206 resultados para Mitochondriale DNS
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During the process of lateral organ development after plant decapitation, cell division and differentiation occur in a balanced manner initiated by specific signaling, which triggers the reentrance into the cell cycle. Here, we investigated short-term variations in the content of some endogenous signals, such as auxin, cytokinins (Cks), and other mitogenic stimuli (sucrose and glutamate), which are likely correlated with the cell cycle reactivation in the axillary bud primordium of pineapple nodal segments. Transcript levels of cell cycle-associated genes, CycD2;1, and histone H2A were analyzed. Nodal segments containing the quiescent axillary meristem cells were cultivated in vitro during 24 h after the apex removal and de-rooting. From the moment of stem apex and root removal, decapitated nodal segment (DNS) explants showed a lower indol-3-acetic acid (IAA) concentration than control explants, and soon after, an increase of endogenous sucrose and iP-type Cks were detected. The decrease of IAA may be the primary signal for cell cycle control early in G1 phase, leading to the upregulation of CycD2;1 gene in the first h. Later, the iP-type Cks and sucrose could have triggered the progression to S-phase since there was an increase in H2A expression at the eighth h. DNS explants revealed substantial increase in Z-type Cks and glutamate from the 12th h, suggesting that these mitogens could also operate in promoting pineapple cell cycle progression. We emphasize that the use of non-synchronized tissue rather than synchronous cell suspension culture makes it more difficult to interpret the results of a dynamic cell division process. However, pineapple nodal segments cultivated in vitro may serve as an interesting model to shed light on apical dominance release and the reentrance of quiescent axillary meristem cells into the cell cycle.
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As redes de computadores experimentam um grande crescimento não apenas em tamanho, mas também no número de serviços oferecidos e no número de protocolos de alto nível e aplicações que são executados sobre elas. Boa parte desses software (ex.: ICQ e Napster), em geral, não está diretamente ligada a aplicações críticas, mas o seu uso não controlado pode degradar o desempenho da rede. Para que se possa medir o impacto dos mesmos sobre a infra-estrutura, mecanismos de gerência ligados à contabilização e caracterização de tráfego são desejáveis. Por outro lado, alguns protocolos, serviços e aplicações (ex. servidores DNS e Web) suportam aplicações e precisam ser monitorados e gerenciados com maior atenção. Para essa classe de software de rede, a simples contabilização e caracterização de tráfego não é suficiente; tarefas de gerência como teste de serviços, detecção e manipulação de falhas, medição de desempenho e detecção de intrusão são importantes para garantir alta disponibilidade e eficiência da rede e aplicações. As ferramentas existentes para essa finalidade são, entre aspectos, (a) não integradas (necessidade de uma ferramenta para monitorar cada aplicação), (b) centralizadas (não oferecem suporte à distribuição de tarefas de gerenciamento) e (c) pouco flexíveis (dificuldade em gerenciar novos protocolos, serviços e aplicações). Nesse contexto, a tese propõe uma arquitetura, centrada na monitoração passiva em temporal do tráfego de rede, para gerenciamento distribuído de protocolos de alto nível, serviços e aplicações em rede. Baseada da MIB (Management Information Base) Script do IETF (Internet Engineering Task Force), a arquitetura Trace oferece mecanismos para a delegação de tarefas de gerenciamento a gerentes intermediários, que interagem com agentes de monitoração e agentes de ação para executá-las. A tese propõe também PTSL (Protocol Trace Specification Language), uma linguagem gráfica/textual criada para permitir que gerentes de rede especificam as interações de protocolos (traços) que lhes interessam monitorar. As especificações são usadas pelso gerentes intermediários para programar os agentes de monitoração. Uma vez programadas, esses agentes passam a monitorar a ocorrência dos traços.As informações obtidas são analisadas pelos agentes intermediários, que podem requisitar de ação a execução de procedimentos (ex: scripts Perl), possibilitando a automação de diversas tarefas de gerenciamento. A arquitetura proposta é validada por um protótipo: a plataforma de gerenciamento Trace.
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O desprendimento de vórtices é responsável por vibrações prejudiciais a estruturas e pelo aumento de seus coeficientes de arraste. Portanto o correto entendimento e o controle do desprendimento de vórtices é de grande interesse de modo a diminuir custos de manutenção de estruturas estáticas e custos com combustíveis de estruturas móveis, por exemplo. O caráter tridimensional do desprendimento de vórtices a baixos números de Reynolds, entre 100 e 300, é aqui estudado através de Simulações Numéricas Diretas (DNS) do escoamento ao redor de cilindros circulares em duas e três dimensões. O controle do desprendimento de vórtices foi estudado nesta dissertação, através do uso de placas de separação do escoamento em simulações numéricas bidimensionais para números de Reynolds 100, 160 e 300, mostrando que para estes números de Reynolds é possível reduzir as freqüências de desprendimento, e em alguns casos até suprimi-las. A simulação tridimensional para Re = 300 mostrou um escoamento aparentemente bidimensional que afeta sensivelmente a freqüência de desprendimento quando em comparação o caso 2D. Para a realização das simulação numéricas foi utilizado um esquema compacto de diferenças finitas em associação com um método de representação virtual de obstáculos imersos em escoamentos, que permite a representação de geometrias complexas sobre uma malha cartesiana.
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A transição à turbulência em uma camada de mistura estavelmente estratificada é de grande interesse para uma variedade de problemas geofísicos e de engenharia. Esta transição é controlada pela competição entre o cisalhamento do escoamento de base e as forças de empuxo, devido à estratificação em densidade do ambiente. Os efeitos do empuxo atuam no escoamento reduzindo a taxa de crescimento das perturbações e retardando a transição à turbulência, enquanto o cisalhamento fornece energia cinética ao escoamento. O presente trabalho investiga a natureza da transição à turbulência em uma camada de mistura temporal estavelmente estratificada através de Simulação Numérica Direta (DNS) e Simulação de Grandes Escalas (LES). O propósito da investigação é analisar o efeito da estratificação estável no desenvolvimento da instabilidade de Kelvin-Helmholtz (K-H) e na formação dos vórtices longitudinais, que se formam após a saturação dos turbilhões primários de K-H. Além deste propósito, é examinado, utilizando de DNS e LES, o desenvolvimento das instabilidades secundárias de K-H na camada baroclínica. Os testes numéricos tridimensionais são realizados com diferentes tipos de condições iniciais para a flutuação de velocidade transversal, enquanto uma condição forçada é usada para as outras duas componentes de flutuação de velocidade. Em particular, o efeito do comprimento transversal do domínio de cálculo é testado empregando diferentes comprimentos, enquanto são usadas as mesmas dimensões para a direção longitudinal e vertical. As simulações bidimensionais mostram que o aumento da estratificação inibe o processo de emparelhamento, reduz a troca de energia entre os turbilhões de K-H e o escoamento, atenua a instabilidade de K-H e diminui o fluxo vertical de massa. A instabilidade secundária do tipo K-H é identtificada na camada baroclínica para Re ¸ 500 quando há o processo de emparelhamento dos vórtices simulados. Na simulação a Re = 500, a instabilidade secundária de K-H aparece tanto para Ri = 0.07 (fraca estratificação) como para Ri = 0.167 (forte estratificação). Os resultados tridimensionais demonstram que os vórtices longitudinais são claramente formados na camada a Ri = 0. Por outro lado, nos casos estratificados os vórtices são enfraquecidos, devido ao gradiente longitudinal de densidade, que diminui a vorticidade nos turbilhões de K-H enquanto aumenta na região entre eles.
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A tradicional representação da estrutura a termo das taxas de juros em três fatores latentes (nível, inclinação e curvatura) teve sua formulação original desenvolvida por Charles R. Nelson e Andrew F. Siegel em 1987. Desde então, diversas aplicações vêm sendo desenvolvidas por acadêmicos e profissionais de mercado tendo como base esta classe de modelos, sobretudo com a intenção de antecipar movimentos nas curvas de juros. Ao mesmo tempo, estudos recentes como os de Diebold, Piazzesi e Rudebusch (2010), Diebold, Rudebusch e Aruoba (2006), Pooter, Ravazallo e van Dijk (2010) e Li, Niu e Zeng (2012) sugerem que a incorporação de informação macroeconômica aos modelos da ETTJ pode proporcionar um maior poder preditivo. Neste trabalho, a versão dinâmica do modelo Nelson-Siegel, conforme proposta por Diebold e Li (2006), foi comparada a um modelo análogo, em que são incluídas variáveis exógenas macroeconômicas. Em paralelo, foram testados dois métodos diferentes para a estimação dos parâmetros: a tradicional abordagem em dois passos (Two-Step DNS), e a estimação com o Filtro de Kalman Estendido, que permite que os parâmetros sejam estimados recursivamente, a cada vez que uma nova informação é adicionada ao sistema. Em relação aos modelos testados, os resultados encontrados mostram-se pouco conclusivos, apontando uma melhora apenas marginal nas estimativas dentro e fora da amostra quando as variáveis exógenas são incluídas. Já a utilização do Filtro de Kalman Estendido mostrou resultados mais consistentes quando comparados ao método em dois passos para praticamente todos os horizontes de tempo estudados.
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A comparative study of nine assay methods for dextransucrase and related enzymes has been made. A relatively widespread method for the reaction of dextransucrase with sucrose is the measurement of the reducing value of D-fructose by alkaline 3,5-dinitrosalicylate (DNS) and thereby the amount of D-glucose incorporated into dextran. Another method is the reaction with C-14-sucrose with the addition of an aliquot to Whatman 3MM paper squares that are washed three times with methanol to remove C-14-D-fructose and unreacted C-14-sucrose, followed by counting of C-14-dextran on the paper by liquid scintillation counting (LSC). It is shown that both methods give erroneous results. The DNS reducing value method gives extremely high values due to over-oxidation of both D-fructose and dextran, and the C-14-paper square method gives significantly low values due to the removal of some of the C-14-dextran from the paper by methanol washes. In the present study, we have examined nine methods and find two that give values that are identical and are an accurate measurement of the dextransucrase reaction. They are (1) a C-14-sucrose/dextransucrase digest in which dextran is precipitated three times with three volumes of ethanol, dissolved in water, and added to paper and counted in a toluene cocktail by LSC: and (2) precipitation of dextran three times with three volumes of ethanol from a sucrose/dextransucrase digest, dried, and weighed. Four reducing value methods were examined to measure the amount of D-fructose. Three of the four (two DNS methods, one with both dextran and D-fructose and the other with only D-fructose, and the ferricyanide/arsenomolybdate method with is-fructose) gave extremely high values due to over-oxidation of D-fructose, D-glucose, leucrose, and dextran. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.
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Invertase was immobilized on aminopropyl silica (APTS-SiO2) activated with humic substances (APTS-SiO2-HS) and on aminopropyl silica activated with glutaraldehyde (APTS-SiO2-GA). The resulting activity of both systems was compared. Humic substances (HS) used for the activation of the silica were extracted from soil of Cananéia, São Paulo State, Brazil, according to the procedure recommended by the International Humic Substances Society. Activity was determined by measuring the rate of formation of reduced sugars using the reaction with dinitrosalicylic acid (DNS). The amount of HS bound on the APTS-SiO2 was equal to 50 mg. The maximum amount of invertase immobilized on APTS-SiO2-HS was 15200 U/g while in the system APTS-SiO2-GA it was 13400 U/g. The experimental enzymatic activity was 3700 and 3300 U/g, for the systems APTS-SiO2-HS and APTS-SiO2-GA, respectively. Considering the increased amount and activity of immobilized enzyme compared with the glutaraldehyde method, it was concluded that this technique opens a new perspective in the preparation of supports for enzyme immobilization employing humic substances. © Springer-Verlag 2000.
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Termites can degrade up to 90% of the lignocellulose they ingest using a repertoire of endogenous and symbiotic degrading enzymes. Termites have been shown to secrete two main glycoside hydrolases, which are GH1 (EC 3.2.1.21) and GH9 (EC 3.2.1.4) members. However, the molecular mechanism for lignocellulose degradation by these enzymes remains poorly understood. The present study was conducted to understand the synergistic relationship between GH9 (CgEG1) and GH1 (CgBG1) from Coptotermes gestroi, which is considered the major urban pest of São Paulo State in Brazil. The goal of this work was to decipher the mode of operation of CgEG1 and CgBG1 through a comprehensive biochemical analysis and molecular docking studies. There was outstanding degree of synergy in degrading glucose polymers for the production of glucose as a result of the endo-β-1,4-glucosidase and exo-β-1,4-glucosidase degradation capability of CgEG1 in concert with the high catalytic performance of CgBG1, which rapidly converts the oligomers into glucose. Our data not only provide an increased comprehension regarding the synergistic mechanism of these two enzymes for cellulose saccharification but also give insight about the role of these two enzymes in termite biology, which can provide the foundation for the development of a number of important applied research topics, such as the control of termites as pests as well as the development of technologies for lignocellulose-to-bioproduct applications. © 2013 Elsevier Ltd.
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
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Pós-graduação em Engenharia Elétrica - FEIS