Distinct sets of alphabeta TCRs confer similar recognition of tumor antigen NY-ESO-1157-165 by interacting with its central Met/Trp residues.

Naturally acquired immune responses against human cancers often include CD8(+) T cells specific for the cancer testis antigen NY-ESO-1. Here, we studied T cell receptor (TCR) primary structure and function of 605 HLA-A*0201/NY-ESO-1(157-165)-specific CD8 T cell clones derived from five melanoma patients. We show that an important proportion of tumor-reactive T cells preferentially use TCR AV3S1/BV8S2 chains, with remarkably conserved CDR3 amino acid motifs and lengths in both chains. All remaining T cell clones belong to two additional sets expressing BV1 or BV13 TCRs, associated with alpha-chains with highly diverse VJ usage, CDR3 amino acid sequence, and length. Yet, all T cell clonotypes recognize tumor antigen with similar functional avidity. Two residues, Met-160 and Trp-161, located in the middle region of the NY-ESO-1(157-165) peptide, are critical for recognition by most of the T cell clonotypes. Collectively, our data show that a large number of alphabeta TCRs, belonging to three distinct sets (AVx/BV1, AV3/BV8, AVx/BV13) bind pMHC with equal antigen sensitivity and recognize the same peptide motif. Finally, this in-depth study of recognition of a self-antigen suggests that in part similar biophysical mechanisms shape TCR repertoires toward foreign and self-antigens.

Carbon isotope stratigraphy and carbonate production during the Early-Middle Jurassic: examples from the Umbria-Marche-Sabina Apennines (Central Italy)

The carbon isotopic signature of carbonates depends on secular variations of organic carbon and carbonate carbon production/burial rates. A decrease in carbonate productivity makes the organic/carbonate carbon ratio unstable up to the point that even minor variations in the organic carbon reservoirs can provoke carbon isotopic shifts. The delta(13)C positive shifts of the middle Carixian (early Pliensbachian) and the early Bajocian recorded in the Umbria-Marche-Sabina domain represent a good example of this mechanism. Both sedimentology and lithostratigraphy of pelagic platform-basin carbonate systems in this area show that important changes in the source of carbonates correspond to the observed isotopic shifts. The middle Carixian event is in fact well correlatable to the drastic reduction of benthic carbonate production on rift-related intrabasinal highs, which then became pelagic carbonate platforms. The early Bajocian event is concomitant with the beginning of a long hiatus on the pelagic carbonate platforms and with a drop of the biodiversity of calcareous organisms followed by the onset of biosiliceous sedimentation in basins. (C) 2002 Elsevier Science B.V. All rights reserved.

Caracterização química e mineralogia de solos antrópicos (terras pretas de índio) na amazônia central

Na Amazônia brasileira é comum a ocorrência de sítios arqueológicos. Frequentemente, observa-se que as ações humanas nesses sítios promoveram modificações significativas em muitas das características físicas, morfológicas e químicas dos solos desses ambientes, tornando-os muito diferentes dos solos adjacentes, especialmente nas áreas de terra firme da região. Embora muitos estudos tenham sido conduzidos visando compreender a magnitude dessas modificações e seus reflexos na gênese dos solos influenciados, muitas questões precisam ser mais bem compreendidas, sobretudo as relacionadas com a mineralogia desses solos. Este estudo teve como objetivo avaliar as características químicas, a composição mineralógica das frações argila e areia e o grau de pedogênese de cinco perfis de solos com horizonte A antrópico (Au), em ambientes de terra firme e várzea, localizados na Bacia Sedimentar do Amazonas, entre Coari e Manaus-AM. Amostras de solos foram coletadas, preparadas e submetidas às análises químicas de rotina e caracterizadas quanto aos teores de carbono oxidável e aos teores de Si, Fe, Al e P; adicionalmente, efetuou-se a identificação dos minerais presentes nas frações argila e areia, por meio de difratometria de raios X. Os resultados mostraram que as modificações promovidas pela atividade humana levaram à melhoria da fertilidade do solo, resultando em solos com acidez moderada, elevados teores de Ca2+ e de P disponíveis e baixos teores de Al3+ trocável. Esses resultados também revelaram teores muito elevados de P-total nos horizontes antrópicos, variando entre 1.630 e 8.840 mg kg-1 de P2O5. A mineralogia da fração argila dos solos antrópicos de terra firme revelou dominância de caulinita, além da ocorrência de gibbsita, de goethita e de óxidos de titânio (anatásio). O perfil de várzea, além de caulinita e goethita, apresentou também minerais do tipo 2:1 na fração argila. A mineralogia da fração areia dos solos estudados revelou dominância de quartzo, independentemente do ambiente. A fração magnética é composta por maghemita e hematita. Constatou-se, portanto, significativa riqueza química nos horizontes antrópicos, bem como diferenças na composição mineralógica desses horizontes.

Computer-assisted cartography using topographic properties: precision and accuracy of local soil maps in central Mexico

Map units directly related to properties of soil-landscape are generated by local soil classes. Therefore to take into consideration the knowledge of farmers is essential to automate the procedure. The aim of this study was to map local soil classes by computer-assisted cartography (CAC), using several combinations of topographic properties produced by GIS (digital elevation model, aspect, slope, and profile curvature). A decision tree was used to find the number of topographic properties required for digital cartography of the local soil classes. The maps produced were evaluated based on the attributes of map quality defined as precision and accuracy of the CAC-based maps. The evaluation was carried out in Central Mexico using three maps of local soil classes with contrasting landscape and climatic conditions (desert, temperate, and tropical). In the three areas the precision (56 %) of the CAC maps based on elevation as topographical feature was higher than when based on slope, aspect and profile curvature. The accuracy of the maps (boundary locations) was however low (33 %), in other words, further research is required to improve this indicator.

Alpine and pre-Alpine magmatism in the root-zone of the western Central Alps

The highest grade of metamorphism and associated structural elements in orogenic belts may be inherited from earlier orogenic events. We illustrate this point using magmatic and metamorphic rocks from the southern steep belt of the Lepontine Gneiss Dome (Central Alps). The U-Pb zircon ages from an anatectic granite at Verampio and migmatites at Corcapolo and Lavertezzo yield 280-290 Ma, i.e., Hercynian ages. These ages indicate that the highest grade of metamorphism in several crystalline nappes of the Lepontine Gneiss Dome is pre-Alpine. Alpine metamorphism reached sufficiently high grade to reset the Rb-Sr and K-Ar systematics of mica and amphibole, but generally did not result in crustal melting, except in the steep belt to the north of the Insubric Line, where numerous 29 to 26 Ma old pegmatites and aplites had intruded syn- and post-kinematically into gneisses of the ductile Simplon Shear Zone. The emplacement age of these pegmatites gives a minimum estimate for the age of the Alpine metamorphic peak in the Monte Rosa nappe. The U-Pb titanite ages of 33 to 31 Ma from felsic porphyritic veins represent a minimum-age estimate for Alpine metamorphism in the Sesia Zone. A porphyric vein emplaced at 448 +/- 5 Ma (U-Pb monazite) demonstrates that there existed a consolidated Caledonian basement in the Sesia Zone.

Audit report on the Honey Creek Resort Operations Account maintained by Central Group Management, LLC for the year ended June 30, 2011

Audit report on the Honey Creek Resort Operations Account maintained by Central Group Management, LLC for the year ended June 30, 2011

Report on a special investigation of the Clay Central-Everly Community School District for the period July 1, 2005 through November 30, 2010

Report on a special investigation of the Clay Central-Everly Community School District for the period July 1, 2005 through November 30, 2010

Variações do carbono orgânico dissolvido e de atributos físicos do solo sob diferentes sistemas de uso da terra na Amazônia central

O presente estudo teve como objetivo verificar a relação entre C orgânico dissolvido (COD) e atributos físicos do solo em diferentes sistemas de uso da terra na Amazônia central. Quantificaram-se as concentrações de COD sob floresta primária, em três posições topográficas, e em áreas de pastagem, sucessão secundária e sistema agroflorestal (SAF) até a profundidade de 2 m. Instalaram-se extratores de solução do solo para coleta e análise do C da solução na fase orgânica durante um ciclo hidrológico. As concentrações médias de C orgânico dissolvido (COD) na solução do solo seguiram a ordem SAF ou sucessão secundária > floresta (platô) > pastagem (períodos seco e chuvoso-seco), exceto nos períodos chuvoso e seco-chuvoso, em que a pastagem iguala ou ultrapassa as concentrações de COD dos outros ambientes em determinadas profundidades. Os resultados demonstraram a capacidade do SAF e sucessão secundária em recuperar e, ou, disponibilizar o C na solução do solo, sendo formas de utilização do solo recomendadas para manter o C no ambiente terrestre. O COD apresentou variação temporal, espacial e em profundidade, decrescendo nesta última. A ação da estruturação do solo, representada pela agregação, C orgânico total (COT) e porosidade, exerce grande influência nas concentrações de COD nas camadas do solo e, aliada à matéria orgânica mais lábil do solo, determinam a manutenção do C na solução do solo. As concentrações de COD obtidas sob os diferentes ambientes estudados refletem a importância do manejo adequado do solo para a permanência do C no ecossistema do solo.