Estabilidade em longo prazo do tratamento da má oclusão de classe II, divisão 1, com a utilização de um aparelho funcional propulsor mandibular fixo: relato de caso

O tratamento da má oclusão de Classe II sem extrações dentárias vem ganhando popularidade na comunidade ortodôntica já há três décadas. Aparelhos funcionais fixos vêm sendo utilizados por profissionais, de maneira crescente, para promover compensações dentoalveolares e corrigir a má oclusão de Classe II. Os efeitos mais significativos são observados em pacientes com padrão de crescimento horizontal. Um caso clínico será relatado com o uso do aparelho fixo Twin Force Bite Corrector em uma paciente do sexo feminino, para a correção da Classe II. Esse dispositivo de ancoragem fixa dispensa o uso de aparelhos funcionais removíveis e não necessita da cooperação do paciente.

MYC, FBXW7 and TP53 copy number variation and expression in Gastric Cancer

Abstract Background MYC deregulation is a common event in gastric carcinogenesis, usually as a consequence of gene amplification, chromosomal translocations, or posttranslational mechanisms. FBXW7 is a p53-controlled tumor-suppressor that plays a role in the regulation of cell cycle exit and reentry via MYC degradation. Methods We evaluated MYC, FBXW7, and TP53 copy number, mRNA levels, and protein expression in gastric cancer and paired non-neoplastic specimens from 33 patients and also in gastric adenocarcinoma cell lines. We also determined the invasion potential of the gastric cancer cell lines. Results MYC amplification was observed in 51.5% of gastric tumor samples. Deletion of one copy of FBXW7 and TP53 was observed in 45.5% and 21.2% of gastric tumors, respectively. MYC mRNA expression was significantly higher in tumors than in non-neoplastic samples. FBXW7 and TP53 mRNA expression was markedly lower in tumors than in paired non-neoplastic specimens. Moreover, deregulated MYC and FBXW7 mRNA expression was associated with the presence of lymph node metastasis and tumor stage III-IV. Additionally, MYC immunostaining was more frequently observed in intestinal-type than diffuse-type gastric cancers and was associated with MYC mRNA expression. In vitro studies showed that increased MYC and reduced FBXW7 expression is associated with a more invasive phenotype in gastric cancer cell lines. This result encouraged us to investigate the activity of the gelatinases MMP-2 and MMP-9 in both cell lines. Both gelatinases are synthesized predominantly by stromal cells rather than cancer cells, and it has been proposed that both contribute to cancer progression. We observed a significant increase in MMP-9 activity in ACP02 compared with ACP03 cells. These results confirmed that ACP02 cells have greater invasion capability than ACP03 cells. Conclusion In conclusion, FBXW7 and MYC mRNA may play a role in aggressive biologic behavior of gastric cancer cells and may be a useful indicator of poor prognosis. Furthermore, MYC is a candidate target for new therapies against gastric cancer.

MYC, FBXW7 and TP53 copy number variation and expression in gastric cancer

BACKGROUND: MYC deregulation is a common event in gastric carcinogenesis, usually as a consequence of gene amplification, chromosomal translocations, or posttranslational mechanisms. FBXW7 is a p53-controlled tumor-suppressor that plays a role in the regulation of cell cycle exit and reentry via MYC degradation. METHODS: We evaluated MYC, FBXW7, and TP53 copy number, mRNA levels, and protein expression in gastric cancer and paired non-neoplastic specimens from 33 patients and also in gastric adenocarcinoma cell lines. We also determined the invasion potential of the gastric cancer cell lines. RESULTS: MYC amplification was observed in 51.5% of gastric tumor samples. Deletion of one copy of FBXW7 and TP53 was observed in 45.5% and 21.2% of gastric tumors, respectively. MYC mRNA expression was significantly higher in tumors than in non-neoplastic samples. FBXW7 and TP53 mRNA expression was markedly lower in tumors than in paired non-neoplastic specimens. Moreover, deregulated MYC and FBXW7 mRNA expression was associated with the presence of lymph node metastasis and tumor stage III-IV. Additionally, MYC immunostaining was more frequently observed in intestinal-type than diffuse-type gastric cancers and was associated with MYC mRNA expression. In vitro studies showed that increased MYC and reduced FBXW7 expression is associated with a more invasive phenotype in gastric cancer cell lines. This result encouraged us to investigate the activity of the gelatinases MMP-2 and MMP-9 in both cell lines. Both gelatinases are synthesized predominantly by stromal cells rather than cancer cells, and it has been proposed that both contribute to cancer progression. We observed a significant increase in MMP-9 activity in ACP02 compared with ACP03 cells. These results confirmed that ACP02 cells have greater invasion capability than ACP03 cells. CONCLUSION: In conclusion, FBXW7 and MYC mRNA may play a role in aggressive biologic behavior of gastric cancer cells and may be a useful indicator of poor prognosis. Furthermore, MYC is a candidate target for new therapies against gastric cancer.

Entwicklung und Überprüfung objektiver Testverfahren zur Messung von Angstbewältigungsdispositionen

Für die Entwicklung objektiver Testverfahren zur Messung von Angstbewältigungsdispositionen, d.h. von Tests, deren Meßprinzip für die Probanden nicht durchschaubar ist, wurde das Dot-Probe-Paradigma verwendet. Mit diesem Paradigma läßt sich das Aufmerksamkeitsverhalten gegenüber bedrohlichem Material messen. Es wurde angenommen, daß dieses Paradigma besonders gut für eine objektive Messung der Angstbewältigungsdispositionen Vigilanz und kognitive Vermeidung geeignet ist, da Vigilanz durch verstärkte Aufnahme und Verarbeitung bedrohungsbezogener Information gekennzeichnet ist, während sich kognitive Vermeidung in der Abwendung der Aufmerksamkeit von diesen Reizen zeigt. In drei Studien wurde für verschiedene Versionen des Dot-Probe-Paradigmas überprüft, ob die für den Einsatz als Testinstrument in der Persönlichkeitsdiagnostik notwendigen Gütekriterien erfüllt sind. Dabei wurde festgestellt, daß das Dot-Probe-Paradigma sowohl bei Verwendung von Wörtern als auch von Bildern als Stimuli für klinisch unauffällige Testpersonen keine reliable Messung ermöglicht. Die erhobenen Werte waren weder über eine Woche hinweg stabil, noch waren sie intern konsistent. Infolge der ungenügenden Reliabilität fanden sich in den Studien nur unsystematische Befunde zum Zusammenhang zwischen dem Aufmerksamkeitsverhalten im Dot-Probe-Paradigma und verschiedenen Fragebogenmaßen. Darüber hinaus vermag die mangelnde Reliabilität auch die in der Literatur berichteten inkonsistenten Befunde bei der Untersuchung nicht-klinischer Stichproben mit diesem Paradigma zu erklären. Mögliche Gründe für die mangelnde Reliabilität der Messung werden diskutiert.

Experimentelle Diagnostik angstbezogener Informationsverarbeitung bei Kindern im Grundschulalter

Ziel war die Entwicklung und Erprobung von Varianten des emotionalen Strooptests zur Analyse angstbezogener Aufmerksamkeitsprozesse bei Grundschulkindern. Dabei wurde überprüft, ob dieses kognitiv-experimentelle Verfahren zukünftig als objektives Testverfahren zur Diagnostik von Ängstlichkeit im Kindesalter geeignet ist. Ausgangspunkt waren zahlreiche Befunde für die Gruppe Erwachsener, wonach die Zuwendung auf bedrohliche Situationsmerkmalen für Ängstliche charakteristisch ist. Für das Kindesalter liegen hierzu nur wenige Studien mit zudem inkonsistenten Befundmuster vor. In insgesamt drei Studien wurde der emotionale Strooptest für das Grundschulalter adaptiert, indem Bilder bzw. altersentsprechendes Wortmaterial als Stimuli eingesetzt wurden. An den Studien nahmen nicht-klinische, nicht-ausgelesene Stichproben mit Kindern der zweiten bis vierten Grundschulklassen teil. Sowohl Ängstlichkeit als auch Zustandsangst der Kinder wurden jeweils über Selbst- und Fremdeinschätzungen (Eltern, Klassenlehrer, Versuchsleiter) erhoben. Die Ergebnisse sprechen für eine nur unzureichende Reliabilität emotionaler Interferenzeffekte. Auch ergaben sich (möglichenfalls infolge) keine substantiellen Hinweise auf differentielle angstbezogene Interferenzeffekte. Die Befunde sprechen vielmehr dafür, dass alle Kinder unabhängig von der Ängstlichkeit höhere Benennungszeiten für bedrohliche Stimuli im Vergleich zur Kontrollbedingung mit neutralen oder freundlichen Stimuli zeigten, wobei zugleich methodische Einflussfaktoren des Strooptests von Relevanz waren. Die Diskussion konzentriert sich auf entwicklungspsychologische Überlegungen sowie mögliche Bedingungen emotionaler Interferenzeffekte unter kritischer Berücksichtigung der Reliabilität emotionaler Stroopinterferenz.

Study of variability and genetic structure of European populations of Myotis emarginatus and Myotis capaccinii (Chiroptera, Vespertilionidae)

The Geoffroy’s bat Myotis emarginatus is mainly present in southern, south-eastern and central Europe (Červerný, 1999) and is often recorded from northern Spain (Quetglas, 2002; Flaquer et al., 2004). It has demonstrated the species’ preference for forest. Myotis capaccinii, confined to the Mediterranean (Guille´n, 1999), is classified as ‘vulnerable’ on a global scale (Hutson, Mickleburgh & Racey, 2001). In general, the species preferred calm waters bordered by well-developed riparian vegetation and large (> 5 m) inter-bank distances (Biscardi et al. 2007). In this study we present the first results about population genetic structure of these two species of genus Myotis. We used two methods of sampling: invasive and non-invasive techniques. A total of 323 invasive samples and a total of 107 non-invasive samples were collected and analyzed. For Myotis emarginatus we have individuated for the first time a set of 7 microsatellites, which can work on this species, started from a set developed on Myotis myotis (Castella et al. 2000). We developed also a method for analysis of non-invasive samples, that given a good percentage of positive analyzed samples. The results have highlighted for the species Myotis emarginatus the presence on the European territory of two big groups, discovered by using the microsatellites tracers. On this species, 33 haplotypes of Dloop have been identified, some of them are presented only in some colonies. We identified respectively 33 haplotypes of Dloop and 10 of cytB for Myotis emarginatus and 25 of dloop and 15 of cytB for Myotis capaccinii. Myotis emarginatus’ results, both microsatellites and mtDNA, show that there is a strong genetic flow between different colonies across Europe. The results achieved on Myotis capaccinii are very interesting, in this case either for the microsatellites or the mitochondrial DNA sequences, and it has been highlighted a big difference between different colonies.

Evaluation der Langzeitcompliance lebertransplantierter Patienten mit der immunsuppressiven Therapie und eines Betreuungsmodells zur intersektoralen kooperativen pharmazeutischen Betreuung durch eine Krankenhausapotheke und öffentliche Apotheken

Ein wichtiger Baustein für den langfristigen Erfolg einer Lebertransplantation ist die Compliance mit der lebenslang einzunehmenden immunsuppressiven Therapie. Im Rahmen der vorliegenden Arbeit wurde erstmals mittels MEMS® die Compliance bei lebertransplantierten Patienten untersucht, deren Transplantation einige Jahre zurücklag. Rekrutiert wurden Patienten, die vor 2, 5, 7 oder 10 Jahren (Gruppe 2 y.p.t., 5 y.p.t., 7 y.p.t., 10 y.p.t.) in der Universitätsmedizin Mainz lebertransplantiert wurden. 39 Patienten nahmen an der prospektiven Anwendungsbeobachtung teil. Die Compliance wurde mittels MEMS® über eine Beobachtungszeit von 6 Monaten erfasst. Bei der MEMS®-Auswertung war zu vermuten, dass 10 Patienten diese nicht wie vorgesehen verwendet hatten. Folglich konnten die mittels MEMS® gemessenen Compliance-Parameter nur für 29 Patienten valide ermittelt werden. Die mittlere Dosing Compliance betrug 81 ± 21 %, wobei die Gruppe 2 y.p.t. mit 86 ± 14 % bessere Werte zu verzeichnen hatte als die Gruppe 5 y.p.t. (75 ± 27 %) und 7 y.p.t. (74 ± 28 %). Die Ergebnisse waren jedoch nicht signifikant unterschiedlich (p=0,335, Kruskal-Wallis-Test). Unter Einbeziehung aller mittels MEMS® gemessenen Compliance-Parameter wurden 19 von 29 Patienten (66 %) als compliant eingestuft. Bei der Analyse der Gesamtcompliance basierend auf den subjektiven Compliance-Messmethoden (Morisky-Fragebogen, MESI-Fragebogen, Selbsteinschätzung), der Arzneimittel-Blutspiegel und der Anzahl an Abstoßungsreaktionen, in der alle 39 Patienten einbezogen werden konnten, wurden 35 Patienten (90 %) als compliant eingestuft. rnIm zweiten Teil der Arbeit wurde die Etablierung und Bewertung eines intersektoralen Pharmazeutischen Betreuungskonzepts für lebertransplantierte Patienten untersucht. Erstmals wurden anhand eines entwickelten schnittstellenübergreifenden, integrierten Betreuungskonzepts niedergelassene Apotheker in die Pharmazeutische Betreuung lebertransplantierter Patienten eingebunden. 20 Patienten wurden rekrutiert und während ihres stationären Aufenthaltes nach Transplantation pharmazeutisch betreut. Die Betreuung umfasste eine intensive Patientenschulung mit drei bis vier Gesprächen durch einen Krankenhausapotheker. Während des stationären Aufenthaltes wurden arzneimittelbezogene Probleme erkannt, gelöst und dokumentiert. Bei Entlassung stellte der Krankenhausapotheker einen Medikationsplan für den Hausarzt sowie für den niedergelassenen Apotheker aus und führte mit den Patienten ein ausführliches Entlassungsgespräch. Darüber hinaus wurden den Patienten Arzneimitteleinnahmepläne und eine Patienteninformation über ihr immunsuppressives Arzneimittel übergeben. 15 Patienten konnten daraufhin ambulant von niedergelassenen Apothekern pharmazeutisch weiterbetreut werden. Das kooperierende pharmazeutische Personal wurde durch ein eigens für die Studie erstelltes Manual zur Pharmazeutischen Betreuung lebertransplantierter Patienten geschult und unterstützt. Die niedergelassenen Apotheker sollten die Patienten in ihrer Arzneimitteltherapie begleiten, indem Beratungsgespräche geführt und arzneimittelbezogene Probleme erkannt und gelöst wurden. Die Nutzeffekte der intensiven Pharmazeutischen Betreuung konnte anhand verschiedener Erhebungsinstrumente dargelegt werden. Im Ergebnis resultierte eine hohe Zufriedenheit der Patienten und Apotheker mit dem Betreuungskonzept, die mittels Selbstbeurteilungsfragebögen ermittelt wurde. Die Compliance der Patienten wurde anhand des Morisky- und MESI-Fragebogens, der Selbsteinschätzung der Patienten, Blutspiegelbestimmungen sowie der Einschätzung durch den niedergelassenen Apotheker bestimmt. 86 % der Patienten wurden als compliant eingeordnet. Die Kenntnisse der Patienten über ihre immunsuppressive Therapie, welche anhand von Interviews erfragt wurden, lagen auf einem sehr hohen Niveau. Abschließend kann festgestellt werden, dass die Pharmazeutische Betreuung lebertransplantierter Patienten in den niedergelassenen Apotheken durchführbar ist. Anhand der Dokumentationsprotokolle lässt sich allerdings nur sehr schwer beurteilen, in welchem Maße die Betreuung tatsächlich erfolgte. Das tatsächliche vorliegen einer mangelnden Betreuung oder aber eine lückenhafte Dokumentation der Betreuungsleistung war nicht zu differenzieren. Ein limitierender Faktor für die intensivierte Betreuung ist sicherlich der erhebliche Aufwand für nur einen Patienten mit einem seltenen Krankheitsbild. Das Erkennen und Lösen von 48 ABP durch den Krankenhausapotheker und 32 ABP durch die niedergelassenen Apotheker, d. h. insgesamt 4,5 ABP pro Patient zeigt, dass die Pharmazeutische Betreuung einen wichtigen Beitrag für eine qualitätsgesicherte Arzneimitteltherapie leistet. Die intersektorale Pharmazeutische Betreuung stellt eine wesentliche Hilfe und Unterstützung der Patienten im sicheren Umgang mit ihrer Arzneimitteltherapie dar.rn

Compliance- und Lebensqualitätsmessung bei Patienten vor einer Nieren- oder Lebertransplantation

Die Arzneimittelcompliance hat eine hohe Vorhersagekraft für den Ausgang einer Organtransplantation. Allerdings wurden soweit keine Studien zur Arzneimittelcompliance mittels eletronischen Compliancemessung bei Dialyse- und Leberzirrhosepatienten durchgeführt. Das primäre Ziel dieser Studie war die Arzneimittelcompliance dieser beiden Patientenkollektive zu evaluieren und als sekundäres Ziel wurden die Einflussfaktoren von Non-Compliance untersucht. rnLeberzirrhosepatinten, die Propranolol und Dialysepatienten, die Phosphatbinder, jeweils 3 x tgl. einnahmen, konnten in der Studie teilnehmen. Die Arzneimittelcompliance wurde mittels MEMSTM über einen Zeitraum von jeweils 6 Monaten bestimmt. Des Weiteren wurde nach Einflussfaktoren wie die demopraphischen Daten, Depression, Lebensqualität und der Gesundheitszustand, bei den Dialysepatienten zusätzlich die Formulierung der Phosphatbinder und die Anzahl evaluiert. Zwischen den organinsuffizienten Patientenkollektiven war ein signifikanter Unterschied in der Dosing Compliancerate auszumachen (p<0,023). Die mittlere DC Rate war bei 61%±6% für Leberzirrhosepatienten im Vergleich zu 43%±5% in Dialysepatienten. Nur 10 Leberzirrhosepatienten (30%) and 6 Dialysepatienten (17%) konnten als compliant eingestuft werden. Je höher die Phosphatbinderdosen waren, umso niedrigere Dosing Complianceraten wurden erzielt. Bei 1,5-3 Tabletten pro Tag betrug die Compliancerate 55%±8% (n=16), bei 4-6 Tabletten pro Tag nur noch 37%±7% (n=15) und bei mehr als 7 Tabletten lediglich 21%±10% (n=5) (p<0,036). Bei den Dialysepatienten war jedoch auffällig, dass die Dosing Compliancerate in Abhängigkeit von der Anzahl der dokumentierten Erkrankungen inkl. Grunderkrankung stieg (Dosing Compliancerate 34%±9% für ≤1 Grunderkrankung, 42%±6% für 1-4 Komorbiditäten, 83%±3% für ≥5 Komorbiditäten; p<0,036).Das geringe Patientenwissen über die Arzneimittel und die Erkrankung und die niedrige Compliancerate bedürfen weitere Untersuchungen um die Aspekte zu verbessern. Diese Studie zeigte das eine pharmazeutische Betreuung schon vor einer Transplantation benötigt wird. Aber eine pharmazeutische Betreuung ist sehr kosten- und zeitintensiv. Vielleicht müssen neue Modelle der pharmazeutische Betreuung untersucht werden oder non-compliante Patienten müssen noch besser identifiziert werden für eine selektive pharmazeutische Betreuung.

Prevalence and impact of cannabis use disorders in adolescents with early onset first episode psychosis

Previous studies on the impact of cannabis use disorders (CU) on outcome in psychosis were predominantly based on non representative samples, often have not controlled for confounders and rarely focused on adolescent patients. Thus, the aims of the present study were to assess: (i) prevalence of CU; (ii) baseline and pretreatment differences between CU and those without CU (NCU); (iii) the impact of baseline and course of CU on 18-month outcomes in a representative cohort of adolescents with early onset first episode psychosis (EOP).

CCND1/CyclinD1 status in metastasizing bladder cancer: a prognosticator and predictor of chemotherapeutic response

The CCND1 gene encodes the protein CyclinD1, which is an important promoter of the cell cycle and a prognostic and predictive factor in different cancers. CCND1 is amplified to a substantial proportion in various tumors, and this may contribute to CyclinD1 overexpression. In bladder cancer, information about the clinical relevance of CCND1/CyclinD1 alterations is limited. In the present study, amplification status of CCND1 and expression of CyclinD1 were evaluated by fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry on tissue microarrays from 152 lymph node-positive urothelial bladder cancers (one sample each from the center and invasion front of the primary tumors, two samples per corresponding lymph node metastasis) treated by cystectomy and lymphadenectomy. CCND1 amplification status and the percentage of immunostained cancer cells were correlated with histopathological tumor characteristics, cancer-specific survival and response to adjuvant chemotherapy. CCND1 amplification in primary tumors was homogeneous in 15% and heterogeneous in 6% (metastases: 22 and 2%). Median nuclear CyclinD1 expression in amplified samples was similar in all tumor compartments (60-70% immunostained tumor nuclei) and significantly higher than in non-amplified samples (5-20% immunostained tumor nuclei; P<0.05). CCND1 status and CyclinD1 expression were not associated with primary tumor stage or lymph node tumor burden. CCND1 amplification in primary tumors (P=0.001) and metastases (P=0.02) and high nuclear CyclinD1 in metastases (P=0.01) predicted early cancer-related death independently. Subgroup analyses showed that chemotherapy was particularly beneficial in patients with high nuclear CyclinD1 expression in the metastases, whereas expression in primary tumors and CCND1 status did not predict chemotherapeutic response. In conclusion, CCND1 amplification status and CyclinD1 expression are independent risk factors in metastasizing bladder cancer. High nuclear CyclinD1 expression in lymph node metastases predicts favorable response to chemotherapy. This information may help to personalize prognostication and administration of adjuvant chemotherapy.

Entwicklung eines Screening-Instruments zu Rumination und Suppression RS-8

Rumination und Suppression sind 2 maladaptive Emotionsregulationsstrategien, die im Zusammenhang mit pathologischem Verhalten wie übermäßigem Essen oder Trinken stehen. Ein Messinstrument, welches beide Strategien in Kurzform erfasst, fehlt bisher. Der RS-8 erfasst mit 8 Items die beiden Dimensionen Rumination und Suppression. Anhand von 2 klinischen (Patienten mit Alkoholabhängigkeit [n = 79], Patienten mit Adipositas [n = 53]) und einer nichtklinischen Stichprobe (n = 133) wurde die psychometrische Qualität der Skala überprüft. Die Ergebnisse zeigen, dass der RS-8 ein valides und reliables Messinstrument ist. Die interne Konsistenz kann als gut und die faktorielle Validität als sehr gut bewertet werden. Der RS-8 ist ein ökonomisches Screening-Instrument, welches bei klinischen und nicht-klinischen Stichproben eingesetzt werden kann.

Die Kurzversion der NMR Skala (NMR-SF) zur Erfassung der selbsteingeschätzten Fähigkeit zur Regulation negativer Stimmungen: Überblick und Konstruktvalidierung

Die NMR-SF ist die Kurzversion der NMR Skala. Die NMR-SF misst die selbsteingeschätze Fähigkeit zur Regulation negativer Stimmungen. Das von der NMR-SF erfasste Konstrukt spielt in der Ätiologie und Psychotherapie psychischer Störungen eine wichtige Rolle. Die vorliegende Studie untersucht die Konstruktvalidität des Verfahrens in 2 nicht-klinischen und einer depressiven Stichprobe. Die NMR-SF korreliert positiv mit funktionalen Strategien zum Umgang mit negativen Stimmungen und negativ mit dysfunktionalen Strategien. Hohe Werte in der NMR-SF gehen weiterhin mit weniger psychischen Beschwerden einher. Die NMR-SF korreliert leicht positiv mit sozialer Erwünschtheit. Die Ergebnisse der aktuellen Studie unterstützen die Kon­struktvalidität der NMR-SF. Die NMR-SF stellt sich als ein psychometrisch gutes Verfahren zur Messung von NMR-Erwartungen dar. Aufgrund ihrer Ökonomie empfiehlt sich die NMR-SF für die Anwendung in klinischen Stichproben, insbesondere im Rahmen von Verlaufsmessungen.

Characterization of granite matrix porosity and pore-space geometry by in situ and laboratory methods

Most available studies of interconnected matrix porosity of crystalline rocks are based on laboratory investigations; that is, work on samples that have undergone stress relaxation and were affected by drilling and sample preparation. The extrapolation of the results to in situ conditions is therefore associated with considerable uncertainty, and this was the motivation to conduct the ‘in situ Connected Porosity’ experiment at the Grimsel Test Site (Central Swiss Alps). An acrylic resin doped with fluorescent agents was used to impregnate the microporous granitic matrix in situ around an injection borehole, and samples were obtained by overcoring. The 3-D structure of the porespace, represented by microcracks, was studied by U-stage fluorescence microscopy. Petrophysical methods, including the determination of porosity, permeability and P -wave velocity, were also applied. Investigations were conducted both on samples that were impregnated in situ and on non-impregnated samples, so that natural features could be distinguished from artefacts. The investigated deformed granites display complex microcrack populations representing a polyphase deformation at varying conditions. The crack population is dominated by open cleavage cracks in mica and grain boundary cracks. The porosity of non-impregnated samples lies slightly above 1 per cent, which is 2–2.5 times higher than the in situ porosity obtained for impregnated samples. Measurements of seismic velocities (Vp ) on spherical rock samples as a function of confining pressure, spatial direction and water saturation for both non-impregnated and impregnated samples provide further constraints on the distinction between natural and induced crack types. The main conclusions are that (1) an interconnected network of microcracks exists in the whole granitic matrix, irrespective of the distance to ductile and brittle shear zones, and (2) conventional laboratory methods overestimate the matrix porosity. Calculations of contaminant transport through fractured media often rely on matrix diffusion as a retardation mechanism.

Next-generation sequencing of HIV-1 RNA genomes: determination of error rates and minimizing artificial recombination.

Next-generation sequencing (NGS) is a valuable tool for the detection and quantification of HIV-1 variants in vivo. However, these technologies require detailed characterization and control of artificially induced errors to be applicable for accurate haplotype reconstruction. To investigate the occurrence of substitutions, insertions, and deletions at the individual steps of RT-PCR and NGS, 454 pyrosequencing was performed on amplified and non-amplified HIV-1 genomes. Artificial recombination was explored by mixing five different HIV-1 clonal strains (5-virus-mix) and applying different RT-PCR conditions followed by 454 pyrosequencing. Error rates ranged from 0.04-0.66% and were similar in amplified and non-amplified samples. Discrepancies were observed between forward and reverse reads, indicating that most errors were introduced during the pyrosequencing step. Using the 5-virus-mix, non-optimized, standard RT-PCR conditions introduced artificial recombinants in a fraction of at least 30% of the reads that subsequently led to an underestimation of true haplotype frequencies. We minimized the fraction of recombinants down to 0.9-2.6% by optimized, artifact-reducing RT-PCR conditions. This approach enabled correct haplotype reconstruction and frequency estimations consistent with reference data obtained by single genome amplification. RT-PCR conditions are crucial for correct frequency estimation and analysis of haplotypes in heterogeneous virus populations. We developed an RT-PCR procedure to generate NGS data useful for reliable haplotype reconstruction and quantification.

Risk factors associated with the longevity of multi-rooted teeth. Long-term outcomes after active and supportive periodontal therapy

AIM To investigate risk factors for the loss of multi-rooted teeth (MRT) in subjects treated for periodontitis and enrolled in supportive periodontal therapy (SPT). MATERIAL AND METHODS A total of 172 subjects were examined before (T0) and after active periodontal therapy (APT)(T1) and following a mean of 11.5 ± 5.2 (SD) years of SPT (T2). The association of risk factors with loss of MRT was analysed with multilevel logistic regression. The tooth was the unit of analysis. RESULTS Furcation involvement (FI) = 1 before APT was not a risk factor for tooth loss compared with FI = 0 (p = 0.37). Between T0 and T2, MRT with FI = 2 (OR: 2.92, 95% CI: 1.68, 5.06, p = 0.0001) and FI = 3 (OR: 6.85, 95% CI: 3.40, 13.83, p < 0.0001) were at a significantly higher risk to be lost compared with those with FI = 0. During SPT, smokers lost significantly more MRT compared with non-smokers (OR: 2.37, 95% CI: 1.05, 5.35, p = 0.04). Non-smoking and compliant subjects with FI = 0/1 at T1 lost significantly less MRT during SPT compared with non-compliant smokers with FI = 2 (OR: 10.11, 95% CI: 2.91, 35.11, p < 0.0001) and FI = 3 (OR: 17.18, 95% CI: 4.98, 59.28, p < 0.0001) respectively. CONCLUSIONS FI = 1 was not a risk factor for tooth loss compared with FI = 0. FI = 2/3, smoking and lack of compliance with regular SPT represented risk factors for the loss of MRT in subjects treated for periodontitis.