Computational statistics, electronic publishing, and access to research data

Abstract not available

Analysis of Federal Policy on Public Access to Scientific Research Data

Presentation from the MARAC conference in Pittsburgh, PA on April 14–16, 2016. S13 - Student Poster Session; Analysis of Federal Policy on Public Access to Scientific Research Data

Towards reliable data - counting the Finnish Open Access publications

Presentation at the CRIS2016 conference in St Andrews, June 10, 2016

Meeting on Provisions in Licensing Incorporating new developments in daily licensing practice: Setting conditions for open access, patron driven access, and data & text mining

Following the workshop on new developments in daily licensing practice in November 2011, we brought together fourteen representatives from national consortia (from Denmark, Germany, Netherlands and the UK) and publishers (Elsevier, SAGE and Springer) met in Copenhagen on 9 March 2012 to discuss provisions in licences to accommodate new developments. The one day workshop aimed to: present background and ideas regarding the provisions KE Licensing Expert Group developed; introduce and explain the provisions the invited publishers currently use;ascertain agreement on the wording for long term preservation, continuous access and course packs; give insight and more clarity about the use of open access provisions in licences; discuss a roadmap for inclusion of the provisions in the publishers’ licences; result in report to disseminate the outcome of the meeting. Participants of the workshop were: United Kingdom: Lorraine Estelle (Jisc Collections) Denmark: Lotte Eivor Jørgensen (DEFF), Lone Madsen (Southern University of Denmark), Anne Sandfær (DEFF/Knowledge Exchange) Germany: Hildegard Schaeffler (Bavarian State Library), Markus Brammer (TIB) The Netherlands: Wilma Mossink (SURF), Nol Verhagen (University of Amsterdam), Marc Dupuis (SURF/Knowledge Exchange) Publishers: Alicia Wise (Elsevier), Yvonne Campfens (Springer), Bettina Goerner (Springer), Leo Walford (Sage) Knowledge Exchange: Keith Russell The main outcome of the workshop was that it would be valuable to have a standard set of clauses which could used in negotiations, this would make concluding licences a lot easier and more efficient. The comments on the model provisions the Licensing Expert group had drafted will be taken into account and the provisions will be reformulated. Data and text mining is a new development and demand for access to allow for this is growing. It would be easier if there was a simpler way to access materials so they could be more easily mined. However there are still outstanding questions on how authors of articles that have been mined can be properly attributed.

[access To Information About How To Prevent Oral Problems Among School Children In The Public School Network].

The scope of this study is to identify the prevalence of access to information about how to prevent oral problems among schoolchildren in the public school network, as well as the factors associated with such access. This is a cross-sectional and analytical study conducted among 12-year-old schoolchildren in a Brazilian municipality with a large population. The examinations were performed by 24 trained dentists and calibrated with the aid of 24 recorders. Data collection occurred in 36 public schools selected from the 89 public schools of the city. Descriptive, univariate and multiple analyses were conducted. Of the 2510 schoolchildren included in the study, 2211 reported having received information about how to prevent oral problems. Access to such information was greater among those who used private dental services; and lower among those who used the service for treatment, who evaluated the service as regular or bad/awful. The latter use toothbrush only or toothbrush and tongue scrubbing as a means of oral hygiene and who reported not being satisfied with the appearance of their teeth. The conclusion drawn is that the majority of schoolchildren had access to information about how to prevent oral problems, though access was associated with the characteristics of health services, health behavior and outcomes.

Inequalities in access and utilization of dental services: a cross-sectional study in an area covered by the Family Health Strategy

This cross-sectional study aimed to investigate the presence of inequalities in the access and use of dental services for people living in the coverage area of the Family Health Strategy (FHS) in Ponta Grossa, Paraná State, Brazil, and to assess individual determinants related to them. The sample consisted of 747 individuals who answered a pre-tested questionnaire. Data analysis was performed by chi-square test and Poisson regression analysis, obtaining explanatory models for recent use and, by limiting the analysis to those who sought dental care, for effective access. Results showed that 41% of the sample had recent dental visits. The lowest visit rates were observed among preschoolers and elderly people. The subjects who most identified the FHS as a regular source of dental care were children. Besides age, better socioeconomic conditions and the presence of a regular source of dental care were positively associated to recent dental visits. We identified inequalities in use and access to dental care, reinforcing the need to promote incentives to improve access for underserved populations.

A framework for selecting appropriate remotely sensed data dimensions for environmental monitoring and management

Two major factors are likely to impact the utilisation of remotely sensed data in the near future: (1)an increase in the number and availability of commercial and non-commercial image data sets with a range of spatial, spectral and temporal dimensions, and (2) increased access to image display and analysis software through GIS. A framework was developed to provide an objective approach to selecting remotely sensed data sets for specific environmental monitoring problems. Preliminary applications of the framework have provided successful approaches for monitoring disturbed and restored wetlands in southern California.

Molecular immunology databases and data repositories

Over recent years databases have become an extremely important resource for biomedical research. Immunology research is increasingly dependent on access to extensive biological databases to extract existing information, plan experiments, and analyse experimental results. This review describes 15 immunological databases that have appeared over the last 30 years. In addition, important issues regarding database design and the potential for misuse of information contained within these databases are discussed. Access pointers are provided for the major immunological databases and also for a number of other immunological resources accessible over the World Wide Web (WWW). (C) 2000 Elsevier Science B.V. All rights reserved.

Does health service utilisation vary by remoteness? South Australian population data and the Accessibility and Remoteness Index of Australia

Objective: To compare rates of self-reported use of health services between rural, remote and urban South Australians. Methods: Secondary data analysis from a population-based survey to assess health and well-being, conducted in South Australia in 2000. In all, 2,454 adults were randomly selected and interviewed using the computer-assisted telephone interview (CATI) system. We analysed health service use by Accessibility and Remoteness Index of Australia (ARIA) category. Results: There was no statistically significant difference in the median number of uses of the four types of health services studied across ARIA categories. Significantly fewer residents of highly accessible areas reported never using primary care services (14.4% vs. 22.2% in very remote areas), and significantly more reported high use ( greater than or equal to6 visits, 29.3% vs. 21.5%). Fewer residents of remote areas reported never attending hospital (65.6% vs. 73.8% in highly accessible areas). Frequency of use of mental health services was not statistically significantly different across ARIA categories. Very remote residents were more likely to spend at least one night in a public hospital (15.8%) than were residents of other areas (e.g. 5.9% for highly accessible areas). Conclusion: The self-reported frequency of use of a range of health services in South Australia was broadly similar across ARIA categories. However, use of primary care services was higher among residents of highly accessible areas and public hospital use increased with increasing remoteness. There is no evidence for systematic rural disadvantage in terms of self-reported health service utilisation in this State.

Improving access to evidence-based mental health care: general practitioners and allied health professionals collaborate

This study evaluated whether projects conducted through the Access to Allied Health Services component of the Australian Better Outcomes in Mental Health Care initiative are improving access to evidence-based, non-pharmacological therapies for people with depression and anxiety. Synthesising data from the first 29 projects funded through the initiative, the study found that the models utilised in the projects have evolved over time. The projects have achieved a high level uptake; at a conservative estimate, 710 GPs and 160 allied health professionals (AHPs) have provided care to 3,476 consumers. The majority of these consumers have depression (77%) and/or anxiety disorders (55%); many are low income earners (57%); and a number have not previously accessed mental health care (40%). The projects have delivered 8,678 sessions of high quality care to these consumers, most commonly providing CBT-based cognitive and behavioural interventions (55% and 41%, respectively). In general, GPs, AHPs and consumers are sanguine about the projects, and have reported positive consumer outcomes. However, as with any new initiative, there are some practical and professional issues that need to be addressed. The projects are improving access to evidence-based, non-pharmacological therapies. The continuation and expansion of the initiative should be a priority.

Comparative Prevalence, Correlates of Impairment, and Service Utilization for Eating Disorders Across US Ethnic Groups: Implications for Reducing Ethnic Disparities in Health Care Access for Eating Disorders

Objective: The study compared the prevalence, correlates of functional impairment, and service utilization for eating disorders across Latinos, Asians, and African Americans living in the United States to non-Latino Whites. Method: Pooled data from the NIMH Collaborative Psychiatric Epidemiological Studies (CPES; NIMH, 2007) were used. Results: The prevalence of anorexia nervosa (AN) and binge-eating disorder (BED) were similar across all groups examined, but bulimia nervosa (BN) was more prevalent among Latinos and African Americans than non-Latino Whites. Despite similar prevalence of BED among ethnic groups examined, lifetime prevalence of any binge eating (ABE) was greater among each of the ethnic minority groups in comparison to non-Latino Whites. Lifetime prevalence of mental health service utilization was lower among ethnic minority groups studied than for non-Latino Whites for respondents with a lifetime history of any eating disorder. Discussion: These findings suggest the need for clinician training and health policy interventions to achieve optimal and equitable care for eating disorders across all ethnic groups in the United States. (C) 2010 by Wiley Periodicals, Inc.

New species of Bakeriella (Hymenoptera, Bethylidae) from the New World and new data on geographic distribution

Bakeriella lata sp. nov. (Brazil, Rondônia), Bakeriella aurata sp. nov. (Brazil, Amazonas) and Bakeriella sulcaticeps sp. nov. (Brazil, Amazonas) are described and illustrated. New geographic records and variation data for B. cristata Evans, 1964, B. floridana Evans, 1964, B. flavicornis Kieffer, 1910, B. incompleta Azevedo, 1994, B. mira Evans, 1997, B. montivaga (Kieffer, 1910), B. olmeca Evans, 1964 and B. subcarinata Evans, 1965 are provided. The male of B. incompleta is described for the first time.

Preliminary clinical trial in percutaneous nephrolithotomy using a real-time navigation system for percutaneous kidney access

Background: Precise needle puncture of renal calyces is a challenging and essential step for successful percutaneous nephrolithotomy. This work tests and evaluates, through a clinical trial, a real-time navigation system to plan and guide percutaneous kidney puncture. Methods: A novel system, entitled i3DPuncture, was developed to aid surgeons in establishing the desired puncture site and the best virtual puncture trajectory, by gathering and processing data from a tracked needle with optical passive markers. In order to navigate and superimpose the needle to a preoperative volume, the patient, 3D image data and tracker system were previously registered intraoperatively using seven points that were strategically chosen based on rigid bone structures and nearby kidney area. In addition, relevant anatomical structures for surgical navigation were automatically segmented using a multi-organ segmentation algorithm that clusters volumes based on statistical properties and minimum description length criterion. For each cluster, a rendering transfer function enhanced the visualization of different organs and surrounding tissues. Results: One puncture attempt was sufficient to achieve a successful kidney puncture. The puncture took 265 seconds, and 32 seconds were necessary to plan the puncture trajectory. The virtual puncture path was followed correctively until the needle tip reached the desired kidney calyceal. Conclusions: This new solution provided spatial information regarding the needle inside the body and the possibility to visualize surrounding organs. It may offer a promising and innovative solution for percutaneous punctures.

WPAC: wireless payment and access control: dispositivos móveis no pagamento de serviços e controlo de acessos

A rápida evolução dos dispositivos móveis e das tecnologias de comunicação sem fios transformou o telemóvel num poderoso dispositivo de computação móvel. A necessidade de estar sempre contactável, comum à civilização moderna, tem aumentado a dependência deste dispositivo, sendo transportado pela maioria das pessoas num ambiente urbano e assumindo um papel talvez mais importante que a própria carteira. A ubiquidade e capacidade de computação dos telemóveis aumentam o interesse no desenvolvimento de serviços móveis, além de tradicionais serviços de voz. Um telemóvel pode em breve tornar-se um elemento activo nas nossas tarefas diárias, servindo como um instrumento de pagamento e controlo de acessos, proporcionando assim novas interfaces para serviços existentes. A unificação de vários serviços num único dispositivo é um desafio que pode simplificar a nossa rotina diária e aumentar o conforto, no limite deixaremos de necessitar de dinheiro físico, cartões de crédito ou débito, chaves de residência e de veículos automóveis, ou inclusive documentos de identificação como bilhetes de identidade ou passaportes. O interesse demonstrado pelos intervenientes, desde os fabricantes de telemóveis e operadores de rede móvel até às instituições financeiras, levaram ao aparecimento de múltiplas soluções de serviços móveis. Porém estas soluções respondem geralmente a problemas específicos, apenas contemplando um fornecedor de serviços ou uma determinada operação de pagamento, como seja a compra de bilhetes ou pagamento de estacionamento. Estas soluções emergentes consistem também tipicamente em especificações fechadas e protocolos proprietários. A definição de uma arquitectura genérica, aberta interoperável e extensível é necessária para que os serviços móveis possam ser adoptados de uma forma generalizada por diferentes fornecedores de serviços e para diversos tipos de pagamento. A maior parte das soluções actuais de pagamento móvel depende de comunicações através da rede móvel, algumas utilizam o telemóvel apenas como uma interface de acesso à internet enquanto outras possibilitam o envio de um SMS (Short Message Service) para autorizar uma transacção, o que implica custos de comunicação em todas as operações de pagamento. Este custo de operação torna essas soluções inadequadas para a realização de micropagamentos e podem por isso ter uma aceitação limitada por parte dos clientes. As soluções existentes focam-se maioritariamente em pagamentos à distância, não tirando partido das características do pagamento presencial e não oferecendo por isso uma verdadeira alternativa ao modelo actual de pagamento com cartões de crédito/débito. As capacidades computacionais dos telemóveis e suporte de diversos protocolos de comunicação sem fio local não têm sido aproveitadas, vendo o telemóvel apenas como um terminal GSM (Global System for Mobile Communications) e não oferecendo serviços adicionais como seja a avaliação dinâmica de risco ou controlo de despesas. Esta dissertação propõe e valida, através de um demonstrador, uma aquitectua aberta para o pagamento e controlo de acesso baseado em dispositivos móveis, intitulada WPAC (Wireless Payment and Access Control). Para chegar à solução apresentada foram estudadas outras soluções de pagamento, desde o aparecimento dos cartões de débito até a era de pagamentos electrónicos móveis, passando pelas soluções de pagamento através da internet. As capacidades dos dispositivos móveis, designadamente os telemóveis, e tecnologias de comunicação sem fios foram também analisadas a fim de determinar o estado tecnológico actual. A arquitectura WPAC utiliza padrões de desenho utilizados pela indústria em soluções de sucesso, a utilização de padrões testados e a reutilização de soluções com provas dadas permite aumentar a confiança nesta solução, um destes exemplos é a utilização de uma infra-estrutura de chave pública para o estabelecimento de um canal de comunicação seguro. Esta especificação é uma arquitectura orientada aos serviços que utiliza os Web Services para a definição do contracto do serviço de pagamento. A viabilidade da solução na orquestração de um conjunto de tecnologias e a prova de conceito de novas abordagens é alcançada com a construção de um protótipo e a realização de testes. A arquitectura WPAC possibilita a realização de pagamentos móveis presenciais, isto é, junto do fornecedor de bens ou serviços, seguindo o modelo de pagamento com cartões de crédito/débito no que diz respeito aos intervenientes e relações entre eles. Esta especificação inclui como aspecto inovador a avaliação dinâmica de risco, que utiliza o valor do pagamento, a existência de pagamentos frequentes num período curto de tempo, e a data, hora e local do pagamento como factores de risco; solicitando ao cliente o conjunto de credenciais adequado ao risco avaliado, desde códigos pessoais a dados biométricos. É também apresentada uma alternativa ao processo normal de pagamento, que apesar de menos cómoda permite efectuar pagamentos quando não é possível estabelecer um canal de comunicação sem fios, aumentando assim a tolerância a falhas. Esta solução não implica custos de operação para o cliente na comunicação com o ponto de venda do comerciante, que é realizada através de tecnologias de comunicação local sem fios, pode ser necessária a comunicação através da rede móvel com o emissor do agente de pagamento para a actualização do agente de software ou de dados de segurança, mas essas transmissões são ocasionais. O modelo de segurança recorre a certificados para autenticação dos intervenientes e a uma infra-estrutura de chave pública para cifra e assinatura de mensagens. Os dados de segurança incluídos no agente de software móvel, para desabilitar a cópia ou corrupção da aplicação mas também para a comparação com as credenciais inseridas pelo cliente, devem igualmente ser encriptados e assinados de forma a garantir a sua confidencialidade e integridade. A arquitectura de pagamento utiliza o standard de Web Services, que é amplamente conhecido, aberto e interoperável, para definição do serviço de pagamento. Existem extensões à especificação de Web Services relativas à segurança que permitem trocar itens de segurança e definem o modo de cifra e assinatura de mensagens, possibilitando assim a sua utilização em aplicações que necessitem de segurança como é o caso de serviços de pagamento e controlo de acesso. O contracto de um Web Service define o modo de invocação dos serviços, transmissão de informação e representação de dados, sendo normalmente utilizado o protocolo SOAP que na prática não é mais que um protocolo de troca de mansagens XML (eXtensible Markup Language). O envio e recepção de mensagens XML; ou seja, a transmissão de simples sequências de caracteres, é suportado pela maioria dos protocolos de comunicação, sendo portanto uma solução abrangente que permite a adopção de diversas tecnologias de comunicação sem fios. O protótipo inclui um agente de software móvel, implementado sobre a forma de uma MIDlet, aplicação Java para dispositivos móveis, que implementa o protocolo de pagamento comunicando sobre uma ligação Bluetooth com o ponto de venda do comerciante, simulado por uma aplicação desenvolvida sobre a plataforma .NET e que por isso faz prova da heterogeneidade da solução. A comunicação entre o comerciante e o seu banco para autorização do pagamento e transferência monetária utiliza o protocolo existente para a autorização de pagamentos, com base em cartões de crédito/débito. A definição desta especificação aberta e genérica em conjunto com o forte interesse demonstrado pelos intervenientes, proporciona uma boa perspectiva em termos de adopção da solução, o que pode impulsionar a implementação de serviços móveis e dessa forma simplificar as rotinas diárias das pessoas. Soluções móveis de pagamento reduzem a necessidade de transportar vários cartões de crédito/débito na nossa carteira. A avaliação dinâmica de risco permite aumentar a segurança dos pagamentos, com a solicitação de mais credenciais ao cliente para pagamentos com um maior risco associado, sendo um ponto importante quer para os clientes quer para as instituições financeiras pois diminui o risco de fraude e aumenta a confiança no sistema. Esta solução de pagamento electrónico pode também facilitar a consulta de pagamentos efectuados e saldos, mantendo um histórico dos movimentos, o que não é possível nos cartões de crédito/débito sem uma visita a uma ATM (Automated Teller Machine) ou utilização de homebanking.

Cluster Analysis of Business Data

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