Monitoring of malaria parasite resistance to chloroquine and sulphadoxine-pyrimethamine in the Solomon Islands by DNA microarray technology.

BACKGROUND: Little information is available on resistance to anti-malarial drugs in the Solomon Islands (SI). The analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in drug resistance associated parasite genes is a potential alternative to classical time- and resource-consuming in vivo studies to monitor drug resistance. Mutations in pfmdr1 and pfcrt were shown to indicate chloroquine (CQ) resistance, mutations in pfdhfr and pfdhps indicate sulphadoxine-pyrimethamine (SP) resistance, and mutations in pfATPase6 indicate resistance to artemisinin derivatives. METHODS: The relationship between the rate of treatment failure among 25 symptomatic Plasmodium falciparum-infected patients presenting at the clinic and the pattern of resistance-associated SNPs in P. falciparum infecting 76 asymptomatic individuals from the surrounding population was investigated. The study was conducted in the SI in 2004. Patients presenting at a local clinic with microscopically confirmed P. falciparum malaria were recruited and treated with CQ+SP. Rates of treatment failure were estimated during a 28-day follow-up period. In parallel, a DNA microarray technology was used to analyse mutations associated with CQ, SP, and artemisinin derivative resistance among samples from the asymptomatic community. Mutation and haplotype frequencies were determined, as well as the multiplicity of infection. RESULTS: The in vivo study showed an efficacy of 88% for CQ+SP to treat P. falciparum infections. DNA microarray analyses indicated a low diversity in the parasite population with one major haplotype present in 98.7% of the cases. It was composed of fixed mutations at position 86 in pfmdr1, positions 72, 75, 76, 220, 326 and 356 in pfcrt, and positions 59 and 108 in pfdhfr. No mutation was observed in pfdhps or in pfATPase6. The mean multiplicity of infection was 1.39. CONCLUSION: This work provides the first insight into drug resistance markers of P. falciparum in the SI. The obtained results indicated the presence of a very homogenous P. falciparum population circulating in the community. Although CQ+SP could still clear most infections, seven fixed mutations associated with CQ resistance and two fixed mutations related to SP resistance were observed. Whether the absence of mutations in pfATPase6 indicates the efficacy of artemisinin derivatives remains to be proven.

Patterns of alcohol consumption in the Seychelles Islands (Indian Ocean).

Self-reported drinking habits were examined in a random sample of 1067 persons aged 25-64 years in the Seychelles, a country in epidemiological transition where consumption of home-brewed, mostly unregistered beverages has been traditionally high. Alcohol consumption was calculated from respondents reporting at least one drink per week ('regular drinkers'). Among men, 51.1% were regular drinkers and had average intake of 112.1 ml alcohol a day. Among women, 5.9% were regular drinkers and had 49.7 ml alcohol a day. Frequency of drinking, but not amount per drinker, was slightly less in the 25-34-year than older-age categories. Home-brews (mostly palm toddy and fermented sugar cane juice) were consumed by 52% of regular drinkers and accounted for 54% of the total alcohol intake reported by all regular drinkers. Based on the reported consumption by regular drinkers only, the average annual alcohol consumption amounted respectively to 20.7 litres and 1.2 litres per man and woman aged 25-64 years, or, using extrapolation, 13.2 litres and 0.8 litres per man and woman respectively of the total population. These values may underestimate the true figures by half, since reported beer consumption accounted for 53% of beer sales. Socio-economic status was associated strongly and inversely with home-brew consumption, but slightly and positively with consumption of commercially marketed beverages. Alcohol intake was associated with smoking, high-density lipoprotein cholesterol, carbohydrate-deficient transferrin and blood pressure, but not with age and body mass index. In conclusion, these data show high alcohol consumption in the Seychelles with an important gender difference, a large proportion of alcohol derived from home-brews, and opposite tendencies for the relationships between socio-economic status and home-made or commercially marketed beverages.

From local groups to early states: the development of complexity in protohistoric Catalonia

La recerca sobre la protohistoria de Catalunya s'ha fonamentat tradicionalment en la historia cultural, pero el treba11 deIs darrers vint-i-cinc anys ha comenat a donar 11um sobre aspectes crucials com el canvi social i la formació de l'Estat arcaico Aquest article és una visió general sobre aquests temes. S'hi analitza particularment el paper del creixement demogrMic com a element crucial del canvi social, pero també s'hi té en compte el paper que eventualment hi hagin pogut tenir els moviments de població i el comerç colonial.

Phyletic trends in uppermost Triassic (Rhaetian) Radiolaria: Two examples from Queen Charlotte Islands, British Columbia, Canada

Risella Carter and Laxtorum Blome, two genera from the diverse Rhaetian fauna of the Sandilands Formation, Queen Charlotte Islands, are used to illustrate phyletic trends in latest Triassic Radiolaria. Several distinct morphotypes constituting a lineage are recognized for each genus. These lineages are homogenous, evolved in situ, and show a continuum of variation through time. The evolution of Risella takes place entirely in the Rhaetian and all species disappear at the end of the Triassic. Earliest species of Laxtorum appear in the upper Norian and evolve rapidly in the Rhaetian. All Rhaetian species go extinct at the end of the Triassic but the genus survives marginally into the Lower Jurassic. Morphological transformations in Risella (a paronaellid) are manifest in the external/cortical shell as the shape changes from triangular to three-rayed. In Laxtorum, distal post abdominal chambers become constricted and eventually develop a terminal tube while, at the same time, an increase in size and sphericity is coupled with a reduction in the number of post abdominal chambers. Evolutionary transitions in the Risella lineage probably represent a reversion of the normal hypothesized trend for paronaellid radiolarians. In the Laxtorum lineage, comparisons with other groups and species displaying similar homeomorphies suggest the evolutionary trends are fundamental and occur repeatedly in faunas of all ages.

Materiales para una flora de las algas del NE de España. I. Zygnemales

Posteriormente a la publicación de mi primera contribución a la flora algológica de nuestras aguas dulces (1944), he dado preferencia a la preparación de trabajos de carácter local y ecológico, por entender que éstos podían conducir más rápidamente al planteamiento, y quizá a la resolución, de problemas de interés superior al puramente taxonómico. Pero el estudio de muchos centenares de muestras de algas, procedentes de localidades dispersas de Cataluña y de comarcas limítrofes, ha ido prosiguiendo independientemente, permitiendo reunir una cantidad considerable de datos inéditos. Eáta nota es la primera de una serie de contribuciones taxonómicas a nuestra flora algológica, que tendrán como base el material no utilizado en otros trabajos de limnología regional o local.

Materiales para una flora de las algas del NE de España. II, Chrysophyceae, Heterocontae, Dinophyceae, Euglenineae

En este segundo artículo (véase Coüecianea Botánica, vol. I, n.' 9) se estudian grupos de particular interés; varios de ellos requieren trabajar con material vivo y son menos conocidos que el resto de las algas. Se da cuenta de especies que no fueron citadas anteriormente, de rectificaciones y de diversos datos sobre especies ya mencionadas en nuestra flora. Varias formas, posiblemente especies nuevas, que no han podido ser completamente estudiadas, son también tenidas en consideración. Numerosas nuevas citas de las especies menos raras se encontrarán en otro trabajo: sobre la vegetación, todavía no publicado.

Materiales para una flora de las algas del NE de España, III a, Euchlorophyceae

Al presente artículo pueden referirse también las advertencias generales que encabezan los que le precedieron (véase Collectanea Botánica, vol. I, pág. 107, y vol. 11, pág. 99). En éste se citan 122 formas, más de la mitad de las cuales son mencionadas por primera vez de Cataluña.

Materiales para una flora de las algas del NE. de España, IV a, Cyanophyceae

La peculiar estructura celular de las cianofíceas puede explicar las dificultades que su sistemática ofrece, notablemente superiores a las que presentan los otros grupos de algas, donde los tipos específicos se suelen mostrar mucho más constantes y caracterizables. Basta una experiencia mediana para darse cuenta de la existencia de un elevado número de razas más o menos distintas dentro de cada «especie» de cianofícea ; consecuencia de la forma de transmitirse los materiales de herencia y de la ausencia de anfimixis...

Materiales para una flora de las algas del NE de España, V a, Bacillariophyta

En las páginas siguientes se estudian las diatomeas contenidas en una serie de recolecciones que no han sido utilizadas en la preparación de trabajos de tipo regional publicados anteriormente, aunque una parte de estos materiales inéditos se aprovechó para un estudio sobre la vegetación de las aguas dulces de Cataluña (Vegetatio, vol. i, págs. 258-284, 1949), en el que se pueden encontrar algunas referencias complementarias sobre ecología y biocenología de las especies.

Materiales para una Flora de las algas del NE de España, VI, Desmidiales, Phodophyceae

Como en anteriores trabajos de esta serie, se reunen en el presente cierto número de datos inéditos sobre especies observadas en recolecciones un tanto esporádicas. La representación de las desmidiales y de las rodofíceas en las tierras bajas de Cataluña es pobre; en conjunto, en la siguiente enumeración no figuran más que ochenta y cuatro nombres.

Materiales para una flora de las algas del NE. de España, VII suplemento

En esta nota adicional se reúnen datos sobre 140 especies, la mayor parte de ellas nuevas para la flora de las tierras bajas catalanas; se han incluido referencias inéditas sobre alguuas pocas formas ya citadas, pero que son raras o que no se encuentran fructificadas habitualmente (edogoniales, zignemales). La clorofícea Thamniochaete frutex se describe como especie nueva; una heteroconta no denominada representa verosímilmente un género nuevo, que deberá recibir nombre cuando pueda disponerse de mejor material.