A first case of protease codon 35 amino acid insertion in a HIV-1 subtype B sequence detected in the Bauru region, state of São Paulo, Brazil: case report

Inserções de aminoácidos na protease têm sido raramente descritas em pacientes infectados pelo HIV. Uma destas inserções foi, recentemente, descrita no codon 35, embora seu impacto na resistência mantém-se pouco conhecido. Este trabalho apresenta um caso de uma variante viral com inserção no codon 35 da protease, descrita pela primeira vez em Bauru, São Paulo, Brasil, circulante em um homem, caucasiano, com 38 anos, o qual apresenta infecção assintomática pelo HIV desde 1997. A variante isolada mostrou uma inserção no codon 35 da protease de dois aminoácidos: uma treonina e um ácido aspártico, resultando na sequência de aminoácidos E35E_TD.

Spatial distribution of trachoma cases in the City of Bauru, State of São Paulo, Brazil, detected in 2006: defining key areas for improvement of health resources

Introduction: The objective of this study was to analyze the spatial behavior of the occurrence of trachoma cases detected in the City of Bauru, State of São Paulo, Brazil, in 2006 in order to use the information collected to set priority areas for optimization of health resources. Methods: the trachoma cases identified in 2006 were georeferenced. The data evaluated were: schools where the trachoma cases studied, data from the 2000 Census, census tract, type of housing, water supply conditions, distribution of income and levels of education of household heads. In the Google Earth® software and TerraView® were made descriptive spatial analysis and estimates of the Kernel. Each area was studied by interpolation of the density surfaces exposing events to facilitate to recognize the clusters. Results: of the 66 cases detected, only one (1.5%) was not a resident of the city's outskirts. A positive association was detected of trachoma cases and the percentage of heads of household with income below three minimum wages and schooling under eight years of education. Conclusions: The recognition of the spatial distribution of trachoma cases coincided with the areas of greatest social inequality in Bauru City. The micro-areas identified are those that should be prioritized in the rationalization of health resources. There is the possibility of using the trachoma cases detected as an indicator of performance of micro priority health programs.

Risk factors and presence of antibodies to Toxoplasma gondii in dogs from the coast of São Paulo State, Brazil

A toxoplasmose é causada por um protozoário parasita intracelular obrigatório, Toxoplasma gondii, e acomete vertebrados homeotérmicos incluindo animais de companhia e o homem. O cão apresenta importância epidemiológica por atuar como sentinela da infecção para o homem. O presente estudo objetivou determinar a ocorrência de anticorpos para T. gondii em 205 amostras de soro de cães do município de Ubatuba, SP, Brasil, pela reação de imunofluorescência indireta (RIFI), assim como os fatores de risco relacionados à infecção nos animais, como raça, idade, sexo, acesso a rua, ingestão de comida caseira, acesso a água não tratada e presença de roedores. 52/205 (25,4%) amostras foram positivas para toxoplasmose, com títulos variando de 16 a 256. Os resultados sorológicos apresentaram associação significativa (P<0,05) com consumo de comida caseira (45/118; 38,1%; IC95% 29,9%-47,2%) (OR=7,0; CI95% 3,0-16,6), e acesso a rua, em que aqueles que não tinham acesso a rua foram prevalentes (37/121; 30,6%; IC95% 23,1%-39,3%) (OR=0,5; CI95% 0,2-1,0). Estes resultados demonstram que a toxoplasmose na região está relacionada com problema de educação sanitária, principalmente quanto ao adequado cozimento dos alimentos, visto que a maioria dos animais positivos não apresentou associação significativa com presença de roedores ou consumo de água não tratada, porém os mesmos permaneciam em casa aos quais fora oferecida comida caseira. Portanto, a toxoplasmose consiste em um problema de saúde pública na região estudada, sendo necessárias medidas sanitárias para o controle da infecção, visto a estreita relação homem-cão e os fatores de risco presentes.

Cryptosporidium spp. infection in mares and foals of the northwest region of São Paulo State, Brazil

O presente estudo teve como objetivo analisar a ocorrência da infecção por Cryptosporidium spp. em éguas e seus respectivos potros. Este estudo foi realizado em 11 fazendas localizadas nos municípios de Araçatuba, Birigui, Guararapes e Santo Antônio do Aracangua, na região Noroeste do Estado de São Paulo, de novembro de 2010 a março de 2011. Um total de 98 éguas e 98 potros de diversas raças foram analisados, sendo que, entre os filhotes, 59 eram machos e 39 fêmeas, cujas idades variavam de três até 330 dias. Fezes foram colhidas diretamente da ampola retal, purificadas e processadas pela técnica de Kinyoun modificada. A ocorrência de Cryptosporidium spp. observada foi de 21,4% (21/98) para potros e 18,4% (18/98) para éguas. A ocorrência de Cryptosporidium spp. teve uma associação significativa com a raça e a idade dos animais. A partir dos resultados obtidos, conclui-se neste estudo que potros com idade superior a dois meses e animais da raça Mangalarga foram menos susceptíveis à ocorrência de Cryptosporidium spp.

First report of Strongyloides sp. (Nematoda, Strongyloididae) in Leopardus tigrinus (Carnivora: Felidae) in the municipality of Botucatu, State of São Paulo, Brazil

O presente estudo reporta o primeiro caso de infecção por Strongyloides sp. em Leopardus tigrinus no município de Botucatu, Estado de São Paulo, Brasil. Fezes do exemplar parasitado de L. tigrinus foram cultivadas em fezes eqüinas esterilizadas e foi realizada infecção experimental em gato (Felis catus domesticus) com três mil larvas L3 infectantes por via subcutânea, para a identificação da espécie de Strongyloides envolvida no parasitismo. As fêmeas partenogenéticas obtidas do animal experimental foram analisadas porém a comparação dos dados biométricos encontrados com os dados da literatura não permitiu a identificação da espécie. Este é o primeiro relato sobre a ocorrência de Strongyloides sp. em L. tigrinus

Breeding season of the hermit crab petrochirus diogenes (anomura : diogenidae) in the north coast of São Paulo state, Brazil

Petrochirus diogenes, one of the largest hermit crabs in the western Atlantic, was studied in the north coast of the State of São Paulo, Brazil, to determine its breeding season through the analysis of gonad development at a macroscopic level. The analysis of 999 crabs collected from 1995 to 1999, based on four categories of gonad development, showed that males present gonads in the advanced stage during all seasons, and although females present developed ovaries all year as well, the peak incidence is in the summer. The peak of recruitment occurs in the winter.

Social Wasp Diversity (Vespidae, Polistinae) in a Forest Fragment in the Northeast of São Paulo State Sampled with Different Methodologies

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Diversity of social wasps (Hymenoptera, Vespidae, Polistinae) in three fragments of semideciduous seasonal forest in the northwest of São Paulo State, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

The late precambrian K-alkaline magmatism in the Ribeira Fold Belt: a case study of the Piracaia Pluton, State of São Paulo, SE Brazil, and its potential mineralization (Cu, Zn, Gd)

The Pluriserial Ribeira Magmatic System-590 of the Late Precambrian Ribeira Fold Belt comprises seven groups of high-K rocks of crustal or mantle origin with ages ranging between 620 and 570 Ma. One of these groups is represented by transalkaline suites akin to appinitic lamprophyres. The suites assemble one or more of following lithologies: (+/- quartz) gabbros and monzogabbros, (+/- quartz) diorites and monzodiorites, (+/- quartz) monzonites and syenites in addition to rare granites. All these rocks occur together in the Piracaia pluton, State of São Paulo. The mineralogy of the Piracaia suite comprises variable amounts of plagioclase (An 60-10), alkali-feldspars (orthoclase, microcline, albite), ortho- (Fe-hypersthene) and clinopyroxenes (augite), amphiboles (hornblende and rare late Fe-hastingsite), abundant biotite, quartz, opaques, sphene, allanite and zircon. Several magmatic pulses constructed the pluton. The Piracaia magma bulk trend evolved initially along the silica-undersaturation plane with simultaneous fractionation of accessory, mafic and felsic minerals. These are segregated in feldspar-rich cumulates. In the late stage, the evolutionary trend followed two distinct paths: one along the or-ab thermal barrier with the crystallization of syenites; the second one along the thermal valley in the or-ab-qz subsystem, producing quartz-syenites and granites. The source of the Piracaia magma was a 'vein-plus-wall-rock-system '. Together the pulses reflect increasing and decreasing participation of peridotites and mica pyroxenites, respectively, in the magmatogenic process. The magmatic pulses were stored in magma chambers, several drained by deep faults or fractures, which were successively reactivated and recharged. Each new pulse underwent mixing with earlier residual magma, followed by fractionation. During ascent through the hot and thickened post-collisional crust, the magma pulses underwent minor compositional changes by crustal contamination. The concentration of valuable elements (Cu, Zn, Gd) in the Piracaia pluton occurred during two phases of the magmatic evolution. Cu and Zn were enriched in cumulates and Gd was concentrated in residual quartz-syenitic veins. Due to their homogeneous dark colour and texture, the monzodiorites are exploited both for polished dimension stones and supports for sensitive scientific instruments. (C) 2001 Elsevier B.V. Ltd. All rights reserved.

The fish community of the Sorocaba River Basin in different habitats (State of São Paulo, Brazil)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Socio-economic characteristics of the Cachoeira de Emas small-scale fishery in Mogi-Guaçu River, State of São Paulo, Brazil

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Pelagic and littoral cladocerans (Crustacea, Anomopoda and Ctenopoda) from reservoirs of the Northwest of São Paulo State, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Shell utilization pattern of the hermit crab Clibanarius vittatus (Crustacea, Anomura) in an estuary at São Vicente, State of São Paulo, Brazil

O objetivo do presente estudo foi avaliar a utilização de conchas de gastrópodes por Clibanarius vittatus (Bosc, 1802), na Praia dos Pescadores, em São Vicente (SP), Brasil. Foram realizadas amostras mensais no período de maio de 2001 a abril de 2003, na região intertidal durante a maré baixa. Todos os animais foram pesados e tiveram o comprimento de seu escudo cefalotorácico mensurados, suas conchas identificadas e medidas quanto ao comprimento (mm), abertura (mm) e peso (g). Capturamos 2.344 ermitões (644 machos, 1.594 fêmeas não-ovígeras, 45 fêmeas ovígeras e 61 em intersexo), utilizando 13 espécies de conchas de gastrópodes, das quais Stramonita haemastoma (Linnaeus, 1767), Cymatium parthenopeum (Von Salis, 1793) e Achatina fulica (Bowdich, 1822) representaram mais de 98% das conchas utilizadas. Obteve-se significativa diferença de tamanho entre os sexos, com machos e indivíduos em intersexo atingindo maior porte físico do que fêmeas. Este padrão influenciou fortemente na ocupação e utilização de conchas, principalmente em A. fulica, que foi a maior concha obtida por C. vittatus, utilizada somente por machos e indivíduos em intersexo. Cymatium parthenopeum foi a única espécie de concha em que se obtiveram elevados coeficientes de determinação para todas os parâmetros analisados. Stramonita haemastoma apresentou elevados e significativos coeficientes de determinação, indicando que esta espécie é o principal recurso de concha ocupada na Praia dos Pescadores.

Isolation of fungi from nature in the region of Botucatu, state of São Paulo, Brazil, an endemic area of paracoccidioidomycosis

In an attempt to isolate Paracoccidioides brasiliensis from nature 887 samples of soil from Botucatu, SP, Brazil, were collected cultured in brain heart infusion agar supplemented with dextrose, in potato dextrose agar and in yeast extract starch dextrose agar, all with antibiotics, at 25º and 37ºC. Five thermo-dependent dimorphic fungi morphologically resembling P. brasiliensis were isolated; two from armadillo holes; further studies of the biology, antigenicity and genetic features of the five dimorphic fungi are necessary to clarify their taxonomy and their possible relation to P. brasiliensis. In addition, 98 dematiaceous fungi and 581 different species of Aspergillus spp. were also isolated. Our findings emphasize that armadillos and their environment are associated with thermo-dimorphic fungi and confirm the ubiquity of pathogenic dematiaceous fungi and Aspergillus spp.