métodos aplicados na detecção de bactérias coliformes, Escherichia coli e Enterococcus sp. em águas para fins recreativos

Dissertação mest., Qualidade em Análises, Universidade do Algarve, 2007

Studies on resistance and response to vancomycin in Enterococcus faecalis: a last resort antibiotic

Dissertation presented to obtain a Ph.D. degree in Biochemistry by Instituto de Tecnologia Química e Biológica Universidade Nova de Lisboa.

Precious transition metals: the importance of Zn2+, Mn2+ and Cu2+ in the human pathogen Enterococcus faecalis

Dissertation presented to obtain the Ph.D degree in Biology

Enterococcus faecalis V583 prophages: Dynamic interactions and contribution to bacterial pathogenic traits

Dissertation presented to obtain the Ph.D degree in Biology.

Epidemiología molecular de aislamientos clínicos de enterococcus faecalis de tres hospitales de tercer nivel de México.

Tesis (Maestría en Ciencias con Especialidad en Microbiología Médica) UANL, 2012.

Eficacia antimicrobiana de microdacyn 60, hipoclorito de sodio al 5.25% y MTAD contra enterococcus faecalis.

Tesis (Maestría en Ciencias Odontológicas con Especialidad en Endodoncia) UANL, 2012.

Efecto antimicrobiano de las nanopartículas de plata contra el microorganismo Enterococcus faecalis

Tesis (Maestría en Odontología Avanzada) UANL, 2014.