Modificações na produtividade e nas características físicas e químicas da madeira de Eucalyptus grandis causadas pela adubação com lodo de esgoto tratado

O Eucalyptus grandis é uma das espécies mais cultivadas no Brasil devido à sua produtividade e qualidade da madeira. Avaliaram-se o efeito da aplicação de lodo de esgoto tratado (0 a 40 t ha-1 base seca) e uma dose de adubo mineral nos atributos físicos e químicos da madeira de Eucalyptus grandis de árvores com cinco anos de idade, no Município de Itatinga, São Paulo, Brasil. O tipo de solo foi caracterizado como Latossolo Vermelho-Amarelo Distrófico (argila = 120 g kg-1 na camada de 0-20 cm) e o clima, como mesotérmico úmido (Cwa), segundo a classificação de Köeppen. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com seis tratamentos e quatro repetições. O diâmetro à altura do peito (DAP), a altura das árvores e o volume de madeira foram obtidos em todas as parcelas de oito árvores com DAP na classe de maior freqüência. As caracterizações físicas e químicas da madeira foram realizadas de acordo com as normas da ABTCP, TAPPI e ABNT. O lodo de esgoto diminuiu a densidade básica da madeira, mas não afetou os teores de celulose, lignina, extrativos e o poder calorífico da madeira. O decréscimo de densidade da madeira pela adubação com lodo de esgoto foi compensado pela maior produtividade de madeira.

Antimicrobial potential of Eucalyptus globulus against biofilms of Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis

Staphylococcus aureus are among the most common species isolated from bovine mastitis. The pathogenesis of this bacterium is facilitated by a number of virulence factors, including the ability to adhere to abiotic surfaces and/or host tissues often leading to biofilms' formation. From the clinical perspective, the most important feature of Staphytococcus species' biofilms is their high tolerance to the conventional antimicrobial therapy. So, the increasing number of bovine mastitis and the higher levels of Staphylococcus species resistance to traditional antimicrobial agents are considered an important alert for the necessity to focus the future research on identification and development of new strategies to combat S. aureus mastitis. RecenUy, the interest in natural alternatives based on plant extracts has been rising. In add~ion to their health benefits, their antimicrobial potential has been increasingly reported. Taking this into consideration, the evaluation of hydromethanolic extracts of E. globulus against S. aureus biofilms was tested and compared with penicillin, one of the antibiotics most often used in the treatment of cattle infections. All mastitis' isolates tested were good-biofilm producers. As expected penicillin has demonstrated poor activity against S. aureus biofilms (<1 log reduction). However, E. globulus Labill was bactericidal, promoting a biofilm cell reduction of 2-3 log. Therefore, the present work showed the potential antimicrobial activity of E. g/obulus against S. aureus from bovine mastitis, namely in biofilm mode of growth and drew attention to its promising use as an alternative to penicillin.

Efeito da aplicação de diferentes pré-tratamentos na gasificação de cepos de Eucalyptus globulus. Densificação, torrefação e torrefação combinada com densificação

Mestrado em Engenharia Florestal e dos Recursos Naturais - Instituto Superior de Agronomia - UL

Rare HIV-1 subtype J genomes and a new H/U/CRF02_AG recombinant genome suggests an ancient origin of HIV-1 in Angola

This is the author’s version of a work that was accepted for publication in AIDS Research and Human Retroviruses .

Estoque de carbono e densidade do solo em plantio de Eucalyptus grandis na Amazônia Oriental.

O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito da conversão de uma floresta sucessional em sistema de floresta plantada de eucalipto sobre a densidade aparente e o estoque de carbono (C) do solo. O estudo foi conduzido em um povoamento de Eucalyptus grandis com quatro anos de idade e em um fragmento de floresta sucessional, em Paragominas, Pará, Brasil. Amostras de solo foram coletadas em quatro parcelas em cada sistema, nas profundidades 0-5, 5-10, 10-20, 20-30 30-50, 50-70 e 70-100 cm. De maneira geral a densidade do solo variou entre 0,9 a 1,2 g cm-3; nas profundidades 5-10 e 10-20 cm, a densidade do solo no plantio de eucalipto foi inferior à floresta sucessional.

Discovery of stable and variable differences in the Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis type I, II, and III genomes by pan-genome microarray analysis

Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis is an important animal pathogen widely disseminated in the environment that has also been associated with Crohn's disease in humans. Three M. avium subsp. paratuberculosis genomotypes are recognized, but genomic differences have not been fully described. To further investigate these potential differences, a 60-mer oligonucleotide microarray (designated the MAPAC array), based on the combined genomes of M. avium subsp. paratuberculosis (strain K-10) and Mycobacterium avium subsp. hominissuis (strain 104), was designed and validated. By use of a test panel of defined M. avium subsp. paratuberculosis strains, the MAPAC array was able to identify a set of large sequence polymorphisms (LSPs) diagnostic for each of the three major M. avium subsp. paratuberculosis types. M. avium subsp. paratuberculosis type II strains contained a smaller genomic complement than M. avium subsp. paratuberculosis type I and M. avium subsp. paratuberculosis type III genomotypes, which included a set of genomic regions also found in M. avium subsp. hominissuis 104. Specific PCRs for genes within LSPs that differentiated M. avium subsp. paratuberculosis types were devised and shown to accurately screen a panel (n = 78) of M. avium subsp. paratuberculosis strains. Analysis of insertion/deletion region INDEL12 showed deletion events causing a reduction in the complement of mycobacterial cell entry genes in M. avium subsp. paratuberculosis type II strains and significantly altering the coding of a major immunologic protein (MPT64) associated with persistence and granuloma formation. Analysis of MAPAC data also identified signal variations in several genomic regions, termed variable genomic islands (vGIs), suggestive of transient duplication/deletion events. vGIs contained significantly low GC% and were immediately flanked by insertion sequences, integrases, or short inverted repeat sequences. Quantitative PCR demonstrated that variation in vGI signals could be associated with colony growth rate and morphology.

FROM GENES TO GENOMES: LOCAL ADAPTATION AND ADAPTIVE POTENTIAL IN TWO ARCTIC SEABIRDS

By investigating the mechanisms underlying the evolution and the maintenance of local adaptations we can help predict how species will adapt to future environmental change. In this thesis I investigate local adaptation and adaptive potential in thick-billed and common murres (Uria lomvia and U. aalge), two arctic seabirds of international conservation concern. Thanks to the recent development of new genomic methods, I address three major themes that are relevant for both the development of evolutionary theory and conservation: 1) the role of gene flow in the origin and maintenance of adaptation; 2) levels and distribution of standing genetic variation, and their contribution to adaptive potential; and 3) the genomic mechanisms maintaining an adaptive dimorphism within a single interbreeding population. First, I review the literature on genomics of local adaptation with gene flow and find that adaptation can be maintained despite gene flow, that gene flow itself can promote adaptation, and that genetic architecture is important in the origin and maintenance of local adaptations. Second, I genotype genome-wide markers and toll-like receptor genes (TLRs) to investigate local adaptation and adaptive potential in thick-billed murres. Thick-billed murres do not show signatures of local adaptation to their breeding grounds, but outlier loci group birds according to their non-breeding distributions, suggesting that selection and/or demographic connectivity in the winter may explain patterns of differentiation in this species. Genetic variation at TLRs does not decrease with increasing latitude as predicted, but tests of selection and measures of genetic diversity suggest differences in local selective regimes at most genes. Thick-billed murres show high levels of standing genetic variation and their adaptive potential will mostly depend on rate and magnitude of environmental change. Finally, I improve and annotate the assembly of the highly heterozygous genome of the thick-billed murre. Using this assembly as a reference, I perform whole genome analyses to investigate the genomic basis of an adaptive dimorphism in Atlantic common murres. I show for the first time that a 60 kb complex copy number variant in a non-coding region maintains differences in plumage and cold adaptation despite high gene flow.

Antioxidant and angiotensin-converting enzyme inhibitory activity of eucalyptus camaldulensis and litsea glaucescens infusions fermented with Kombucha Consortium

Physicochemical properties, consumer acceptance, antioxidant and angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitory activities of infusions and fermented beverages of Eucalyptus camaldulensis and Litsea glaucescens were compared. Among physicochemical parameters, only the pH of fermented beverages decreased compared with the unfermented infusions. No relevant changes were reported in consumer preference between infusions and fermented beverages. Phenolic profi le measured by UPLC MS/MS analysis demonstrated signifi cant concentration changes of these compounds in plant infusions and fermented beverages. Fermentation induced a decrease in the concentration required to stabilize 50 % of DPPH radical (i.e. lower IC50). Additionally, it enhanced the antioxidant activity measured by the nitric oxide scavenging assay (14 % of E. camaldulensis and 49 % of L. glaucescens); whereas relevant improvements in the fermented beverage were not observed in the lipid oxidation assay compared with unfermented infusions. The same behaviour was observed in the inhibitory activity of ACE; however, both infusions and fermented beverages had lower IC50 than positive control (captopril). The present study demonstrated that fermentation has an infl uence on the concentration of phenolics and their potential bioactivity. E. camaldulensis and L. glaucescens can be considered as natural sources of biocompounds with antihypertensive potential used either as infusions or fermented beverages.

Heat shock response in bacteria with large genomes: lessons from rhizobia

Rhizobia are important soil bacteria due to their ability to establish nitrogen-fixing symbioses with legume plants. In this dual lifestyle, as free-living bacteria or as plant symbiont, rhizobia are often exposed to different environmental stresses. The present chapter overviews the current knowledge on the heat shock response of rhizobia, highlighting how these large genome bacteria respond to heat from a transcriptional point of view. Response to heat shock in rhizobia involves genome wide changes in the transcriptome that may affect more than 30% of the genome and involve all replicons. In addition to the expected upregulation of genes already known to be involved in stress response (dnaK, groEL, ibpA, clpB), the reports on the heat shock response in rhizobia also showed particular aspects of stress response in these resourceful bacteria. The transcriptional response to heat in rhizobia includes the overexpression of a large number of genes involved in transcription and carbohydrate transport and metabolism. Additional studies are needed in order to better understand the transcriptional regulation of stress response in bacteria with large genomes.

Effect of silicon application to Eucalyptus camaldulensis on the population of Glycaspis brimblecombei (Hemiptera: Aphalaridae).

O uso do silício na área florestal tem aumentado recentemente, pois o elemento está relacionado a uma melhoria na resistência a insetos pragas. O psilídeo de concha, Glycaspis brimblecombei é encontrado em todas as regiões produtoras de eucalipto no Brasil. O efeito do silício aplicado em Eucalyptus camaldulensis, na população do psilídeo, foi estudado em dois ensaios. No primeiro experimento, as aplicações foram via solo (silicato de cálcio) e foliar (silicato de potássio) em uma plantação de nove meses. No segundo experimento, este mineral foi aplicado em mudas de eucalipto, no substrato ou sobre as folhas. Mensalmente, durante 24 meses, ovos e imaturos de G. brimblecombei foram amostrados nas folhas. A altura das plantas foi medida com 9, 12, 16 e 24 meses (experimento 1) e, aos 4, 8, 12 e 24 meses (experimento 2) após a aplicação dos tratamentos. O número de ovos e de imaturos foram menores nos períodos de maior precipitação, indicando menos ataque dos psilídeos durante a estação chuvosa. A população psilídeo foi menor nos tratamentos com aplicação de silício tanto foliar como via solo. Nenhuma diferença significativa foi encontrada na altura de plantas de E. camaldulensis.

Plagas exóticas de importância en Eucalyptus en Brasil.

2008

Performance and quality of wood in a clone of Eucalyptus in monoculture and silvipastoral system.

Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de avaliar e comparar o desempenho e as variações na qualidade da madeirade árvores de eucalipto implantadas em sistema silvipastoril e em monocultivo. Os dados foram coletados em 13 árvores amostras aos 36 meses de idade, selecionadas em função do intervalo de confiança da média dos diâmetros a altura do peito (DAP), e da posição das árvores na faixa de plantio no sistema silvipastoril, com face de exposição sul, norte e central. Foram avaliadas as variáveis DAP, altura total e altura comercial, volume e conicidade do tronco, densidade básica e deslocamento da medula. Concluiu-se que no sistema silvipastoril as árvores apresentaram maior DAP, menor altura total e maior conicidade do tronco que no monocultivo. O DAP não diferiu em relação à posição na faixa de plantio, porém as árvores com face de exposição norte foram mais baixas e cônicas. A densidade básica e o deslocamento da medula não foram influenciados pelo sistema de cultivo.

Variação longitudinal do poder calorífico de clones de Eucalyptus sp.

2016

Influence of nitrogen sources on the enzymatic activity and grown by Lentinula edodes in biomass Eucalyptus benthamii.

Lignocelulose é o componente mais abundante do meio ambiente e recurso orgânico renovável no solo. Alguns fungos filamentosos têm desenvolvido a habilidade de degradar e utilizar celulose, hemicelulose e lignina como fonte de energia. O objetivo deste trabalho foi analisar o efeito de três fontes de nitrogênio (sulfato de amônio, nitrato de potássio e farelo de soja) na atividade enzimática de Lentinula edodes EF 50 utilizando como substrato serragem de E. benthamii. Foi aplicado um planejamento experimental de mistura com três repetições no ponto central constituído de sete tratamentos (T) de iguais concentrações em nitrogênio de sulfato de amônia, nitrato de potássio e farinha de soja cozida. Foram determinadas a atividade enzimática da avicelase, carboximetilcelulase, β-glicosidase, xilanases e manganês peroxidase. Foram avaliados o teor de umidade, pH, atividade de água (aw) e análise qualitativa do crescimento micelial em 8 tempos de cultivo. Os resultados mostraram efeito negativo na produção das enzimas nos tratamentos com máxima concentração de sulfato de amônia e nitrato de potássio. Os tratamentos com farinha de soja cozida expressaram maiores atividades enzimáticas, nos tempos de 3, 6 e 9 dias de cultivo exceto na atividade do manganês peroxidase. A maior produção foi observada no tratamento com sulfato de amônia e farinha de soja cozida (83.86 UI.L?1) em 20 dias de cultivo.

Modelagem de biomassa por unidade de área em plantações de Eucalyptus no Estado de Minas Gerais.

Este trabalho teve como objetivo estimar a quantidade de biomassa seca em plantios de Eucalyptus no estado de Minas Gerais, a partir de resultados de 244 parcelas de inventário florestal, considerando variações de qualidade do sítio, área basal e idade entre 2 e 8 anos. Foi estabelecida a classificação de sítio, com ajuste de equação utilizando os dados de idade e altura dominante. A biomassa total por hectare foi calculada multiplicando-se o volume por hectare pela densidade da madeira de Eucalyptus grandis e por um fator de expansão de biomassa. Avaliando-se a correlação entre biomassa total por hectare e variáveis ambientais e dendrométricas, verificou-se que a área basal e o índice de sítio foram as duas variáveis do povoamento de correlação mais alta, 0,93 e 0,64, respectivamente. Doze modelos foram ajustados para representar a quantidade de biomassa total por hectare tendo como variáveis independentes a área basal, o índice de sítio e a idade, bem como combinações entre estas. O modelo que apresentou melhor ajuste e precisão foi: Bs = exp[−6,7518 + 0,9567 × ln(G) + 0,0388 × ln?(G) + 4,0732 × ln(IS) − 0,4799 × ln?(IS)] × 1,0020, com R²ajustado de 0,955 e Syx% de 5,29%, e indicou valores de estoque de biomassa entre 39,7 e 174,9 Mg.ha-1, para área basal entre 8,9 e 27,9 m2.ha-1. A aplicação do modelo ajustado, com as variáveis índice de sitio e área basal por hectare, pode estimar de maneira prática e precisa a biomassa total por hectare, por utilizar variáveis de simples obtenção e por ter sido gerada a partir de um conjunto de dados com pouca variabilidade atribuída ao material genético.