Allopatric speciation in ticks: genetic and reproductive divergence between geographic strains of Rhipicephalus (Boophilus) microplus

Background: The cattle tick, Rhipicephalus (Boophilus) microplus, economically impact cattle industry in tropical and subtropical regions of the world. The morphological and genetic differences among R. microplus strains have been documented in the literature, suggesting that biogeographical and ecological separation may have resulted in boophilid ticks from America/Africa and those from Australia being different species. To test the hypothesis of the presence of different boophilid species, herein we performed a series of experiments to characterize the reproductive performance of crosses between R. microplus from Australia, Africa and America and the genetic diversity of strains from Australia, Asia, Africa and America. Results: The results showed that the crosses between Australian and Argentinean or Mozambican strains of boophilid ticks are infertile while crosses between Argentinean and Mozambican strains are fertile. These results showed that tick strains from Africa (Mozambique) and America (Argentina) are the same species, while ticks from Australia may actually represent a separate species. The genetic analysis of mitochondrial 12S and 16S rDNA and microsatellite loci were not conclusive when taken separately, but provided evidence that Australian tick strains were genetically different from Asian, African and American strains. Conclusion: The results reported herein support the hypothesis that at least two different species share the name R. microplus. These species could be redefined as R. microplus (Canestrini, 1887) (for American and African strains) and probably the old R. australis Fuller, 1899 (for Australian strains), which needs to be redescribed. However, experiments with a larger number of tick strains from different geographic locations are needed to corroborate these results.

Title Model for Computer Networks Optimization

The TCP/IP architecture was consolidated as a standard to the distributed systems. However, there are several researches and discussions about alternatives to the evolution of this architecture and, in this study area, this work presents the Title Model to contribute with the application needs support by the cross layer ontology use and the horizontal addressing, in a next generation Internet. For a practical viewpoint, is showed the network cost reduction for the distributed programming example, in networks with layer 2 connectivity. To prove the title model enhancement, it is presented the network analysis performed for the message passing interface, sending a vector of integers and returning its sum. By this analysis, it is confirmed that the current proposal allows, in this environment, a reduction of 15,23% over the total network traffic, in bytes.

Tetra-crowned porphyrin as P450 biomimetic model for carbamazepine oxidation

A substituted porphyrin bearing four crown ether units, H(2)(TCP), was synthesized from the reaction between (5,10,15,20-tetra(o-aminophenyl) porphyrin) and the acyl derivative of the ether (4-carboxy-18-crown-6). The free-base porphyrin was characterized by C, N, and H elemental analysis; UV-vis and IR spectroscopies; and (1)H NMR. The corresponding ironporphyrin, Fe(TCP)Cl, was obtained via iron insertion into H(2)(TCP). Fe(TCP)Cl was employed as catalyst for carbamazepine (CBZ) oxidation by iodosylbenzene (PhIO), 3-chloroperoxybenzoic acid (m-CPBA) or sodium hypochlorite (NaOCl), in methanol or in a biphasic water/dichloroethane system. The crowned ironporphyrin proved to be a highly efficient and selective catalyst for CBZ epoxidation even in the biphasic dichloroethane /H(2)O system, with no need for an additional phase transfer agent.

Multi-threading and message communication in Qu-Prolog

This paper presents the multi-threading and internet message communication capabilities of Qu-Prolog. Message addresses are symbolic and the communications package provides high-level support that completely hides details of IP addresses and port numbers as well as the underlying TCP/IP transport layer. The combination of the multi-threads and the high level inter-thread message communications provide simple, powerful support for implementing internet distributed intelligent applications.

An efficient Fmoc strategy for the rapid synthesis of peptide para-nitroanilides

A new strategy has been developed for the rapid synthesis of peptide para-nitroanilides (pNA). The method involves derivatization of commercially available tritylchloride resin (TCP-resin) with 1,4-phenylenediamine, subsequent coupling with desired amino acids by the standard Fmoc protocol, and oxidation of the intermediate para-aminoanilides (pAA) with Oxone(R). This procedure allows easy assembly of the desired para-aminoanilides (pAA) on standard resin and efficient oxidation and purification of the corresponding para-nitroanilides (pNA). The method allows easy access to any desired peptide para-nitroanilides, which are useful substrates for the characterization and study of proteolytic enzymes.

A Wireless EEG Acquisition Platform based on Embedded Systems

This paper proposes a wireless EEG acquisition platform based on Open Multimedia Architecture Platform (OMAP) embedded system. A high-impedance active dry electrode was tested for improving the scalp- electrode interface. It was used the sigma-delta ADS1298 analog-to-digital converter, and developed a “kernelspace” character driver to manage the communications between the converter unit and the OMAP’s ARM core. The acquired EEG signal data is processed by a “userspace” application, which accesses the driver’s memory, saves the data to a SD-card and transmits them through a wireless TCP/IP-socket to a PC. The electrodes were tested through the alpha wave replacement phenomenon. The experimental results presented the expected alpha rhythm (8-13 Hz) reactiveness to the eyes opening task. The driver spends about 725 μs to acquire and store the data samples. The application takes about 244 μs to get the data from the driver and 1.4 ms to save it in the SD-card. A WiFi throughput of 12.8Mbps was measured which results in a transmission time of 5 ms for 512 kb of data. The embedded system consumes about 200 mAh when wireless off and 400 mAh when it is on. The system exhibits a reliable performance to record EEG signals and transmit them wirelessly. Besides the microcontroller-based architectures, the proposed platform demonstrates that powerful ARM processors running embedded operating systems can be programmed with real-time constrains at the kernel level in order to control hardware, while maintaining their parallel processing abilities in high level software applications.

Modelos Teóricos acerca dos Determinantes dos Comportamentos Preventivos na Transmissão do Vírus da Imunodeficiência Humana

Vários modelos têm sido desenvolvidos com o objectivo de compreender a mudança de comportamentos associados à transmissão do Vírus da Imunodeficiência Humana (VIH). Os modelos cognitivo-sociais procuram explicar o desempenho de comportamentos preventivos a partir de constructos como a percepção de susceptibilidade, as intenções comportamentais e a percepção de controlo. Apesar das contribuições das teorias da mudança comportamental para a redução do risco de infecção pelo VIH, persiste a necessidade de desenvolvimento de modelos que contemplem a complexidade do comportamento sexual. Este artigo faz uma revisão dos modelos dos determinantes dos comportamentos preventivos na transmissão do VIH e dos estudos neles baseados. Aaplicabilidade e as implicações dos resultados, de acordo com o modelo utilizado, para o desenvolvimento de estratégias de educação e prevenção na área dos determinantes psicológicos dos comportamentos preventivos associados à transmissão do VIH, é discutida. Cada modelo parece ser predictor de diferentes aspectos do comportamento e os modelos desenvolvidos especificamente para o comportamento sexual, em relação aos modelos genéricos para a saúde, parecem ter vantagens na compreensão dos comportamentos sexuais de risco.

Sistemas de informação: message integration bus

O trabalho apresentado por este documento aborda os problemas que advêm da necessidade de integração de aplicações, desenvolvidas em diferentes instantes no tempo, por diferentes equipas de trabalho, que para enriquecer os processos de negócio necessitam de comunicar entre si. A integração das aplicações tem de ser feita de forma opaca para estas, sendo disponibilizada por uma peça de software genérica, robusta e sem custos para as equipas desenvolvimento, na altura da integração. Esta integração tem de permitir que as aplicações comuniquem utilizando os protocolos que desejarem. Este trabalho propõe um middleware orientado a mensagens como solução para o problema identificado. A solução apresentada por este trabalho disponibiliza a comunicação entre aplicações que utilizam diferentes protocolos, permite ainda o desacoplamento temporal, espacial e de sincronismo na comunicação das aplicações. A implementação da solução tem base num sistema publish/subscribe orientado ao conteúdo e tem de lidar com as maiores exigências computacionais que este tipo de sistema acarta, sendo que a utilização deste se justifica com o enriquecimento da semântica de subscrição de eventos. Esta implementação utiliza uma arquitectura semi-distribuída, com o objectivo de aumentar a escalabilidade do sistema. A utilização da arquitectura semi-distribuída implica que a implementação da solução tem de lidar com o encaminhamento de eventos e divulgação das subscrições, pelos vários servidores de eventos. A implementação da solução disponibiliza garantias de persistência, processamento transaccional e tolerância a falhas, assim como transformação de eventos entre os diversos protocolos. A extensibilidade da solução é conseguida à custa de um sistema de pluggins que permite a adição de suporte a novos protocolos de comunicação. Os protocolos suportados pela implementação final do trabalho são RestMS e TCP.

Garantia de qualidade de serviço (QOS) em arquitecturas MPLS

Os prestadores de serviços de telecomunicações e operadores de telecomunicações deparam-se com um aumento exponencial das necessidades de largura de banda. A evolução e massificação dos serviços Internet e Intranet pelos serviços públicos e privados deixaram de ser uma mera adaptação do protocolo TCP, à qualidade da ligação sendo uma necessidade a diferenciação do tráfego. As metodologias que asseguram uma qualidade de serviço no âmbito dos fornecedores de serviços internet são a forma de garantir uma qualidade de serviço adequada a cada tipo de tráfego. Estas metodologias são suportadas pela rede IP MPLS dos diversos operadores de telecomunicações no transporte dos diversos serviços dos seus clientes empresarias e domésticos no acesso à internet dos diversos serviços públicos de dados e voz e nas redes virtuais privadas. Os portais aplicacionais são a interface directa com o cliente para definição dos acordos de nível de serviço “Service Level Agreements” e a sua associação à especificação dos níveis de serviço “Service Level Specification”, para posterior relação com a definição de métricas adequadas à qualidade de serviço acordada com o cliente no desenho dos serviços de uma rede IP “MultiProtocol Label Switch”. A proposta consiste em criar uma metodologia para mapear as necessidades de serviços dos clientes em SLAs e registá-los numa base de dados, separando claramente a qualidade do serviço vista na óptica do operador em: arquitectura de rede de transporte, arquitectura do serviço e arquitectura de monitoria. Estes dados são mapeados em parâmetros e especificações de implementação dos serviços de suporte ao negócio do operador tendo em vista a criação de um “Work Flow” fim a fim. Paralelamente define-se os serviços a disponibilizar comercialmente, o conjunto de serviços suportados pela rede e tecnologia IP MPLS com a parametrização de ”Quality of Service Assurance” adequada a cada um, cria-se uma arquitectura de rede de suporte ao transporte base entre os diversos equipamentos agregadores de acessos através do “Backbone”, define-se uma arquitectura de suporte para cada tipo de serviço independente da arquitectura de transporte. Neste trabalho implementam-se algumas arquitecturas de QoS estudadas no IP MPLS em simuladores disponibilizados pela comunidade “Open Source” e analisamos as vantagens de desvantagens de cada uma. Todas as necessidades são devidamente equacionadas, prevendo o seu crescimento, desempenho, estabelecendo regras de distribuição de largura de banda e análise de desempenho, criando redes escaláveis e com estimativas de crescimento optimistas. Os serviços são desenhados de forma a adaptarem-se à evolução das necessidades aplicacionais, ao crescimento do número de utilizadores e evolução do próprio serviço.

Solução doméstica para televisão digital

Mestrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores

CCTα and CCTδ chaperonin subunits are essential and required for cilia assembly and maintenance in Tetrahymena

Background - The eukaryotic cytosolic chaperonin CCT is a hetero-oligomeric complex formed by two rings connected back-to-back, each composed of eight distinct subunits (CCTalpha to CCTzeta). CCT complex mediates the folding, of a wide range of newly synthesised proteins including tubulin (alpha, beta and gamma) and actin, as quantitatively major substrates. Methodology/Principal findings - We disrupted the genes encoding CCTalpha and CCTdelta subunits in the ciliate Tetrahymena. Cells lacking the zygotic expression of either CCTalpha or CCTdelta showed a loss of cell body microtubules, failed to assemble new cilia and died within 2 cell cycles. We also show that loss of CCT subunit activity leads to axoneme shortening and splaying of tips of axonemal microtubules. An epitope-tagged CCTalpha rescued the gene knockout phenotype and localized primarily to the tips of cilia. A mutation in CCTalpha, G346E, at a residue also present in the related protein implicated in the Bardet Biedel Syndrome, BBS6, also caused defects in cilia and impaired CCTalpha localization in cilia. Conclusions/Significance - Our results demonstrate that the CCT subunits are essential and required for ciliary assembly and maintenance of axoneme structure, especially at the tips of cilia.

Subunits of the chaperonin CCT are associated with Tetrahymena microtubule structures and are involved in cilia biogenesis

The cytosolic chaperonin CCT is a heterooligomeric complex of about 900 kDa that mediates the folding of cytoskeletal proteins. We observed by indirect immunofluorescence that the Tetrahymena TpCCTalpha, TpCCTdelta, TpCCTepsilon, and TpCCTeta-subunits colocalize with tubulin in cilia, basal bodies, oral apparatus, and contractile vacuole pores. TpCCT-subunits localization was affected during reciliation. These findings combined with atomic force microscopy measurements in reciliating cells indicate that these proteins play a role during cilia biogenesis related to microtubule nucleation, tubulin transport, and/or axoneme assembly. The TpCCT-subunits were also found to be associated with cortex and cytoplasmic microtubules suggesting that they can act as microtubule-associated proteins. The TpCCTdelta being the only subunit found associated with the macronuclear envelope indicates that it has functions outside of the 900 kDa complex. Tetrahymena cytoplasm contains granular/globular-structures of TpCCT-subunits in close association with microtubule arrays. Studies of reciliation and with cycloheximide suggest that these structures may be sites of translation and folding. Combined biochemical techniques revealed that reciliation affects the oligomeric state of TpCCT-subunits being tubulin preferentially associated with smaller CCT oligomeric species in early stages of reciliation. Collectively, these findings indicate that the oligomeric state of CCT-subunits reflects the translation capacity of the cell and microtubules integrity.

The Tetrahymena chaperonin subunit CCT eta gene is coexpressed with CCT gamma gene during cilia biogenesis and cell sexual reproduction

We report here the cloning and the characterization of the T. pyriformis CCT eta gene (TpCCT eta) and also a partial sequence of the corresponding T. thermophila gene (TtCCT eta). The TpCCt eta gene encodes a protein sharing a 60.3% identity with the mouse CCT eta. We have studied the expression of these genes in Tetrahymena exponentially growing cells, cells regenerating their cilia for different periods and during different stages of the cell sexual reproduction. These genes have similar patterns of expression to those of the previously identified TpCCt gamma gene. Indeed, the Tetrahymena CCT eta and CCT gamma genes are up-regulated at 60-120 min of cilia recovery, and in conjugation when vegetative growth was resumed and cell division took place. Our results seem to indicate that both CCT subunits play an important role in the biogenesis of the newly synthesized cilia of Tetrahymena and during its cell division.

Justiça e transição: os juízes dos tribunais plenários no processo revolucionário português

As transições democráticas colocam as elites e a sociedade perante o desafio de enfrentar os legados dos regimes ditatoriais e a portuguesa foi particularmente importante sob este ponto de vista, quer pela longa duração do regime autoritário quer pela natureza de ruptura no tipo de mudança de regime. Acresce que o caso português, enquanto o primeiro da chamada “terceira vaga” teve escassos modelos de inspiração e nenhum de contágio foi, como alguém a definiu recentemente uma experiência, de “democracia depois da guerra”, onde os militares desempenharam um papel determinante no derrube da Ditadura (Bermeo: 2004). Assim, este artigo propõe-se analisar os saneamentos levados a cabo no Ministério da Justiça, dando particular atenção à liquidação dos tribunais políticos do salazarismo (Tribunais Criminais Plenários - TCP).

Aplicação para gestão de activos de rede do Aeroporto do Porto

O presente trabalho enquadra-se na área das redes de computadores, fazendo referência aos protocolos e ao conjunto de equipamentos e softwares necessários para a administração, controlo e monitorização desse tipos de infra-estruturas. Para a gestão de uma rede de dados, é essencial dispor de conhecimentos e documentação de nível técnico para representar da forma mais fiel possível a configuração da rede, seguindo passo a passo a interligação entre os equipamentos existentes e oferecendo assim uma visão o mais fidedigna possível das instalações. O protocolo SNMP é utilizado em larga escala sendo praticamente um standard para a administração de redes baseadas na tecnologia TCP/IP. Este protocolo define a comunicação entre um administrador e um agente, estabelecendo o formato e o significado das mensagens trocadas entre ambos. Tem a capacidade de suportar produtos de diferentes fabricantes, permitindo ao administrador manter uma base de dados com informações relevantes da monitorização de vários equipamentos, que pode ser consultada e analisada por softwares NMS concebidos especialmente para a gestão de redes de computadores. O trabalho apresentado nesta dissertação teve como objectivo desenvolver uma ferramenta para apoiar à gestão da infra-estrutura de comunicações do Aeroporto Francisco Sá Carneiro que permitisse conhecer em tempo real o estado dos elementos de rede, ajudar no diagnóstico de possíveis problemas e ainda apoiar a tarefa de planeamento e expansão da rede instalada. A ferramenta desenvolvida utiliza as potencialidades do protocolo SNMP para adquirir dados de monitorização de equipamentos de rede presentes na rede do AFSC, disponibilizando-os numa interface gráfica para facilitar a visualização dos parâmetros e alertas de funcionamento mais importantes na administração da rede.