PCR-SSCP and Isoelectric Focusing as Screening Methods for Identification of (Sub-) Tropical Fish Species

To ensure the authentication of fishery products lacking biological characters, rapid species identification methods are required. Two DNA- and protein-based methods, PCR-SSCP (polymerase chain reaction - single strand conformation polymorphism) of a 464 bp segment of the cytochrome b ��� gene and isoelectric focusing (IEF) of water-soluble proteins from fish fillets, were applied to identify fillets of (sub-) tropical fish species available on the European market. Among the samples analysed were two taxonomically identified species from the family Sciaenidae and one from Sphyraenidae. By comparison of DNA- and protein patterns of different samples, information about intra-species variability of patterns, and homogeneity of batches (e.g. fillet blocks or bags) can be obtained. PCR-SSCP and IEF may be useful for pre-checking of a large number of samples by food control laboratories. Zusammenfassung Zur Sicherstellung der Authentizit��t von Fischerei-Erzeugnissen ohne biologische Merkmale sind schnelle Verfahren zur Speziesidentifizierung hilfreich. Zwei Methoden der DNA- bzw. Protein-Analyse wurden eingesetzt, um Filets (sub-) tropischer Fischarten, die auf dem europ��ischen Markt angeboten werden, zu identifizieren. Bei diesen Methoden handelt es sich um die PCR-SSCP (Polymerase-Kettenreaktion ��� Einzelstrang-Konformationspolymorphismus) ��� Analyse der PCR-Produkte und die IEF (isoelektrische Fokussierung) der wasserl��slichen Fischmuskelproteine. Unter den untersuchten Proben waren zwei taxonomisch bestimmte Arten aus der Familie Sciaenidae und eine Spezies aus der Familie Sphyraenidae. Durch Vergleich der DNA- bzw. Proteinmuster lassen sich Informationen ��ber die intra-spezifische Variabilit��t solcher Muster und die Einheitlichkeit von Partien (beispielsweise Filetbl��cke oder Filetbeutel) gewinnen. PCR-SSCP und IEF k��nnen in Laboratorien der Lebensmittel��berwachung als Vortest gerade bei hohen Probenzahlen sinnvoll eingesetzt werden.

Comunidades macrofaunais b��nticas associadas ��s algas de deriva e �� grama marinha Halodule wrightii Ascherson na Ilha do Japon��s, Cabo Frio, RJ

As extensas pradarias submersas formadas pelas gramas marinhas s��o importantes habitats da costa, onde ocorrem intera����es ecol��gicas entre diversas esp��cies da vegeta����o subaqu��tica, invertebrados bent��nicos e peixes. As gramas marinhas e algas de deriva s��o conhecidas como macr��fitas marinhas e, por ocuparem o mesmo tipo de substrato, s��o normalmente encontradas juntas, proporcionando oxig��nio, alimento, prote����o, abrigo al��m de s��tios de reprodu����o e pastagem para os animais associados a essas pradarias. Amostras de algas de deriva e de H. wrightii foram coletadas, ao longo de transectos fixos de 50 m paralelos �� Ilha do Japon��s, a fim de analisar a exist��ncia de rela����es positivas entre as esp��cies de macr��fitas marinhas e sua macrofauna associada, comparar as duas comunidades e avaliar a estrutura����o da comunidade macrofaunal b��ntica do local. Os transectos foram alocados de acordo com a posi����o do banco de grama marinha. Observou-se que a densidade de eixos e a biomassa de H. wrightii n��o explicam a varia����o da biomassa, riqueza de esp��cies e diversidade (��ndice de Simpson) das algas de deriva. A grande movimenta����o das algas de deriva ao longo do banco de grama marinha faz com que elas se homogene��zem e ocupem diferentes lugares ao acaso na pradaria, muitos desses locais com baixa biomassa de H. wrightii devido �� grande variabilidade na distribui����o dessa esp��cie no local de estudo. Os descritores ecol��gicos da grama marinha tamb��m n��o tiveram rela����es positivas com sua macrofauna b��ntica associada. A comunidade macrofaunal associada ��s gramas marinhas foi mais densa, rica e diversa do que a comunidade macrofaunal associada ��s algas de deriva. Os moluscos Anomalocardia flexuosa, Cerithium atratum, Ostrea sp, Tellina lineata e Divalinga quadrissulcata dominaram o ambiente de gramas marinhas. A maior complexidade estrutural das algas de deriva forneceu um habitat protegido mais atrativo para os crust��ceos como, Pagurus criniticornis, Cymadusa filosa e Batea catharinensis. A malacofauna associada ��s algas n��o foi abundante, mas um novo registro foi a ocorr��ncia do bivalve invasor Lithopaga aristatus, perfurando uma concha de Ostrea sp. As rela����es entre os descritores da biomassa algal foram comprovadas para a maioria dos descritores de sua fauna associada. As rela����es das macr��fitas marinhas com a macrofauna total associada seguiram o mesmo padr��o das rela����es das algas de deriva. As an��lises de agrupamento e ordena����o mostraram que as comunidades macrofaunais b��nticas do local s��o estruturadas de acordo com os t��xons dos organismos associados mais dominantes influenciados pelo tipo de vegeta����o basibionte (algas de deriva ou grama marinha). Destaca-se com o presente estudo a import��ncia de medidas de maior prote����o no local para a preserva����o e manuten����o do ecossistema da Ilha do Japon��s, RJ, Brasil