Structure and Applications of a Rhamnolipid Surfactant Produced in Soybean Oil Waste

Soybean oil soapstock was utilized as an alternative carbon source for the production of rhamnolipids by Pseudomonas aeruginosa LBI strain. The chemical composition and properties of the rhamnolipid mixture obtained were determined to define its potential applications. The chemical characterization of the rhamnolipid has revealed the presence of ten different homologues. The monorhamnolipid RhaC(10)C(10) and the dirhamnolipid Rha(2)C(10)C(10) were the main components of the mixture that showed predominance of 44% and 29%, respectively, after 144-h of cultivation. The biosurfactant was able to form stable emulsions with several hydrocarbons and showed excellent emulsification for soybean oil and chicken fat (100%). The rhamnolipid removed 67% of crude oil present in sand samples and presented antimicrobial activity against Bacillus cereus and Mucor miehei at 64 mu g/mL and inhibition of Neurospora crassa, Staphylococcus aureus, and Micrococcus luteus at 256 mu g/mL. The results demonstrated that the rhamnolipid produced in soybean oil soapstock can be useful in environmental and food industry applications.

Modelling dominance in a flexible intercross analysis

The aim of this paper is to develop a flexible model for analysis of quantitative trait loci (QTL) in outbred line crosses, which includes both additive and dominance effects. Our flexible intercross analysis (FIA) model accounts for QTL that are not fixed within founder lines and is based on the variance component framework. Genome scans with FIA are performed using a score statistic, which does not require variance component estimation. RESULTS: Simulations of a pedigree with 800 F2 individuals showed that the power of FIA including both additive and dominance effects was almost 50% for a QTL with equal allele frequencies in both lines with complete dominance and a moderate effect, whereas the power of a traditional regression model was equal to the chosen significance value of 5%. The power of FIA without dominance effects included in the model was close to those obtained for FIA with dominance for all simulated cases except for QTL with overdominant effects. A genome-wide linkage analysis of experimental data from an F2 intercross between Red Jungle Fowl and White Leghorn was performed with both additive and dominance effects included in FIA. The score values for chicken body weight at 200 days of age were similar to those obtained in FIA analysis without dominance. CONCLUSION: We have extended FIA to include QTL dominance effects. The power of FIA was superior, or similar, to standard regression methods for QTL effects with dominance. The difference in power for FIA with or without dominance is expected to be small as long as the QTL effects are not overdominant. We suggest that FIA with only additive effects should be the standard model to be used, especially since it is more computationally efficient.

Cytotoxicity of Diepoxybutane and Epichlorohydrin in Relation to Stages of the Cell Cycle

Work conducted in the Millard Biochemistry Research Laboratory examines the dual nature of molecules as carcinogens and anti-tumor agents through the molecular mechanisms of duplex DNA damage by bifunctional alkylating agents. Diepoxybutane (DEB) and epichlorohydrin (ECH) are polar molecules that form covalent DNA interstrand lesions by cross-linking the N7 position of deoxyguanosine residues. A recent experiment indicated that ECH preferentially targets nuclear DNA over mitochondrial DNA, whereas DEB shows similar rates of lesion formation for both loci. It was concluded that preferential targeting of nuclear DNA results from relatively poor uptake of ECH across the mitochondrial membrane. The objective of my honors research was to determine if the cytotoxicities of DEB and ECH vary according to the presence of the nuclear envelope in 6C2 chicken erythro-progenitor cells. The cytotoxicity of DEB and ECH was compared between cells randomly distributed throughout the cell cycle (Go/G, and S » G2/M) and cells enriched in G2/M stages. Results indicated that ECH is more cytotoxic than DEB in both unsynchronized control 6C2 cells and synchronized 6C2 cells enriched in G2/M stages of the cell cycle. Treatment with either bifunctional alkylating agent induced greater cytotoxicity in 6C2 cells enriched in G2/M stages than in unsynchronized control 6C2 cells, suggesting that the presence of the nuclear envelope-or any plasma membrane-may inhibit the reactivity of DEB and ECH.

Comparação de diferentes etapas de enriquecimento seletivo no isolamento de Salmonella sp. a partir de fezes de suínos de terminação

A detecção de Salmonella sp. é fundamental nos programas de controle de salmonelose. Métodos de detecção mais eficientes permitem uma melhor determinação do nível de infecção dos rebanhos, um melhor entendimento da epidemiologia da infecção por Salmonella sp. e o desenvolvimento de programas de controle do patógeno, que visem a segurança biológica do alimento. Nos métodos convencionais, o enriquecimento seletivo é uma etapa crítica, pois inibe a microbiota competitiva e permite a multiplicação de Salmonella sp. Vários caldos de enriquecimento seletivo têm sido comparados quanto à eficiência na recuperação de Salmonella sp. a partir de alimentos, contudo existem poucos estudos relativos a fezes de suínos. O objetivo deste trabalho foi comparar caldos de enriquecimento seletivo para o isolamento de Salmonella sp. a partir de fezes de suínos. Numa primeira fase, amostras de fezes foram contaminadas artificialmente e os caldos Rappaport-Vassiliadis incubado a 42°C (RV), Tetrationato Müller-Kauffmann a 37°C (TMK37) e 42°C (TMK42), e Selenito Cistina (SC) a 37°C foram testados, em associação com meios sólidos seletivos: Rambach (RA), Xilose Lisina Tergitol 4 (XLT4), e Verde Brilhante Vermelho de Fenol Lactose Sacarose (VB). Na segunda fase os caldos RV, TMK37 e TMK42, semeados nos meios XLT4 e VB, foram testados com amostras naturalmente contaminadas. Na primeira fase o RV, TMK42 e TMK37 foram mais eficientes que o SC. No isolamento de Salmonella sp. em amostras naturalmente contaminadas os caldos TMK42 e RV foram superiores ao TMK37. O desempenho destes influenciou diretamente a capacidade seletiva e indicadora dos meios sólidos seletivos. No presente estudo, a associação TMK42/XLT4 demonstrou ser mais sensível, e a RV/XLT4 mais específica. O ágar VB também é recomendado para aumentar a probabilidade de detecção do patógeno. Desta forma os caldos RV e TMK42 e o ágar XLT4 e o VB foram considerados os mais indicados para a implantação de protocolos de detecção de Salmonella sp. em fezes suínas.

Prevalência de anticorpos contra o vírus da anemia infecciosa das galinhas em matrizes de corte na região sul do Brasil.

O vírus da anemia infecciosa das galinhas (CAV, de “chicken anemia virus”), causa doença em aves jovens, caracterizada por anemia aplástica, atrofia linfóide generalizada e conseqüente imunodepressão. A doença clínica ocorre quando os pintos são infectados durante as duas primeiras semanas de vida e pode ser evitada se as reprodutoras passarem anticorpos em quantidade suficiente para sua progênie. Após as duas semanas de idade, as aves podem se infectar com o vírus, porém não desenvolverão a doença clínica. As matrizes infectadas durante o período de reprodução não demonstram sinais clínicos, nem alterações na postura, fertilidade dos ovos e viabilidade embrionária. Após algumas semanas, desenvolvem anticorpos que irão controlar a infecção e serão passados para o ovo, protegendo total ou parcialmente a progênie durante a fase de suscetibilidade a doença. O objetivo deste trabalho foi determinar o estado imune das matrizes, através da determinação da prevalência dos anticorpos em indivíduos e lotes de matrizes, determinar em que fase da criação as matrizes se infectaram e verificar se os títulos de anticorpos das matrizes eram suficientes para proteger a sua progênie. Fizeram parte deste estudo, 20 empresas da Região Sul do País (Paraná, Santa Catarina, Rio Grande do Sul), totalizando 64 lotes de matrizes não vacinadas e 12 lotes de matrizes vacinadas contra o CAV. Foram analisados 1709 soros através de um “kit” de ELISA indireto (KPL). A criação das matrizes foi dividida em quatro fases (Recria, 1ª, 2ª e 3ª fase de produção) para a coleta das amostras e constatou-se que todos os lotes de matrizes de corte não vacinados possuíam aves com anticorpos contra o CAV, 88,86% das matrizes foram soropositivas e 52,33% destas matrizes apresentaram títulos protetores para a progênie. Isto demonstrou que a maioria das aves se infectou durante a sua vida, entretanto, 47,67% das matrizes produziram uma progênie suscetível ou parcialmente protegida. A prevalência de matrizes não vacinadas soropositivas manteve-se constante a partir da fase de recria até o pico de produção, caindo no último terço da produção. Em todas as matrizes vacinadas foram encontrados anticorpos contra o CAV com títulos protetores para a progênie.

Comparação do desempenho de frangos positivos e negativos para a presença de anticorpos contra o vírus da anemia das galinhas

O vírus da anemia das galinhas – CAV (chicken anemia virus) está presente em praticamente todos os países com produção avícola investigados, inclusive no Brasil. O CAV causa a doença chamada de anemia infecciosa das galinhas em aves jovens, que se caracteriza por anemia, aplasia de medula óssea, retardo no crescimento, mortalidade variável (2 a 20%), atrofia de órgãos linfóides e imunodepressão. O controle da anemia infecciosa das galinhas é baseado na transferência de imunidade passiva das matrizes à progênie. A transferência de anticorpos maternos via ovo em nível suficiente é uma forma de prevenir a transmissão vertical do vírus, reduzindo assim a ocorrência de surtos da doença. Este trabalho teve como objetivo comparar o desempenho entre frangos nascidos positivos e negativos para a presença de anticorpos contra o CAV. Para isso, foram utilizados dois lotes de matrizes pesadas, sendo um vacinado e o outro não. Com a progênie obtida dessas matrizes de ambos os lotes, foram constituídos três tratamentos com 50 fêmeas e 50 machos cada: T1 - pintos oriundos de matrizes vacinadas com títulos protetores; T2 - pintos oriundos de matrizes não vacinadas com títulos médios e; T3 - pintos oriundos de matrizes não vacinadas e negativas ou com títulos baixos. Todos os tratamentos permaneceram em regime de criação intensiva usual por 47 dias em 5 propriedades diferentes, portanto o experimento teve 5 repetições. Os dados analisados foram o peso inicial e final, conversão alimentar e mortalidade. Como resultado, foi observado que não houve diferença significativa (p>0,05) no peso final entre os tratamentos com relação as fêmeas. Já, nos machos, os frangos negativos (T3) foram significativamente (p<0,05) mais pesados que os frangos positivos (T1 e T2). Não houve diferença significativa (p>0,05) entre os tratamentos em relação à mortalidade e a conversão alimentar. A análise do soro e histologia do timo determinaram a não ocorrência do desafio durante o período de criação dos frangos. A vacinação das matrizes contra o CAV não gerou títulos de anticorpos superiores aos obtidos nas matrizes não vacinadas e infectadas naturalmente. Este estudo indicou que a presença de anticorpos contra o CAV em frangos de corte, seja através da vacinação ou da infecção natural das matrizes, não gerou uma progênie com melhor desempenho nas condições de criação testadas.

Isolamento e caracterização de Salmonella sp. em suínos ao abate e em cortes de pernil

A Salmonella sp. é uma das principais causas de doenças transmitidas por alimentos, principalmente de origem animal. Os suínos podem ser portadores assintomáticos de Salmonella sp. e, nessa condição, serem levados ao abate. Desta forma, a entrada de Salmonella sp. na cadeia de produção é uma preocupação para a indústria. Sabendo-se da importância deste microrganismo, pelo seu impacto na indústria e na saúde pública, este trabalho teve como objetivo determinar a prevalêncía de Salmonella sp. em suínos levados ao abate em um frigorífico sob inspeção federal no Rio Grande do Sul, e correlacionar com a contaminação de cortes de pernil. Para tanto, 64 amostras de conteúdo intestinal e 121 amostras de cortes de pernil coletadas em 4 visitas, foram submetidas ao isolamento e identificação de Salmonella sp. As amostras de Salmonella sp. foram avaliadas quanto a resistência a 14 antimicrobianos, através da técnica de difusão em ágar. Salmonella sp. foi isolada de 46,87% das amostras de conteúdo intestinal e de 49,59% dos cortes de pernil. Foi encontrado grande número de sorovares, sendo os mais prevalentes Panama e Bredeney. Das amostras isoladas, 60,8% apresentaram perfil de multiresistência, sendo os maiores índices de resistência a sulfonamida, ácido nalidíxico e tetraciclina. Utilizando o perfil de resistência a antimicrobianos de amostras de um mesmo sorovar forma comparadas quanto a sua similaridade e agrupadas em dendrogramas, observou-se grande diversidade nas linhagens isoladas. Os resultados demonstraram que a entrada de animais no frigorífico excretando Salmonella sp., pode contribuir para a contaminação do produto final. A diversidade de sorovares e linhagens pode representar que são várias as fontes de contaminação, tanto dos animais quanto do produto final.

The market of academic journals : empirical evidence from data on French libraries

This paper analyzes the demand and cost structure of the French market of academic journals, taking into account its intermediary role between researchers, who are both producers and consumers of knowledge. This two sidedness feature will echoes similar problems already observed in electronic markets – payment card systems, video game console etc - such as the chicken and egg problem, where readers won’t buy a journal if they do not expect its articles to be academically relevant and researchers, that live under the mantra “Publish or Perish”, will not submit to a journal with either limited public reach or weak reputation. After the merging of several databases, we estimate the aggregated nested logit demand system combined simultaneously with a cost function. We identify the structural parameters of this market and find that price elasticities of demand are quite large and margins relatively low, indicating that this industry experiences competitive constraints.

Fecal androgen levels in common marmoset (Callithrix jacchus) males living in captive family groups

In captive common marmoset groups, the reproductive inhibition observed in subordinate female seems to be a result of olfactory, visual and behavioral cues from the dominant female. However, few studies have examined the relationship among adult males living in the same social group. These studies have shown that reproductive failure among peer males seems to be based on hormonal and behavioral mechanisms. New insights on sexual strategies in primates have been shown using fecal steroids, but so far no information is available for common marmoset males. In the present study, we evaluated the influence of light-dark cycle, age and reproductive condition on the profile of fecal androgens in males living in the same family group. Feces were collected from six fathers and six sons for androgen determination during the light phase of the 24-h cycle for eight days randomly distributed over a 4-week period. Androgen levels were determined by enzyme immunoassay technique. Adult sons showed higher androgen levels (166.97 ± 22.95 ng/g) than fathers (80.69 ± 44.38 ng/g) and juveniles (49.06 ± 23.15 ng/g; P < 0.05). No diurnal variation (P > 0.05) in fecal androgen profile was observed in adults or juveniles. No indication of androgen-mediated social competition between fathers and adult sons was demonstrable. These results provide basic information on fecal androgen profile useful to investigate the socioendocrinology of free-ranging common marmoset males and verify that, in contrast to daughters, the reproductive suppression of sons is not based on physiological inhibition of their gonads

Avaliação da concentração de retinol em fígados frescos e congelados de frangos das linhagens Cobb e Ross

The intake of adequate quantities of food, including those rich in vitamins, is necessary for a healthy life. The lack of vitamin A has been characterized as a public health problem in developing countries, however, a high intake of vitamin A can result in toxic and teratogenics effects. High concentrations of vitamin A have been observed in the livers of animals. The objective of this study was to assess the levels of retinol in chicken livers and verify the effect of frozen storage on these levels. 64 livers from two chicken strains, Cobb and Ross, were used, came from four different farms. We examined 32 livers from each strain, 8 samples from each farm. Liver sample were homogenized individually, then 4 aliquots were taken from each sample. One of aliquots was analyzed immediately after slaughter (T0), the others were analyzed after 30, 60 and 90 days of storage at -18oC (T30, T60 and T90, respectively). Retinol dosage in the liver was determined by High Performance Liquid Chromatography (HPLC). The levels of retinol varied significantly according to the strain. The mean retinol value in the fresh samples was 6678.0 ± 1337.7 and 8324.1 ± 1158.5 µg/100g in the Cobb and Ross strain, respectively. Values of 4258 ± 918.7 ± 1391.7 and 4650.5 ± 1391.7 μg/100g were found after 90 days of storage for Cobb and Ross strain, respectively. The liver freezing caused a significant reduction in their levels of retinol, causing a loss of up to 44% with respect to fresh livers. The reduction in retinol levels occurred from 30 days of storage. Even with the losses from the frozen, the ingestion of a typical portion of 100 g of liver, regardless the chicken strain analyzed, surpass all recommendations of consumption and the maximum tolerable intake of vitamin A (3000 μg/day) for adults