Molecular phylogeny of the yuhinas (Sylviidae : Yuhina): a paraphyletic group of babblers including Zosterops and Philippine Stachyris

Mitochondrial sequences (2,379 bp) from cytochrome b, ND3, 12s and 16s rRNA were analyzed in order to reconstruct the phylogenetic relationships within the yuhinas (Yuhina), including the chestnut-faced babbler Stachyris whiteheadi which is endemic to the

纤细眼虫( Euglena gracilis)核纤层蛋白基因的初步研究

　目的:探讨在纤细眼虫( Euglena gracilis) 中是否存在核纤层蛋白(lamin) 基因,为核纤层 蛋白基因的起源与进化研究提供线索. 方法:以较为低等生物的核纤层蛋白基因cDNA 序列为参 考,设计引物P0010 和P0012 ,以纤细眼虫总DNA 为模板进行PCR ,PCR 产物回收、测序. 由于不能 获取完整序列,所以据测序结果又设计了P0013 和P0014 两条中间引物,组成P0010/ P0013 和 P0014/ P0012 引物对进行PCR ,回收产物测序. 结果:P0010/ P0012、P0010/ P0013 和P0014/ P0012 引物 对进行PCR 分别获得775、400 和395 bp 的特异性PCR 产物,对这3 种产物分别测序,最终获得了 P0010 和P0012 之间的全序列,共775 bp. 结论:在纤细眼虫中存在着核纤层蛋白基因.

蓝氏贾第虫核纤层蛋白基因的初步研究

贾第虫一度被认为是迄今已知的最原始的真核细胞, 但近来争议日盛。利用PCR 和测序等技术, 对 蓝氏贾第虫( Giardia lamblia) 的核纤层蛋白(lamin) 基因进行了研究。结果表明: 蓝氏贾第虫基因组中存在 一个编码具有明显lamin 特征的基因序列。如该基因序列的3′- 端具有编码与核内膜亲和的特征性模体(motif ) CaaX 的序列; 具有B 型lamin 基因所特有的高度保守的27 bp 片段, 该片段编码高度保守的位于α螺旋杆状区 的9 氨基酸片段等。同时, 这些序列特征又与多细胞的后生动物存在一定差异。这些事实说明在贾第虫中已经 进化产生了典型真核细胞的B 型lamin (基因) 或至少是类似B 型的lamin (基因) , 该生物的进化地位可能并 非过去所认为的那么原始。

蓝氏贾第虫分离株tim 基因序列分析比较研究

　为了探讨来源于不同地理位置贾第虫分离株之间的遗传学关系, 采用tim 基因扩增、限制性酶切和 DNA 序列分析方法对来自我国(C1、C2、、CH2、CH3)、柬埔寨(CAM )、澳大利亚(A 1、A 2) 和美国(BP、CDC) 共9 株 蓝氏贾第虫的基因型进行了分析比较。结果表明,A 1、A 2 和CAM 属第1 型(WB) ; CH2 和CH3 属第2 型(JH) ; C1、 C2、BP 和CDC 属第3 型(GS)。本实验结果提示, 虫株间遗传学关系并非由地理位置的远近所决定。来源于同一地 理位置的虫株其遗传学特性可有很大的差异。相反, 来源于地理位置相隔很远的虫株其遗传学特性却可极为相近。 贾第虫分离株基因型的确定可为本虫分子系统进化和分子流行病学研究提供重要资料。

DNA sequence analysis of the triose phosphate isomerase gene from isolates of Giardia lamblia

Objective To confirm the genetic relation between Giardia lamblia (G. lamblia) isolates from different geographic regions of China and other countries. Methods Genomic DNA were extracted from the trophozoites or cysts of Giardia lamblia. The triose phosphate isomerase (tim) gene was amplified using polymerase chain reaction (PCR) technique. PCR products were digested with endonuclease and sequenced. The data of sequencing were analyzed with the DNAstar software and compared with that of the isolates acquired from GenBank. Results Of nine isolates of Giardia lamblia from China (C1, C2, CH2 and CH3), Cambodia (CAM), Australia (A1 and A2) and America (BP and CDC), respectively, 3 (A1, A2 and CAM) fit into Group 1 (WB), 2 (CH2 and CH3) into Group 2, and 4 (C1, C2, BP and CDC) into Group 3 (GS). The results confirmed the genetic relatedness of G. lamblia isolates from all over the world. Conclusion Genotyping isolates of G. Lamblia provides important information for establishing the phylogenetic relationship or for the epidemiological evaluation of the spreading of this organism.