963 resultados para RT-nested PCR


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Human and rodent uncoupling protein (UCP)3 mRNA is upregulated after acute exercise. Moreover, exercise increases plasma levels of free fatty acid (FFA), which are also known to upregulate UCP3. We investigated whether the upregulation of UCP3 after exercise is an effect of exercise per se or an effect of FFA levels or substrate oxidation. Seven healthy untrained men [age: 22.7 ± 0.6 yr; body mass index: 23.8 ± 1.0 kg/m2; maximal O2 uptake (VO2 max): 3,852 ± 211 ml/min] exercised at 50% VO2 max for 2 h and then rested for 4 h. Muscle biopsies and blood samples were taken before and immediately after 2 h of exercise and 1 and 4 h in the postexercise period. To modulate plasma FFA levels and fat/glucose oxidation, the experiment was performed two times, one time with glucose ingestion and one time while fasting. UCP3 mRNA and UCP3 protein were determined by RT-competitive PCR and Western blot. In the fasted state, plasma FFA levels significantly increased (P < 0.0001) during exercise (293 ± 25 vs. 1,050 ± 127 μmol/l), whereas they were unchanged after glucose ingestion (335 ± 54 vs. 392 ± 74 µmol/l). Also, fat oxidation was higher after fasting (P < 0.05), whereas glucose oxidation was higher after glucose ingestion (P < 0.05). In the fasted state, UCP3L mRNA expression was increased significantly (P < 0.05) 4 h after exercise (4.6 ± 1.2 vs. 9.6 ± 3.3 amol/µg RNA). This increase in UCP3L mRNA expression was prevented by glucose ingestion. Acute exercise had no effect on UCP3 protein levels. In conclusion, we found that acute exercise had no direct effect on UCP3 mRNA expression. Abolishing the commonly observed increase in plasma FFA levels and/or fatty acid oxidation during and after exercise prevents the upregulation of UCP3 after acute exercise. Therefore, the previously observed increase in UCP3 expression appears to be an effect of prolonged elevation of plasma FFA levels and/or increased fatty acid oxidation.

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Metallothioneins (MTs) belong to a family of cysteine-rich, metal-binding intracellular proteins, which have been linked with cell proliferation. In this study, expression levels of the 8 known MT-1 and MT-2 functional isoforms in human invasive ductal breast cancer specimens were determined by RT–PCR. The expression profiles of the MT protein and MT-2A mRNA were further evaluated in 79 cases of human invasive ductal breast carcinoma by immunohistochemistry and in situ hybridization, and correlated with cancer cell proliferation (determined by Ki-67 nuclear antigen immunolabeling). MT-1A, MT-1E, MT-1F, MT-1G, MT-1H, MT-1X and MT-2A but not MT-1B, were detected in breast cancer tissue samples. The MT-2A mRNA transcript was the highest among all the isoforms detected. A positive correlation was observed between MT-2A mRNA and MT protein expression with Ki-67 labeling (P = 0.0003 and P < 0.0001, respectively) but not with apoptosis (P = 0.1244 and P = 0.8189, respectively). Co-localization of the MT protein and Ki-67 nuclear antigen in breast cancer cells was demonstrated by double immunofluorescence staining. There was also significantly higher MT protein and MT-2A mRNA expression in histological grade 3 tumors than in histological grade 1 and 2 tumors. The finding that MT 2A appears to be the main isoform associated with cell proliferation in invasive ductal breast cancer tissues, may have therapeutic implications.

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OBJETIVO: Investigar a presença do papiloma vírus humano no adenocarcinoma de cólon e reto. MÉTODOS: Setenta e dois pacientes com adenocarcinoma de cólon e reto foram analisados. Foram coletadas duas amostras de cada paciente: uma amostra do tumor e outra de mucosa não neoplásica distante 15 cm do tumor. Como grupo de controle, também foram estudadas amostras de mucosa de quinze pacientes sem câncer colorretal. Os tecidos foram analisados por “auto nested” PCR usando o primer consensus GP5+/GP6+. Dois primers específicos para região E6 dos HPV 16 e HPV 18 também foram utilizados. RESULTADOS: O DNA do HPV foi detectado em tecidos de cólon e reto de 60 pacientes com câncer ( 83 por cento), enquanto que este não foi encontrado em nenhum dos pacientes controles sem tumor ( p<0,001). Em vinte e três pacientes, o DNA do HPV estava presente tanto no tecido tumoral como na mucosa não neoplásica adjacente. Em vinte e três pacientes o DNA do HPV foi encontrado apenas no tumor, enquanto que em quatorze, só foram encontrados nos tecidos normais coletados próximos ao tumor de cólon e reto. Em setenta e cinco por cento dos casos positivos foram identificados os HPV tipo 16 ou 18 por PCR com primers E6 específicos. Os achados positivos obtidos por PCR foram confirmados por seqüenciamento viral. CONCLUSÃO: O HPV está presente no cólon e reto da maioria dos pacientes com carcinoma de cólon e reto estudados, sugerindo que este vírus pode estar relacionado à patogênese do câncer colorretal. Serão necessários mais estudos para determinar o papel do HPV na carcinogênese colorretal.

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Ehrlichia chaffeensis was detected for the first time in blood samples from Brazilian marsh deers (Blastocerus dichotomus) captured in the marshes of Parana River in Southeast Brazil in 1998. Seven EDTA-blood samples from deers were analyzed by PCR and nested PCR for presence of Ehrlichia chaffeensis, Ehrlichia ewingii, Ehrlichia canis, Neoriickettsia risticii, Anaplasma phagocytophilum and Anaplasma marginale. Three samples showed positive reactions for E. chaffeensis and Anaplasma marginale. None contained detectable A. phagocytophilum, E. ewingii, E. canis or Neorickettsia risticii DNA. In Brazil, the wild marsh deer may be a natural reservoir of the agents that cause human monocytotropic ehrlichiosis and ruminant erythrocytic anaplasmosis. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

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Chlamydophila psittaci (C. psittaci) infection was evaluated in 77 free-living nestlings of Blue-fronted Amazon parrots (Amazona aestiva) and Hyacinth macaws (Anodorhynchus hyacinthinus) in the Pantanal of Mato Grosso do Sul, Brazil. Tracheal and cloacal swab samples from 32 wild parrot and 45 macaw nestlings were submitted to semi-nested PCR, while serum samples were submitted to complement fixation test (CFT). Although all 32 Amazon parrot serum samples were negative by CFT, cloacal swabs from two birds were positive for Chlamydophila DNA by semi-nested PCR (6.3%); these positive birds were 32 and 45 days old. In macaws, tracheal and cloacal swabs were positive in 8.9% and 26.7% of the samples, respectively. Complement-fixing antibodies were detected in 4.8% of the macaw nestlings; macaw nestlings with positive findings were between 33 and 88 days old. These results indicate widespread dissemination of this pathogen in the two evaluated psittacine populations. No birds had clinical signs suggestive of chlamydiosis. To the best of our knowledge, this is the first report on C. psittaci in free-living Blue-fronted Amazon parrots and Hyacinth macaws in Brazil. (c) 2006 Elsevier B.V. All rights reserved.

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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A Erliquiose é uma doença zoonótica causada por bactérias gram-negativas e intracelulares obrigatórias. A Anaplasmose Granulocítica Equina - AGE (anteriormente denominada Erliquiose Granulocítica Equina, EGE) é uma enfermidade sazonal, normalmente auto-limitante em equinos. No Brasil, existem poucos relatos deste agente erliquial, bem como de seus vetores naturais. Atualmente, veterinários têm levantado a suspeita de casos de AGE em equinos com sinais clínicos sugestivos de erliquiose e não responsivos ao tratamento para a piroplasmose equina. O objetivo do presente estudo foi identificar equinos expostos a A. phagocytophilum por meio de técnicas sorológicas e moleculares. Vinte amostras de sangue e soro de equinos da região Centro-oeste do Brasil foram avaliados por meio do exame microscópico de capa leucocitária, ensaio imunoenzimático indireto (ELISA), reação de imunofluorescência indireta (RIFI) e reação em cadeia da polimerase (nested PCR). Adicionalmente, o diagnóstico sorológico de Theileria equi pela RIFI e ELISA foram realizados, assim como o diagnóstico molecular pelo nPCR. Treze (65%) amostras de soro foram positivas para A. phagocytophilum pelo teste de ELISA, entretanto nenhum equino foi positivo pelo exame microscópico da capa leucocitária ou nPCR. Anticorpos IgG anti-T. equi foram detectados em 18 (90%) e 17 (85%) equinos pela RIFI e ELISA, respectivamente e o agente foi detectado em 9 (45%) animais pelo nPCR. Estes dados sugerem importante informação para o entendimento da ocorrência da AGE e piroplasmose equina no Centro-oeste do Brasil.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Chlamydophila psittaci (C. psittaci) has been detected in 460 avian species, among them the most frequent are the Psittaciformes, Columbiformes, Anseriformes and raptors. In Brazil, the main avian species recognized as healthy carriers belong to the order Psittaciformes and Columbiformes, but very few studies have been done in other bird families. Reports of the occurrence of this disease in the clinical form are rare in the Ramphastids; consequently, they are not commonly evaluated for this agent. The present study reports the investigation of C. psittaci in 25 captive ramphastids from a zoological park in São Paulo State, Brazil. Swabs samples from the cloaca were submitted to semi-nested polymerase chain reaction (semi-nested PCR) for direct detection of the microorganism. Additionally, blood samples obtained from these birds were submitted to the Complement Fixation Test (CFT) for detection of antibodies anti-C. psittaci. The presence of C. psittaci was not detected in the cloacal swab samples tested by the PCR. Nevertheless, 16% (4/25) of the bird's sera were positive by the CFT. Among the species with positive results, there are the saffron toucanet (Pteroglossus bailloni) and black-necked-aracari (Pteroglossus aracari), two species with no descriptions of the survey of C. psittaci published in the literature. Intermittent elimination of C. psittaci is a feature of chronically infected birds; however the absence of a positive-antigen sample did not guarantee that the bird is Chlamydophila-free. The serological results obtained show that the ramphastids tested were previously exposed to the pathogen and developed immune response, but showed no clinical signs of the disease and didn't eliminate regularly the organism in their feces in the moment of the sample collection.

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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INTRODUÇÃO: Microdissecção e captura a laser (MCL) é uma técnica de desenvolvimento recente que permite a coleta de células individuais ou pequeno conjunto de células para análise molecular. Atualmente, no Brasil, há raros microscópios para MCL, de modo que a divulgação dos procedimentos inerentes a essa técnica é oportuna para destacar seu amplo potencial para diagnóstico e investigação. OBJETIVO: Este trabalho descreve a padronização dos procedimentos de MCL e de extração de DNA de material fixado em formalina e incluído em parafina. MATERIAL E MÉTODOS: Foram estudados o éxon 8 do gene TP53 e o gene da ciclofilina em amostras de tecido normal e de neoplasias de fígado e rim provenientes de modelo de carcinogênese química induzida em rato. A extração do DNA foi comprovada por reação em cadeia da polimerase (nested-PCR). RESULTADOS: Foram padronizados os procedimentos de preparo dos cortes histológicos, de microdissecção e captura a laser e de obtenção de seqüências gênicas pela reação de nested-PCR para tecidos incluídos em parafina. Obtivemos amplificação de 48,3% das amostras para o éxon 8 do gene TP53 e 51,7% para o gene da ciclofilina. Considerando pelo menos um dos dois segmentos gênicos, foram amplificadas 79,3% das amostras. DISCUSSÃO E CONCLUSÃO: A extração de DNA de tecidos fixados em formalina e incluídos em parafina e a técnica de nested-PCR foram adequadamente padronizadas para produtos gênicos de interesse, obtidos de material coletado por MCL. Esses procedimentos podem ser úteis para a obtenção de seqüências de DNA de arquivos para análise molecular.

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To produce an epidemiological map of neosporosis in Brazil and identify the types of transmission of this disease, the present study evaluated the occurrence of Neospora caninum in Nelore cattle (Bos indicus) in Presidente Prudent, west region of São Paulo state; its vertical transmission; and the early stage in which fetuses are infected. To achieve this, serum samples from 518 slaughtered pregnant heifers and their fetuses were tested by ELISA technique and fetal brain tissues subjected to PCR. One hundred and three heifers (19.88%) had antibodies to N. caninum, as well as 38 (36.8%) of fetuses from 4 months of gestation. The conventional PCR failed to detect N. caninum DNA. These findings show that neosporosis occurs in the area studied and that it may be transmitted the transplacental route, althought N. caninum had not detected in brain tissue from non-aborted fetuses. The use of nested PCR it would be applied to increase the sensitivy of test.