Vector flow mapping using plane wave ultrasound imaging

Les diagnostics cliniques des maladies cardio-vasculaires sont principalement effectués à l’aide d’échographies Doppler-couleur malgré ses restrictions : mesures de vélocité dépendantes de l’angle ainsi qu’une fréquence d’images plus faible à cause de focalisation traditionnelle. Deux études, utilisant des approches différentes, adressent ces restrictions en utilisant l’imagerie à onde-plane, post-traitée avec des méthodes de délai et sommation et d’autocorrélation. L’objectif de la présente étude est de ré-implémenté ces méthodes pour analyser certains paramètres qui affecte la précision des estimations de la vélocité du flux sanguin en utilisant le Doppler vectoriel 2D. À l’aide d’expériences in vitro sur des flux paraboliques stationnaires effectuées avec un système Verasonics, l’impact de quatre paramètres sur la précision de la cartographie a été évalué : le nombre d’inclinaisons par orientation, la longueur d’ensemble pour les images à orientation unique, le nombre de cycles par pulsation, ainsi que l’angle de l’orientation pour différents flux. Les valeurs optimales sont de 7 inclinaisons par orientation, une orientation de ±15° avec 6 cycles par pulsation. La précision de la reconstruction est comparable à l’échographie Doppler conventionnelle, tout en ayant une fréquence d’image 10 à 20 fois supérieure, permettant une meilleure caractérisation des transitions rapides qui requiert une résolution temporelle élevée.

Role of the ASPP Family in the Regulation of p53-Mediated Apoptotic Death of Retinal Ganglion Cells after Optic Nerve Injury

Le glaucome est la première cause de cécité irréversible à travers le monde. À présent il n’existe aucun remède au glaucome, et les thérapies adoptées sont souvent inadéquates. La perte de vision causée par le glaucome est due à la mort sélective des cellules rétiniennes ganglionnaires, les neurones qui envoient de l’information visuelle de la rétine au cerveau. Le mécanisme principal menant au dommage des cellules rétiniennes ganglionnaires lors du glaucome n’est pas bien compris, mais quelques responsables putatifs ont été proposés tels que l’excitotoxicité, le manque de neurotrophines, la compression mécanique, l’ischémie, les astrocytes réactifs et le stress oxidatif, parmis d’autres. Indépendamment de la cause, il est bien établi que la perte des cellules rétiniennes ganglionnaires lors du glaucome est causée par la mort cellulaire programmée apoptotique. Cependant, les mécanismes moléculaires précis qui déclenchent l’apoptose dans les cellules rétiniennes ganglionnaires adultes sont mal définis. Pour aborder ce point, j’ai avancé l’hypothèse centrale que l’identification de voies de signalisations moléculaires impliquées dans la mort apoptotique des cellules rétiniennes ganglionnaires offrirait des avenues thérapeutiques pour ralentir ou même prévenir la mort de celles-ci lors de neuropathies oculaires telles que le glaucome. Dans la première partie de ma thèse, j’ai caractérisé le rôle de la famille de protéines stimulatrices d’apoptose de p53 (ASPP), protéines régulatrices de la famille p53, dans la mort apoptotique des cellules rétiniennes ganglionnaires. p53 est un facteur de transcription nucléaire impliqué dans des fonctions cellulaires variant de la transcription à l’apoptose. Les membres de la famille ASPP, soit ASPP1, ASPP2 et iASPP, sont des protéines de liaison de p53 qui régulent l’apoptose. Pourtant, le rôle de la famille des ASPP dans la mort des cellules rétiniennes ganglionnaires est inconnu. ASPP1 et ASPP2 étant pro-apoptotiques, l’hypothèse de cette première étude est que la baisse ciblée de ASPP1 et ASPP2 promouvrait la survie des cellules rétiniennes ganglionnaires après une blessure du nerf optique. Nous avons utilisé un modèle expérimental bien caractérisé de mort apoptotique neuronale induite par axotomie du nerf optique chez le rat de type Sprague Dawley. Les résultats de cette étude (Wilson et al. Journal of Neuroscience, 2013) ont démontré que p53 est impliqué dans la mort apoptotique des cellules rétiniennes ganglionnaires, et qu’une baisse ciblée de ASPP1 et ASPP2 par acide ribonucléique d’interference promeut la survie des cellules rétiniennes ganglionnaires. Dans la deuxième partie de ma thèse, j’ai caractérisé le rôle d’iASPP, le membre anti-apoptotique de la famille des ASPP, dans la mort apoptotique des cellules rétiniennes ganglionnaires. L’hypothèse de cette seconde étude est que la surexpression d’iASPP promouvrait la survie des cellules rétiniennes ganglionnaires après axotomie. Mes résultats (Wilson et al. PLoS ONE, 2014) démontrent que le knockdown ciblé de iASPP exacerbe la mort apoptotique des cellules rétiniennes ganglionnaires, et que la surexpression de iASPP par virus adéno-associé promeut la survie des cellules rétiniennes ganglionnaires. En conclusion, les résultats présentés dans cette thèse contribuent à une meilleure compréhension des mécanismes régulateurs sous-jacents la perte de cellules rétiniennes ganglionnaires par apoptose et pourraient fournir des pistes pour la conception de nouvelles stratégies neuroprotectrices pour le traitement de maladies neurodégénératives telles que le glaucome.

Visible-light-mediated synthesis of helicenes in batch and continuous flow systems

Le présent mémoire décrit le développement d’une méthode de synthèse des hélicènes catalysée par la lumière visible. Les conditions pour la formation de [5]hélicène ont été établies par une optimisation du photocatalyseur, du solvant, du système d’oxydation et du temps réactionnel. Suite aux études mécanistiques préliminaires, un mécanisme oxydatif est proposé. Les conditions optimisées ont été appliquées à la synthèse de [6]hélicènes pour laquelle la régiosélectivité a été améliorée en ajoutant des substituants sur la colonne hélicale. La synthèse de thiohélicènes a aussi été testée en utilisant les mêmes conditions sous irradiation par la lumière visible. La méthode a été inefficace pour la formation de benzodithiophènes et de naphtothiophènes, par contre elle permet la formation du phenanthro[3,4-b]thiophène avec un rendement acceptable. En prolongeant la surface-π de la colonne hélicale, le pyrène a été fusionné aux motifs de [4]- et [5]hélicène. Trois dérivés de pyrène-hélicène ont été synthétisés en utilisant les conditions optimisées pour la photocyclisation et leurs caractéristiques physiques ont été étudiées. La méthode de cyclisation sous l’action de la lumière visible a aussi été étudiée en flux continu. Une optimisation du montage expérimental ainsi que de la source lumineuse a été effectuée et les meilleures conditions ont été appliquées à la formation de [5]hélicène et des trois dérivés du pyrène-hélicène. Une amélioration ou conservation des rendements a été observée pour la plupart des produits formés en flux continu comparativement à la synthèse en batch. La concentration de la réaction a aussi été conservée et le temps réactionnel a été réduit par un facteur de dix toujours en comparaison avec la synthèse en batch.

Evanescent Wave Fibre Optic Sensors for Trace Analysis of Fe3+ in Water

In this communication, we discuss the details of fabricating an off-line fibre optic sensor (FOS) based on evanescent wave absorption for detecting trace amounts of Fe3+ in water. Two types of FOS are developed; one type uses the unclad portion of a multimode silica fibre as the sensing region whereas the other employs the microbent portion of a multimode plastic fibre as the sensing region. Sensing is performed by measuring the absorption of the evanescent wave in a reagent medium surrounding the sensing region. To evaluate the relative merits of the two types of FOS in Fe3+ sensing, a comparative study of the sensors is made, which reveals the superiority of the latter in many respects, such as smaller sensing length, use of a double detection scheme (for detecting both core and cladding modes) and higher sensitivity of cladding mode detection at an intermediate range of concentration along with the added advantage that plastic fibres are inexpensive. A detection limit of 1 ppb is observed in both types of fibre and the range of detection can be as large as 1 ppb–50 ppm. All the measurements are carried out using a LabVIEW set-up.

Evanescent wave fibre optic sensors for trace analysis of Fe3+ in water

In this communication, we discuss the details of fabricating an off-line fibre optic sensor (FOS) based on evanescent wave absorption for detecting trace amounts of Fe3+ in water. Two types of FOS are developed; one type uses the unclad portion of a multimode silica fibre as the sensing region whereas the other employs the microbent portion of a multimode plastic fibre as the sensing region. Sensing is performed by measuring the absorption of the evanescent wave in a reagent medium surrounding the sensing region. To evaluate the relative merits of the two types of FOS in Fe3+ sensing, a comparative study of the sensors is made, which reveals the superiority of the latter in many respects, such as smaller sensing length, use of a double detection scheme (for detecting both core and cladding modes) and higher sensitivity of cladding mode detection at an intermediate range of concentration along with the added advantage that plastic fibres are inexpensive. A detection limit of 1 ppb is observed in both types of fibre and the range of detection can be as large as 1 ppb–50 ppm. All the measurements are carried out using a LabVIEW set-up.

Evanescent wave fibre optic sensors for trace analysis of Fe3+ in water

In this communication, we discuss the details of fabricating an off-line fibre optic sensor (FOS) based on evanescent wave absorption for detecting trace amounts of Fe3+ in water. Two types of FOS are developed; one type uses the unclad portion of a multimode silica fibre as the sensing region whereas the other employs the microbent portion of a multimode plastic fibre as the sensing region. Sensing is performed by measuring the absorption of the evanescent wave in a reagent medium surrounding the sensing region. To evaluate the relative merits of the two types of FOS in Fe3+ sensing, a comparative study of the sensors is made, which reveals the superiority of the latter in many respects, such as smaller sensing length, use of a double detection scheme (for detecting both core and cladding modes) and higher sensitivity of cladding mode detection at an intermediate range of concentration along with the added advantage that plastic fibres are inexpensive. A detection limit of 1 ppb is observed in both types of fibre and the range of detection can be as large as 1 ppb–50 ppm. All the measurements are carried out using a LabVIEW set-up.

Evanescent wave fibre optic sensors for trace analysis of Fe3+ in water

In this communication, we discuss the details of fabricating an off-line fibre optic sensor (FOS) based on evanescent wave absorption for detecting trace amounts of Fe3+ in water. Two types of FOS are developed; one type uses the unclad portion of a multimode silica fibre as the sensing region whereas the other employs the microbent portion of a multimode plastic fibre as the sensing region. Sensing is performed by measuring the absorption of the evanescent wave in a reagent medium surrounding the sensing region. To evaluate the relative merits of the two types of FOS in Fe3+ sensing, a comparative study of the sensors is made, which reveals the superiority of the latter in many respects, such as smaller sensing length, use of a double detection scheme (for detecting both core and cladding modes) and higher sensitivity of cladding mode detection at an intermediate range of concentration along with the added advantage that plastic fibres are inexpensive. A detection limit of 1 ppb is observed in both types of fibre and the range of detection can be as large as 1 ppb–50 ppm. All the measurements are carried out using a LabVIEW set-up.

A fibre optic evanescent wave sensor for monitoring the rate of pulsed laser deposition of metal thin films

A novel sensing technique for the in situ monitoring of the rate of pulsed laser deposition (PLD) of metal thin films has been developed. This optical fibre based sensor works on the principle of the evanescent wave penetration of waveguide modes into the uncladded portion of a multimode fibre. The utility of this optical fibre sensor is demonstrated in the case of PLD of silver thin films obtained by a Q-switched Nd:YAG laser which is used to irradiate a silver target at the required conditions for the preparation of thin films. This paper describes the performance and characteristics of the sensor and shows how the device can be used as an effective tool for the monitoring of the deposition rate of silver thin films. The fibre optic sensor is very simple, inexpensive and highly sensitive compared with existing techniques for thin film deposition rate measurements

A fibre optic evanescent wave sensor for monitoring the rate of pulsed laser deposition of metal thin films

A novel sensing technique for the in situ monitoring of the rate of pulsed laser deposition (PLD) of metal thin films has been developed. This optical fibre based sensor works on the principle of the evanescent wave penetration of waveguide modes into the uncladded portion of a multimode fibre. The utility of this optical fibre sensor is demonstrated in the case of PLD of silver thin films obtained by a Q-switched Nd:YAG laser which is used to irradiate a silver target at the required conditions for the preparation of thin films. This paper describes the performance and characteristics of the sensor and shows how the device can be used as an effective tool for the monitoring of the deposition rate of silver thin films. The fibre optic sensor is very simple, inexpensive and highly sensitive compared with existing techniques for thin film deposition rate measurements.

A fibre optic evanescent wave sensor used for the detection of trace nitrites in water

A fibre optic technique for detecting trace amounts of nitrite compounds in water is described. The off-line fibre optic sensor outlined here is based on evanescent field absorption in a test solution formed by the reaction of nitrite compounds in water with suitable chemical reagents. A short unclad portion of a plastic clad silica fibre acts as the sensing region. The experimental results clearly establish the usefulness of the present technique for detecting very low concentrations of the order of 1 ppb (parts per billion) of nitrite compounds with a large dynamic range of 1–1000 ppb. Such a high sensitivity enables the present device to be used for measuring the nitrite content in drinking water.

A sensitive fibre optic pH sensor using multiple sol–gel coatings

The fabrication and characterization of a fibre optic pH sensor based on evanescent wave absorption is presented. The unclad portion of a multi-mode optical fibre is coated with a pH sensitive dye, which is immobilized by the sol–gel route. The sensitivity of the device has been found to increase when multiple sol–gel coatings are used as the sensing region. The dynamic range and the temporal response of the sensor are investigated for two different dyes, namely bromocresol purple and bromocresol green. The performance of the device is evaluated in terms of the results obtained during actual measurements.

A sensitive fibre optic pH sensor using multiple sol–gel coatings

The fabrication and characterization of a fibre optic pH sensor based on evanescent wave absorption is presented. The unclad portion of a multi-mode optical fibre is coated with a pH sensitive dye, which is immobilized by the sol–gel route. The sensitivity of the device has been found to increase when multiple sol–gel coatings are used as the sensing region. The dynamic range and the temporal response of the sensor are investigated for two different dyes, namely bromocresol purple and bromocresol green. The performance of the device is evaluated in terms of the results obtained during actual measurements

A sensitive fibre optic pH sensor using multiple sol–gel coatings

The fabrication and characterization of a fibre optic pH sensor based on evanescent wave absorption is presented. The unclad portion of a multi-mode optical fibre is coated with a pH sensitive dye, which is immobilized by the sol–gel route. The sensitivity of the device has been found to increase when multiple sol–gel coatings are used as the sensing region. The dynamic range and the temporal response of the sensor are investigated for two different dyes, namely bromocresol purple and bromocresol green. The performance of the device is evaluated in terms of the results obtained during actual measurements

Fibre optic sensor for the detection of adulterant traces in coconut oil

The design and development of a fibre optic evanescent wave refractometer for the detection of trace amounts of paraffin oil and palm oil in coconut oil is presented. This sensor is based on a side-polished plastic optical fibre. At the sensing region, the cladding and a small portion of the core are removed and the fibre nicely polished. The sensing region is fabricated in such a manner that it sits perfectly within a bent mould. This bending of the sensing region enhances its sensitivity. The oil mixture of different mix ratios is introduced into the sensing region and we observed a sharp decrease in the output intensity. The observed variation in the intensity is found to be linear and the detection limit is 2% (by volume) paraffin oil/palm oil in coconut oil. The resolution of this refractometric sensor is of the order of 10−3. Since coconut oil is consumed in large volumes as edible oil in south India, this fibre optic sensor finds great relevance for the detection of adulterants such as paraffin oil or palm oil which are readily miscible in coconut oil. The advantage of this type of sensor is that it is inexpensive and easy to set up. Another attraction of the side-polished fibre is that only a very small amount of analyte is needed and its response time is only 7 s.