Non-invasive diagnosis of pediatric tuberculosis

Thesis (Master's)--University of Washington, 2016-08

Mycobacterium Tuberculosis e a resistência do bacilo de Koch

Ao longo dos últimos tempos, a Mycobacterium tuberculosis tem sido alvo de estudos mais aprofundados, visto ser um dos agentes infeciosos que mais pessoas infeta em todo mundo, quer sob a forma ativa, quer sob a forma latente. Assim sendo, têm sido desenvolvidas várias estratégias para o seu controlo e tratamento, que se mostram bastante promissoras. Atualmente existe ainda uma preocupação especial relativamente ao aparecimento de resistências ao bacilo de Kock. Desta forma, são importantes algumas medidas que promovam a diminuição destes casos de resistência, nomeadamente o supervisionamento por um profissional de saúde, como garantia que o tratamento medicamentoso é feito de forma completa e correta. Apesar de tudo, os últimos desenvolvimentos no controlo e tratamento da tuberculose apresentam algumas falhas, desde a falta de eficácia até ao aparecimento de efeitos adversos indesejados, o que alarga ainda mais o período que leva até que um novo tratamento e/ou vacina possam ser inseridos no sistema de saúde. Este trabalho tem como objetivo a revisão do estado atual dos desenvolvimentos em torno do tratamento e controlo da tuberculose nomeadamente da forma resistente, assim como o seu atual impacto na sociedade.

Parameter Identification in a Tuberculosis Model for Cameroon

A deterministic model of tuberculosis in Cameroon is designed and analyzed with respect to its transmission dynamics. The model includes lack of access to treatment and weak diagnosis capacity as well as both frequency-and density-dependent transmissions. It is shown that the model is mathematically well-posed and epidemiologically reasonable. Solutions are non-negative and bounded whenever the initial values are non-negative. A sensitivity analysis of model parameters is performed and the most sensitive ones are identified by means of a state-of-the-art Gauss-Newton method. In particular, parameters representing the proportion of individuals having access to medical facilities are seen to have a large impact on the dynamics of the disease. The model predicts that a gradual increase of these parameters could significantly reduce the disease burden on the population within the next 15 years.

Prevalencia y características clínico-epidemiológicas de los niños con tuberculosis diagnosticados a partir de un caso índice: Uruguay 2012-2014

Introducción: la tuberculosis (TB) es considerada por la Organización Mundial de la Salud (OMS) una emergencia global en salud pública. En Uruguay se registra un aumento de casos desde el año 2011 con una tasa de incidencia actual de 25,1 por 10(5) habitantes. La investigación de contactos adultos con enfermedad pulmonar activa constituye el método más eficiente para identificar niños infectados con Mycobacterium tuberculosis. Objetivo: describir la prevalencia de pacientes menores de 15 años enfermos de tuberculosis a partir del diagnóstico de un caso índice y sus características clínico-epidemiológicas. Metodología: se realizó un estudio descriptivo entre el 1 de enero de 2012 y el 1 de enero de 2014, utilizando como fuente primaria de datos las historias clínicas de los menores de 15 años con diagnóstico de tuberculosis captados por la Comisión Honoraria de Lucha Antituberculosa a partir de un caso índice. En el niño se analizaron las siguientes variables: edad, sexo, estado nutricional, patología concomitante, escolaridad, prueba tuberculínica, estudio bacteriologico radiografía de tórax, adherencia a los controles, necesidad de hospitalización y presencia de resistencia. En el caso índice las variables fueron: parentesco o relación con el niño, edad, estudio bacteriológico, localización de la enfermedad (pulmonar o extrapulmonar), antecedente de reclusión, adicciones o enfermedades concomitantes que causen inmunodepresión, procedencia y presencia de resistencia. Se calcularon medianas como medida de tendencia central, frecuencias absolutas y porcentajes con su respectivo intervalo de confianza de 95%. Resultados: se identificaron 1672 casos de tuberculosis, 497 con contactos menores de 15 años. De ellos 49 transmitieron tuberculosis a los niños (9,9%). De los 872 contactos estudiados, 60 enfermaron (6,9%, IC 95% 5,3%-8,8%). No se pudieron captar para seguimiento 253 menores de 15 años. De los 49 casos índice, 40 presentaron un solo contacto, enfermo menor de 15 años, el resto dos o más. La mediana de edad fue 30 años y el 49% eran familiares de primer grado. La confirmación bacteriológica se obtuvo en 95% de los casos. La letalidad fue 8% y dos casos presentaron multirresistencia. Los niños enfermos tenían una mediana de edad de 4 años y el 60% tenía un adecuado estado nutricional. La mayoría de los pacientes (75%, n=45) no presentó comorbilidad. El PPD fue positivo en 32 de 51 pacientes, el 93% tuvo radiografía de tórax patológica. La confirmación bacteriológica por examen directo o cultivo se logró en 35% de los casos. La adherencia fue adecuada en el 62% (42% en usuarios del subsector público y 80% en el privado). Ingresaron 70% de los pacientes, 57% para estudio e inicio de tratamiento. Se constató multidrogorresistencia en dos casos y la letalidad fue de 1,7%. Conclusiones: la tuberculosis es un grave problema de salud, con un progresivo aumento del número de casos a nivel nacional. La prevalencia de enfermedad entre los contactos menores de 15 años en este estudio fue 6.9% pero la cifra puede estar sesgada por las dificultades en la captación de los contactos, población con mayor riesgo de enfermar. La radiografía de tórax patológica fue el pilar más importante para decidir el inicio de tratamiento en esta población; el aislamiento del germen es muy inferior al del caso índice (35% vs 95%). La adherencia al tratamiento es mala. La detección, seguimiento y estudio de los contactos son las mayores herramientas en el diagnóstico y prevención.

Tuberculosis: detección bacteriológica de casos en sintomáticos respiratorios estudio realizado en la parroquia Taday provincia del Cañar 1990-1991

Doctor en Medicina y Cirugía

A more reliable PCR for detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples

Diagnostic techniques based on PCR have two major problems: false-positive reactions due to contamination with DNA fragments from previous PCRs (amplicons) and false-negative reactions caused by inhibitors that interfere with the PCR. We have improved our previously reported PCR based on the amplification of a fragment of the Mycobacterium tuberculosis complex-specific insertion element IS6110 with respect to both problems. False-positive reactions caused by amplicon contamination were prevented by the use of uracil-N-glycosylase and dUTP instead of dTTP. We selected a new set of primers outside the region spanned by the formerly used primers to avoid false-positive reactions caused by dTTP-containing amplicons still present in the laboratory. With this new primer set, 16 copies of the IS6110 insertion element, the equivalent of two bacteria, could be amplified 10(10) times in 40 cycles, resulting in a mean efficiency of 77% per cycle. To detect the presence of inhibitors of the Taq polymerase, which may cause false-negative reactions, part of each sample was spiked with M. tuberculosis DNA. The DNA purification method using guanidinium thiocyanate and diatoms effectively removed most or all inhibitors of the PCR. However, this was not suitable for blood samples, for which we developed a proteinase K treatment followed by phenol-chloroform extraction. This method permitted detection of 20 M. tuberculosis bacteria per ml of whole blood. Various laboratory procedures were introduced to reduce failure or inhibition of PCR and avoid DNA cross contamination. We have tested 218 different clinical specimens obtained from patients suspected of having tuberculosis. The samples included sputum (n=145), tissue biopsy samples (n=25), cerebrospinal fluid (n=15), blood (n=14), pleural fluid (n=9), feces, (n=7), fluid from fistulae (n=2), and pus from a wound (n=1). The results obtained by PCR were consistent with those obtained with culture, which is the "gold standard." We demonstrate that PCR is a useful technique for the rapid diagnosis of tuberculosis at various sites.

La hospitalización terapéutica obligatoria en el control de la tuberculosis

Este trabajo describe las acciones de los servicios de salud pública de la ciudad de Barcelona para evitar la transmisión de la tuberculosis por pacientes bacilíferos incumplidores utilizando las posibilidades de la Ley 3/1986. Se basan en la resolución de la autoridad sanitaria de la necesidad de su localización y hospitalización terapéutica obligatoria para administrar el tratamiento, movilizando la colaboración policial, comunicándolo a la persona afectada y pidiendo al Juzgado de lo Contencioso Administrativo su ratificación. Se describen el proceso y las características de los casos. Desde julio de 2006 hasta junio de 2015, a lo largo de 9 años, se ha activado sólo en 12 ocasiones. Se valora que se ha usado con prudencia y proporcionalidad, y que ha permitido tratar a pacientes que comportaban riesgo en su entorno, reduciendo así la transmisión de la infección.

Second worldwide proficiency study on variable number of tandem repeats typing of Mycobacterium tuberculosis complex

Global Network for the Molecular Surveillance of Tuberculosis 2010: A. Miranda (Tuberculosis Laboratory of the National Institute of Health, Porto, Portugal)

Cribado de la tuberculosis

Hay pruebas de que el cribado universal de la infección tuberculosa latente (ITBL) en zonas de baja incidencia tiene un rendimiento pobre, un número elevado de falsos positivos y no es coste-efectivo. Hay evidencias de que el cribado de la ITBL en los grupos que tienen riesgo elevado de desarrollar una infección tuberculosa activa (ITBA) mejora el rendimiento de las pruebas diagnósticas, el balance beneficio-riesgo y debe formar parte de las estrategias para disminuir el impacto de la tuberculosis. Sobre el dilema de cuál de las tres estrategias (prueba cutánea de la tuberculina ENT#091;PCTENT#093; sola, determinación de la liberación de interferón gamma ENT#091;IGRAENT#093; solo o PCT seguida de IGRA) para el diagnóstico de la ITBL es la que ofrece mejor rendimiento, existe variabilidad tanto en las recomendaciones de las guías de práctica clínica (GPC) y las instituciones como en las conclusiones de los estudios sobre el tema, aunque la mayoría de las recomendaciones van en el mismo sentido que las que proponemos en este documento. La prueba cutánea de la tuberculina sigue siendo el test diagnóstico con mejor rendimiento para realizar el cribado de la infección tuberculosa latente en niños y adolescentes. Recomendaciones de PrevInfad (GRADE): 1. Se recomienda no realizar el cribado universal de la infección tuberculosa latente en los niños y adolescentes de nuestro país. 2. Se recomienda realizar el cribado de la infección tuberculosa latente en los niños y adolescentes que pertenecen a grupos de riesgo. 3. Se sugiere el uso de la prueba cutánea de la tuberculina (PCT) como primera prueba para el cribado de la infección tuberculosa latente en niños y adolescentes de nuestro país. 4. Se sugiere utilizar los IGRA para los niños y adolescentes de cinco o más años con PCT positiva y antecedente de vacunación con bacilo de Calmette-Guérin (BCG) para mejorar la especificidad de la prueba de cribado.

Programa de intervención para mejorar conocimientos y actitudes sobre la tuberculosis y captar sintomáticos respiratorios. Area 1 de Salud del Cañar. 2007

Con el objetivo de aplicar un programa de capacitación personal para mejorar conocimientos y prácticas sobre el control de la tuberculosis y mejorar la captación de sintomáticos respiratorios. Materiales y métodos: con un diseño cuasi experimental se incluyeron 63 profesionales sanitarios: 33 médicos, 17 odontólogos, 11 enfermeras y 2 obstetrices, distribuidos en 29 unidades operativas; 2 Centros de Salud, 16 subcentros de Salud y 12 puestos de Salud, pertenecientes al Ministerio de Salud Pública. Se aplicó un tes de 20 preguntas para evaluar conocimientos y prácticas antes de la intervención y otro de igual numero para medir el efecto de la intervención después de cumplir el programa de capacitación. Resultados: antes de la intervención, el promedio de respuestas correctas fue de 35,8 ± 4,3 (entre 23 y 56). El incremento de conocimientos fue significativo (p= 0,0001). La captación de sintomáticos respiratorios se incrementó en un 17% en los dos trimestres posteriores a la capacitación, RR 7,8 (IC95% 1,8-32,9) P=0,0003. En cuarto trimestre descendió a los valores pre intervención. Implicaciones: un programa de capacitación permanente sobre control de la Tuberculosis es una estrategia válida para mejorar los conocimientos y las prácticas sanitarias tendientes a incrementar la captación de sintomáticos respiratorios como la mejor medida para detectar la enfermedad

Paradoxical Deterioration During Anti-Tuberculous Therapy in Non-HIV-Infected Patients with Pleural Tuberculosis: A Pragmatic Approach

We report a case of paradoxical deterioration. A male patient diagnosed with pleural tuberculosis, but who was not infected with human immunodeficiency virus (HIV), experienced clinical deterioration 3 weeks after the initiation of anti-tuberculous treatment. After other diagnoses were ruled out, a paradoxical response to treatment was established and the patient was started on systemic corticosteroids. Paradoxical response to treatment should be considered in patients with clinical deterioration after they start on anti-tuberculous treatment.

Endometrial tuberculosis simulating an ovarian cancer

Female genital tuberculosis remains a major health problem in developing countries and is an important cause of infertility. As symptoms, laboratory data and physical fndings are non-specifc, its diagnosis can be diffcult. We describe a case of a 39-year-old woman suffering from peri-umbilical pain and increased abdominal size for one year, anorexia, asthenia, weight loss, occasionally dysuria and dyspareunia, and four months amenorrhea. Laboratory data revealed cancer antigen 125 (CA-125) level of 132.3 U/mL, erythrocyte sedimentation rate of 42 mm/h, and gamma-globulins of 2.66 g/dL. Computer Tomography scan showed loculated ascites. It was initially suspected a carcinomatous origin, but ascites evaluation was negative for malignant cells. Magnetic Resonance Imaging from another hospital showed endometrial heterogeneity. Therefore, an endometrial biopsy was performed demonstrating an infammatory infltrate with giant cells of type Langhans and bacteriological culture identifed Mycobacterium tuberculosis

Thyroid function in multidrug-resistant tuberculosis patients with or without human immunodeficiency virus (HIV) infection before commencement of MDR-TB drug regimen.

Background: Mycobacterium tuberculosis and human immunodeficiency virus (HIV) are known to cause abnormal thyroid function. There is little information on whether HIV infection aggravates alteration of thyroid function in patients with MDRTB. Objectives: This study was carried out to determine if HIV co-infection alters serum levels of thyroid hormones (T3, T4) and thyroid stimulating hormone (TSH) in patients with MDR-TB patients and to find out the frequency of subclinical thyroid dysfunction before the commencement of MDR-TB therapy. Methods: This observational and cross-sectional study involved all the newly admitted patients in MDR-TB Referral Centre, University College Hospital, Ibadan, Nigeria between July 2010 and December 2014. Serum levels of thyroid stimulating hormone (TSH), free thyroxine (fT4) and free triiodothyronine (fT3) were determined using ELISA. Results: Enrolled were 115 patients with MDR-TB, out of which 22 (19.13%) had MDR-TB/HIV co-infection. Sick euthyroid syndrome (SES), subclinical hypothyroidism and subclinical hyperthyroidism were observed in 5 (4.35%), 9 (7.83%) and 2 (1.74%) patients respectively. The median level of TSH was insignificantly higher while the median levels of T3 and T4 were insignificantly lower in patients with MDR-TB/HIV co-infection compared with patients with MDRT-TB only. Conclusion: It could be concluded from this study that patients with MDR-TB/HIV co-infection have a similar thyroid function as patients having MDR-TB without HIV infection before commencement of MDR-TB drug regimen. Also, there is a possibility of subclinical thyroid dysfunction in patients with MDR-TB/HIV co-infection even, before the commencement of MDR-TB therapy.