Fish-assemblage structure of the Corumbatai river basin, São Paulo State, Brazil: characterization and anthropogenic disturbances

O rio Corumbataí é um dos principais tributários da margem direita do rio Piracicaba que é um tributário do rio Tietê. O rio Corumbataí integra a bacia do rio Paraná e é regionalmente importante não só por possuir águas de boa qualidade, mas também por possuir elementos raros na paisagem local. Este estudo visou caracterizar as assembléias de peixes do rio Corumbataí e fornecer dados que contribuam para uma avaliação da sua qualidade ambiental. Na bacia do rio Corumbataí, foram amostrados 4 rios principais, cada um com 3 pontos de coleta. Vinte e quatro amostras foram coletadas durante os meses de março a julho e de setembro a dezembro de 2001. Dados bióticos foram avaliados por medidas de diversidade. Um modelo linear ANCOVA foi utilizado para testar a hipótese de variação espaço-temporal nas assembléias de peixes, com a riqueza de espécies como variável resposta, ordem do rio como fator e temperatura e logaritmo natural do número de indivíduos como covariáveis. Esta análise mostrou uma variação espaço-temporal que é corroborada por conceitos exaustivamente discutidos na literatura, tais como relação espécie-área e o conceito de rio contínuo. Dados provenientes do rio Ribeirão Claro mostraram um padrão diferente quando comparados com os outros rios. Esta diferença foi provavelmente devido à interferência humana e atesta o processo de fragmentação de hábitats aquáticos que podem ter levado a um isolamento das populações locais de peixes.

Identification of sex in Carica papaya L. using RAPD markers

Brazil is currently the worlds largest producer of papaya (Carica papaya L.), producing fruits for both the domestic market and export. Only fruits from hermaphrodite plants are marketed because they have the necessary commercial characteristics, i.e. they are pear-shaped and have thicker flesh and a smaller internal cavity. Increased papaya yield has been limited mainly by the ratio of female to hermaphrodite (1:2) plants normally occurring in orchards. This ratio causes great losses to papaya producers and the identification of the sex of seedlings during the nursery stage would be an important advance. In our study random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was used to differentiate between the sexual forms of three commercial C. papaya cultivars belonging to the Solo group. RAPD assays using the BC210 primer were able to detect hermaphrodites in all of the cultivars tested. The BC210(438)molecular marker was much better at papaya sex differentiation than other markers described in the literature.

Bird species of black water inundation forests in the Jau National Park (Amazonas state, Brazil): their contribution to regional species richness

We compared the relative contribution of blackwater inundation forest (igapo) and unflooded (terra firme) forest for regional bird species diversity in the lower Rio Negro region. For analyses of habitat preference we used mist-net samples and an unpublished bird species check-list. The igapo forest had lower bird species diversity than the terra firme forest. However, some 14% of the forest bird species in the region are restricted to igapo forest. Species composition was found to be distinct between the understories of the two forest types. Common forest bird guilds in the Neotropics such as ant-following birds avoid igapo forest. The differential habitat selection among birds in the inundated and unflooded forest is likely to result from vegetation structure and biological interactions such as aggressive behaviour. Since the inundated forest has a typical biota, conservation efforts needs to be directed to protect these habitats. Unfortunately, inundation forests are threatened by several human actions, especially dam construction. The extent of protected areas in the Brazilian Amazon is insufficient for the adequate protection of the inundated habitats, because it includes only 3% of the total area.

Mirmecofauna em um fragmento de floresta atlântica urbana no município de Marília, Brasil

The aim of this study was to verify the influence of the habitat fragmentation on the Ant Fauna in an urban fragment of Semideciduous Seasonal Atlantic Forest located in the municipality of Marilia, São Paulo, Brazil. The studied fragment was divided into three environments in relation to edge: "Edge" (2m), "Transition" (30m) and "Interior" (90m). By using pitfalls traps and attractive baits there were done nine samples between November 2007 and February 2008. There were collected 3.873 individuals distributed into five subfamilies, 19 genera and 33 species. Five species were abundant on three studied environments: Ectatomma sp1, Mycocepurus goeldii, Paratrechina sp1, Pheidole sp2, Trachymyrmex sp1, Wasmannia auropunctata. The edge and transition environments presented the lower Simpsons diversity index and higher species dominance. However, it was observed little variation between these parameters between environments. Faunistic similarity between environments, expressed by Jaccard's similarity index showed high similarity between all studied environments. Because the studied site is an urban fragment, the similarity found between these areas can be related to habitat fragmentation process, an historical of constant anthropic perturbation and low local colonization rates. However, we suggest that a posteriori evaluation should be done with other arthropods groups like spiders and beetles in due to understand the changes that occur in urban fragments and support the choice of conservation and management actions in favor of this important forest remnant localized in urban area of Marilia, São Paulo, Brazil.

Evaluation of DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers (RAPD) as genetically associated elements to differentiate virulent and non-virulent Paracoccidioides brasiliensis isolates

Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of 35 Paracoccidioides brasiliensis isolates was carried out to evaluate the correlation of RAPD profiles with the virulence degree or the type of the clinical manifestations of human paracoccidioidomycosis. The dendrogram presented two main groups sharing 64% genetic similarity. Group A included two isolates from patients with chronic paracoccidioidomycosis; group B comprised the following isolates showing 65% similarity: two non-virulent, six attenuated, five virulent, eight from patients with chronic paracoccidioidomycosis and two from patients with acute paracoccidioidomycosis. The virulent Pb18 isolate and six attenuated or non-virulent samples derived from it were genetically indistinguishable (100% of similarity). Thus, in our study, RAPD patterns could not discriminate among 35 P. brasiliensis isolates according to their differences either in the degree of virulence or in the type of the clinical manifestation of this fungal infection. © 2002 Federation of European Microbiological Societies. Published by Elsevier Science B.V. All rights reserved.

Diversity of cry genes and genetic characterization of Bacillus thuringiensis isolated from Brazil

Two hundred and eighteen Bacillus thuringiensis isolates from Brazil were characterized by the presence of crystal protein genes by PCR with primers specific to different cry and cyt genes. Among these isolates, 95 were selected according to their geographic origin for genetic characterization with the 16S rRNA gene, RAPD, and plasmid profile. Isolates containing cryl genes were the most abundant (48%) followed by the cry11 and cyt (7%) and cry8 genes (2%). Finally, 40.3% of the isolates did not produce any PCR product. The plasmid profile and RAPD analysis showed a remarkable diversity among the isolates of B. thuringiensis not observed in the 16S rRNA gene. These results suggest that the genetic diversity of B. thuringiensis species results from the influence of different ecological factors and spatial separation between strains generated by the conquest of different habitats.

Genetic conservation of Brazilian fishes - Present state and perspectives

Natural environments have been worldwide affected by the growing impact of anthropogenic actions that promote the reduction or the extinction of several vertebrate species. Aquatic ecosystems represent one of the most affected environments and many fish species and/or populations have been increasingly fragmented distributed due to habitat degradation, predatory fishing, introduction of exotic species, river sedimentation, deforestation, pollution, reduction of food resource, and construction of hydroelectric dams. Actually, more than 150 Brazilian fish species, including freshwater, estuary and coastal species, can be considered threatened. Information on the diversity, conservation biology and population analysis on threatened species or populations, with several DNA markers, can be extremely useful for the success of fish species-recovery and maintenance programs. Although DNA analysis in Neotropical fish species are just beginning, they tend to increase with the widespread attention to the use of molecular approaches to minimize problems related to the risk of extinction. The accumulation of information on biology and pattern of genetic variation of fish species, associated with ecological and demographic data, and also education and respect to the nature, constitutes a crucial task to develop efficient conservation strategies in order to preserve the genetic diversity in aquatic environments.

Efeito de borda em um fragmento de floresta estacional semidecidual no interior do Estado de São Paulo

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Insecta e Arachnida associados ao solo: plantas herbáceas como área de refúgio visando ao controle biológico conservativo

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Genetic structure of red-handed howler monkey populations in the fragmented landscape of Eastern Brazilian Amazonia

We genotyped 15 microsatellite loci in order to evaluate the effects of habitat fragmentation, caused by flooding of the Tucuruí reservoir, on the genetic structure of Alouatta belzebul in eastern Amazonia. The analysis included two populations sampled in 1984, representing both margins of the Tocantins river, and three populations sampled 18 years later. Minimal differences in the diversity levels between present-day (Ho = 0.62-0.69 and AR = 6.07-7.21) and pre-flooding (Ho = 0.60-0.62 and AR = 6.27-6.77) populations indicated there was no significant loss of genetic variability, possibly because of successful management strategies applied during the flooding. The changes observed were limited to shifts in the composition of alleles, which presumably reflect the admixture of subpopulations during flooding. Given this, there were significant differences in the Rst values (p = 0.05) in all but one between-site comparison. Both present-day and original populations showed a deficit of heterozygotes, which suggests that this may be typical of the species, at least at a local level, perhaps because of specific ecological characteristics. The relatively large number of private alleles recorded in all populations may be a consequence of the Wahlund effect resulting from population admixture or a process of expansion rather than the loss of rare alleles through genetic drift. Additionally, the levels of genetic variability observed in this study were higher than those reported for other species of Neotropical primates, suggesting good fitness levels in these A. belzebul populations. Regular genetic monitoring of remnant populations, especially on islands, should nevertheless be an integral component of long-term management strategies.

Ecologia da paisagem para avaliação da idoneidade de redes ecológicas, como subsídio para o planejamento territorial

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

O coatá-de-testa-branca (Ateles marginatus) do baixo Rio Tapajós, Pará: distribuição, abundância e conservação

O coatá-de-testa-branca, Ateles marginatus, é uma espécie de primata ameaçada de extinção segundo a UICN. Endêmica da Amazônia brasileira, este status deve-se a uma combinação de uma distribuição geográfica relativamente restrita e às crescentes pressões antrópicas dentro desta área. O presente estudo compreendeu a margem direita do baixo Rio Tapajós, centrado na rodovia BR-163 (Santarém-Cuiabá), região de intensa e antiga ocupação humana. O objetivo principal do estudo foi uma avaliação da distribuição e abundância de A. marginatus dentro desta área, e a análise dos fatores determinantes destas variáveis. Foram visitados 16 sítios, onde moradores foram entrevistados informalmente para a confirmação da presença ou ausência da espécie. Levantamentos populacionais de transecção linear foram realizados em oito sítios, representativos de diferentes graus de fragmentação de hábitat, com um percurso total de 697,6 km. Em dois sítios, agrupamentos de A. marginatus foram monitorados para a obtenção de dados sobre seu comportamento e ecologia. Os resultados indicam que a espécie é ausente de algumas áreas, incluindo lacunas naturais em sua distribuição e uma zona de extinção local, que parece estender até pelo menos 60 km a sul da cidade de Santarém. Um total de 23 espécies de mamíferos não-voadores foram registradas nos levantamentos populacionais, mas a presença de A. marginatus foi confirmada em apenas três sítios. O estudo indica que fragmentos isolados de floresta com menos de cem hectares não suportam populações de A. marginatus. No caso de fragmentos maiores, a presença e abundância da espécie parecem ser influenciadas mais diretamente por fatores antrópicos (caça e extração de madeira). Mesmo em floresta contínua, a espécie parece ser relativamente pouco abundante, mas semelhante a outras populações de Ateles na Amazônia brasileira. Dois grupos, um com oito membros e o outro com pelo menos vinte, foram identificados durante o monitoramento. Como em outros membros do gênero, a formação de subagrupamentos (fissão-fusão), uma proporção relativamente alta de fêmeas na população e uma dieta frugívora são observadas também em A. marginatus. O estudo deixa clara a situação crítica da espécie na região, frente à ocupação humana, e a necessidade urgente tanto de deter o processo de fragmentação de hábitat como de implantar novas unidades de conservação.

Caça em assentamento rural no sul da floresta amazônica

Neste trabalho investiguei os efeitos sobre as populações locais de mamíferos silvestres das atividades de caça praticadas por sitiantes de um assentamento rural na Floresta Amazônica do norte do Estado de Mato Grosso. A segunda parte do Assentamento Japuranã, na qual foi realizado este estudo, foi ocupada ha três anos. Entrevistas formais foram realizadas com 17 moradores. Informações adicionais foram coletadas informalmente, durante todo tipo de contato com assentados durante o período de estudo. A maioria dos assentados são provenientes dos estados do Sul e Sudeste do Brasil. Tipicamente, são trabalhadores rurais, semi-analfabetos, com baixa renda mensal. As principais técnicas de caça praticadas são a "espera", "cachorros" e "excursão". A carne de caça se mostrou um elemento importante na alimentação aparecendo em cerca de um terço das refeições. A atividade de 14 caçadores foi monitorada entre maio e novembro de 2003, neste período eles abateram 113 mamíferos de 17 espécies. Análises da estrutura da população baseadas em crânios foram possíveis para apenas as espécies de porco-do-mato, Tayassu pecari (queixada) e Pecari tajacu (cateto). A análise indicou que a situação da estrutura da população do T. pecari e do P. tajacu é sensível e poderia seriamente ser afetada se a pressão da caça aumentar. Estimou-se a extração de 4096,3 kg de biomassa em uma área de aproximadamente 38 km2, representando um consumo médio de carne de 0,268 kg/pessoa por dia. Levantamentos populacionais de transecção linear foram realizados em três pontos, dois no assentamento e um em uma área vizinha de floresta contínua, como "controle", na qual a caça não é praticada. Num percurso total de 108 km, foram registradas quinze espécies de mamíferos e quatro de aves, com taxas de avistamento relativamente altas em comparação com outros sítios da Amazônia central e oriental. Entretanto, a riqueza de espécies e sua abundância foram maiores em ambos os pontos do assentamento em comparação com o controle. A abundância de ungulados (porcos-do-mato e veados.), os principais alvos dos caçadores, também foi maior no assentamento (ambos os pontos de coleta) em comparação com o controle. Isto sugere claramente que a caça ainda não teve um impacto significativo sobre as populações de mamíferos do assentamento, em termos de sua abundância, pelo menos. A maior parte da atividade de caça foi de subsistência (85,8%), a restante foi para o controle de animais predadores de criações domésticas (8,0%) ou depredatória (6,2%), neste caso, basicamente para a proteção dos cachorros durante perseguições. Apesar desta pressão, a abundância relativa de mamíferos na área do assentamento sugere que a caça seja sustentável a curto prazo (três anos), possivelmente em função da abundância natural de mamíferos na região, e a densidade populacional humana ainda baixa. Entretanto, esta situação pode durar pouco, já que o desmatamento e a conseqüente fragmentação de hábitat na área do assentamento é um processo contínuo, e a caça ocorre sem qualquer controle. Os resultados deste estudos fornecem uma base importante para o desenvolvimento de planos de manejo para a fauna local, envolvendo a comunidade local, órgãos fiscalizadores, o governo e instituições de pesquisa. Serão fundamentais tanto para conservação das espécies como pelo melhor aproveitamento dos recursos de caça pelos sitiantes locais.

Ecosystem fragmentation drives increased diet variation in an endemic livebearing fish of the Bahamas

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Ocorrência e distribuição espacial de mamíferos não-voadores em reflorestamento no sudeste do Brasil

The Conservation in countrysides landscapes only it will be understood in the context of the habitat fragmentation that have been affected the species richness, abundance and distribution. We carried out a mammal survey in platation forest at São Paulo State and 8 we discussed the species richness comparing with others sites surveyed elsewhere. We investigate the landscape influence in the mammal species distribution through spatial analysis. The absence of primate species in plantation forests appear to be a pattern for this environments. The species richness was similar among areas and it was higher when there have contiguous native forest remnants. Moreover the landscape interference don’t appeared affect the mammal species distribution. In overview the landscape connectivity is ameliorate with forest plantation. However, those species more susceptible to extinction in fragmented landscape only can persist when there are contiguous forest fragments from the plantation forests. The management of plantation forests can improves the conservation value for medium and large size mammals species at countryside landscapes.