Antibiotic resistance in invasive Streptococcus pneumoniae isolates identified in Scotland between 1999 and 2007

Data from 4727 invasive isolates of Streptococcus pneumoniae submitted to the Scottish Haemophilus, Legionella, Meningococcus and Pneumococcus Reference Laboratory between 1999 and 2007 were analysed to establish susceptibility profiles to penicillin, erythromycin and cefotaxime. Pneumococcal resistance to penicillin over the study period remained low, with only 0.2 % (n=7/4727) of isolates falling into this category (MIC ≥2 mg l−1). These isolates have been sporadic, and have mainly represented serogroup 14 (ST9) and 9 (ST156). In comparison, the ‘intermediate sensitivity’ group (MIC 0.12–1 mg l−1) ranged between 2 and 6 % per year, the majority from serogroup 9 (ST156). Over the study period, we found that 12 % (n=585/4727) of isolates were erythromycin-resistant (MIC >0.5 mg l−1), with the majority (n=467; 80 %) of these isolates identified as serogroup 14 (ST9). Cephalosporin resistance (cefotaxime MIC >1 mg l−1) was found in only 0.06 % (n=2/3135) of isolates. Internationally recognized clones (Pneumococcal Molecular Epidemiology Network) accounted for 35 % (n=28/81) of the penicillin non-susceptible isolates and 75 % (n=248/330) of the macrolide-resistant isolates, with ST9 and ST306 predominating. Between 1999 and 2007 we found that 11.6 % (n=18/155) of the penicillin non-susceptible isolates and 4.8 % (n=28/585) of the macrolide-resistant isolates were from serogroups not covered by the 7-valent conjugate pneumococcal vaccine in use in the UK since 2006. Susceptibility to first-line antimicrobial agents for invasive pneumococcal disease in Scotland remained high over the period 1999–2007.

A mathematical model for the spread of streptococcus pneumoniae with transmission due to sequence type

This paper discusses a simple mathematical model to describe the spread of Streptococcus pneumoniae. We suppose that the transmission of the bacterium is determined by multi-locus sequence type. The model includes vaccination and is designed to examine what happens in a vaccinated population if MLSTs can exist as both vaccine and non vaccine serotypes with capsular switching possible from the former to the latter. We start off with a discussion of Streptococcus pneumoniae and a review of previous work. We propose a simple mathematical model with two sequence types and then perform an equilibrium and (global) stability analysis on the model. We show that in general there are only three equilibria, the carriage-free equilibrium and two carriage equilibria. If the effective reproduction number Re is less than or equal to one, then the carriage will die out. If Re > 1, then the carriage will tend to the carriage equilibrium corresponding to the multi-locus sequence type with the largest transmission parameter. In the case where both multi-locus sequence types have the same transmission parameter then there is a line of carriage equilibria. Provided that carriage is initially present then as time progresses the carriage will approach a point on this line. The results generalize to many competing sequence types. Simulations with realistic parameter values confirm the analytical results.

Influência da seleção do grupo controle na análise de fatores de risco para infecções hospitalares por Klebsiella pneumoniae produtora de B-lactamase de espectro estendido

Resumo não disponível.

Estudo da resistência do streptococcus pneumoniae à penicilina em pneumopatias infecciosas nas cidades de Porto Alegre e Caxias do Sul (RS - Brasil)

A resistência aos antibióticos dos patógenos mais comuns do trato respiratório está aumentando mundialmente. Recentemente, Streptococcus pneumoniae resistente à penicilina tem sido isolado em diversos países, e a freqüência dessas cepas tem elevado de modo alarmante. O aumento da resistência, com conseqüentes implicações terapêuticas, tem levado a uma reavaliação do uso dos antibióticos ß-lactâmicos para o tratamento de infecções pneumocócicas. No presente trabalho, um total de 107 amostras de Streptococcus pneumoniae, obtidas de materiais provenientes de pacientes adultos ambulatoriais e hospitalizados, em dois centros médicos de duas cidades do Rio Grande do Sul (Porto Alegre e Caxias do Sul), os quais apresentavam quadro clínico-radiológico de infecção pulmonar, foram analisadas com o objetivo de estudar-se a resistência do germe à penicilina. As amostras constituídas de escarro (80,4%), lavado brônquico (13,5%) e aspirado traqueal (6,6%) foram coletadas no período compreendido entre Julho de 1998 e Julho de 1999. O material foi semeado em meio de Agar sangue e as colônias suspeitas de Streptococcus pneumoniae foram transferidas para meio de Mueller-Hinton para teste de optoquina e de sensibilidade à penicilina com discos de oxacilina. Um halo de inibição da oxacilina menor do que 20 mm indicava a realização de teste para determinação da concentração inibitória mínima (MIC) com E-test. Um total de nove cepas foi identificado como tendo resistência intermediária à penicilina (MIC 0,1-1,0μg/ml) e nenhuma cepa resistente (resistência elevada: MIC > 2,0 μg/ml) foi identificada. Uma monitorização local das cepas quanto à resistência antimicrobiana é de grande importância para os clínicos no manejo de infecções pneumocócicas.

Antimicrobial resistance of isolated Streptococcus pneumoniae in a hospital of the Brazilian public system

Streptococcus pneumoniae is the predominant bacterial agent that affects the human population with pneumonia. This disease is an important cause of death in the elderly and the children under five years old. In this study, 29 strains of invasive S. pneumoniae were isolated from 29 patients of pneumonia, bacteremia and meningitis in the laboratory of the Municipal Hospital in Paulinia, Brazil, from May 2006 to October 2007. Patients' age ranged from 8 months old to 60 years old. These strains of S. pneumoniae were isolated from blood, pleural fluid and cerebrospinal fluid (CSF) of patients. After typing of encapsulated strains of S. pneumoniae through quellung reaction, their resistance to antimicrobial agents was gauged through Disc Diffusion Technique followed by determination of minimum inhibitory concentration (MIC). Among the 29 strains analyzed, 23 were methicillin-sensitive and six were methicillin-resistant and penicillin intermediate resistant. No strain presented full resistance to penicillin. Serotyping was performed only in two samples, which belonged to serotype 18. Our data may alert ambulatory regarding the incidence of pneumococcal strains resistant to the most common drugs due to inappropriate use of antimicrobials and also collaborate to the elaboration of pneumococcal conjugate vaccines specific to each region.

Assessment of genetic relationship between Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca samples isolated from a dental office

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Peracute bovine mastitis caused by Klebsiella pneumoniae

Relata-se a ocorrência de graves sintomas de mastite hiperaguda em vaca, causada por Klebsiella pneumoniae, na terceira semana de lactação. Descrevem-se aspectos epidemiológicos, sintomas clínicos, procedimentos de diagnóstico microbiológico, conduta terapêutica e medidas de controle.

High Prevalence of bla(CTX-M) Extended Spectrum Beta-Lactamase Genes in Klebsiella pneumoniae Isolates from a Tertiary Care Hospital: First report of bla(SHV-12), bla(SHV-31), bla(SHV-38), and bla(CTX-M-15) in Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Molecular epidemiology and extended-spectrum β-lactamases production of klebsiella pneumoniae isolated from three dairy herds

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Clonagem e expressão de genes de Klebsiella pneumoniae responsáveis pela produção de 1,3-propanodiol em cepa mutante de Escherichia coli

Pós-graduação em Ciências Biológicas (Microbiologia Aplicada) - IBRC

Associação entre marcadores da resposta inflamatória e a imunopatogênese de agentes infecciosos de natureza viral (Vírus da dengue, HTLV-1 e HTLV-2) e bacteriana (Chlamydia trachomatis e Chlamydia pneumoniae)

A base genética das doenças é frequentemente estudada a partir dos polimorfismos dos genes de citocinas. O presente estudo investigou marcadores da resposta inflamatória associados a infecções virais e bacterianas que possam influenciar o curso da infecção. Foram medidos os níveis séricos (por ensaio imunoenzimático) e os polimorfismos de TNF-α (-308), TNF-β (+252), IFN-γ (+874) e da proteína C reativa, por meio de PCR e RFLP ou PCR alelo específico, em grupos de pessoas infectadas pelo vírus da dengue (n=80), com doença febril, não infectados (100), um grupo de infectados pelo HTLV (30 sintomáticos e 47 assintomáticos), um grupo com doença coronariana (58 com sororreatividade para Chlamydia e 31 com sorologia negativa) e um grupo controle (99 pessoas com sorologia negativa para dengue, HTLV e Chlamydia). Nenhum grupo mostrou associação com informações demográficas. O Vírus da dengue 3 (66,2%) e o HTLV-1 (90% em sintomáticos e 76,6% em assintomáticos) foram os agentes mais frequentes dentre os grupos respectivos. A maioria com doença coronariana (65,1%) apresentou anticorpos para Chlamydia (39,6% para C. trachomatis e C. pneumoniae, 58,6% apenas para C. trachomatis e 1,7% somente para C. pneumoniae). Foram significantes as diferenças encontradas entre: (i) os níveis séricos de TNF-β, IFN-γ e PrtCR dos grupos dengue positivo e dengue negativo com o grupo controle (p< 0,01); (ii) os níveis séricos de TNF-α, TNF-β, e IFN-γ dos grupos de HTLV (incluindo os tipos) e grupo controle; (iii) os níveis séricos de TNF-α, TNF-β, IFN-γ e PrtCR entre os pacientes com doença coronariana e sorologia positiva para Chlamydia e o grupo controle; (iv) a presença de anticorpos para C. trachomatis e C. pneumoniae e o grupo controle na comparação com a TNF-β, IFN-γ e PrtCR. As distribuições de frequências genotípicas foram estatisticamente significantes para os polimorfismos: (i) dos genes TNF-α (p=0,0494) e IFN-γ (p= 0,0008), entre os grupos dengue positivo, dengue negativo e controle e para o IFN-γ (p= 0,0007) entre os grupos DEN 1, DEN 2 e DEN 3 e o controle; (ii) do gene IFN-γ (p= 0,0023) nos grupos de pacientes com doença coronariana e sorologia positiva para C. trachomatis e C. pneumoniae, assim como nos monoreativos na comparação entre a positividade para C. trachomatis e o grupo controle.

Soroepidemiologia de Chlamydia trachomatis, Chlamydia pneumoniae e Treponema pallidum nas aldeias indígenas Bakajá, Apyterewa, Xingu e Mrotidjãm, Altamira, Pará, Brasil

As bactérias do gênero Chlamydia estão associadas à diversas doenças, como cegueira, infecções genitais e pneumonia. Existem poucos dados sobre como a Chlamydia e o Treponema pallidum afetam indígenas na Amazônia brasileira. Este estudo objetivou determinar a soroprevalência das infecções pela Chlamydia trachomatis, Chlamydia pneumoniae e Treponema pallidum nas aldeias indígenas Bakajá, Apyterewa, Xingu e Mrotdidjãm, no município de Altamira, Pará, Brasil. O estudo incluiu 270 amostras de sangue coletadas no ano de 2007. A detecção de anticorpos das classes IgM e IgG anti-Chlamydia foi realizada empregando-se o ensaio imunoenzimático (ELISA), e selecionada de forma aleatória amostragem de 36, entre os positivos, para determinar a sorotipagem pela microimunofluorescência. Para detecção de anticorpos anti-T. pallidum foi utilizado um teste treponêmico (ELISA) e as amostras positivas foram submetidas a um teste não treponêmico (RPR). A prevalência geral de anticorpos anti-Chlamydia foi de 26,7%, com prevalência de 100% para C. trachomatis entre as amostras testadas pela MIF. Para a C. pneumoniae a prevalência foi de 61,1% e a prevalência de anticorpos contra Treponema pallidum foi baixa. As bactérias do estudo circulam nas comunidades indígenas da Amazônia brasileira estudada, o que requer uma resposta urgente das autoridades de saúde pública, pois estas bactérias podem causar doenças graves, mas são sensíveis a tratamento específico, quando diagnosticadas adequadamente.

Soroepidemiologia de Chlamydia trachomatis, Chlamydia pneumoniae e Treponema pallidum em portadores do Vírus da imunodeficiência humana (HIV), no Estado do Pará

A Chlamydia trachomatis e o Treponema pallidum compartilham com o HIV uma importante forma de transmissão: a via sexual. Por conta do comprometimento imunológico dos portadores de HIV, a C. pneumoniae pode apresentar um papel potencial em infecções respiratórias. Este trabalho objetivou a descrição da soroprevalência destes três agentes em portadores de HIV do Estado do Pará, Brasil. Entre setembro de 2007 a junho de 2008, foram coletadas 430 amostras de portadores de HIV em Belém, Pará. Estas foram submetidas a um ELISA para detecção de anticorpo IgG e IgM anti-Chlamydia e, dentre os positivos, uma amostragem aleatória foi escolhida e submetida à microimunofluorescência para sorotipagem. Para a detecção de anticorpos anti-Treponema pallidum foi feito um teste não treponêmico (RPR) e um teste treponêmico (ELISA). Os resultados obtidos foram analisados pelo teste do χ². A prevalência geral de anticorpos anti-Chlamydia foi 64,2% (51,6% para IgG e 4% para IgM). A sorotipagem mostrou uma alta prevalência de C. trachomatis (100% tanto para IgG como IgM), e C. pneumoniae (73,5% IgG e 70,5% IgM), sendo que houve uma larga disseminação dos sorotipos que causam infecções genitais da Chlamydia trachomatis. A prevalência geral de anticorpos contra o Treponema pallidum foi de 34,9%, sendo que 7,3% apresentaram resultado laboratorial indicativo de sífilis. As variáveis que apresentaram associação com a infecção por Chlamydia e Treponema pallidum foram: o gênero masculino, maior idade, baixa escolaridade, número de parceiros por semana, a prática de sexo anal, homossexualismo/bissexualismo, uso de droga não-endovenosa, histórico de IST. Faz-se necessário tanto a conscientização como o monitoramento da população, para impedir a transmissão destes agentes e para a melhoria da qualidade de vida dos indivíduos portadores de HIV.

Produção de 1,3-propanodiol por Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli: otimização de meio e clonagem de genes

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)