Alternative splicing of the FMR1 gene in human tissues of fetal and adult

To study the time- and tissue-specificity of alternative splicing of the FMR1 gene, we analyzed the alternative splicing pattern of the FMR1 gene in human tissues from adult and fetus using RT-PCR coupled with capillary electrophoresis. Seven alternative splicing variants of FMR1 were found in adult liver and lung. The major three alternative splicing variants of the FMR1 gene in all analyzed fetal tissues were same, though the number of minor isoforms and the relative abundance of major isoforms were different. The major difference of the alternative splicing pat tem between adult and fetus was in exon 12 and 17. The results suggest that the alternative splicing pattern of the FMR1 gene is non-tissue-specific in the same developmental stage and a developmental switch may be present.

Aplicações da proteômica na pesquisa vegetal.

A Proteômica surgiu como uma das vertentes da era pós-genômica e vem contribuindo significativamente para o entendimento global e integrado do sistema biológico. O estudo do proteoma envolve todo o conjunto de proteínas expresso pelo genoma de uma célula, como também pode ser direcionado somente àquelas que se expressam diferencialmente em condições específicas. Proteômica dedica-se também ao conjunto de isoformas de proteínas e modificações pós-traducionais, às interações entre elas, bem como à descrição estrutural de moléculas e seus complexos. Esta revisão apresenta as principais tecnologias empregadas em estudos proteômicos, e faz um levantamento de trabalhos recentes que utilizaram abordagens proteômicas para a identificação de genes e rotas envolvidos na resposta da planta a estresses bióticos e abióticos. Finalmente, são discutidos aspectos do potencial do emprego da proteômica na compreensão de questões biológicas complexas e no melhoramento genético de plantas na busca de genótipos superiores.

Impacto ambiental do regulador de crescimento vegetal paclobutrazol.

Capítulo 1. Paclobutrazol - Regulador de Crescimento Vegetal. Capítulo 2. Xenobióticos e seus Impactos Ambientais. Capítulo 3. Efeito de Paclobutrazol na Microbiota do Filoplano de Mangueiras. Capítulo 4. Efeito do Paclobutrazol sobre a Microbiota do Solo. Capítulo 5. Degradação do Paclobutrazol em Solos Tropicais. Capítulo 6. Análise do Polimorfismo de Bactérias Degradadoras do Paclobutrazol. Capítulo 7. Avaliação de Risco em decorrência da Exposição Perinatal ao Paclobutrazol: análise de alguns indicadores físicos e neurocomportamentais. Capítulo 8. Toxicidade do Paclobutrazol em Ambiente Aquático.

Memória do Projeto Cooperativo Rede de Sanidade Vegetal CUBA-BRASIL

2008

Preservação de germoplasma vegetal, com ênfase na conservação in vitro de variedades de mandioca.

O melhoramento genético de plantas tem contribuído sobremaneira para o aumento da produção em diversas espécies de grande importância econômica e/ou social, beneficiando bilhões de pessoas, especialmente de menor poder aquisitivo, que vivem em países em desenvolvimento distribuídos por todo o mundo. Esses aumentos na produção resultam da obtenção de novos genótipos, que apresentam rendimentos mais elevados, adaptados a diversas condições ecológicas, muitas das vezes adversas, e resistentes a pragas e doenças. No entanto, para a geração desses materiais melhorados, torna-se necessário que características de interesse sejam incorporadas às novas cultivares, dentro de programas de melhoramento genético bem definidos, de forma que possam ser, ao final de todo o processo, exploradas comercialmente.

Avaliacao de substâncias de origem vegetal no controle de pragas de grãos armazenados.

1997

Procedimento da Embrapa Milho e Sorgo para extração de DNA de tecido vegetal em larga escala.

2010

Mapeamento do uso atual e cobertura vegetal dos solos do estado do Rio de Janeiro.

O conhecimento do uso atual e cobertura do solo é imprescindível em qualquer projeto de caracterização e monitoramento ambientais, permitindo demarcar os diferentes usos da terra e vegetação, bem como subsidiar o planejamento e gestão ambientais. O presente trabalho abrange a totalidade do Estado do Rio de Janeiro, compreendido entre os meridianos 410 e 450 de longitude Oeste e os paralelos 200 30? e 230 30? de latitude Sul, estendendo-se por aproximadamente 44.000 km2. Tem como objetivo inventariar e mapear o estado atual da ocupação dos solos, distinguindo e quantificando os principais tipos de uso do solo e de cobertura vegetal, apresentados numa escala generalizada de 1:250.000. Para tal, fez-se um mapeamento preliminar com base nos padrões espectrais das imagens de satélite Landsat ETM7+, cedidas pela EMATER-RJ, utilizando-se de diferentes algoritmos de classificação espectral. Durante a elaboração da versão final do Mapa de Uso Atual e Cobertura Vegetal dos Solos do Estado do Rio de Janeiro, foram viagens de verificação in situ a fim de esclarecer dúvidas e subsidiar ajustes e modificações posteriores. O trabalho de pré-processamento, interpretação e classificação das imagens para a produção e edição final do Mapa de Uso Atual e Cobertura Vegetal realizou-se no período de março de 2002 a fevereiro de 2003, pelas equipes técnicas da CPRM (Serviço Geológico Brasileiro), Divisão de Geoprocessamento - DIGEOP, Departamento de Informações Institucionais (DEINF) e o Laboratório de Geoinformação da Embrapa Solos. Foram identificadas e mapeadas 13 grandes classes de uso e ocupação do solo, algumas delas subdivididas em tipos, assim classificadas e distribuídas: 1 ? Mata Atlântica (Remanescente/Secundária e Ciliar); 2 ? Mangue (Mangue e Mangue Degradado); 3 ? Restinga; 4 - Pecuária (Pastagem Plantada e Campo / Passtagem em Zona Úmida); 5 ? Agricultura; 6 ? Reflorestamento; 7 ? Afloramento de Rocha; 8 ? Solo Exposto; 9 ? Corpo d?Água; 10 ? Salina; 11 ? Extração de Areia / Mineração; 12 ? Praia e Duna; 13 ? Área Urbana.

Métodos quantitativos para determinação de características bioquímicas e fisiológicas associadas com bactérias promotoras do crescimento vegetal.

Metodologia para as análises em laboratório; Produção de sideróforos; Produção de ácido indol acético (AIA); Produção de citocininas e giberelinas; Fixação assimbiotica de N2; Produção de quitinase; Producao de B-1,3-glucanase; Produção de 1-aminociclopropano-1-carboxylato deaminase; Produção de ácido cianidrico; Solubilizacao de fosfatos; Produção de pectinase; Produção de celulase; Antagonismo direto a fungos; Antagonismo indireto a fungos (compostos volateis); Antagonismo entre bacterias.

Marcadores moleculares: princípios básicos e uso em programas de melhoramento genético vegetal.

2000

Variabilidade e diversidade genética vegetal: requisito fundamental em um programa de melhoramento.

2002

Citogenética vegetal: da era clássica à molecular.

2007

Irrigação na cultura da bucha vegetal.

2013

Reference genes for quantitative RT-PCR data in gastric tissues and cell lines

AIM: To evaluate the suitability of reference genes in gastric tissue samples and cell lines.METHODS: the suitability of genes ACTB, B2M, GAPDH, RPL29, and 18S rRNA was assessed in 21 matched pairs of neoplastic and adjacent nonneoplastic gastric tissues from patients with gastric adenocarcinoma, 27 normal gastric tissues from patients without cancer, and 4 cell lines using reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR). the ranking of the best single and combination of reference genes was determined by NormFinder, geNorm (TM), BestKeeper, and DataAssist (TM). in addition, GenEx software was used to determine the optimal number of reference genes. To validate the results, the mRNA expression of a target gene, DNMT1, was quantified using the different reference gene combinations suggested by the various software packages for normalization.RESULTS: ACTB was the best reference gene for all gastric tissues, cell lines and all gastric tissues plus cell lines. GAPDH + B2M or ACTB + B2M was the best combination of reference genes for all the gastric tissues. On the other hand, ACTB + B2M was the best combination for all the cell lines tested and was also the best combination for analyses involving all the gastric tissues plus cell lines. According to the GenEx software, 2 or 3 genes were the optimal number of references genes for all the gastric tissues. the relative quantification of DNMT1 showed similar patterns when normalized by each combination of reference genes. the level of expression of DNMT1 in neoplastic, adjacent non-neoplastic and normal gastric tissues did not differ when these samples were normalized using GAPDH + B2M (P = 0.32), ACTB + B2M (P = 0.61), or GAPDH + B2M + ACTB (P = 0.44).CONCLUSION: GAPDH + B2M or ACTB + B2M is the best combination of reference gene for all the gastric tissues, and ACTB + B2M is the best combination for the cell lines tested. (C) 2013 Baishideng Publishing Group Co., Limited. All rights reserved.

Petacas tradicionales elaboradas en fibra vegetal de yaré por los indígenas Nukak Makú, y diversificación desarrollada por otras comunidades Guaviare.

15 hojas : ilustraciones, fotografías a color.