Modelos de previsão de preços de commodities

O principal objectivo deste trabalho assenta em desenvolver modelos de previsão de preços de commodities para assim comparar a capacidade preditiva da simulação de Monte Carlo com a das redes neuronais. A simulação de Monte Carlo é principalmente utilizada para avaliar as opções, já as redes neuronais são utilizadas para fazer previsões, classificações, clustering ou aproximação de funções. Os diversos modelos desenvolvidos foram aplicados na previsão do preço futuro do milho, petróleo, ouro e cobre. Sendo que os horizontes temporais testados neste trabalho foram 1 dia, 5 dias, 20 dias e 60 dias. Através da análise do erro absoluto médio percentual (MAPE) concluiu-se que no geral o modelo individual que apresentou um melhor desempenho preditivo foram as redes neuronais. Contudo, nas previsões a 1 e a 5 dias os resultados obtidos foram semelhantes para ambos os modelos. Para se tentar melhorar os resultados obtidos pelos modelos individuais foram aplicadas algumas técnicas de combinação de modelos. A combinação de modelos demonstrou no geral capacidade para melhorar os resultados dos modelos individuais, porém apenas para o horizonte a 60 dias é que os resultados melhoraram significativamente.

Família de DSLs para integrated modular avionics

Na atualidade existe a necessidade de produzir novos aviões de forma rápida, eficiente e económica com o objetivo de abrir novas rotas de voo, expansão das já existentes e substituição de aviões em fim de vida útil. Neste contexto, e sem nunca deixar de cumprir os apertados requisitos do domínio que incluem a exigência de elevada qualidade, a indústria adotou a arquitetura IMA que permite executar várias aplicações aviónicas num único sistema de computação partilhado. Com esta arquitetura, o desenvolvimento do software para as aeronaves ganhou uma elevada relevância, sendo necessário gerar código automaticamente, reutilizar código já testado proveniente de outras aplicações anteriormente desenvolvidas e garantir o mais cedo possível que o software desenvolvido se encontra de acordo com os standards. Apesar da complexidade do domínio, desenvolveu-se uma ferramenta que permite produzir a estrutura do código de novas aplicações para a aviónica. Aferramenta lida com a variabilidade das diversas linhas de produto e reduz o tempo de desenvolvimento. Uma DSL poderia ser uma solução apropriada, pois permite cobrir diversos requisitos exigidos, no entanto, esta solução não é exequível porque seria necessário produzir uma linguagem para cada configuração de software aviónico diferente se pretendêssemos tirar partido da especificidade. Com esta dissertação, solucionou-se esta dificuldade com recurso à noção de família de DSLs. Trata-se de um conjunto de linguagens para um domínio específico, que apresentam um conjunto comum de conceitos chave, mas que adaptam alguns desses conceitos para cumprir a variabilidade dos requisitos. Utilizou-se a abordagem MDD para desenvolver um gerador automático de DSLs que é capaz de produzir a linguagem desejada de acordo com a configuração de software pretendida para a partição pertencente a um módulo aviónico. As linguagens geradas apresentam um nível de usabilidade adequada para o domínio, bem como têm a capacidade de validar as construções efetuadas usando a DSL e produzir os artefactos pretendidos.

Automatic delimitation of the clinical region of interest in ultra-wide field of view images of the retina

Retinal ultra-wide field of view images (fundus images) provides the visu-alization of a large part of the retina though, artifacts may appear in those images. Eyelashes and eyelids often cover the clinical region of interest and worse, eye-lashes can be mistaken with arteries and/or veins when those images are put through automatic diagnosis or segmentation software creating, in those cases, the appearance of false positives results. Correcting this problem, the first step in the development of qualified auto-matic diseases diagnosis programs can be done and in that way the development of an objective tool to assess diseases eradicating the human error from those processes can also be achieved. In this work the development of a tool that automatically delimitates the clinical region of interest is proposed by retrieving features from the images that will be analyzed by an automatic classifier. This automatic classifier will evaluate the information and will decide which part of the image is of interest and which part contains artifacts. The results were validated by implementing a software in C# language and validated through a statistical analysis. From those results it was confirmed that the methodology presented is capable of detecting artifacts and selecting the clin-ical region of interest in fundus images of the retina.

Oi S.A.

UNL - NSBE

Aplicação do Seis Sigma na avaliação da inexatidão dos resultados laboratoriais do parâmetro cortisol sérico

No desenvolvimento deste caso de estudo, dentro do Programa Nacional de Avaliação Externa da Qualidade do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge utilizou-se o Seis Sigma como metodologia e como métrica, de maneira a estruturar de forma intuitiva a sua aplicação na resolução de problemas e definir o principal objetivo. Como metodologia, o Seis Sigma recorre a diversas técnicas e ferramentas da qualidade, que visam a melhoria contínua de procedimentos. Enquanto métrica, o Seis Sigma apresenta uma meta a atingir para a qualidade. O ideal seria atingir-se a meta dos Seis Sigma, que significa 3,4 defeitos por milhão de oportunidades (taxa de defeitos de um determinado procedimento). Para reduzir a variabilidade de resultados entre laboratórios, referentes ao parâmetro Cortisol Sérico, aplicou-se o ciclo DMAIC (Define – Measure – Analyze – Improve – Control), a que correspondem cinco etapas diferentes. Em cada uma destas etapas utilizam-se as técnicas e ferramentas da qualidade, como referido anteriormente acerca do Seis Sigma enquanto metodologia, com o objetivo de melhorar processos. Inicia-se a primeira etapa com a identificação do problema e finaliza-se a última com o controlo e monitorização dos efeitos provocados pelas ações de melhoria implementadas. O objetivo dos programas de Avaliação Externa da Qualidade do Programa Nacional de Avaliação Externa da Qualidade é avaliar a performance quanto à variabilidade/uniformidade de resultados entre os laboratórios participantes. É de extrema importância a harmonização de resultados clínicos entre laboratórios, pois são estes resultados que fornecem informações ao profissional de saúde, sobre o estado de saúde do paciente, auxiliando no diagnóstico, tratamento e controlo de doenças. Caso isto não aconteça, será um fator crítico que pode fazer a diferença na saúde pública. Foram identificadas as causas de erros sistemáticos, causas de inexatidão laboratorial, a nível de métodos, equipamentos, reagentes e calibradores utilizados em laboratório e implementadas ações de melhoria mais relevantes. No final obteve-se um nível de qualidade sigma superior ao inicial, tal como tinha sido previsto nos objetivos. O nível da qualidade deve ser controlado ao longo do tempo, com o objetivo de identificar novas anomalias e melhorar continuamente.

Serviços públicos em diferentes contextos territoriais: (re)organização das redes e relações com os sistemas urbanos

A presença de serviços públicos nos aglomerados populacionais suscita diferentes arti-culações e rearranjos socioterritoriais e promove a sua dinamização e especialização, fomenta a economia local e contribui, direta e indiretamente, para a coesão, o desen-volvimento, a atratividade, a competitividade e a resiliência dos territórios. Nas últimas décadas, as lógicas da oferta e da procura dos serviços públicos têm evoluído rapida-mente, passando de um modelo de gestão fechado e burocrático, para um modelo mais aberto, diversificado, simplificado e participativo. Com elas, surgiram (novos) de-safios na sua gestão, que vão desde a sua sustentabilidade económica até aos impac-tos sociais e territoriais resultantes da modernização, sem esquecer a maior (e cres-cente) exigência do cidadão. Estas mutações têm repercussões na filosofia da sua or-ganização e no modus operandi, com uma crescente orientação para as necessidades da procura e a satisfação do utente, procurando, em simultâneo, reduzir os custos e aumentar a produtividade e a qualidade dos serviços prestados, com base em políticas de inovação e em parcerias e governação em rede. Na prática, estas alterações condu-zem a processos diferenciados, que têm passado pela fusão, reconversão ou mesmo encerramento de serviços públicos. Num contexto de crise económico-financeira, como o que se vive em Portugal, e aten-dendo às mutações ocorridas na oferta e na procura de serviços públicos de educação, saúde, eventos de vida, defesa e segurança e justiça, importa refletir sobre os concei-tos inerentes a estes serviços e sintetizar as principais dinâmicas nesse período de tempo, tendo como pressupostos que, por um lado, o território é um elemento dife-renciador na prestação e na utilização de serviços e que, por outro lado, estes serviços, pela sua natureza estratégica para a sociedade e para a economia, exigem a definição de políticas e de estratégias territoriais consentâneas e inclusivas. Esta investigação centra a sua análise em dois âmbitos geográficos. Numa primeira fa-se, à escala de Portugal continental, onde se obtém um retrato atual da espacialização dos serviços públicos referidos acima. Em seguida, após a criação de uma metodologia inovadora baseada em análises e modelação de informação geográfica para a tipifica-ção dos diferentes tipos de territórios, são identificados três casos de estudo regionais, com características distintas. Assim, são estudados territórios metropolita-nos/densamente urbanizados (constituídos pelos concelhos de Lisboa, Almada, Seixal, Palmela, Sesimbra e Setúbal), eixo urbano-rural (Évora, Portel, Viana do Alentejo, Vidi-gueira, Cuba e Beja) e territórios profundamente rurais (Barrancos, Moura, Serpa e Mértola), para os quais foi realizado um inquérito à população, com o objetivo de compreender a utilização que fazem dos serviços públicos e quais as suas expetativas em relação aos mesmos. Os resultados obtidos para as análises nacional e regionais são acompanhados por uma reflexão sobre a territorialização das políticas de serviços públicos, as quais incidem em matérias relacionadas com o seu planeamento e, sobre-tudo, com a sua gestão.

"Virar a Sala de Aula”: centrar a aprendizagem no aluno recorrendo a ferramentas cognitivas

Relatório de projeto de mestrado em Ensino de Informática

A breakthrough on Amanita phalloides poisoning: an effective antidotal effect by polymyxin B

Amanita phalloides is responsible for more than 90 % of mushroom-related fatalities, and no effective antidote is available. a-Amanitin, the main toxin of A. phalloides, inhibits RNA polymerase II (RNAP II), causing hepatic and kidney failure. In silico studies included docking and molecular dynamics simulation coupled to molecular mechanics with generalized Born and surface area method energy decomposition on RNAP II. They were performed with a clinical drug that shares chemical similarities to a-amanitin, polymyxin B. The results show that polymyxin B potentially binds to RNAP II in the same interface of a-amanitin, preventing the toxin from binding to RNAP II. In vivo, the inhibition of the mRNA transcripts elicited by a-amanitin was efficiently reverted by polymyxin B in the kidneys. Moreover, polymyxin B significantly decreased the hepatic and renal a-amanitin-induced injury as seen by the histology and hepatic aminotransferases plasma data. In the survival assay, all animals exposed to a-amanitin died within 5 days, whereas 50 % survived up to 30 days when polymyxin B was administered 4, 8, and 12 h post-a-amanitin. Moreover, a single dose of polymyxin B administered concomitantly with a-amanitin was able to guarantee 100 % survival. Polymyxin B protects RNAP II from inactivation leading to an effective prevention of organ damage and increasing survival in a-amanitin-treated animals. The present use of clinically relevant concentrations of an already human-use-approved drug prompts the use of polymyxin B as an antidote for A. phalloides poisoning in humans.

Early loss of splenic Tfh cells in SIV-infected rhesus macaques

Early loss of splenic Tfh cells in SIV-infected rhesus macaques

The Warburg effect in mycobacterial granulomas is dependent on the recruitment and activation of macrophages by interferon-γ

Granulomas are the hallmark of mycobacterial disease. Here, we demonstrate that both the cell recruitment and the increased glucose consumption in granulomatous infiltrates during Mycobacterium avium infection are highly dependent on interferon-y (IFN-y). Mycobacterium avium-infected mice lacking IFN-y signalling failed to developed significant inflammatory infiltrations and lacked the characteristic uptake of the glucose analogue fluorine-18-fluorodeoxyglucose (FDG). To assess the role of macrophages in glucose uptake we infected mice with a selective impairment of IFN-y signalling in the macrophage lineage (MIIG mice). Although only a partial reduction of the granulomatous areas was observed in infected MIIG mice, the insensitivity of macrophages to IFN-y reduced the accumulation of FDG. In vivo, ex vivo and in vitro assays showed that macrophage activated by IFN-y displayed increased rates of glucose uptake and in vitro studies showed also that they had increased lactate production and increased expression of key glycolytic enzymes. Overall, our results show that the activation of macrophages by IFN-y is responsible for the Warburg effect observed in organs infected with M. avium.

Myeloid Sirtuin 2 expression does not impact long-term Mycobacterium tuberculosis control

Sirtuins (Sirts) regulate several cellular mechanisms through deacetylation of several transcription factors and enzymes. Recently, Sirt2 was shown to prevent the development of inflammatory processes and its expression favors acute Listeria monocytogenes infection. The impact of this molecule in the context of chronic infections remains unknown. We found that specific Sirt2 deletion in the myeloid lineage transiently increased Mycobacterium tuberculosis load in the lungs and liver of conditional mice. Sirt2 did not affect long-term infection since no significant differences were observed in the bacterial burden at days 60 and 120 post-infection. The initial increase in M. tuberculosis growth was not due to differences in inflammatory cell infiltrates in the lung, myeloid or CD4+ T cells. The transcription levels of IFN-?, IL-17, TNF, IL-6 and NOS2 were also not affected in the lungs by Sirt2-myeloid specific deletion. Overall, our results demonstrate that Sirt2 expression has a transitory effect in M. tuberculosis infection. Thus, modulation of Sirt2 activity in vivo is not expected to affect chronic infection with M. tuberculosis.

NF-kB pathway controls mitochondrial dynamics

The Optic atrophy 1 protein (OPA1) is a key element in the dynamics and morphology of mitochondria. We demonstrated that the absence of I?B kinase-a, which is a key element of the nonclassical NF-?B pathway, has an impact on the mitochondrial network morphology and OPA1 expression. In contrast, the absence of NF-?B essential modulator (NEMO) or I?B kinase-ß, both of which are essential for the canonical NF-?B pathway, has no impact on mitochondrial dynamics. Whereas Parkin has been reported to positively regulate the expression of OPA1 through NEMO, herein we found that PARK2 overexpression did not modify the expression of OPA1. PARK2 expression reduced the levels of Bax, and it prevented stress-induced cell death only in Bak-deficient mouse embryonic fibroblast cells. Collectively, our results point out a role of the nonclassical NF-?B pathway in the regulation of mitochondrial dynamics and OPA1 expression.

Concise server-wide causality management for eventually consistent data stores

Large scale distributed data stores rely on optimistic replication to scale and remain highly available in the face of net work partitions. Managing data without coordination results in eventually consistent data stores that allow for concurrent data updates. These systems often use anti-entropy mechanisms (like Merkle Trees) to detect and repair divergent data versions across nodes. However, in practice hash-based data structures are too expensive for large amounts of data and create too many false conflicts. Another aspect of eventual consistency is detecting write conflicts. Logical clocks are often used to track data causality, necessary to detect causally concurrent writes on the same key. However, there is a nonnegligible metadata overhead per key, which also keeps growing with time, proportional with the node churn rate. Another challenge is deleting keys while respecting causality: while the values can be deleted, perkey metadata cannot be permanently removed without coordination. Weintroduceanewcausalitymanagementframeworkforeventuallyconsistentdatastores,thatleveragesnodelogicalclocks(BitmappedVersion Vectors) and a new key logical clock (Dotted Causal Container) to provides advantages on multiple fronts: 1) a new efficient and lightweight anti-entropy mechanism; 2) greatly reduced per-key causality metadata size; 3) accurate key deletes without permanent metadata.

Promising blood-derived biomarkers for estimation of the postmortem interval

A precise estimation of the postmortem interval (PMI) is one of the most important topics in forensic pathology. However, the PMI estimation is based mainly on the visual observation of cadaverous pheno- mena (e.g. algor, livor and rigor mortis) and on alternative methods such as thanatochemistry that remain relatively imprecise. The aim of this in vitro study was to evaluate the kinetic alterations of several bio- chemical parameters (i.e. proteins, enzymes, substrates, electrolytes and lipids) during putrefaction of human blood. For this purpose, we performed kinetic biochemical analysis during a 264 hour period. The results showed a significant linear correlation between total and direct bilirubin, urea, uric acid, transferrin, immunoglobulin M (IgM), creatine kinase (CK), aspartate transaminase (AST), calcium and iron with the time of blood putrefaction. These parameters allowed us to develop two mathematical models that may have predictive values and become important complementary tools of traditional methods to achieve a more accurate PMI estimation

Síntese e testes in vitro de novas pirimido[5,4-d] pirimidinas em células resistentes do cancro coloretal

Dissertação de mestrado em Química Medicinal