The log-exponentiated Weibull regression model for interval-censored data

In interval-censored survival data, the event of interest is not observed exactly but is only known to occur within some time interval. Such data appear very frequently. In this paper, we are concerned only with parametric forms, and so a location-scale regression model based on the exponentiated Weibull distribution is proposed for modeling interval-censored data. We show that the proposed log-exponentiated Weibull regression model for interval-censored data represents a parametric family of models that include other regression models that are broadly used in lifetime data analysis. Assuming the use of interval-censored data, we employ a frequentist analysis, a jackknife estimator, a parametric bootstrap and a Bayesian analysis for the parameters of the proposed model. We derive the appropriate matrices for assessing local influences on the parameter estimates under different perturbation schemes and present some ways to assess global influences. Furthermore, for different parameter settings, sample sizes and censoring percentages, various simulations are performed; in addition, the empirical distribution of some modified residuals are displayed and compared with the standard normal distribution. These studies suggest that the residual analysis usually performed in normal linear regression models can be straightforwardly extended to a modified deviance residual in log-exponentiated Weibull regression models for interval-censored data. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.

Prediction in Multilevel Logistic Regression

The purpose of this article is to present a new method to predict the response variable of an observation in a new cluster for a multilevel logistic regression. The central idea is based on the empirical best estimator for the random effect. Two estimation methods for multilevel model are compared: penalized quasi-likelihood and Gauss-Hermite quadrature. The performance measures for the prediction of the probability for a new cluster observation of the multilevel logistic model in comparison with the usual logistic model are examined through simulations and an application.

Local Influence Under Parameter Constraints

Calculations of local influence curvatures and leverage have been well developed when the parameters are unrestricted. In this article, we discuss the assessment of local influence and leverage under linear equality parameter constraints with extensions to inequality constraints. Using a penalized quadratic function we express the normal curvature of local influence for arbitrary perturbation schemes and the generalized leverage matrix in interpretable forms, which depend on restricted and unrestricted components. The results are quite general and can be applied in various statistical models. In particular, we derive the normal curvature under three useful perturbation schemes for generalized linear models. Four illustrative examples are analyzed by the methodology developed in the article.

Process evaluation of a knowledge translation intervention using facilitation of local stakeholder groups to improve neonatal survival in the Quang Ninh province, Vietnam

BACKGROUND: Annually, 2.8 million neonatal deaths occur worldwide, despite the fact that three-quarters of them could be prevented if available evidence-based interventions were used. Facilitation of community groups has been recognized as a promising method to translate knowledge into practice. In northern Vietnam, the Neonatal Health - Knowledge Into Practice trial evaluated facilitation of community groups (2008-2011) and succeeded in reducing the neonatal mortality rate (adjusted odds ratio, 0.51; 95 % confidence interval 0.30-0.89). The aim of this paper is to report on the process (implementation and mechanism of impact) of this intervention. METHODS: Process data were excerpted from diary information from meetings with facilitators and intervention groups, and from supervisor records of monthly meetings with facilitators. Data were analyzed using descriptive statistics. An evaluation including attributes and skills of facilitators (e.g., group management, communication, and commitment) was performed at the end of the intervention using a six-item instrument. Odds ratios were analyzed, adjusted for cluster randomization using general linear mixed models. RESULTS: To ensure eight active facilitators over 3 years, 11 Women's Union representatives were recruited and trained. Of the 44 intervention groups, composed of health staff and commune stakeholders, 43 completed their activities until the end of the study. In total, 95 % (n = 1508) of the intended monthly meetings with an intervention group and a facilitator were conducted. The overall attendance of intervention group members was 86 %. The groups identified 32 unique problems and implemented 39 unique actions. The identified problems targeted health issues concerning both women and neonates. Actions implemented were mainly communication activities. Communes supported by a group with a facilitator who was rated high on attributes and skills (n = 27) had lower odds of neonatal mortality (odds ratio, 0.37; 95 % confidence interval, 0.19-0.73) than control communes (n = 46). CONCLUSIONS: This evaluation identified several factors that might have influenced the outcomes of the trial: continuity of intervention groups' work, adequate attributes and skills of facilitators, and targeting problems along a continuum of care. Such factors are important to consider in scaling-up efforts.

A metodologia de análise de dados espaciais aplicada a plantas forrageiras

Dois experimentos e um levantamento por amostragem foram analisados no contexto de dados espaciais. Os experimentos foram delineados em blocos completos casualizados sendo que no experimento um (EXP 1) foram avaliados oito cultivares de trevo branco, sendo estudadas as variáveis Matéria Seca Total (MST) e Matéria Seca de Gramíneas (MSGRAM) e no experimento dois (EXP 2) 20 cultivares de espécies forrageiras, onde foi estudada a variável Percentagem de Implantação (%IMPL). As variáveis foram analisadas no contexto de modelos mistos, sendo modelada a variabilidade espacial através de semivariogramas exponencias, esféricos e gaussianos. Verificou-se uma diminuição em média de 19% e 14% do Coeficiente de Variação (CV) das medias dos cultivares, e uma diminuição em média de 24,6% e 33,3% nos erros padrões dos contrastes ortogonais propostos em MST e MSGRAM. No levantamento por amostragem, estudou-se a associação espacial em Aristida laevis (Nees) Kunth , Paspalum notatum Fl e Demodium incanum DC, amostrados em uma transecção fixa de quadros contiguos, a quatro tamanhos de unidades amostrais (0,1x0,1m; 0,1x0,3m; 0,1x0,5m; e 0,1x1,0m). Nas espécies Aristida laevis (Nees) Kunth e Paspalum notatum Fl, existiu um bom ajuste dos semivariogramas a tamanhos menores das unidades amostrais, diminuíndo quando a unidade amostral foi maior. Desmodium incanum DC apresentou comportamento contrario, ajustando melhor os semivariogramas a tamanhos maiores das unidades amostrais.

Latent heat loss of dairy cows in an equatorial semi-arid environment

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Comparação de critérios de seleção para precocidade de crescimento em bovinos da raça Guzerá

Objetivou-se com este estudo comparar a seleção com base no ganho médio diário de peso na pré-desmama (GMD) e no número de dias para ganhar 160 kg nessa fase (D160), com e sem correção para efeitos de grupos de contemporâneos (GC), em bovinos da raça Guzerá. Utilizou-se o banco de dados de desenvolvimento ponderal da Associação Brasileira de Criadores de Zebu (ABCZ) para esta raça. A obtenção dos parâmetros e valores genéticos foi feita pelo método da máxima verossimilhança restrita utilizando-se modelo unicaracterístico com equações de modelos mistos. O modelo utilizado foi composto pelo efeito fixo de grupo genético e pelos efeitos aleatórios, genético aditivo direto e de ambiente permanente, além do erro residual. A média para D160 foi de 270,5 dias e para GMD, 642,3 g. As correlações de Spearman entre ganho médio diário e a precocidade em dias para ganhar 160 kg na pré-desmama (PD160), e GMD e PD160c (PD160 corrigido para o efeito de grupo de contemporâneo), foram iguais a 0,91 e 0,94, respectivamente. A seleção para PD160 favorece touros que produzem progênie com desempenho superior e menos variável e a padronização deste critério com base no grupo de contemporâneos melhorou sua eficiência. A classificação dos touros varia de acordo com o critério de seleção utilizado, GMD ou PD160, principalmente nos extremos, onde ocorrem seleção e descarte de reprodutores.

Estudo de simulação de modelos lineares mistos com distribuição normal contaminada no melhoramento genético animal

Objetivou-se com esse trabalho comparar estimativas de componentes de variâncias obtidas por meio de modelos lineares mistos Gaussianos e Robustos, via Amostrador de Gibbs, em dados simulados. Foram simulados 50 arquivos de dados com 1.000 animais cada um, distribuídos em cinco gerações, em dois níveis de efeito fixo e três valores fenotípicos distintos para uma característica hipotética, com diferentes níveis de contaminação. Exceto para os dados sem contaminação, quando os modelos foram iguais, o modelo Robusto apresentou melhores estimativas da variância residual. As estimativas de herdabilidade foram semelhantes em todos os modelos, mas as análises de regressão mostraram que os valores genéticos preditos com uso do modelo Robusto foram mais próximos dos valores genéticos verdadeiros. Esses resultados sugerem que o modelo linear normal contaminado oferece uma alternativa flexível para estimação robusta em melhoramento genético animal.

An experimental assessment of landscape configuration effects on frog and toad abundance and diversity in tropical agro-savannah landscapes of southeastern Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Influência do modelo de análise estatística e da forma das parcelas experimentais na seleção de clones de Eucalyptus spp.

Foram avaliadas três formas de parcelas experimentais (retangular, uma linha - linear e parcela de uma árvore - STP) em testes clonais de Eucalyptus spp, utilizando-se três experimentos, cada um com 18 clones. Foram usados três modelos de análise (mínimos quadrados ordinários - ANOVA tradicional, modelos mistos com fator clone fixo ou com fator clone aleatório - REML/BLUP). Os dois primeiros modelos apresentaram resultados similares. Com REML/BLUP houve estreitamento das predições em relação às amplitudes obtidas com as médias, e essa redução foi proporcionalmente maior com parcelas retangulares e STP. O ordenamento dos clones também foi similar com esses dois tipos de parcelas. É provável que com parcelas STP haja um balanço compensatório das alocompetições, pois se pode trabalhar com maior número de repetições e menor custo. Portanto, com parcelas STP haverá economia de recursos e sem prejuízos para o Programa de Melhoramento Florestal.

Genetic and non-genetic effects on calf vigor at birth and preweaning mortality in nellore calves

The objective of the present study was to evaluate the genetic and non-genetic effects that influencevigor at birth and preweaning mortality in Nellore calves. A total of 11,727 records of births that occurred between 1978 and 2006, offspring of 363 sires, were analyzed. Poor calf vigor at birth (VB) and preweaning mortality divided into stillbirth (SB), early mortality (EM) and total mortality (TM) were analyzed as binary variables. Generalized linear models were used for the evaluation of non-genetic effects and generalized linear mixed models for genetic effects (sire and animal models). The incidences were 4.75% for VB, 2.66% for SB, 5.28% for EM, and 7.99% for TM. Birth weight was the effect that most influenced the traits studied. Calves weighing less than 22kg(females) and less than 24kg (males) were at a higher risk of low vigor and preweaning mortality. Preweaning mortality was higher among calves born from cows aged .3 and .11 years at calving compared with cows aged 7 to 10 years. Male calves presented less vigor and higher preweaning mortality than female calves. Selection for postweaning weight did not influence preweaning mortality. The heritability estimates ranged between 0.01 and 0.09 for VB, 0.00 and 0.27 for SB, 0.03 and 0.17 for EM and 0.02 and 0.10 for TM. Stillbirth should be included as a selection criterion in breeding programs of Nellore cattle, alone or as part of a selection index, aiming to reduce preweaning mortality. © 2013 Sociedade Brasileira de Zootecnia.

Aspectos genéticos da produção de leite e de seus constituintes em búfalas mestiças

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Estimativas de parâmetros genéticos para escores visuais e características de crescimento na raça Nelore

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Metodologias estatísticas na análise de germinação de sementes de mamona

Pós-graduação em Agronomia (Energia na Agricultura) - FCA

Variabilidades genética e não genética na mortalidade pré-desmama de bezerros de corte

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)