Analysis of physiological data from the International Clonal Trial (CFC)

A range of physiological parameters (canopy light transmission, canopy shape, leaf size, flowering and flushing intensity) were measured from the International Clone Trial, typically over the course of two years. Data were collected from six locations, these being: Brazil, Ecuador, Trinidad, Venezuela, Côte d’Ivoire and Ghana. Canopy shape varied significantly between clones, although it showed little variation between locations. Genotypic variation in leaf size was differentially affected by the growth location; such differences appeared to underlie a genotype by environment interaction in relation to canopy light transmission. Flushing data were recorded at monthly intervals over the course of a year. Within each location, a significant interaction was observed between genotype and time of year, suggesting that some genotypes respond to a greater extent than others to environmental stimuli. A similar interaction was observed for flowering data, where significant correlations were found between flowering intensity and temperature in Brazil and flowering intensity and rainfall in Côte d’Ivoire. The results demonstrate the need for local evaluation of cocoa clones and also suggest that the management practices for particular planting material may need to be fine-tuned to the location in which they are cultivated.

The role of the international cocoa germplasm database and the international cocoa quarantine centre in information management and distribution of cocoa genetic resources

A range of physiological parameters (canopy light transmission, canopy shape, leaf size, flowering and flushing intensity) were measured from the International Clone Trial, typically over the course of two years. Data were collected from six locations, these being: Brazil, Ecuador, Trinidad, Venezuela, Côte d’Ivoire and Ghana. Canopy shape varied significantly between clones, although it showed little variation between locations. Genotypic variation in leaf size was differentially affected by the growth location; such differences appeared to underlie a genotype by environment interaction in relation to canopy light transmission. Flushing data were recorded at monthly intervals over the course of a year. Within each location, a significant interaction was observed between genotype and time of year, suggesting that some genotypes respond to a greater extent than others to environmental stimuli. A similar interaction was observed for flowering data, where significant correlations were found between flowering intensity and temperature in Brazil and flowering intensity and rainfall in Côte d’Ivoire. The results demonstrate the need for local evaluation of cocoa clones and also suggest that the management practices for particular planting material may need to be fine-tuned to the location in which they are cultivated.

APOE genotype influences triglyceride and C-reactive protein responses to altered dietary fat intake in UK adults

Background: The response of plasma lipids to dietary fat manipulation is highly heterogeneous, with some indications that APOE genotype may be important. Objective: The objective was to use a prospective recruitment approach to determine the effect of dietary fat quantity and composition on both lipid and nonlipid cardiovascular disease biomarkers according to APOE genotype. Design: Participants had a mean (±SD) age of 51 ± 9 y and a BMI (in kg/m2) of 26.0 ± 3.8 (n = 44 E3/E3, n = 44 E3/E4) and followed a sequential dietary intervention (the SATgenϵ study) in which they were assigned to a low-fat diet, a high-fat high-SFA (HSF) diet, and the HSF diet with 3.45 g DHA/d (HSF-DHA), each for 8 wk. Fasting blood samples were collected at the end of each intervention arm. Results: An overall diet effect was evident for all cholesterol fractions (P < 0.01), with no significant genotype × diet interactions observed. A genotype × diet interaction (P = 0.033) was evident for plasma triglycerides, with 17% and 30% decreases in APOE3/E3 and APOE3/E4 individuals after the HSF-DHA diet relative to the low-fat diet. A significant genotype × diet interaction (P = 0.009) was also observed for C-reactive protein (CRP), with only significant increases in concentrations after the HSF and HSF-DHA diets relative to the low-fat diet in the APOE3/E4 group (P < 0.015). Conclusions: Relative to the wild-type APOE3/E3 group, our results indicate a greater sensitivity of fasting triglycerides and CRP to dietary fat manipulation in those with an APOE3/E4 genotype (25% population), with no effect of this allelic profile on cholesterol concentrations. The SATgenϵ study was registered at clinicaltrials.gov as NCT01384032.

Efeito de períodos de semeadura e das condições de armazenamento sobre a qualidade de grãos de feijão para o cozimento

A conservação adequada pode manter as características do grão recém-colhido por mais tempo, assegurando o valor comercial do produto estocado. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de períodos de semeadura na qualidade de cozimento de grãos de feijão da cultivar TPS Nobre, quando armazenados em diferentes condições de temperatura, de umidade e tempo de estocagem. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com três repetições. Os tratamentos consistiram da combinação de três períodos de semeadura, com três ambientes de armazenamento e três tempos de armazenamento dos grãos (0, 3 e 6 meses). A interpretação dos resultados permitiu inferir que as porcentagens de grãos normais e de grãos duros revelaram comportamento diferenciado em função do ambiente e do tempo de armazenamento. Constatou-se maior porcentagem de grãos duros após seis meses de armazenamento, realizado sob temperatura média do ar de 12 °C e umidade relativa de 45%-50% e também quando os grãos foram resultantes de semeadura realizada tardiamente (21/10/03). A absorção de água e o tempo de cozimento dos grãos de feijão foram alterados em função do período de semeadura, das condições e do tempo de armazenamento, caracterizando a existência de efeitos da interação genótipos x ambientes na qualidade para o cozimento dos grãos. Sendo assim, maior ou menor tempo para a absorção de água ou para o cozimento podem ser requeridos em função da qualidade dos grãos no momento da colheita ou das condições de temperatura e de umidade de armazenamento.

Qualidade nutricional e tecnológica de genótipos de feijão cultivados em diferentes safras agrícolas

O feijão é um dos alimentos mais produzidos em todo o território nacional, sendo intensa a busca por cultivares produtivas, adaptadas ao local de cultivo e com boas características culinárias. Assim, este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar o comportamento de genótipos de feijoeiro, quanto ao teor de proteína, tempo para cozimento e capacidade de hidratação dos grãos. O experimento foi desenvolvido em três safras, correspondendo às épocas da seca 2005, das águas 2005 e da seca 2006. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com 24 tratamentos, representados pelos genótipos de feijoeiro dos grupos comerciais Carioca e Preto, com quatro repetições. Os grãos de feijão produzidos na safra das águas 2005 tiveram maior tempo médio para cozimento, menor teor de proteína bruta e maior tempo para máxima hidratação. Os genótipos LP 98-20 e CNFC 9494 (Grupo comercial Carioca), como também as cultivares Graúna e IAC Una (Grupo comercial Preto) destacaram-se quanto ao menor tempo para cozimento nas três safras estudadas, enquanto Gen 96A10, CNFC 9484 (Ambos do grupo comercial Carioca) e CNFP 10138 (Grupo comercial Preto) destacaram-se em relação aos demais pela baixa porcentagem de grãos de casca dura e menor tempo para a máxima hidratação dos grãos.

Adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos de cenoura

Avaliaram-se a adaptabilidade e a estabilidade fenotípica de dez genótipos de cenoura, nove de polinização aberta [Alvorada (FELTRIN); Tropical (ISLA); Brasília (ISLA); Nova Brasília (ISLA); Carandaí (SVS); Brasília (SVS); Brazlândia (HORTEC); HT-2000 (HORTEC), e Brasília-RL (SAKATA)] e o híbrido AF-845 (SAKATA), em semeaduras, de janeiro e março, em São José do Rio Pardo (SP), janeiro e fevereiro, em Ponta Grossa (PR), e na primeira e última semana de fevereiro, em São Gotardo (MG), e Carandaí (MG), totalizando oito experimentos (SJRP-JAN; SJRP-MAR; PG-JAN; PG-FEV; SG-FEV'; SG-FEV''; C-FEV', e C-FEV''), que foram implementados em blocos casualizados com quatro repetições. Os dados foram submetidos à análise de variância individual e conjunta, e à análise de adaptabilidade e de estabilidade. Dos oito ambientes testados, apenas C-FEV'', PG-JAN e SG-FEV'' foram considerados favoráveis ao cultivo de cenoura, com destaque para C-FEV''. Entre genótipos, na maioria dos ambientes, 'Brazlândia' se destacou tanto na produtividade total, quanto na produtividade comercial de raízes. Na análise de adaptabilidade, 'Brazlândia' e 'Brasília-RL' indicaram possuir desempenho mais do que proporcional à melhoria promovida pelo ambiente, sendo indicados para semeaduras em ambientes favoráveis. O híbrido AF-845 mostrou ter pequena capacidade em responder às variações ambientais, não sendo indicado para nenhum dos ambientes estudados. Os genótipos de cenoura, em geral, apresentaram estabilidade de comportamento nos ambientes estudados.

Adaptabilidade e estabilidade fenotípica de cultivares de cenoura

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Use of ridge regression for the prediction of early growth performance in crossbred calves

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Interação genótipo-ambiente em cruzamentos de bovinos de corte

Dados de rebanhos bovinos comerciais foram analisados com o objetivo de estimar as interações dos efeitos genéticos com o ambiente que podem influenciar a avaliação de características de crescimento em rebanhos de animais puros e cruzados. O conjunto de dados analisado foi obtido a partir de animais das raças Hereford, Nelore e seus cruzamentos. As características em estudo foram os pesos à desmama e ao sobreano dos animais. As análises estatísticas foram realizadas pelo método dos quadrados mínimos e o modelo proposto incluiu os efeitos de região, grupo de contemporâneos dentro de região, mês de nascimento e sexo do bezerro, os efeitos lineares e quadráticos para a idade do bezerro e idade da vaca ao parto, ambas analisadas dentro de sexo, e os efeitos de grupo genético e da interação grupo genético × região. de modo geral, o desempenho de todos os grupos genéticos foi influenciado pelo efeito de região. Além disso, observou-se tendência de que o aumento da proporção de genes zebuínos promoveu diminuição na diferença de desempenho entre as regiões. Todos os genótipos foram beneficiados no ambiente menos restritivo, o que indica a existência de interação genótipo-ambiente e comprova a importância de que sistemas de cruzamento sejam realizados de forma a manter a adaptação das matrizes e de seus produtos.

Interaction between resistant tomato genotypes and plant extracts on Bemisia tabaci (Genn.) biotype B

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Seleção de progênies de meios-irmãos do composto Isanão VF-1 de milho na safra e safrinha

O aumento significativo da produção de milho na segunda safra no Brasil, principalmente no centro-sul do país, têm estimulado os programas de melhoramento da cultura a selecionar genótipos que sejam adaptáveis às condições climáticas das diferentes épocas de semeadura. Nesse sentido, o objetivo do presente trabalho foi quantificar a interação progênies x épocas de semeadura e verificar seus reflexos no progresso genético com o uso de índice de seleção multivariado para seleção de progênies do Composto Isanão VF-1 de milho. As semeaduras foram realizadas na segunda safra em 2004 e na primeira safra do ano agrícola 2004/05. Foram utilizadas 71 progênies de meios irmãos avaliadas em blocos ao acaso, com três repetições. Os caracteres avaliados foram: altura de plantas, altura de espigas, tombamento, prolificidade e rendimento de grãos. Realizaram-se a decomposição da interação progênies x épocas e foram estimados os ganhos pelo índice de seleção descrito por Mulamba e Mock. Houve predomínio da interação do tipo simples para maioria dos caracteres, exceto para prolificidade, que revelou 86% de interação do tipo complexa. Pelo índice de Mulamba e Mock, os ganhos proporcionais mais adequados para o conjunto de caracteres avaliados foi obtido pelos pesos econômicos atribuídos por tentativas. Os ganhos preditos foram de 1,41, 0,86, -13,03, 9,54 e 16,12% para altura de planta, altura de espiga, tombamento, prolificidade e rendimento de grãos, respectivamente.

Temporal stability for unpredictable annual climatic variability for Hevea genotype selection

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Produtividade, estabilidade e adaptabilidade em progênies de Myracrodruon urundeuva F.F. & M.F. Allemão – Anacardiaceae

The use and inadequate exploitation of natural resources is restricting the occurrence of aroeira (Myracrodruon urundeuva F.F. & M.F. Allemao), which now is on the FAO list of endangered species. This exploitation causes a decrease in the genetic base of M. urundeuva populations, which makes it difficult to find genotypes with stability and adaptability to different growing conditions. This study aimed at estimating the genetic variation and productivity, stability and adaptability of progenies of a M. urundeuva natural population, from the Ecological Station of Paulo de Faria - SP, under different planting systems. DBH (diameter at breast height) was evaluated in four progeny tests of M. urundeuva: i) planted with Anandenanthera falcata and Guazuma ulmifolia (TP-AMA); ii) single (TP-ASO); iii) planted with annual crops (TP-SAF) and iv) planted with Corymbia citriodora (TP-EUCA), installed in Selviria-MS. The experimental design consisted of complete randomized blocks with three replications and a variable number of plants per plot in each of the four planting systems. From the joint analysis of the planting systems studied, it was found that: i) there were variations among planting systems particularly in TP-SAF; ii) only in TP-EUCA it was possible to detect variations among the progenies; iii) the effects of the genotype x environment interaction were not significant. Thereby, the harmonic mean of genotypic values (MHVG), the relative performance of genotypic values from the mean of each site (PRVG) and the harmonic mean of the relative performance of genotypic values (MHPRVG) for DBH showed, respectively: progenies with greater stability, adaptability, and stability and simultaneous adaptability within different planting systems. The use of these selection criteria provided a more refined selection of the best progenies of M. urundeuva under the different planting systems studied.

Validação cruzada com correção de autovalores e regressão isotônica nos modelos de efeitos principais aditivos e interação multiplicativa

This paper presents an application of AMMI models - Additive Main effects and Multiplicative Interaction model - for a thorough study about the effect of the interaction between genotype and environment in multi-environments experiments with balanced data. Two methods of crossed validation are presented and the improvement of these methods through the correction of eigenvalues, being these rearranged by the isotonic regression. A comparative study between these methods is made, with real data. The results show that the EASTMENT & KRZANOWSKI (1982) method selects a more parsimonious model and when this method is improved with the correction of the eigenvalues, the number of components are not modified. GABRIEL (2002) method selects a huge number of terms to hold back in the model, and when this method is improved by the correction of eigenvalue, the number of terms diminishes. Therefore, the improvement of these methods through the correction of eigenvalues brings a great benefit from the practical point of view for the analyst of data proceeding from multi-ambient, since the selection of numbers of multiplicative terms represents a profit of the number of blocks (or repetitions), when the model AMMI is used, instead of the complete model.

Avaliação final de clones IAC de cana-de-açúcar da série 1982, em latossolo roxo da região de Ribeirão Preto

Doze clones de cana-de-açúcar, provenientes de hibridações realizadas em 1982, foram avaliados em três experimentos, em latossolo roxo, da região de Ribeirão Preto (SP). Para tanto, utilizou-se o delineamento em blocos ao acaso, com seis repetições, efetuando-se a análise estatística com a média das quatro colheitas (1. º, 2.º, 3.º e 4.º cortes). Avaliaram-se as produtividades de cana e açúcar, pol% cana, fibra% cana, população de colmos e intensidade de florescimento. Considerando-se essas características, assim como a curva de maturação dos clones, e tomando-se como padrões as variedades SP70-1143, SP71-1406, IAC64-257 e RB76-5418, o clone IAC82-2045 apresentou um desempenho equivalente, caracterizando-se como material de alta produtividade agrícola, boa riqueza, com a maturação do meio para o final de safra, podendo ser incluído em novos estudos de manejo varietal para outras condições paulistas. Ainda se destacou, com algumas restrições, indicadas pela interação ambiente x clone para a produtividade agrícola, o clone IAC82-2120, com boa riqueza e possibilidade de ser colhido a partir de junho. Estimando-se os parâmetros genéticos, observou-se, mediante a componente da variância genótipo x ambiente, a significativa resposta dos genótipos a ambientes específicos, mais acentuadamente para os caracteres produtivi-dade agrícola e produtividade média de açúcar, e menos expressiva para teor de sacarose.