Detecting female precise natal philopatry in green turtles using assignment methods

It is well established that sea turtles return to natal rookeries to mate and lay their eggs, and that individual females are faithful to particular nesting sites within the rookery. Less certain is whether females are precisely returning to their natal beach. Attempts to demonstrate such precise natal philopatry with genetic data have had mixed success. Here we focused on the green turtles of three nesting sites in the Ascension Island rookery, separated by 5–15 km. Our approach differed from previous work in two key areas. First, we used male microsatellite data (five loci) reconstructed from samples collected from their offspring (N = 17) in addition to data for samples taken directly from females (N = 139). Second, we employed assignment methods in addition to the more traditional F-statistics. No significant genetic structure could be demonstrated with FST. However, when average assignment probabilities of females were examined, those for nesting populations in which they were sampled were indeed significantly higher than their probabilities for other populations (Mann–Whitney U-test: P < 0.001). Further evidence was provided by a significant result for the mAIC test (P < 0.001), supporting greater natal philopatry for females compared with males. The results suggest that female natal site fidelity was not sufficient for significant genetic differentiation among the nesting populations within the rookery, but detectable with assignment tests.

Análise morfométrica da reação intimal secundária ao implante de stent em artérias ilíacas submetidas à angioplastia : estudo experimental em suínos

OBJETIVO: analisar, por meio da morfometria digital, o espessamento intimal presente na artéria ilíaca de suínos, submetidos à angioplastia isoladamente e à angioplastia seguida do implante de stent. MATERIAIS E MÉTODOS: em dez suínos sadios, foi realizada a angioplastia de ambas as artérias ilíacas comuns (AIC) seguida do implante de um “Z” stent autoexpansível na AIC esquerda. Após quatro semanas, os animais foram sacrificados para a retirada de amostras de tecido arterial e preparo das lâminas histológicas de três grupos de peças de cada suíno divididas do seguinte modo: grupo 1, envolvendo o segmento arterial proximal do stent; grupo 2, envolvendo o segmento distal do stent; grupo 3, área da angioplastia da AIC direita. As imagens das lâminas foram digitalizadas e analisadas por programa de morfometria com cálculo da área luminal, área da camada íntima e área da camada média dos cortes histológicos. A análise estatística foi realizada através de média e desvio padrão das áreas em cada grupo, utilizando ANOVA, com teste Post-Hoc de Tukey e LSD. O valor de p≤0,05 foi considerado significativo. RESULTADOS: na análise das médias das áreas obtidas, foi encontrada uma diferença estatisticamente significativa quanto à camada íntima dos grupos 1 (5,41 mm²) e 2 (5,25 mm²), quando comparados ao grupo 3 (0,65 mm²), em relação à camada média dos grupos 1 (3,51 mm²) e 2 (3,70 mm²), quando comparados ao grupo 3 (5,59 mm²) e não se observou diferença significativa nas médias das áreas luminais dos três grupos (grupo 1: 6,63 mm²; grupo 2: 5,25 mm²; grupo 3: 5,78 mm²). CONCLUSÃO: a angioplastia da AIC do suíno, seguida do implante do stent, gerou um espessamento intimal maior do que aquele produzido apenas pela angioplastia; porém, a área da camada média apresentou-se diminuída nos grupos “angioplastia + stent”; a luz arterial não apresentou diferença entre estes grupos.

Estado nutricional antropométrico, composição corporal e pressão arterial em adolescentes

Os objetivos deste trabalho foram: (1) estimar as prevalências de excesso de peso e de gordura corporal, obesidade central e pressão arterial elevada (PAE) em adolescentes beneficiários do Programa Nacional de Alimentação Escolar (PNAE) da rede municipal de ensino de Natal-RN; (2) verificar a associação entre variáveis antropométricas e de composição corporal com a pressão arterial, a maturação sexual e a história familiar positiva de fatores de risco para doença cardiovascular (FRDCV); (3) comparar dois padrões de referência para classificação do excesso de peso em adolescentes; e (4) propor equações preditivas de massa gorda (MG) e massa livre de gordura (MLG) baseadas nos perímetros corporais. Trata-se de um estudo transversal, com 526 adolescentes beneficiários do PNAE, em Natal, Brasil. O tamanho da população de estudo foi definido por amostragem aleatória, em dois estágios, e ponderada segundo número de alunos de cada escola. No primeiro estudo, o excesso de peso foi determinado por Índice de Massa Corporal (IMC), a gordura corporal estimada por dobras cutâneas e a obesidade central por perímetro abdominal. A pressão arterial elevada foi classificada conforme a American Academy of Pediatrics. As prevalências foram apresentadas em valores relativos e efeito do desenho. Realizou-se uma análise fatorial para sintetizar o conjunto de variáveis antropométricas visando identificar fatores comuns. Extraíram-se dois fatores: (1) padrão excesso de adiposidade e (2) padrão adiposidade central elevada. Para avaliar a associação entre os padrões de adiposidade corporal com pressão arterial elevada, faixa etária, maturação sexual e história familiar de FRDCV utilizou-se a Razão de Chances e respectivo intervalo de confiança de 95% e regressão logística. No segundo estudo, calculou-se a sensibilidade e a especificidade do excesso de peso classificado segundo o IOTF e a World Health Organization WHO em relação ao excesso de adiposidade corporal; e a estatística Kappa para medir a concordância entre os dois padrões de referência. No terceiro estudo, foram elaborados modelos preditivos de MG e MLG com base em nove perímetros corporais, utilizando a bioimpedância Byodinamics 450 como padrão de referência. Para tanto foram selecionados 218 adolescentes eutróficos, segundo o IMC a partir do estudo transversal. As equações foram estimadas por regressão linear múltipla, considerando a idade e os perímetros corporais. Os resultados apontaram que 14,1% dos meninos e 15,7% das meninas tinham excesso de peso; 15,3% dos meninos e 11,6% das meninas tinham excesso de gordura corporal e dentre os meninos 14,3% tinham pressão arterial elevada e as meninas, 21,4%. Todos os efeitos do desenho foram inferiores a 2,5%. Nos meninos, o padrão excesso de adiposidade foi associado à história familiar positiva de FRDCV (ORajust=2,60; 1,09-6,22), maturação sexual (ORajust=2,92; 1,04-8,22) e PAE (ORajust=3,66; 1,34-9,94). Os meninos com 12 anos e mais apresentaram 6,1 vezes mais chance de apresentar padrão adiposidade central elevada do que os adolescentes com 10 a 11 anos (IC95% 2,32-16,04), assim como os púberes apresentaram 3,2 vezes este mesmo padrão em relação aos pré-púberes (IC95%1,14-8,85). A partir da comparação entre os dois padrões de referencia de classificação do excesso de peso por meio do IMC, observou-se que a sensibilidade foi de 79,3% para o critério IOTF e de 88,9% para WHO e a especificidade foi de 94,7% e 89,9%, respectivamente. O nível de concordância foi maior para o critério IOTF (Kappa=0,70 x Kappa=0,64). Em relação à construção das equações preditivas de gordura corporal, do total de 106 meninos e 112 meninas, foram desenvolvidas duas equações para estimar MG e duas para MLG, considerando o sexo. No sexo masculino, a equação para estimar a MG incluiu as variáveis idade, punho, quadril e perímetro abdominal (R2=0,552; AIC=416,04) e MLG, idade, punho e antebraço (R2=0,869; AIC=578,24). Enquanto que no feminino, MG foi estimada pelas variáveis punho, perímetro do abdômen, do quadril, da coxa proximal e da panturrilha (R2=0,838; AIC=415,36); e a MLG por idade, punho, perímetro do abdômen, do quadril e da panturrilha (R2=0,878; AIC=512,48). Conclui-se que os adolescentes tinham elevada prevalência de excesso de adiposidade corporal e de pressão arterial elevada. Tanto o padrão excesso de adiposidade quanto adiposidade central elevada constituem-se em padrões de risco. O padrão excesso de adiposidade foi associado à pressão arterial, história familiar positiva de FRDCV e maturação sexual em meninos. O critério IOTF mostrou-se menos sensível, mais específico, com maior nível de concordância e maior probabilidade de identificar corretamente o excesso de gordura corporal nos adolescentes avaliados. Quatro equações foram desenvolvidas para a estimativa da MG e MLG em adolescentes. As equações desenvolvidas para estimar a MG no sexo feminino e MLG para ambos os sexos apresentaram valores elevados de coeficiente de determinação ajustados e, portanto, são as preferenciais. Este estudo foi realizado com a participação de equipe multidisciplinar composta por professores da área de Nutrição, Endocrinologia Pediátrica, Estatística, Educação Física, discentes do Curso de Graduação em Nutrição e residentes em Pediatria

Estimação de parâmetros genéticos para produção de leite de cabras da raça Alpina

Foram utilizados 9.374 registros semanais de produção de leite de 302 primeiras lactações de cabras da raça Alpina. A produção de leite no dia do controle foi analisada por meio de um modelo animal, unicarater, de regressão aleatória, em que as funções de covariâncias para os componentes genéticos aditivos e de ambiente permanente foram modeladas por meio das funções de Wilmink, Ali e Schaeffer e por polinômios ortogonais, em uma escala de Legendre de ordens cúbica e quíntica. Assumiu-se, ainda, variância residual homogênea durante toda a lactação e heterogênea com três e quatro classes de variância residual. Os modelos foram comparados pelo critério de informação de Akaike (AIC), pelo critério de informação Bayesiano de Schwar (BIC), pela função de verossimilhança (Ln L), pela visualização das estimativas de variâncias genéticas, de ambiente permanente, fenotípicas e residuais e pelas herdabilidades. O polinômio de Legendre de ordem quíntica, com quatro e três classes de variâncias residuais, e a função de Ali e Schaeffer, com quatro classes de variâncias residuais, foram indicados como os mais adequados pelo AIC, BIC e Ln L. Estes modelos diferiram na partição da variância fenotípica para as variâncias de ambiente permanente, genética e residual apenas no início e no final da lactação. Contudo, a função de Ali e Schaeffer resultou em estimativas negativas de correlação genética entre os controles mais distantes. O polinômio de Legendre de ordem quíntica, assumindo variância residual heterogênea, mostrou-se mais adequado para ajustar a produção de leite no dia do controle de cabras da raça Alpina.

Estimação de parâmetros genéticos para peso do nascimento aos 550 dias de idade para animais da raça Tabapuã utilizando-se modelos de regressão aleatória

Foram utilizados 21.762 registros de peso do nascimento aos 550 dias de idade de 4.221 animais para estimativa das funções de covariância empregando modelos de regressão aleatória. Os modelos incluíram, como aleatórios, os efeitos genéticos aditivo direto e materno, de ambiente permanente de animal e de ambiente permanente materno e, como fixos, os efeitos de grupo contemporâneo, a idade da vaca ao parto (linear e quadrático) e o polinômio ortogonal de Legendre da idade do animal (regressão cúbica), como covariáveis. As variâncias residuais foram modeladas por uma função de variâncias com ordens de 2 a 6. Análises com polinômios ortogonais de diversas ordens foram realizadas para os efeitos genético aditivo direto, genético aditivo materno, de ambiente permanente de animal e de ambiente permanente materno. Os modelos foram comparados pelos critérios de informação Bayesiano de Schwarz (BIC) e Akaike (AIC). O melhor modelo indicado por todos os critérios foi o que considerou o efeito genético aditivo direto ajustado por um polinômio cúbico, o efeito genético materno ajustado por um polinômio quadrático, o efeito de ambiente permanente de animal ajustado por polinômio quártico e o efeito de ambiente permanente materno ajustado por polinômio linear. As estimativas de herdabilidade para o efeito direto foram maiores no início e no final do período estudado, com valores de 0,28 ao nascimento, 0,21 aos 240 dias e 0,24 aos 550 dias de idade. As estimativas de herdabilidade materna foram maiores aos 160 dias de idade (0,10) que nas demais fases do crescimento. As correlações genéticas variaram de moderadas a altas, diminuindo conforme o aumento da distância entre as idades. Maior eficiência na seleção para peso pode ser obtida considerando os pesos pós-desmama, período em que as estimativas de variância genética e herdabilidade foram superiores.

Comparação de modelos de regressão aleatória para estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros

Objetivou-se avaliar a melhor modelagem para as variâncias genética aditiva, de ambiente permanente e residual da produção de leite no dia do controle (PLDC) de caprinos. Utilizaram-se modelos de regressão aleatória sobre polinômios ortogonais de Legendre com diferentes ordens de ajuste e variância residual heterogênea. Consideraram-se como efeitos fixos os efeitos de grupo de contemporâneos, a idade da cabra ao parto (co-variável) e a regressão fixa da PLDC sobre polinômios de Legendre, para modelar a trajetória média da população; e, como efeitos aleatórios, os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente. O modelo com quatro classes de variâncias residuais foi o que proporcionou melhor ajuste. Os valores do logaritmo da função de verossimilhança, de AIC e BIC apontaram para seleção de modelos com ordens mais altas (cinco para o efeito genético e sete para o efeito de ambiente permanente). Entretanto, os autovalores associados às matrizes de co-variâncias entre os coeficientes de regressão indicaram a possibilidade de redução da dimensionalidade. As altas ordens de ajuste proporcionaram estimativas de variâncias genéticas e correlações genéticas e de ambiente permanente que não condizem com o fenômeno biológico estudado. O modelo de quinta ordem para a variância genética aditiva e de sétima ordem para o ambiente permanente foi indicado. Entretanto, um modelo mais parcimonioso, de quarta ordem para o efeito genético aditivo e de sexta ordem para o efeito de ambiente permanente, foi suficiente para ajustar as variâncias nos dados.

Um sistema para estimação da vazão de gás de poços produzindo por Plunger Lift para vaso separador de teste em plataformas de petróleo

This work intends to analyze the behavior of the gas flow of plunger lift wells producing to well testing separators in offshore production platforms to aim a technical procedure to estimate the gas flow during the slug production period. The motivation for this work appeared from the expectation of some wells equipped with plunger lift method by PETROBRAS in Ubarana sea field located at Rio Grande do Norte State coast where the produced fluids measurement is made in well testing separators at the platform. The oil artificial lift method called plunger lift is used when the available energy of the reservoir is not high enough to overcome all the necessary load losses to lift the oil from the bottom of the well to the surface continuously. This method consists, basically, in one free piston acting as a mechanical interface between the formation gas and the produced liquids, greatly increasing the well s lifting efficiency. A pneumatic control valve is mounted at the flow line to control the cycles. When this valve opens, the plunger starts to move from the bottom to the surface of the well lifting all the oil and gas that are above it until to reach the well test separator where the fluids are measured. The well test separator is used to measure all the volumes produced by the well during a certain period of time called production test. In most cases, the separators are designed to measure stabilized flow, in other words, reasonably constant flow by the use of level and pressure electronic controllers (PLC) and by assumption of a steady pressure inside the separator. With plunger lift wells the liquid and gas flow at the surface are cyclical and unstable what causes the appearance of slugs inside the separator, mainly in the gas phase, because introduce significant errors in the measurement system (e.g.: overrange error). The flow gas analysis proposed in this work is based on two mathematical models used together: i) a plunger lift well model proposed by Baruzzi [1] with later modifications made by Bolonhini [2] to built a plunger lift simulator; ii) a two-phase separator model (gas + liquid) based from a three-phase separator model (gas + oil + water) proposed by Nunes [3]. Based on the models above and with field data collected from the well test separator of PUB-02 platform (Ubarana sea field) it was possible to demonstrate that the output gas flow of the separator can be estimate, with a reasonable precision, from the control signal of the Pressure Control Valve (PCV). Several models of the System Identification Toolbox from MATLAB® were analyzed to evaluate which one better fit to the data collected from the field. For validation of the models, it was used the AIC criterion, as well as a variant of the cross validation criterion. The ARX model performance was the best one to fit to the data and, this way, we decided to evaluate a recursive algorithm (RARX) also with real time data. The results were quite promising that indicating the viability to estimate the output gas flow rate from a plunger lift well producing to a well test separator, with the built-in information of the control signal to the PCV

Comparison of non-linear growth models to describe the growth curve in West African Dwarf sheep

The objectives of this study were to compare the goodness of fit of four non-linear growth models, i.e. Brody, Gompertz, Logistic and Von Bertalanffy, in West African Dwarf (WAD) sheep. A total of 5274 monthly weight records from birth up to 180 days of age from 889 lambs, collected during 2001 to 2004 in Betecoucou breeding farm in Benin were used. In the preliminary analysis, the General Linear Model Procedure of the Statistical Analysis Systems Institute was applied to the dataset to identify the significant effects of the sex of lamb (male and female), type of birth (single and twin), season of birth (rainy season and dry season), parity of dam (1, 2 and 3) and year of birth (2001, 2002, 2003 and 2004) on the observed birth weight and monthly weight up to 6 months of age. The models parameters (A, B and k), coefficient of determination (112), mean square error (MSE) were calculated using language of technical computing package Matlab(R), 2006. The mean values of A, B and k were substituted into each model to calculate the corresponding Akaike's Information Criterion (AIC). Among the four growth functions, the Brody model has been selected for its accuracy of fit according to the higher R(2), lower MSE and A/C Finally, the parameters A, B and k were adjusted in Matlab(R) 2006 for the sex of lamb, year of birth, season of birth, birth type and the parity of ewe, providing a specific slope of the Brody growth curve. The results of this study suggest that Brody model can be useful for WAD sheep breeding in Betecoucou farm conditions through growth monitoring.

Estudo das propriedades psicométricas da escala WHOQOLold em idosos da região Nordeste

The population aging process increases the number of elderly people worldwide. In Brazil, a country of continental size, this process began in the 40s and happens with specific features in each of the different region s realities. This way, this thesis aimed to evaluate the psychometric properties of a elderly s quality of life (QOL) scale, the WHOQOL-old, in a population of the Northeast of Brazil. We sought to investigate the congruence between the content covered by the scale and the ones deemed as relevant by the participants. It aimed also study the validity evidences of the instrument s internal structure. To achieve the research objectives we adopted the design of multiple methods. The research was organized in two studies. For data collection, both studies used a sociodemographic questionnaire to obtain a profile of the participants and the Mini Mental State Exam (MMSE), used as exclusion criterion. A number of 18 elderly residents of the cities of Natal-RN and Campina Grande-PB, mean age of 73.3 years (SD = 5.9) took part od the study, They were organized into three focal groups (FG) in witch they discussed about the concept of QOL, what enhance and what hinders QOL. For Study II, a quantitative approach, 335 elderly from Campina Grande responded scale WHOQOL-old. They are between 65 and 99 years (M = 74.17, SD = 6.5). The FG data were analyzed by categorical thematic content. For the data analysis of the WHOQOL-old scale were used exploratory factor analysis and calculation of the Akaike and Bayesian information criteria. The results of both studies were triangulated. According to the discussions in the FG, health and social participation have central roles in quality of life. Social participation is related to all the other QOL s influences raised. The participants indicated the relevance of religiosity and were divided about the importance of sexual activity. Exploratory factor analysis (EFA) extracted a model of six factors. Two items (OLD_3 and OLD_9), not loaded on any factor and were excluded. The other items had factor loadings > 0.3. The response categories were reduced from five to three. After the scale changes, the empirical model showed better fit (-2loglikelihood = 8993.90, BIC and AIC = 9183.90 = 9546.24) than the theoretical model (-2loglikelihood = 18390.88, AIC = 18678.88 and BIC = 19228.11). Despite the best information criterion values, the RMESA remained above the ideal (0.06). We conclude that the WHOQOL-old presents psychometric parameters below the ideal when used with the Northeast population, but the improvements made the scale s use acceptable. The WHOQOL-old uses observable variables that matches with the participants' perceptions on quality of life. However, new strategies must be tested for a better sacale refinement

Choosing between Cox proportional hazards and logistic models for interval-censored data via bootstrap

This work develops a new methodology in order to discriminate models for interval-censored data based on bootstrap residual simulation by observing the deviance difference from one model in relation to another, according to Hinde (1992). Generally, this sort of data can generate a large number of tied observations and, in this case, survival time can be regarded as discrete. Therefore, the Cox proportional hazards model for grouped data (Prentice & Gloeckler, 1978) and the logistic model (Lawless, 1982) can befitted by means of generalized linear models. Whitehead (1989) considered censoring to be an indicative variable with a binomial distribution and fitted the Cox proportional hazards model using complementary log-log as a link function. In addition, a logistic model can be fitted using logit as a link function. The proposed methodology arises as an alternative to the score tests developed by Colosimo et al. (2000), where such models can be obtained for discrete binary data as particular cases from the Aranda-Ordaz distribution asymmetric family. These tests are thus developed with a basis on link functions to generate such a fit. The example that motivates this study was the dataset from an experiment carried out on a flax cultivar planted on four substrata susceptible to the pathogen Fusarium oxysoprum. The response variable, which is the time until blighting, was observed in intervals during 52 days. The results were compared with the model fit and the AIC values.

Non-stationary frequency analysis of extreme daily rainfall in São Paulo, Brazil

This work is an assessment of frequency of extreme values (EVs) of daily rainfall in the city of São Paulo. Brazil, over the period 1933-2005, based on the peaks-over-threshold (POT) and Generalized Pareto Distribution (GPD) approach. Usually. a GPD model is fitted to a sample of POT Values Selected With a constant threshold. However. in this work we use time-dependent thresholds, composed of relatively large p quantities (for example p of 0.97) of daily rainfall amounts computed from all available data. Samples of POT values were extracted with several Values of p. Four different GPD models (GPD-1, GPD-2, GPD-3. and GDP-4) were fitted to each one of these samples by the maximum likelihood (ML) method. The shape parameter was assumed constant for the four models, but time-varying covariates were incorporated into scale parameter of GPD-2. GPD-3, and GPD-4, describing annual cycle in GPD-2. linear trend in GPD-3, and both annual cycle and linear trend in GPD-4. The GPD-1 with constant scale and shape parameters is the simplest model. For identification of the best model among the four models WC used rescaled Akaike Information Criterion (AIC) with second-order bias correction. This criterion isolates GPD-3 as the best model, i.e. the one with positive linear trend in the scale parameter. The slope of this trend is significant compared to the null hypothesis of no trend, for about 98% confidence level. The non-parametric Mann-Kendall test also showed presence of positive trend in the annual frequency of excess over high thresholds. with p-value being virtually zero. Therefore. there is strong evidence that high quantiles of daily rainfall in the city of São Paulo have been increasing in magnitude and frequency over time. For example. 0.99 quantiles of daily rainfall amount have increased by about 40 mm between 1933 and 2005. Copyright (C) 2008 Royal Meteorological Society

Growth and home range size of the gracile mouse opossum Gracilinanus microtarsus (Marsupialia: Didelphidae) in Brazilian cerrado

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)