Mechanisms of summer intraseasonal sea surface temperature oscillations in the Bay of Bengal

Intraseasonal variations (ISV) of sea surface temperature (SST) in the Bay of Bengal (BoB) is highest in its northwestern part. An Indian Ocean model forced by QuikSCAT winds and climatological river discharge (QR run) reproduces ISV of SST, albeit with weaker magnitude. Air-sea fluxes, in the presence of a shallow mixed layer, efficiently effect intraseasonal SST fluctuations. Warming during intraseasonal events is smaller (<1°C) for June - July period and larger (1.5° to 2°C) during September, the latter due to a thinner mixed layer. To examine the effect of salinity on ISV, the model was run by artificially increasing the salinity (NORR run) and by decreasing it (MAHA10 run). In NORR, both rainfall and river discharge were switched off and in MAHA10 the discharge by river Mahanadi was increased tenfold. The spatial pattern of ISV as well as its periodicity was similar in QR, NORR and MAHA10. The ISV was stronger in NORR and weaker in MAHA10, compared to QR. In NORR, both intraseasonal warming and cooling were higher than in QR, the former due to reduced air-sea heat loss as the mean SST was lower, and the latter due to enhanced subsurface processes resulting from weaker stratification. In MAHA10, both warming and cooling were lower than in QR, the former due to higher air-sea heat loss owing to higher mean SST, and the latter due to weak subsurface processes resulting from stronger stratification. These model experiments suggest that salinity effects are crucial in determining amplitudes of intraseasonal SST variations in the BoB.

A LSQR-type method provides a computationally efficient automated optimal choice of regularization parameter in diffuse optical tomography

Purpose: Developing a computationally efficient automated method for the optimal choice of regularization parameter in diffuse optical tomography. Methods: The least-squares QR (LSQR)-type method that uses Lanczos bidiagonalization is known to be computationally efficient in performing the reconstruction procedure in diffuse optical tomography. The same is effectively deployed via an optimization procedure that uses the simplex method to find the optimal regularization parameter. The proposed LSQR-type method is compared with the traditional methods such as L-curve, generalized cross-validation (GCV), and recently proposed minimal residual method (MRM)-based choice of regularization parameter using numerical and experimental phantom data. Results: The results indicate that the proposed LSQR-type and MRM-based methods performance in terms of reconstructed image quality is similar and superior compared to L-curve and GCV-based methods. The proposed method computational complexity is at least five times lower compared to MRM-based method, making it an optimal technique. Conclusions: The LSQR-type method was able to overcome the inherent limitation of computationally expensive nature of MRM-based automated way finding the optimal regularization parameter in diffuse optical tomographic imaging, making this method more suitable to be deployed in real-time. (C) 2013 American Association of Physicists in Medicine. http://dx.doi.org/10.1118/1.4792459]

Construction of Block Orthogonal STBCs and Reducing Their Sphere Decoding Complexity

Construction of high rate Space Time Block Codes (STBCs) with low decoding complexity has been studied widely using techniques such as sphere decoding and non Maximum-Likelihood (ML) decoders such as the QR decomposition decoder with M paths (QRDM decoder). Recently Ren et al., presented a new class of STBCs known as the block orthogonal STBCs (BOSTBCs), which could be exploited by the QRDM decoders to achieve significant decoding complexity reduction without performance loss. The block orthogonal property of the codes constructed was however only shown via simulations. In this paper, we give analytical proofs for the block orthogonal structure of various existing codes in literature including the codes constructed in the paper by Ren et al. We show that codes formed as the sum of Clifford Unitary Weight Designs (CUWDs) or Coordinate Interleaved Orthogonal Designs (CIODs) exhibit block orthogonal structure. We also provide new construction of block orthogonal codes from Cyclic Division Algebras (CDAs) and Crossed-Product Algebras (CPAs). In addition, we show how the block orthogonal property of the STBCs can be exploited to reduce the decoding complexity of a sphere decoder using a depth first search approach. Simulation results of the decoding complexity show a 30% reduction in the number of floating point operations (FLOPS) of BOSTBCs as compared to STBCs without the block orthogonal structure.

Basis pursuit deconvolution for improving model-based reconstructed images in photoacoustic tomography

The model-based image reconstruction approaches in photoacoustic tomography have a distinct advantage compared to traditional analytical methods for cases where limited data is available. These methods typically deploy Tikhonov based regularization scheme to reconstruct the initial pressure from the boundary acoustic data. The model-resolution for these cases represents the blur induced by the regularization scheme. A method that utilizes this blurring model and performs the basis pursuit deconvolution to improve the quantitative accuracy of the reconstructed photoacoustic image is proposed and shown to be superior compared to other traditional methods via three numerical experiments. Moreover, this deconvolution including the building of an approximate blur matrix is achieved via the Lanczos bidagonalization (least-squares QR) making this approach attractive in real-time. (C) 2014 Optical Society of America

Hardware Accelerator for 3D Method of Moments based Parasitic Extraction

A Field Programmable Gate Array (FPGA) based hardware accelerator for multi-conductor parasitic capacitance extraction, using Method of Moments (MoM), is presented in this paper. Due to the prohibitive cost of solving a dense algebraic system formed by MoM, linear complexity fast solver algorithms have been developed in the past to expedite the matrix-vector product computation in a Krylov sub-space based iterative solver framework. However, as the number of conductors in a system increases leading to a corresponding increase in the number of right-hand-side (RHS) vectors, the computational cost for multiple matrix-vector products present a time bottleneck, especially for ill-conditioned system matrices. In this work, an FPGA based hardware implementation is proposed to parallelize the iterative matrix solution for multiple RHS vectors in a low-rank compression based fast solver scheme. The method is applied to accelerate electrostatic parasitic capacitance extraction of multiple conductors in a Ball Grid Array (BGA) package. Speed-ups up to 13x over equivalent software implementation on an Intel Core i5 processor for dense matrix-vector products and 12x for QR compressed matrix-vector products is achieved using a Virtex-6 XC6VLX240T FPGA on Xilinx's ML605 board.

On Fast Bilateral Filtering Using Fourier Kernels

It was demonstrated in earlier work that, by approximating its range kernel using shiftable functions, the nonlinear bilateral filter can be computed using a series of fast convolutions. Previous approaches based on shiftable approximation have, however, been restricted to Gaussian range kernels. In this work, we propose a novel approximation that can be applied to any range kernel, provided it has a pointwise-convergent Fourier series. More specifically, we propose to approximate the Gaussian range kernel of the bilateral filter using a Fourier basis, where the coefficients of the basis are obtained by solving a series of least-squares problems. The coefficients can be efficiently computed using a recursive form of the QR decomposition. By controlling the cardinality of the Fourier basis, we can obtain a good tradeoff between the run-time and the filtering accuracy. In particular, we are able to guarantee subpixel accuracy for the overall filtering, which is not provided by the most existing methods for fast bilateral filtering. We present simulation results to demonstrate the speed and accuracy of the proposed algorithm.

Distribución y variabilidad de Ralstonia solanacearum e.f. Smith agente causal de marchitez bacteriana en el cultivo de papa (Solanum tuberosum L), en tres departamentos del norte de Nicaragua (Esteli, Matagalpa y Jinotega)

La marchitez bacteriana de la papa causada por Ralstonia solanacearum (E. F. Smith) es una de las principales limitantes en la producción de es te cultivo. R.olanacearum es una especie altamente variable, el estudio de su diversidad poblacional es un importante factor a considerar para su control. Con el objetivo de conocer la distribución y la variabilidad, se realizó un estudio durante el período comprendido de Septiembre de 2006 a Enero de 2007, en diferentes localidades distribuidas en tres departamentos de Nicaragua (Estelí, Matagalpa y Jinotega ), donde se recolectaron 18 muestras de tejidos vegetales (tubérculos y tallos) de papa (Solanum tuberosum L.) y suelo, las que fueron analizadas en laboratorio de Microbiología de la Universidad Nacional Agraria (UNA), para el aislamiento, identificación y multiplicación de la bacteria. Se realizaron siembras en plato petri que contenían medio de cultivo medio agar sacarosa-peptona. Posterior a su aislamiento se realizó purificación en un medio específico (tetrazolium). Las cepas bacterianas se identificaron mediante la determinación de características culturales, morfológicas, fisiológicas y bioquímicas. En el primer caso, se observaron características de borde, elevación, consistencia y color de las cepas individuales cultivadas en el medio agar sacarosa- peptona. Las características morfológicas se comprobaron a través observación en el microscopio óptico. La confirmación de las características fisiológicas y bioquímicas, se realizó a través de pruebas de KOH al 3%, oxidasa, catalasa y revelación de flagelos. Las colonias bacterianas identificadas como Ralstonia solanacearun, se les realizó la prueba de carbohidratos para la caracterización de biovares, basada en la utilización de azúcares y oxidación de alcoholes (Hayward, 1991). Las pruebas de hipersensibilidad se realizaron en plantas de tabaco (Nicotiana tabacumL.). Estas fueron inoculadas mediante la infiltración de la suspensión bacteriana de 24 hrs de crecimiento. Como resultado de la prueba, se identificaron dieciséis aislamientos pertenecientes al biovar 3 y dos aislamientos pertenecientes al biovar 1. Siendo el biovar 3 el más prevaleciente en los sitios de muestro. La raza fue identificada en base a sintomatología presentada, resultando ser la raza 1.

Determinacion de brucelosis en la poblacion canina en ocho barrios del distrito dos de Managua utilizando el metodo de Rosa de Bengala y Rivanol en Septiembre - Diciembre 2007

En Nicaragua se desconoce la situación actual nacional de Brucelosis en la población canina, debido a que solo se ha realizado un estudio en la zona urbana y suburbana de la ciudad de León acerca de esta enfermedad en esta especie. La importancia del estudio consiste en beneficiar a propietarios y criadores de razas caninas, a los profesionales de la medicina veterinaria que se dedican a las especies menores y técnicos de laboratorios, brindándoles información acerca de la situación de esta enfermedad para ser tomada en cuenta en su labor diaria. Con el objetivo de determinar la prevalencia de brucelosis en caninos con la colaboración del ministerio de salud (MINSA) durante la jornada de vacunación antirrábica se realizó un muestreo serológico en canes en los barrios Bo Monseñor Lezcano, Las Palmas, Santa Ana Norte, San Sebastián, Bóer, San José, Acahualinca y Batahola Norte del Distrito II de Managua en los meses de Septiembre a Diciembre del año 2007. Se recolectó un total de 100 sueros de canes de ambos sexos, sin categorizarlos por su raza y edad en el momento de la toma de las muestras, las cuales se analizaron por el método Rosa de Bengala (antígeno Brucella abortus cepa 1119-3)en el Centro Veterinario de Diagnóstico de investigación, Unidad de Microbiología UNAN -León y como prueba confirmatoria se utilizó Rivanol 1% en el laboratorio del MAGFOR Unidad de Sanidad Animal León. Los resultados obtenidos para el primer método fue de un reactor correspondiente una hembra de 2 meses de edad de raza no definida del barrio Las Palmas que posteriormente resultó negativa a la prueba de Rivanol. La prevalencia encontrada es del 0%.

Estudio epidemiológico y etiológico de la bacteriosis de la pitahaya (Hylocereus undatus, Britt y Rose), Smith, y su efecto sobre cinco variedades del cultivo

En la finca "Quinto Patio" ubicada en la comarca Guanacaste del municipio de Diriomo, Dpto de Granada, se realizó colecta de malezas, insectos y material enfermo de Pitahaya. Los materiales colectados fueron analizados en el laboratorio de Microbiología e invernadero de la Escuela de Sanidad Vegetal de la Universidad Agraria (UNA), ubicada en el km 12-1/2 carretera Norte, Managua, Nicaragua. El propósito del estudio fue determinar el agente causal de la enfermedad denominada Pudrición de la Pitahaya y de sus diseminadores, por medio de pruebas bioquímicas a bacterias aisladas de esquejes de Pitahaya infectados así como a insectos y malezas encontrados en este cultivo. Los esquejes de Pitahaya colectados presentaron síntomas que catalogamos como sistémicos y localizados. Sistémicos por encontrarse manchas amarillas acuosas en todo el esqueje; localizados por encontrarse manchas oscuras ubicadas en un mismo punto. En los esquejes de Pitahaya infectados se encontró la bacteria Erwinia carotovora,, sbspp carotovora, Smith, que también fué aislada de insectos colectados. En las malezas no se encontró Erwinia, pero sí se encontró la bacteria del género Pseudomonas. Se inocularon 50 plantas de 5 variedades (Lisa, Orejona, Cebra, Rosa, Chocoya) con las bacterias aisladas de los síntomas sistémicos y localizados, para observar la reacción de cada variedad ante la bacteria Erwinia carotovora, sbspp carotovora, Smith. Los síntomas que se encontraron en las plantas inoculadas fueron manchas oscuras y amarillas claras. Las variedades que presentaron menor reacción a la bacteria Erwinia carotovora, Srnith, fueron la Chocoya y la Cebra. Las variedades Rosa, Orejona y Lisa resultaron susceptibles a la inoculación. Seguidamente se procedió al reaislamiento de los síntomas presentados en cada una de las variedades inoculadas, encontrándose que eran causados por Erwinia carotovora. Se realizaron pruebas de patogenicidad a plantas de tabaco y tomate inoculándolas con la bacteria Erwinia carotovora, Smith. Las plantas mostraron amarillamiento. De estos sintomas se aisló la misma bacteria. En las zonas de Carazo y Masaya se realizaron encuestas a viveristas. El objetivo de éstas fué determinar el tipo de prácticas que éllos realizan a las plantas de Pitahaya para evitar o controlar el ataque de la bacteriosis y a la vez conocer la reacción de cada una de las variedades ante la bacteria Erwinia carotovora. Smith.

Manual de teoria: Microbiologia veterinaria II

El Manual de Teoría de Microbiología II tiene como principal objetivo reunir la mayor información básica de los contenidos establecidos en el programa de la asignatura, de esta forma los estudiantes adquieran los conocimientos necesarios. Les aporta además la forma estructurada para el aprendizaje, lo cual le posi- bilita un método de estudio y establecer las interrelaciones necesarias para un estudio sistemático. Como texto básico podrá después utilizar textos con mayor información teniendo de antemano los conocimientos previos y necesarios. La información reunida en el presente Manual de Microbiología II es el resultado de la recopilación de la información de autores y especialistas, solo nos correspondió sobre las experiencias de los que nos precedieron reunir y estructurar los contenidos. Es necesario establecer para su estudio un pensamiento lógico y de constante interrelación y a la vez de integración hacia el desarrollo de un pensamiento independiente y creativo. Es muy importante establecer un estudio sistemático y el uso de la síntesis y a la vez emplear un método científico, elevada avidez por saber y profundizar para adquirir la formación de un profesional preparado y capacitado para asumir las responsabilidades en el cumplimiento de sus compromisos sociales.

Calidad bromatológica del ensilaje de hoja de plátano (Musàcea: variedad FHIA-01) con dos niveles de inclusión de levadura de torula (Candida utilis) más melaza

El presente estudio se realizó con el objetivo de determinar la calidad bromatológica (materia seca MS, proteína bruta PB, fibra neutro detergente FND), ácidos grasos volátiles AGV (ácido láctico, ácido acético, acido butírico) y pH del ensilaje de hoja de plátano (Musácea; variedad, FHIA-01), con dos niveles de inclusión de levadura de Torula (Candida utilis). El muestreo se realizó en la granja porcina y en los laboratorios de bromatología y microbiología de la Facultad de Ciencia Animal de la UNA. Los micro silos fueron conservados por 30 días. Los tratamientos evaluados fueron dos niveles de inclusión de levadura de Torula (Candida utilis al 0.5 y 1%). Los tratamientos se distribuyeron en un diseño completamente al azar (DCA) con tres repeticiones. El tratamiento uno (T1) consistió en hoja de plátano; el tratamiento dos (T2) en hoja de platano+melaza+0.5%levadura de Torula y el tratamiento tres (T3) en hoja de platano+melaza+1% levadura de Torula. Los resultados de la calidad bromatológica para MS por tratamiento fueron para T3:17.68%, T2: 17.22% y para T1: 16.46%. La PB alcanzó valores de: 14.08%, 13.50%, 13.12% para T3, T1 y T2, respectivamente. La FND presentó valores por tratamiento de T1: 67.80%, T3: 61.32% y T2: 56.39. Para los AGV, los resultados fueron para ácido láctico: T2 con 1.25%, T3 con 1.19% y T1 con 0.74%; para ácido acético T1 con 2.46%, T2 con 1.44% y T3 con 1.40; para ácido butírico no hubo presencia en ninguno de los tratamientos. Los resultados para el pH fueron para T1: 6.75%, para T3: 4.17% y para T2: 4.07. Con base en estos resultados, el T3 presentó mejor resultado en la calidad bromatológica y pH, superando al resto de los tratamientos, aunque obtuvo mejor resultado el T2 para el caso del ácido láctico. El uso de levaduras y melaza en el ensilaje mejora su calidad bromatológica.

Evaluación bromatológica del ensilaje de Guácimo de Ternero (Guázuma ulmifolia Lam.) y el pasto Cubano CT-115 (Pennisetum purpureum x P. tiphoides), bajo diferentes niveles de proporción de hojas, más melaza en la alimentación animal

El presente estudio se realizó con el objetivo de determinar la calidad bromatológica (materia seca MS, proteína bruta PB, fibra neutro detergente FND, fibra acido detergente FAD, nitrógeno amoniacal N-NH· y pH del ensilaje de Guácimo de Ternero (Guázuma ulmifolia Lam.) y el Pasto Cubano CT-115 (Pennisetum purpureum x P. tiphoides), bajo diferentes niveles de proporción de hojas, más melaza en la alimentación animal. El muestreo se realizó en la granja porcina y en los laboratorios de bromatología y microbiología de la Facultad de Ciencia Animal de la UNA. Los micros silos fueron conservados por 30 días. Los tratamientos evaluados fueron tres niveles de proporción del Guácimo de ternero y el pasto cubano CT-115, más melaza. Los tratamientos se distribuyeron en un diseño completamente al azar (DCA) con tres repeticiones. El tratamiento uno (T1) consistió 50 % de Guácimo de ternero y 50 % de pasto cubano CT- 115; el tratamiento dos (T2) en 60 % de Guácimo de ternero y 40 % de pasto cubano CT- 115; y el tratamiento tres (T3) en 70 % de Guácimo de ternero y 30 % de pasto cubano CT- 115. Los resultados de la calidad bromatológica para MS por tratamiento fueron para T3:31.02%, T2: 32.03 % y para T1: 28.01 %. La PB alcanzó valores de: 15.03 %, 13.07 %, 15.02 % para T3, T1 y T2, respectivamente. La FND presentó valores por tratamiento de T1: 63.18 %, T3: 64.80 % y T2: 70.02 %. Para los FAD, los resultados fueronT2 con 51.14 %, T3 con 52.15 % y T1 con 51.36 %; el N-NH3: T1 con 6.3 %, T2 con 6.7 % y T3 con 4.0 %; .Los resultados para el pH fueron para T1: 4.89 %, para T3: 5.22 % y para T2: 5.37 %. Con base en estos resultados, el T1 (MS) y T3 (PB) presentó mejor resultado en la calidad bromatológica y pH (T1), superando al resto de los tratamientos, aunque obtuvo mejor resultado el T1 (FND) y para el caso de FAD el (T2). El uso del Guácimo de ternero y el pasto cubano CT-115 y melaza en el ensilaje mejora su calidad bromatológica.

A new dynamic model for study of dislocation pattern formation

Based on the principle given in nonlinear diffusion-reaction dynamics, a new dynamic model for dislocation patterning is proposed by introducing a relaxation time to the relation between dislocation density and dislocation flux. The so-called chemical potential like quantities, which appear in the model can be derived from variation principle for free energy functional of dislocated media, where the free energy density function is expressed in terms of not only the dislocation density itself but also their spatial gradients. The Linear stability analysis on the governing equations of a simple dislocation density shows that there exists an intrinsic wave number leading to bifurcation of space structure of dislocation density. At the same time, the numerical results also demonstrate the coexistence and transition between different dislocation patterns.

Contribución de los bacteriófagos a la eliminación de Escherichia coli en los sistemas acuáticos

Poster presentado al XXII Congreso Nacional de Microbiología celebrado en Almería los días 21-24 septiembre de 2009.

Influencia de las bajas temperaturas en la supervivencia y el perfil proteico de Vibrio harveyi

Poster presentado al XXII Congreso Nacional de Microbiología celebrado en Salamanca los días 11-14 julio de 2011.