Quasispecies of hepatitis C virus genotype 1 and treatment outcome with Peginterferon and Ribavirin

The majority of patients with chronic hepatitis C fail to respond to antiviral therapy. The genetic basis of this resistance is unknown. The quasispecies nature of HCV may have an important implication concerning viral persistence and response to therapy. The HCV nonstructural 5A (NS5A) protein has been controversially implicated in the inherent resistance of HCV to interferon (IFN) antiviral therapy. To evaluate whether the NS5A quasispecies pre-treatment composition of HCV 1a/1b is related to responsiveness to combined pegylated interferon (PEG-IFN) and Ribavirin therapy, detailed analyses of the complete NS5A were performed. Fifteen full-length NS5A clones were sequenced from 11 pretreatment samples of patients infected with genotype 1 HCV (3 virological sustained responders, 4 non-responders, and 4 end-of-treatment responders). Our study could not show a significant correlation between the mean number of mutations in HCV NS5A before treatment and treatment outcome, and the phylogenetic construction of complete NS5A sequences obtained from all patients failed to show any clustering associated with a specific response pattern. No single amino acid position was associated with different responses to therapy in any of the NS5A regions analyzed, and mutations were clustered downstream the ISDR, primarily in the V3 region. We observed that the CRS and NLS regions of the NS5A protein were conflicting for some variables analyzed, although no significant differences were found. If these two regions can have antagonistic functions, it seems viable that they present different mutation profiles when compared with treatment response. The patient sample that presented the lowest genetic distance values also presented the smallest number of variants, and the most heterogeneous pattern was seen in the end-of-treatment patients. These results suggest that a detailed molecular analysis of the NS5A region on a larger sample size may be necessary for understanding its role in the therapy outcome of HCV 1a/1b infection. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.

Reproductive relationships and degree of synapsis in the polytene chromosomes of the Drosophila buzzatii species cluster

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Esterase profile in a pyrethroid-resistant Brazilian strain of the cattle tick Boophilus microplus (Acari, Ixodidae)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Social isolation and aggressiveness in the Amazonian juvenile fish Astronotus ocellatus

Testamos o efeito do isolamento social sobre a agressividade no peixe amazônico, Astronotus ocellatus. Dez peixes juvenis foram transferidos de um aquário de agrupamento (60 x 60 x 40 cm) contendo 15 indivíduos (sem discriminação de sexo) para um aquário de isolamento (50 x 40 x 40 cm). A agressividade foi testada por meio de ataques e exibições direcionadas à imagem do peixe no espelho. O comportamento foi filmado durante 10 min em 4 momentos: 30 min, 1 dia, 5 dias e 15 dias após o isolamento. Nós analisamos a motivação agressiva por meio da latência para início do comportamento agonístico e pela freqüência dos ataques totais e específicos direcionados ao espelho. A latência para o comportamento agonístico reduziu ao longo do isolamento e houve uma tendência de aumento da freqüência de mouth fighting (um ataque de alta intensidade de agressão), mostrando-nos um aumento na motivação agressiva. Os resultados estão de acordo com os encontrados para ciclídeos juvenís de Haplochromis burtoni, mas discordam com os encontrados para Pterophylum scalare (acará bandeira). Sugerimos que o aumento da agressividade em A. ocellatus pode ser mediado pelo efeito de exposição prévia, da residência prévia ou por processos envolvendo reconhecimento de co-específicos.

Effect of Static and Cyclic Loading on Ceramic Laminate Veneers Adhered to Teeth with and Without Aged Composite Restorations

Purpose: Existing composite restorations on teeth are often remade prior to the cementation of fixed dental prostheses. The aim of this study was to evaluate the effect of static and cyclic loading on ceramic laminate veneers adhered to aged resin composite restorations.Materials and Methods: Eighty sound maxillary incisors were collected and randomly divided into four groups: group 1: control group, no restorations; group 2: two Class III restorations; group 3: two Class IV restorations; group 4: complete composite substrate. Standard composite restorations were made using a microhybrid resin composite (Anterior Shine). Restored teeth were subjected to thermocycling (6000 cycles). Window preparations were made on the labial surface of the teeth for ceramic laminate fabrication (Empress II). Teeth were conditioned using an etch-and-rinse system. Existing composite restorations representing the aged composites were silica coated (CoJet) and silanized (ESPE-Sil). Ceramic laminates were cemented using a bis-GMA-based cement (Variolink Veneer). The specimens were randomly divided into two groups and were subjected to either static (groups 1a, 2a, 3a, 4a) or cyclic loading (groups 1b, 2b, 3b, 4b). Failure type and location after loading were classified. Data were analyzed using one-way ANOVA and Tukey's test.Results: Significantly higher fracture strength was obtained in group 4 (330 +/- 81 N) compared to the controls in group 1 (179 +/- 120 N) (one-way ANOVA, p < 0.05). Group lb survived a lower mean number of cyclic loads (672,820 cycles) than teeth of groups 2b to 4b (846x10(3) to 873x10(3) cycles). Failure type evaluation after the fracture test showed predominantly adhesive failures between dentin and cement, but after cyclic loading, more cohesive fractures in the ceramic were seen.Conclusion: Ceramic laminate veneers bonded to conditioned aged composite restorations provided favorable results. Surface conditioning of existing restorations may eliminate the necessity of removing aged composite restorations.

Atividade tripanocida de Piper arboreum e Piper tuberculatum (Piperaceae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Annual and short-term variability in primary productivity by phytoplankton and correlated abiotic factors in the Jurumirim Reservoir (São Paulo, Brazil)

A variabilidade anual da produção fotossintética (PP) pelo fitoplâncton na zona da barragem da Represa de Jurumirim (São Paulo, Brasil) foi medida após um estudo no período de três anos sucessivos, com o objetivo de identificar padrões recorrentes e suas causas. Medidas da variabilidade da PP em escala diária foram obtidas em dois períodos do ano (estações seca e chuvosa). Nenhum padrão recorrente foi verificado nos dados de PP, visto não haver relação de sua variabilidade com nenhum fator hidrológico (precipitação, nível e vazão de água e washout) nem, aparentemente, com as condições nutritivas da água. A análise de componentes principais revelou que a PP e a taxa de assimilação foram mais elevadas na época do ano em que o conteúdo de PO4(3-) e N-NH4+ foi mais baixo e quando as razões Z EU/Z MIX foram mais elevadas. A produtividade primária/área pode ser estimada pela razão entre a produtividade volumétrica máxima e o coeficiente de extinção vertical da luz. Entretanto, a biomassa integrada na Z EU foi um pobre preditor da produtividade primária/área. Nenhuma correlação foi encontrada entre a temperatura da água com a produtividade primária (por área e volumétrica máxima). em conseqüência, o estudo da PP em três anos sucessivos mostrou que o padrão de variabilidade é tipicamente caótico. em relação às medidas de curta duração, maior PP foi encontrada na estação seca do que na chuvosa. em ambos os períodos, a variabilidade da PP (por área) foi de aproximadamente 35-40%. O padrão foi atribuído não somente à variação na concentração dos nutrientes mas também à magnitude de penetração de luz na água associado ao regime de circulação. Um comentário sobre a relação entre produção primária pelo fitoplâncton com produção pesqueira é também apresentada.

Stock assessment and fishery management of the pink shrimp Farfantepenaeus brasiliensis Latreille, 1970 and F. paulensis Pérez-Farfante, 1967 in Southeastern Brazil (23° to 28° S)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Colleters in Caryocar brasiliense (Caryocaraceae) ontogenesis, ultrastructure and secretion

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

First gonadal maturation of Pinirampus pirinampu (Siluriformes: Pimelodidae) in the Pantanal, Mato Grosso do Sul State, Brazil

Informações sobre o ciclo reprodutivo de espécies exploradas pela pesca são imprescindíveis para o seu manejo adequado. O tamanho de início da atividade reprodutiva do Pinirampus pirinampu (Spix, 1829) foi determinado. Os exemplares foram capturados em setembro, outubro e dezembro de 1997 e fevereiro e março de 1998. O estádio de desenvolvimento gonadal foi identificado macroscopicamente. O índice gonadossomático médio (IGS), calculado mensalmente, foi utilizado como indicador da época de desova. Para determinação do comprimento da primeira maturação gonadal agruparam-se, separadamente, machos e fêmeas por classes de comprimento em imaturos e adultos. Os resultados referentes aos indivíduos adultos foram lançados em gráficos e a mediana correspondeu à estimativa do comprimento no qual 50% dos indivíduos atingem a maturidade (L50). Foi também determinado o L100, estimativa do comprimento em que todos os indivíduos estão aptos à reprodução. Machos e fêmeas em processo de maturação gonadal foram encontrados a partir de outubro, com maior freqüência em fevereiro, e, somente a partir deste mês, foram encontrados indivíduos com gônadas esvaziadas. O índice gonadossomático mostrou que a partir de setembro inicia-se o processo de desenvolvimento gonadal, com seu valor máximo em fevereiro. O L50 para fêmeas foi 574 mm e para machos foi 536 mm. O L100 para fêmeas foi 590 mm e para os machos, 580 mm.

In vitro anti-Mycobacterium tuberculosis activity of some Brazilian Cerrado plants

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Phenomenology of infrared finite gluon propagator and coupling constant

We report on some recent solutions of the Dyson-Schwinger equations for the infrared behavior of the gluon propagator and coupling constant, discussing their differences and proposing that these different behaviors can be tested through hadronic phenomenology. We discuss which kind of phenomenological tests can be applied to the gluon propagator and coupling constant, how sensitive they are to the infrared region of momenta and what specific solution is preferred by the experimental data.

B-chromosomes in two Brazilian populations of Dendropsophus nanus (Anura, Hylidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Co-infecção HIV/HCV em pacientes de Botucatu e região

Devido à similaridade nas rotas de transmissão, a co-infecção HIV/HCV é freqüente, afetando em média 30 a 50% dos portadores de HIV. O presente estudo visou avaliar uma possível associação entre os subtipos do HIV e genótipos do HCV em pacientes co-infectados, com base na análise das freqüências em pacientes mono e co-infectados. Para determinação da freqüência dos subtipos HIV e genótipos HCV, foram analisados respectivamente 124 e 496 pacientes mono-infectados. O estudo da co-infecção foi realizado num grupo de 150 pacientes HIV positivos e esteve presente em 22 (14,7%) dos pacientes. A freqüência dos subtipos do HIV-1 em mono-infectados foi: subtipo B (85,5%), subtipo F (12,9%) e recombinante B/F (1,6%), enquanto nos genótipos HCV foi: 1a (25%), 1b (29,4%), 1a/1b (3,6%), 3a (35%), 2 (1,8%) e 5 (0,4%). Nos co-infectados o padrão de distribuição dos subtipos HIV-1 é semelhante aos mono-infectados, ou seja, subtipo B (85,0%), seguido do subtipo F (15,0%). A distribuição de freqüência de genótipos HCV nos co-infectados foi: 1a (36,3%), 1b (27,3%), 1a/1b (9,1%) e 3a (27,3%) mostrando um aumento de 10% na freqüência do genótipo 1, queda de 7,7% no genótipo 3 e ausência de outros genótipos. A análise estatística de associação entre os subtipos HIV e genótipos HCV (Goodman) mostrou que no genótipo 1 (HCV) ocorreu predominância do subtipo B, enquanto no genótipo 3 (HCV) a distribuição dos subtipos B e F (HIV-1) foi casual. Isto aponta para a necessidade de mais estudos desse grupo e um maior valor amostral.

Differential distribution of functional alpha(1)-adrenergic receptor subtypes along the rat tail artery

The rat tail artery has been used for the study of vasoconstriction mediated by alpha(1A)-adrenoceptors (ARs). However, rings from proximal segments of the tail artery (within the initial 4 cm, PRTA) were at least 3- fold more sensitive to methoxamine and phenylephrine (n = 6 - 12; p < 0.05) than rings from distal parts (between the sixth and 10th cm, DRTA). Interestingly, the imidazolines N-[ 5-( 4,5- dihydro- 1H- imidazol-2-yl)-2-hydroxy-5,6,7,8- tetrahydronaphthalen- 1- yl] methanesulfonamide hydrobromide (A-61603) and oxymetazoline, which activate selectively alpha(1A)- ARs, were equipotent in PRTA and DRTA (n = 4 - 12), whereas buspirone, which activates selectively alpha(1D)-AR, was approximate to 70-fold more potent in PRTA than in DRTA (n = 8; p < 0.05). The selective alpha(1D)-AR antagonist 8-[2-[4-(methoxyphenyl)-1-piperazinyl] ethyl]-8-azaspiro[4.5] decane-7,9-dione dihydrochloride (BMY- 7378) was approximate to 70- fold more potent against the contractions induced by phenylephrine in PRTA (pK(B) of approximate to 8.45; n = 6) than in DRTA (pK B of approximate to 6.58; n = 6), although the antagonism was complex in PRTA. 5-Methylurapidil, a selective alpha(1A)-antagonist, was equipotent in PRTA and DRTA (pK(B) of approximate to 8.4), but the Schild slope in DRTA was 0.73 +/- 0.05 ( n = 5). The noncompetitive alpha(1B)-antagonist conotoxin rho-TIA reduced the maximal contraction induced by phenylephrine in DRTA, but not in PRTA. These results indicate a predominant role for alpha(1A)-ARs in the contractions of both PRTA and DRTA but with significant coparticipations of alpha(1D)-ARs in PRTA and alpha(1B)-ARs in DRTA. Semiquantitative reverse transcription-polymerase chain reaction revealed that mRNA encoding alpha(1A)- and alpha(1B)-ARs are similarly distributed in PRTA and DRTA, whereas mRNA for alpha(1D)-ARs is twice more abundant in PRTA. Therefore, alpha(1)-ARs subtypes are differentially distributed along the tail artery. It is important to consider the segment from which the tissue preparation is taken to avoid misinterpretations on receptor mechanisms and drug selectivities. antagonism was complex in PRTA. 5- Methylurapidil, a selective alpha(1A)-antagonist, was equipotent in PRTA and DRTA (pK(B) of approximate to 8.4), but the Schild slope in DRTA was 0.73 +/- 0.05 ( n = 5). The noncompetitive alpha(1B)-antagonist conotoxin rho-TIA reduced the maximal contraction induced by phenylephrine in DRTA, but not in PRTA. These results indicate a predominant role for alpha(1A)-ARs in the contractions of both PRTA and DRTA but with significant coparticipations of alpha(1D)-ARs in PRTA and alpha(1B)-ARs in DRTA. Semiquantitative reverse transcription-polymerase chain reaction revealed that mRNA encoding alpha(1A)- and alpha(1B)- ARs are similarly distributed in PRTA and DRTA, whereas mRNA for alpha(1D)-ARs is twice more abundant in PRTA. Therefore, alpha(1)-ARs subtypes are differentially distributed along the tail artery. It is important to consider the segment from which the tissue preparation is taken to avoid misinterpretations on receptor mechanisms and drug selectivities.