Evaluation of three field monitoring-density estimation protocols and their relevance to Komodo dragon conservation

Finding practical ways to robustly estimate abundance or density trends in threatened species is a key facet for effective conservation management. Further identifying less expensive monitoring methods that provide adequate data for robust population density estimates can facilitate increased investment into other conservation initiatives needed for species recovery. Here we evaluated and compared inference-and cost-effectiveness criteria for three field monitoring-density estimation protocols to improve conservation activities for the threatened Komodo dragon (Varanus komodoensis). We undertook line-transect counts, cage trapping and camera monitoring surveys for Komodo dragons at 11 sites within protected areas in Eastern Indonesia to collect data to estimate density using distance sampling methods or the Royle-Nichols abundance induced heterogeneity model. Distance sampling estimates were considered poor due to large confidence intervals, a high coefficient of variation and that false absences were obtained in 45 % of sites where other monitoring methods detected lizards present. The Royle-Nichols model using presence/absence data obtained from cage trapping and camera monitoring produced highly correlated density estimates, obtained similar measures of precision and recorded no false absences in data collation. However because costs associated with camera monitoring were considerably less than cage trapping methods, albeit marginally more expensive than distance sampling, better inference from this method is advocated for ongoing population monitoring of Komodo dragons. Further the cost-savings achieved by adopting this field monitoring method could facilitate increased expenditure on alternative management strategies that could help address current declines in two Komodo dragon populations.

Estimating animal populations and body sizes from burrows: marine ecologists have their heads buried in the sand

Most ecological studies require knowledge of animal abundance, but it can be challenging and destructive of habitat to obtain accurate density estimates for cryptic species, such as crustaceans that tunnel deeply into the seafloor, beaches, or mudflats. Such fossorial species are, however, widely used in environmental impact assessments, requiring sampling techniques that are reliable, efficient, and environmentally benign for these species and environments.2.Counting and measuring the entrances of burrows made by cryptic species is commonly employed to index population and body sizes of individuals. The fundamental premise is that burrow metrics consistently predict density and size. Here we review the evidence for this premise. We also review criteria for selecting among sampling methods: burrow counts, visual censuses, and physical collections.3.A simple 1:1 correspondence between the number of holes and population size cannot be assumed. Occupancy rates, indexed by the slope of regression models, vary widely between species and among sites for the same species. Thus, 'average' or 'typical' occupancy rates should not be extrapolated from site- or species specific field validations and then be used as conversion factors in other situations.4.Predictions of organism density made from burrow counts often have large uncertainty, being double to half of the predicted mean value. Whether such prediction uncertainty is 'acceptable' depends on investigators' judgements regarding the desired detectable effect sizes.5.Regression models predicting body size from burrow entrance dimensions are more precise, but parameter estimates of most models are specific to species and subject to site-to-site variation within species.6.These results emphasise the need to undertake thorough field validations of indirect census techniques that include tests of how sensitive predictive models are to changes in habitat conditions or human impacts. In addition, new technologies (e.g. drones, thermal-, acoustic- or chemical sensors) should be used to enhance visual census techniques of burrows and surface-active animals.

Estimating abundance and spatial distribution patterns of the bubble crab Dotilla fenestrata (Crustacea : Brachyura)

The bubble crab Dotilla fenestrata forms very dense populations on the sand flats of the eastern coast of Inhaca Island, Mozambique, making it an interesting biological model to examine spatial distribution patterns and test the relative efficiency of common sampling methods. Due to its apparent ecological importance within the sandy intertidal community, understanding the factors ruling the dynamics of Dotilla populations is also a key issue. In this study, different techniques of estimating crab density are described, and the trends of spatial distribution of the different population categories are shown. The studied populations are arranged in discrete patches located at the well-drained crests of nearly parallel mega sand ripples. For a given sample size, there was an obvious gain in precision by using a stratified random sampling technique, considering discrete patches as strata, compared to the simple random design. Density average and variance differed considerably among patches since juveniles and ovigerous females were found clumped, with higher densities at the lower and upper shore levels, respectively. Burrow counting was found to be an adequate method for large-scale sampling, although consistently underestimating actual crab density by nearly half. Regression analyses suggested that crabs smaller than 2.9 mm carapace width tend to be undetected in visual burrow counts. A visual survey of sampling plots over several patches of a large Dotilla population showed that crab density varied in an interesting oscillating pattern, apparently following the topography of the sand flat. Patches extending to the lower shore contained higher densities than those mostly covering the higher shore. Within-patch density variability also pointed to the same trend, but the density increment towards the lowest shore level varied greatly among the patches compared.

Spatial analysis of the distribution of Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) and losses in maize crop productivity using geostatistics

A lagarta-do-cartucho, Spodoptera frugiperda (J.E. Smith), é uma das principais pragas do milho nas Américas. O estudo de sua distribuição espacial é fundamental para a utilização de estratégias de controle, otimização de técnicas de amostragens, determinação de danos econômicos e incorporação de um programa de agricultura de precisão. em uma área cultivada com milho foram realizadas amostragens com intervalo semanal, correspondendo ao estádio vegetativo que compreende desde a germinação até o pendoamento. Foram amostradas 10 plantas ao acaso por parcela, no total de 2000 plantas em cada amostragem. A produtividade foi obtida através da colheita de todas as parcelas que eram pesadas separadamente no campo e em cada parcela foram coletadas 15 espigas aleatoriamente para estimar o comprimento e o diâmetro médio. As análises espaciais, utilizando geoestatística, mostraram que o modelo esférico apresentou o melhor ajuste às lagartas pequenas. À medida que as lagartas foram se desenvolvendo sua distribuição foi tornando aleatória, representada por um modelo ajustado por uma reta, não tendo sido detectado nenhum tipo de dependência espacial nos pontos de amostragem. A produtividade e o diâmetro e comprimento da espiga foram descritos por modelos esféricos, indicando uma variabilidade espacial nos parâmetros de produtividade na área cultivada. A geoestatística mostrou-se promissora para a aplicação de métodos precisos no controle integrado de pragas.

FLUTUAÇÃO POPULACIONAL DE Dione juno juno (Cramer, 1779) (Lepidoptera: Nymphalidae) em MARACUJAZEIROS (Passiflora spp.), MÉTODOS DE AMOSTRAGEM E RESISTÊNCIA DE GENÓTIPOS

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Avaliação da ocorrência sazonal de percevejos em cinco espécies de maracujazeiro, utilizando dois métodos de amostragem

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Amostragem, diversidade e sazonalidade de Hemerobiidae (Neuroptera) em Coffea arabica L. cv. Obatã (Rubiaceae)

Este estudo teve por objetivo avaliar métodos de amostragem, abundância sazonal e diversidade da população de Hemerobiidae associada a cultivo de café Coffea arabica L. cv. Obatã em Cravinhos, São Paulo, Brasil. Para tanto foram realizadas amostragens semanais no período de maio de 2005 a abril de 2006. Os métodos de amostragem utilizados foram: rede de varredura e armadilhas de Möericke e luminosa. Foram coletados 491 exemplares de Hemerobiidae pertencentes a quatro gêneros: Nusalala (231 espécimes / 47,2% do total de hemerobiídeos coletados), Megalomus (110 / 22,5%), Hemerobius (104 / 21,3%) e Sympherobius (44 / 9%). A rede de varredura foi a mais eficiente para a captura de Hemerobiidae e a armadilha de Möericke foi o método de amostragem que apresentou os maiores valores de diversidade (H'= 0,56) e de equitabilidade (J= 0,93). Os hemerobiídeos estiveram presentes na área estudada durante o ano todo; as maiores freqüências foram registradas entre agosto e março (final do inverno, primavera e verão) e o maior pico populacional ocorreu em janeiro (na metade do verão). Megalomus apresentou correlação positiva e significativa (p< 0,05) com a precipitação pluviométrica e as temperaturas máxima e mínima; Nusalala com as temperaturas máxima e mínima e, Sympherobius apenas com a temperatura máxima.

Degradação in situ da matéria seca e da fração fibrosa do capim marandu obtido por diferentes métodos de amostragem, no período seco do ano

Este trabalho foi realizado na Faculdade de Ciências Agrárias Veterinárias - Unesp - Jaboticabal e foi conduzido, com o objetivo de avaliar a influência do método de amostragem do pasto sobre a degradabilidade in situ da matéria seca e da fração fibrosa de capim Marandu, colhido no período seco dos anos de 2003 e 2005. O experimento foi instalado em delineamento de blocos casualizados com parcela subdividida, com três repetições, representadas pelos piquetes amostrados. Nas parcelas, foram avaliados cinco métodos de amostragens de forragem (método do quadrado metálico; método de avaliação através de extrusa de bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio de extrusa de bovino Cruzado (Red Angus x Nelore); método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino Cruzado (Red Angus x Nelore) e as subparcelas foram constituídas pelos anos de amostragem, 2003 e 2005. Foram determinadas as frações da cinética ruminal: solúvel A; insolúvel potencialmente degradável B; taxa de degradação Kd; degradação potencial (DP) e fração não degradável C da MS e degradação potencial (DP), fração não degradável C e taxa de degradação Kd da FDN e da FDA. de acordo com os resultados obtidos, observou-se que o método do quadrado metálico subestimou as características da degradação do capim. Os métodos do pastejo simulado se assemelharam muito ao das extrusas, no entanto, a prática do simulador é que assegurou a amostragem eficiente, conforme foi constatado pelos dados obtidos no ano de 2003 e 2005.

The validity of n-alkanes to estimate intake and digestibility in Nellore beef cattle fed a tropical grass (Brachiaria brizantha cv. Marandu)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Species composition and spatial distribution of a stream fish assemblage in the east coast of Brazil: comparison of two field study methodologies

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Amphibians and reptiles from a highly diverse area of the Caatinga domain: composition and conservation implications

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Lagartos (Squamata: Lacertilia) em áreas de floresta e de pastagem em Espigão do Oeste, Rondônia, sudoeste da Amazônia, Brasil

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Social Wasp Diversity (Vespidae, Polistinae) in a Forest Fragment in the Northeast of São Paulo State Sampled with Different Methodologies

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Herpetofauna em uma área de Floresta Atlântica na Ilha Anchieta, município de Ubatuba, sudeste do Brasil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Métodos de amostragem e avaliação utilizados em estudos fenológicos de florestas tropicais

Nos últimos 30 anos não foram levadas em consideração questões metodológicas importantes relativas ao estudo da fenologia de plantas. O uso de vários métodos na amostragem e avaliação dos dados fenológicos tem levado a uma grande dificuldade na interpretação e comparação de resultados. Esse estudo tem por objetivos realizar uma revisão da literatura em fenologia de florestas tropicais, compilando informações sobre os métodos de amostragem e avaliação utilizados, e discutir as proporções em que foram utilizados e as aplicações de cada método. Nos 60 estudos avaliados, os métodos de amostragem encontrados distribuem-se da seguinte forma: trilhas (20%), transecções (18%), parcelas (15%), coletores (10%), sendo que 37% dos estudos não definiram o método de amostragem utilizado. Para avaliação fenológica foram levantados dois métodos: qualitativo, presença e ausência das fenofases (20%) e quantitativo com quantificação da intensidade das fenofases (62%), e a combinação entre métodos qualitativos e quantitativos (17%). Ao longo do tempo cresceu a preocupação com a aplicação de métodos de amostragem e de avaliação quantitativa. Entretanto, a falta de padronização no uso desses métodos, mesmo nos dias atuais, ainda se faz presente, resultando na impossibilidade de comparação adequada dos estudos. É imprescindível, portanto, a realização de estudos comparativos de métodos fenológicos com espécies arbóreas em florestas tropicais.