Espacialização vertical e horizontal dos indicadores de qualidade para um latossolo vermelho cultivado com citros

O objetivo deste trabalho foi verificar a forma de espacialização vertical e horizontal dos indicadores de qualidade química, física e hídrica de um Latossolo Vermelho distrófico textura média, cultivado com citros. O pomar de laranjeira Valência sobre limoeiro Cravo foi plantado em 1995, em Alto Paraná, região noroeste do Paraná. Em agosto de 2002, coletaram-se amostras deformadas e indeformadas de solo para realizar determinações químicas, físicas e hídricas. A amostragem foi feita em 24 transeções perpendiculares aos troncos das laranjeiras, em duas profundidades (0-0,20 e 0,20-0,40 m) e em três posições (projeção da copa da laranjeira, rodado da entrelinha e centro da entrelinha). Os indicadores avaliados foram submetidos às análises multivariadas, por meio dos componentes principais, e agrupados pelo método de Tocher. Os resultados demonstraram que a qualidade do solo apresentou espacialização heterogênea entre os indicadores de qualidade física, química e hídrica do solo, resultante das ações de manejo do pomar de laranjeira. A integração dos indicadores de qualidade física, química e hídrica do solo caracterizou a espacialização vertical da qualidade do solo (0-0,40 m) na projeção da copa da laranjeira e a espacialização vertical e horizontal (0-0,20 e 0,20-0,40 m) no rodado da entrelinha e centro da entrelinha. No rodado da entrelinha (0-0,20 m) ocorreu a maior restrição física e hídrica associada à melhor condição química do solo para as laranjeiras.

Consolidômetro: equipamento pneumático-eletrônico para avaliação do estado de consolidação do solo

A obtenção da pressão de preconsolidação (sigmap) se dá a partir de um método denominado ensaio de consolidação, cuja definição consiste no processo de transferência gradual de uma carga aplicada ao solo até que todos os vazios deste sejam comprimidos. O ensaio de consolidação preconiza a utilização de um consolidômetro. Entretanto, esse equipamento não é ainda produzido no Brasil, e os modelos disponíveis para importação são de alto custo. Motivos como estes têm inviabilizado, em alguns casos, o acesso por parte de pesquisadores e agricultores às informações sobre a Capacidade de Suporte de Carga (CSC) do solo. Como alternativa, este trabalho teve por objetivo desenvolver e avaliar um equipamento pneumático-eletrônico que possibilitasse a obtenção de sigmap. O equipamento foi desenvolvido no Núcleo de Estudos de Máquinas e Pneus Agrícolas (NEMPA) da Faculdade de Ciências Agronômicas da Universidade Estadual Paulista, campus de Botucatu, SP. A sua avaliação se deu por meio de ensaios uniaxiais, os quais foram realizados em corpos-de-prova de duas camadas (superficial e subsuperficial) de um Latossolo Vermelho. O desempenho do equipamento foi constatado durante a sua avaliação; nas curvas de compressão do solo, verificaram-se incrementos dos valores de densidade do solo, isto é, variação no recalque dos corpos-de-prova em função do aumento dos níveis de pressão e de crescentes teores de água. A eficiência do equipamento na realização dos ensaios uniaxiais pôde ser comprovada pelo comportamento diferenciado tanto das curvas de compressão como das equações obtidas para os modelos de capacidade de suporte de carga, as quais foram capazes de detectar os diferentes graus de consolidação, assim como as distintas histórias de tensão da estrutura de cada camada do Latossolo Vermelho.

The interplay between relatedness and horizontal gene transfer drives the evolution of plasmid-carried public goods.

Plasmids carry a wide range of genes that are often involved in bacterial social behaviour. The question of why such genes are frequently mobile has received increasing attention. Here, we use an explicit population genetic approach to model the evolution of plasmid-borne bacterial public goods production. Our findings highlight the importance of both transmission and relatedness as factors driving the evolution of plasmid-borne public goods production. We partition the effects of plasmid transfer of social traits into those of infectivity and the effect of increased relatedness. Our results demonstrate that, owing to its effect on relatedness, plasmid mobility increases the invasion and stability of public goods, in a way not seen in individually beneficial traits. In addition, we show that plasmid transfer increases relatedness when public goods production is rare but this effect declines when production is common, with both scenarios leading to an increase in the frequency of plasmid-borne public goods. Plasmids remain important vectors for the spread of social genes involved in bacterial virulence thus an understanding of their dynamics is highly relevant from a public health perspective.

Modeling water movement in horizontal columns using fractal theory

Fractal mathematics has been used to characterize water and solute transport in porous media and also to characterize and simulate porous media properties. The objective of this study was to evaluate the correlation between the soil infiltration parameters sorptivity (S) and time exponent (n) and the parameters dimension (D) and the Hurst exponent (H). For this purpose, ten horizontal columns with pure (either clay or loam) and heterogeneous porous media (clay and loam distributed in layers in the column) were simulated following the distribution of a deterministic Cantor Bar with fractal dimension H" 0.63. Horizontal water infiltration experiments were then simulated using Hydrus 2D software. The sorptivity (S) and time exponent (n) parameters of the Philip equation were estimated for each simulation, using the nonlinear regression procedure of the statistical software package SAS®. Sorptivity increased in the columns with the loam content, which was attributed to the relation of S with the capillary radius. The time exponent estimated by nonlinear regression was found to be less than the traditional value of 0.5. The fractal dimension estimated from the Hurst exponent was 17.5 % lower than the fractal dimension of the Cantor Bar used to generate the columns.

Desenvolvimento de um consolidômetro pneumático: modelagem da compactação, penetrometria e resistência tênsil de agregados de solo

A compactação é um dos processos responsáveis pela degradação física do solo que pode ocasionar a perda da sustentabilidade da produção agrícola. Assim, é fundamental dispor de estratégias instrumentais para quantificar as propriedades físicas que são influenciadas pela compactação e utilizadas para avaliar a qualidade do solo. Os objetivos deste trabalho foram: desenvolver um consolidômetro com propulsão pneumática de baixo custo; avaliar sua funcionalidade mediante estudo do comportamento compressivo de um Latossolo Vermelho distrófico de textura argilo-arenosa sob plantio direto; e avaliar o potencial de utilização da propulsão pneumática para determinações de resistência do solo à penetração (RP) e de resistência tênsil de agregados (RT). A avaliação do comportamento compressivo do solo foi realizada mediante curvas de compressão, utilizando amostras indeformadas, obtidas das posições de amostragem relativas à linha e à entrelinha da cultura de aveia-preta. Nessas amostras, foram realizados ensaios de compressão uniaxial em condição de teor de água correspondente ao potencial mátrico de -10 kPa, sendo determinados o índice de compressão (IC) e a pressão de preconsolidação (σp), bem como suas relações com outras propriedades físicas do solo. A RP foi determinada em amostras indeformadas de um Argissolo Vermelho-Amarelo distrófico de textura franco-arenosa sob citros. Para as determinações da RT foram utilizados agregados de dois solos: um Argissolo Acinzentado distrófico arênico coeso e um Argissolo Amarelo distrófico arênico. Os resultados mostram que a densidade do solo, antes do ensaio de compressão uniaxial, foi maior (p < 0,05) para a entrelinha da cultura de aveia-preta. A curva de compressão foi sensível às alterações estruturais do solo entre as posições de amostragem; a σp e o IC indicaram, respectivamente, maior capacidade de suporte de carga e menor suscetibilidade à compactação (p < 0,05) para a entrelinha da cultura de aveia-preta. A utilização de propulsão pneumática não influenciou os resultados da RP e da RT. Isso permite concluir que a curva de compressão do solo, a RP e a RT podem ser determinadas utilizando o equipamento desenvolvido neste estudo.

Rapid disease emergence through horizontal gene transfer between eukaryotes.

Among different species of eukaryotes, the extent and evolutionary significance of horizontal gene transfer remains poorly understood. A newly published study by Friesen and colleagues indicates that a recent gene transfer between two species of fungi has enabled the recipient to rapidly acquire high virulence on wheat. The study highlights a mechanism by which diseases can suddenly emerge, but also brings up the controversial issues of how horizontal gene transfer occurs and whether fungal incompatibility barriers to gene flow are more 'leaky' than was previously thought.

Comparing the horizontal and vertical individualism and collectivism scale and the Auckland individualism and collectivism scale in two cultures: Switzerland and South Africa

This study investigated the psychometric properties of the Horizontal and Vertical Individualism and Collectivism Scale (HVIC) and the Auckland Individualism and Collectivism Scale (AICS). The sample consisted of 1,403 working individuals from Switzerland (N = 585) and from South Africa (N = 818). Principal component factor analyses indicated that a two-factor structure replicated well across the two countries for both scales. In addition, the HVIC four-factor structure replicated well across countries, whereas the responsibility dimension of individualism of the AICS replicated poorly. Confirmatory factor analyses provided satisfactory support to the original theoretical models for both the HVIC and the AICS. Equivalence measurement indices indicated that the cross-cultural replicability properties of both instruments are generally acceptable. However, canonical correlations and correlations between the HVIC and AICS dimensions confirm that these two instruments differ in their underlying meaning of the individualism and collectivism constructs, suggesting that these two instruments assess individualism and collectivism differently.

DETERMINAÇÃO DA CONDUTIVIDADE HIDRÁULICA E DA SORVIDADE DE UM SOLO NÃO-SATURADO UTILIZANDO-SE PERMEÂMETRO A DISCO

Dois métodos, utilizando permeâmetros a disco, foram usados para medir a sorvidade e a condutividade hidráulica em três horizontes de um solo de Santa Maria da Boa Vista, Pernambuco, utilizando-se potenciais de fornecimento de água de 0, -2,5, -5 e -10 cm de água. No primeiro método, a condutividade hidráulica foi obtida através de estimativas da sorvidade e do fluxo estacionário, utilizando-se apenas um permeâmetro. No segundo, as medidas da sorvidade e da condutividade hidráulica foram feitas utilizando-se valores dos fluxos estacionários, obtidos a partir de dois permeâmetros de diferentes raios. Esse segundo método apresentou resultados mais consistentes dos tempos -- gravitacional e geométrico --, e do raio característico de poros que o primeiro método. A sorvidade foi tão importante quanto a condutividade hidráulica para caracterizar o processo de infiltração. A redução brusca dos valores dos raios característicos de poros do horizonte A2/B, com mudanças no potencial de fornecimento de água, revelou a heterogeneidade da estrutura deste horizonte, permitindo identificar a influência dos volumes argilosos compactados sobre o processo de infiltração.

Learning from failure - rationale and design for a study about discontinuation of randomized trials (DISCO study).

BACKGROUND: Randomized controlled trials (RCTs) may be discontinued because of apparent harm, benefit, or futility. Other RCTs are discontinued early because of insufficient recruitment. Trial discontinuation has ethical implications, because participants consent on the premise of contributing to new medical knowledge, Research Ethics Committees (RECs) spend considerable effort reviewing study protocols, and limited resources for conducting research are wasted. Currently, little is known regarding the frequency and characteristics of discontinued RCTs. METHODS/DESIGN: Our aims are, first, to determine the prevalence of RCT discontinuation for specific reasons; second, to determine whether the risk of RCT discontinuation for specific reasons differs between investigator- and industry-initiated RCTs; third, to identify risk factors for RCT discontinuation due to insufficient recruitment; fourth, to determine at what stage RCTs are discontinued; and fifth, to examine the publication history of discontinued RCTs.We are currently assembling a multicenter cohort of RCTs based on protocols approved between 2000 and 2002/3 by 6 RECs in Switzerland, Germany, and Canada. We are extracting data on RCT characteristics and planned recruitment for all included protocols. Completion and publication status is determined using information from correspondence between investigators and RECs, publications identified through literature searches, or by contacting the investigators. We will use multivariable regression models to identify risk factors for trial discontinuation due to insufficient recruitment. We aim to include over 1000 RCTs of which an anticipated 150 will have been discontinued due to insufficient recruitment. DISCUSSION: Our study will provide insights into the prevalence and characteristics of RCTs that were discontinued. Effective recruitment strategies and the anticipation of problems are key issues in the planning and evaluation of trials by investigators, Clinical Trial Units, RECs and funding agencies. Identification and modification of barriers to successful study completion at an early stage could help to reduce the risk of trial discontinuation, save limited resources, and enable RCTs to better meet their ethical requirements.

Eficacia e ineficacia de la comunicación horizontal en los movimientos sociales. Caso análisis: Oposiciones justas en Cataluña 2011

Las redes sociales están generando un amplio entramado de comunicaciones, a distintos niveles y con distintos objetivos. En este artículo analizamos un caso concreto, fruto de la observación y el seguimiento de un grupo creado para la defensa de unas oposiciones justas para el acceso a la función pública de docentes para educación secundaria. Se trata de un grupo creado como reacción a una serie de posibles irregularidades. Interesa observar tanto la creación del grupo, como las distintas fases que sigue la evolución, muy ligada a la efectividad de los procesos de comunicación, y la vinculación de estos últimos a las posibilidades de acción y resolución del conflicto que existe en la base del grupo

Genomic islands: tools of bacterial horizontal gene transfer and evolution.

Abstract Bacterial genomes evolve through mutations, rearrangements or horizontal gene transfer. Besides the core genes encoding essential metabolic functions, bacterial genomes also harbour a number of accessory genes acquired by horizontal gene transfer that might be beneficial under certain environmental conditions. The horizontal gene transfer contributes to the diversification and adaptation of microorganisms, thus having an impact on the genome plasticity. A significant part of the horizontal gene transfer is or has been facilitated by genomic islands (GEIs). GEIs are discrete DNA segments, some of which are mobile and others which are not, or are no longer mobile, which differ among closely related strains. A number of GEIs are capable of integration into the chromosome of the host, excision, and transfer to a new host by transformation, conjugation or transduction. GEIs play a crucial role in the evolution of a broad spectrum of bacteria as they are involved in the dissemination of variable genes, including antibiotic resistance and virulence genes leading to generation of hospital 'superbugs', as well as catabolic genes leading to formation of new metabolic pathways. Depending on the composition of gene modules, the same type of GEIs can promote survival of pathogenic as well as environmental bacteria.

Horizontal vestibulo-ocular reflex dynamics in acute vestibular neuritis and viral labyrinthitis: evidence of otolith-canal interaction.

OBJECTIVE: To evaluate the dynamic properties of the horizontal vestibulo-ocular reflex (h-VOR) in the acute stage of two common labyrinthine diseases that provoke severe attacks of vertigo with spontaneous nystagmus: vestibular neuritis (vestibular loss alone) and viral labyrinthitis (cochleovestibular loss). MATERIAL AND METHODS: Sixty-three patients were investigated: 42 were diagnosed with vestibular neuritis and 21 with viral labyrinthitis. The h-VOR function was evaluated by conventional caloric and impulsive testing. A simplified model of vestibular function was used to analyze the vestibulo-ocular response to rotational stimulation. RESULTS: The results showed a significant difference in h-VOR characteristics between the two pathologies. Patients with vestibular neuritis exhibited a strong horizontal semicircular canal deficit, but no h-VOR asymmetry between the two rotational directions. In contrast, patients with viral labyrinthitis demonstrated moderate canal paresis and a marked h-VOR deficit in rotation toward the affected ear. CONCLUSION: These findings support the hypothesis that the h-VOR dynamic asymmetry that occurs after an acute unilateral inner ear lesion is not due to canal dysfunction alone, but involves complex adaptive changes in the central VOR that may implicate the otolith system. Based on histopathologic and clinical differences in the two pathologies reported in the literature, we postulate that this otolith-canal interaction is mainly linked to the loss of saccular function.

Distribuição horizontal e vertical de fósforo em sistemas de cultivos exclusivos de soja e de integração lavoura-pecuária-floresta

O objetivo deste trabalho foi avaliar a distribuição horizontal e vertical do fósforo no solo e a produtividade de soja em sistemas de cultivos exclusivos e de integração lavoura-pecuária-floresta (ILPF). Foram avaliados os tratamentos: floresta plantada de eucalipto; lavoura de soja e milho safrinha consorciado com Urochloa brizantha 'Marandu'; pastagem de U. brizantha; sistema de ILPF; e duas áreas controle, com floresta nativa e pousio. O solo foi coletado nas camadas de 0-5, 5-10, 10-20 e 20-30 cm, para determinação das características químicas. As avaliações foram realizadas no segundo ano agrícola após a implantação do experimento. No sistema de ILPF, solo e produtividade foram avaliados em quatro transectos equidistantes, no centro do renque e a 3, 6, 10 e 15 m do renque, nas faces norte e sul. Os teores de P disponível (Mehlich-1) foram maiores nas camadas superficiais do solo, nos sistemas com soja/milho safrinha e com ILPF. No ILPF, os teores de P disponível não diferiram entre as distâncias do renque das árvores, e a produtividade de soja não diferiu da observada no sistema com soja/milho safrinha. Portanto, com dois anos de implantação, o sistema ILPF ainda não é capaz de interferir marcadamente nas características químicas do solo e na produtividade da soja.

Stochasticity and bistability in horizontal transfer control of a genomic island in Pseudomonas.

Genomic islands (GEI) comprise a recently recognized large family of potentially mobile DNA elements and play an important role in the rapid differentiation and adaptation of bacteria. Most importantly, GEIs have been implicated in the acquisition of virulence factors, antibiotic resistances or toxic compound metabolism. Despite detailed information on coding capacities of GEIs, little is known about the regulatory decisions in individual cells controlling GEI transfer. Here, we show how self-transfer of ICEclc, a GEI in Pseudomonas knackmussii B13 is controlled by a series of stochastic processes, the result of which is that only a few percent of cells in a population will excise ICEclc and launch transfer. Stochastic processes have been implicated before in producing bistable phenotypic transitions, such as sporulation and competence development, but never before in horizontal gene transfer (HGT). Bistability is instigated during stationary phase at the level of expression of an activator protein InrR that lays encoded on ICEclc, and then faithfully propagated to a bistable expression of the IntB13 integrase, the enzyme responsible for excision and integration of the ICEclc. Our results demonstrate how GEI of a very widespread family are likely to control their transfer rates. Furthermore, they help to explain why HGT is typically confined to few members within a population of cells. The finding that, despite apparent stochasticity, HGT rates can be modulated by external environmental conditions provides an explanation as to why selective conditions can promote DNA exchange.

An operon of three transcriptional regulators controls horizontal gene transfer of the integrative and conjugative element ICEclc in Pseudomonas knackmussii B13.

The integrative and conjugative element ICEclc is a mobile genetic element in Pseudomonas knackmussii B13, and an experimental model for a widely distributed group of elements in Proteobacteria. ICEclc is transferred from specialized transfer competent cells, which arise at a frequency of 3-5% in a population at stationary phase. Very little is known about the different factors that control the transfer frequency of this ICE family. Here we report the discovery of a three-gene operon encoded by ICEclc, which exerts global control on transfer initiation. The operon consists of three consecutive regulatory genes, encoding a TetR-type repressor MfsR, a MarR-type regulator and a LysR-type activator TciR. We show that MfsR autoregulates expression of the operon, whereas TciR is a global activator of ICEclc gene expression, but no clear role was yet found for MarR. Deletion of mfsR increases expression of tciR and marR, causing the proportion of transfer competent cells to reach almost 100% and transfer frequencies to approach 1 per donor. mfsR deletion also caused a two orders of magnitude loss in population viability, individual cell growth arrest and loss of ICEclc. This indicates that autoregulation is an important feature maintaining ICE transfer but avoiding fitness loss. Bioinformatic analysis showed that the mfsR-marR-tciR operon is unique for ICEclc and a few highly related ICE, whereas tciR orthologues occur more widely in a large variety of suspected ICE among Proteobacteria.