Effect of air-drying pre-treatment on the characterization of forest soil carbon pools

Archived soils could represent a valuable resource for the spatio-temporal inventory of soil carbon stability. However, archived soils are usually air-dried before storage and the impact of a drying pretreatment on physically and chemically-defined C fractions has not yet been fully assessed. Through the comparison of field-moist and corresponding air-dried (at 25oC for 2 weeks) forest soil samples, we examined the effect of air-drying on: a) the quantity and the quality of cold- (CWEC) and hot-water (HWEC) extractable C and b) the concentration of C in physically isolated fractions (free- and intra-aggregate light and organo-mineral). Soil samples were collected from the organic (O) and mineral (A and B) horizons of three different forest soils from southeastern England: (i) Cambisol under Pine (Pinus nigra); (ii) Cambisol under Beech (Fagus sylvatica) and (iii) Gleysol under oak (Quercus robur). CWEC concentrations for dry samples were up to 2 times greater than for corresponding field moist samples and had significantly (p < 0.001) higher phenolic content. However, the effect of drying pretreatment on HWEC, its phenolic content was not significant (p > 0.05) for most samples. Dried soils had significantly (p < 0.001) higher concentrations of free light-C while having lower concentrations of intra-aggregate-C when compared to moist samples (p < 0.001). However, fine silt and clay fractions were not significantly affected by the drying pretreatment (p=0.789). Therefore, based on the results obtained from gleysol and cambisol forest soils studied here, C contents in hot-water extractions and fine particle size physical fractions (< 25µm) seem to be robust measurements for evaluating C fractions in dried stored forest soils. Further soil types should be tested to evaluate the wider generality of these findings.

Discovering biomarkers for antidepressant response: protocol from the Canadian biomarker integration network in depression (CAN-BIND) and clinical characteristics of the first patient cohort

Background Major Depressive Disorder (MDD) is among the most prevalent and disabling medical conditions worldwide. Identification of clinical and biological markers (“biomarkers”) of treatment response could personalize clinical decisions and lead to better outcomes. This paper describes the aims, design, and methods of a discovery study of biomarkers in antidepressant treatment response, conducted by the Canadian Biomarker Integration Network in Depression (CAN-BIND). The CAN-BIND research program investigates and identifies biomarkers that help to predict outcomes in patients with MDD treated with antidepressant medication. The primary objective of this initial study (known as CAN-BIND-1) is to identify individual and integrated neuroimaging, electrophysiological, molecular, and clinical predictors of response to sequential antidepressant monotherapy and adjunctive therapy in MDD. Methods CAN-BIND-1 is a multisite initiative involving 6 academic health centres working collaboratively with other universities and research centres. In the 16-week protocol, patients with MDD are treated with a first-line antidepressant (escitalopram 10–20 mg/d) that, if clinically warranted after eight weeks, is augmented with an evidence-based, add-on medication (aripiprazole 2–10 mg/d). Comprehensive datasets are obtained using clinical rating scales; behavioural, dimensional, and functioning/quality of life measures; neurocognitive testing; genomic, genetic, and proteomic profiling from blood samples; combined structural and functional magnetic resonance imaging; and electroencephalography. De-identified data from all sites are aggregated within a secure neuroinformatics platform for data integration, management, storage, and analyses. Statistical analyses will include multivariate and machine-learning techniques to identify predictors, moderators, and mediators of treatment response. Discussion From June 2013 to February 2015, a cohort of 134 participants (85 outpatients with MDD and 49 healthy participants) has been evaluated at baseline. The clinical characteristics of this cohort are similar to other studies of MDD. Recruitment at all sites is ongoing to a target sample of 290 participants. CAN-BIND will identify biomarkers of treatment response in MDD through extensive clinical, molecular, and imaging assessments, in order to improve treatment practice and clinical outcomes. It will also create an innovative, robust platform and database for future research.

Avaliação da ocorrência sazonal de percevejos em cinco espécies de maracujazeiro, utilizando dois métodos de amostragem

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Degradação in situ da matéria seca e da fração fibrosa do capim marandu obtido por diferentes métodos de amostragem, no período seco do ano

Este trabalho foi realizado na Faculdade de Ciências Agrárias Veterinárias - Unesp - Jaboticabal e foi conduzido, com o objetivo de avaliar a influência do método de amostragem do pasto sobre a degradabilidade in situ da matéria seca e da fração fibrosa de capim Marandu, colhido no período seco dos anos de 2003 e 2005. O experimento foi instalado em delineamento de blocos casualizados com parcela subdividida, com três repetições, representadas pelos piquetes amostrados. Nas parcelas, foram avaliados cinco métodos de amostragens de forragem (método do quadrado metálico; método de avaliação através de extrusa de bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio de extrusa de bovino Cruzado (Red Angus x Nelore); método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino da raça Nelore; método de avaliação por meio do pastejo, simulando bovino Cruzado (Red Angus x Nelore) e as subparcelas foram constituídas pelos anos de amostragem, 2003 e 2005. Foram determinadas as frações da cinética ruminal: solúvel A; insolúvel potencialmente degradável B; taxa de degradação Kd; degradação potencial (DP) e fração não degradável C da MS e degradação potencial (DP), fração não degradável C e taxa de degradação Kd da FDN e da FDA. de acordo com os resultados obtidos, observou-se que o método do quadrado metálico subestimou as características da degradação do capim. Os métodos do pastejo simulado se assemelharam muito ao das extrusas, no entanto, a prática do simulador é que assegurou a amostragem eficiente, conforme foi constatado pelos dados obtidos no ano de 2003 e 2005.

The validity of n-alkanes to estimate intake and digestibility in Nellore beef cattle fed a tropical grass (Brachiaria brizantha cv. Marandu)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Methacycline: A Review of Analytical Methods

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Herpetofauna em uma área de Floresta Atlântica na Ilha Anchieta, município de Ubatuba, sudeste do Brasil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Métodos de amostragem e avaliação utilizados em estudos fenológicos de florestas tropicais

Nos últimos 30 anos não foram levadas em consideração questões metodológicas importantes relativas ao estudo da fenologia de plantas. O uso de vários métodos na amostragem e avaliação dos dados fenológicos tem levado a uma grande dificuldade na interpretação e comparação de resultados. Esse estudo tem por objetivos realizar uma revisão da literatura em fenologia de florestas tropicais, compilando informações sobre os métodos de amostragem e avaliação utilizados, e discutir as proporções em que foram utilizados e as aplicações de cada método. Nos 60 estudos avaliados, os métodos de amostragem encontrados distribuem-se da seguinte forma: trilhas (20%), transecções (18%), parcelas (15%), coletores (10%), sendo que 37% dos estudos não definiram o método de amostragem utilizado. Para avaliação fenológica foram levantados dois métodos: qualitativo, presença e ausência das fenofases (20%) e quantitativo com quantificação da intensidade das fenofases (62%), e a combinação entre métodos qualitativos e quantitativos (17%). Ao longo do tempo cresceu a preocupação com a aplicação de métodos de amostragem e de avaliação quantitativa. Entretanto, a falta de padronização no uso desses métodos, mesmo nos dias atuais, ainda se faz presente, resultando na impossibilidade de comparação adequada dos estudos. É imprescindível, portanto, a realização de estudos comparativos de métodos fenológicos com espécies arbóreas em florestas tropicais.

Field methods for the study of ants in sugarcane plantations in Southeastern Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Methods to estimate the number of surface nucleation sites on glass particles

Based on the Johnson-Mehl-Avrami-Kolmogorov (JMAK) theory, we propose two new models to describe the crystallisation kinetics of glass particles and use them to determine the density of nucleation sites, N(s), on glass powders. We tested these models with sintered compacts of diopside glass particles using sinter-crystallisation treatments at 825 degrees C (T(g)similar to 727 degrees C), that covered from null to almost 100% crystallised volume time fraction. We measured and compared the evolution of the crystallised volume fractions by optical microscopy and x-ray diffraction. Then we fit our expressions to experimental data using Ns and R (the average particle radius) as adjustable parameters. For comparison, we also fit to our data existing expressions that describe the crystallised volume fraction in glass powders. We demonstrate that all the methods allow one to estimate N(s) with reasonable accuracy. For our ground and water washed diopside glass powder, N(s) is between 10(10)-10(11) sites.m(-2). The reasonable agreement between experimental and adjusted R confirms the consistency of all five models tested. However, one of our equations does not require taking into account the change of crystallisation mode from 3-dimensional to 1-dimensional, and this is advantageous.

Influência de componentes locais e da paisagem na estrutura de uma metacomunidade de anfíbios anuros em uma paisagem fragmentada na Região Neotropical

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Dados ecológicos da herpetofauna do Parque Estadual da Ilha Anchieta, Ubatuba, São Paulo, Brasil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Efeitos da defaunação na comunidades de pequenos mamíferos na Mata Atlântica

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Estudo comparativo da diversidade de vespas sociais (Hymenoptera, Vespidae) em mata ciliar e cultura de cana-de-açúcar na região de Ipeúna - SP

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Diversidade de mamíferos de médio e grande porte e sua relação com o mosaico vegetacional na fazenda experimental Edgárdia, Unesp, Botucatu/SP

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)