Mitochondrial gene sequences useful for species identification of western North Atlantic Ocean sharks

Molecular-based approaches for shark species identification have been driven largely by issues specific to the fishery. In an effort to establish a more comprehensive identification data set, we investigated DNA sequence variation of a 1.4-kb region from the mitochondrial genome covering partial sequences from the 12S rDNA, 16S rDNA, and the complete valine tRNA from 35 shark species from the Atlantic fishery. Generally, within-species variability was low in relation to interspecific divergence because species haloptypes formed monophyletic groups. Phylogenetic analyses resolved ordinal relationships among Carcharhiniformes and Lamniformes, and revealed support for the families Sphyrnidae and Triakidae (within Carcharhiniformes) and Lamnidae and Alopidae (within Lamniformes). The combination of limited intraspecific variability and sufficient between-species divergence indicates that this locus is suitable for species identification.

Classification of Coastal Communities Reporting Commercial Fish Landings in the U.S. Northeast Region: Developing and Testing a Methodology

The National Marine Fisheries Service is required by law to conduct social impact assessments of communities impacted by fishery management plans. To facilitate this process, we developed a technique for grouping communities based on common sociocultural attributes. Multivariate data reduction techniques (e.g. principal component analyses, cluster analyses) were used to classify Northeast U.S. fishing communities based on census and fisheries data. The comparisons indicate that the clusters represent real groupings that can be verified with the profiles. We then selected communities representative of different values on these multivariate dimensions for in-depth analysis. The derived clusters are then compared based on more detailed data from fishing community profiles. Ground-truthing (e.g. visiting the communities and collecting primary information) a sample of communities from three clusters (two overlapping geographically) indicates that the more remote techniques are sufficient for typing the communities for further in-depth analyses. The in-depth analyses provide additional important information which we contend is representative of all communities within the cluster.

Deepwater and Other Sharks of the U.S. Atlantic Ocean Exclusive Economic Zone

Fifty-one deepwater and other shark species of the U.S. Exclusive Economic Zone in the Atlantic Ocean and Gulf of Mexico, which currently are not included in any Federal fishery management plan, are described, with a focus on primary distribution. Many of these shark species are not well known, while others which are more common may be of particular interest. Owing to concerns regarding possible increases in fishing effort for some of these species, as well as possible increases in bycatch rates as other fisheries move farther offshore, it is important that these sharks be considered in marine ecosystem management efforts. This will necessitate a better understanding of their biology and distribution. Primary distribution maps are included, based on geographic information system (GIS) analyses of both published and unpublished data, and a review of the literature. The most recent systematic classification and nomenclature for these species is used.

Cook Inlet Belugas, Delphinapterus leucas: Status and Overview

Of the five populations of beluga, Delphinapterus leucas, in Alaska, the most isolated is the one in Cook Inlet (Hazard, 1988; Hill and DeMaster, 1998) (Fig. 1). The geographic and genetic segregation of this stock (O’Corry-Crowe et al., 1997), combined with the beluga’s tendency toward site fidelity in summer, makes this population especially vulnerable to impacts from large or persistent harvests.

Beluga, Delphinapterus leucas, Habitat Associations in Cook Inlet, Alaska

A review of available information describing habitat associations for belugas, Delphinapterus leucas, in Cook Inlet was undertaken to complement population assessment surveys from 1993-2000. Available data for physical, biological, and anthropogenic factors in Cook Inlet are summarized followed by a provisional description of seasonal habitat associations. To summarize habitat preferences, the beluga summer distribution pattern was used to partition Cook Inlet into three regions. In general, belugas congregate in shallow, relatively warm, low-salinity water near major river outflows in upper Cook Inlet during summer (defined as their primary habitat), where prey availability is comparatively high and predator occurrence relatively low. In winter, belugas are seen in the central inlet, but sightings are fewer in number, and whales more dispersed compared to summer. Belugas are associated with a range of ice conditions in winter, from ice-free to 60% ice-covered water. Natural catastrophic events, such as fires, earthquakes, and volcanic eruptions, have had no reported effect on beluga habitat, although such events likely affect water quality and, potentially, prey availability. Similarly, although sewage effluent and discharges from industrial and military activities along Cook Inlet negatively affect water quality, analyses of organochlorines and heavy metal burdens indicate that Cook Inlet belugas are not assimilating contaminant loads greater than any other Alaska beluga stocks. Offshore oil and gas activities and vessel traffic are high in the central inlet compared with other Alaska waters, although belugas in Cook Inlet seem habituated to these anthropogenic factors. Anthropogenic factors that have the highest potential negative impacts on belugas include subsistence hunts (not discussed in this report), noise from transportation and offshore oil and gas extraction (ship transits and aircraft overflights), and water quality degradation (from urban runoff and sewage treatment facilities). Although significant impacts from anthropogenic factors other than hunting are not yet apparent, assessment of potential impacts from human activities, especially those that may effect prey availability, are needed.

Development of Beluga, Delphinapterus leucas, Capture and Satellite Tagging Protocol in Cook Inlet, Alaska

Attempts to capture and place satellite tags on belugas, Delphinapterus leucas, in Cook Inlet, Alaska were conducted during late spring and summer of 1995, 1997, and 1999. In 1995, capture attempts using a hoop net proved impractical in Cook Inlet. In 1997, capture efforts focused on driving belugas into nets. Although this method had been successful in the Canadian High Arctic, it failed in Cook Inlet due to the ability of the whales to detect and avoid nets in shallow and very turbid water. In 1999, belugas were successfully captured using a gillnet encirclement technique. A satellite tag was attached to a juvenile male, which subsequently provided the first documentation of this species’ movements within Cook Inlet during the summer months (31 May–17 September).

The Origin of the Florida Sponge Fishery

Sponges were used domestically by Key West, Fla., pioneers soon after the town was settled in 1822 (Collins, 1887). Fortunately, aroung 1852, it was discovered that Florida sponges were able to compete with imported sponges from the Mediterranean, and they soon became commercially successful (Moore, 1910). These Florida-caught sponges were shipped to markets in New York and sold for domestic cleaning and personal hygiene, as upholstery stuffing and packing material, and for cleaning military cannons.

EaD e Ciberespaço: um estudo sobre a Didática nos ambientes virtuais de aprendizagem e as possibilidades de construção de saberes

O presente trabalho de pesquisa investiga a didática, relacionando-a com as atividades educativas desenvolvidas intencionalmente nos ambientes virtuais de aprendizagem. O trabalho se desenvolve a partir do conceito de didática, compreendida como meios e mecanismos pelos quais se desenvolvem os processos de ensino-aprendizagem relacionados ao contexto sociociocultural. Utiliza-se como base teórica predominantemente, os conceitos de didática de Libâneo (1994, 2009, 2010, 2011, 2012), Candau (2003, 2011) e Pimenta (2011, 2013). Com relação ao contexto sociocultural utiliza-se Castells (2003, 2013), Lévy (1998, 2012), Lemos (2010) e Moore (2013). Investiga-se a sequência didática utilizada por duas instituições, através da coleta e análise das páginas web e dos planejamentos de curso disponibilizados nos AVA. Esta pesquisa situa-se no âmbito das pesquisas qualitativas e desta forma não houve uma estruturação rígida. Foi delineado um design mínimo para início do trabalho focando os aspectos da estruturação da aula virtual e dos elementos estruturais elencados por Libâneo. No decorrer da investigação foram adotados procedimentos de acordo com a realidade investigada. Observa-se que ambas as instituições apresentam uma sequência didática singular, com diferenças de concepção na sua elaboração. Percebe-se que, no ambiente online, a didática está sempre presente, embora tal qual no ambiente presencial, retratando as diferentes concepções de ensino.

Hardware reconfigurável para geração de música harmonizada utilizando autômatos celulares.

Desde os primórdios da humanidade, a descoberta do método de processamento cerebral do som, e consequentemente da música, fazem parte do imaginário humano. Portanto, as pesquisas relacionadas a este processo constituem um dos mais vastos campos de estudos das áreas de ciências. Dentre as inúmeras tentativas para compreensão do processamento biológico do som, o ser humano inventou o processo automático de composição musical, com o intuito de aferir a possibilidade da realização de composições musicais de qualidade sem a imposição sentimental, ou seja, apenas com a utilização das definições e estruturas de música existentes. Este procedimento automático de composição musical, também denominado música aleatória ou música do acaso, tem sido vastamente explorado ao longo dos séculos, já tendo sido utilizado por alguns dos grandes nomes do cenário musical, como por exemplo, Mozart. Os avanços nas áreas de engenharia e computação permitiram a evolução dos métodos utilizados para composição de música aleatória, tornando a aplicação de autômatos celulares uma alternativa viável para determinação da sequência de execução de notas musicais e outros itens utilizados durante a composição deste tipo de música. Esta dissertação propõe uma arquitetura para geração de música harmonizada a partir de intervalos melódicos determinados por autômatos celulares, implementada em hardware reconfigurável do tipo FPGA. A arquitetura proposta possui quatro tipos de autômatos celulares, desenvolvidos através dos modelos de vizinhança unidimensional de Wolfram, vizinhança bidimensional de Neumann, vizinhança bidimensional Moore e vizinhança tridimensional de Neumann, que podem ser combinados de 16 formas diferentes para geração de melodias. Os resultados do processamento realizado pela arquitetura proposta são melodias no formato .mid, compostas através da utilização de dois autômatos celulares, um para escolha das notas e outro para escolha dos instrumentos a serem emulados, de acordo com o protocolo MIDI. Para tal esta arquitetura é formada por três unidades principais, a unidade divisor de frequência, que é responsável pelo sincronismo das tarefas executadas pela arquitetura, a unidade de conjunto de autômatos celulares, que é responsável pelo controle e habilitação dos autômatos celulares, e a unidade máquina MIDI, que é responsável por organizar os resultados de cada iteração corrente dos autômatos celulares e convertê-los conforme a estrutura do protocolo MIDI, gerando-se assim o produto musical. A arquitetura proposta é parametrizável, de modo que a configuração dos dados que influenciam no produto musical gerado, como por exemplo, a definição dos conjuntos de regras para os autômatos celulares habilitados, fica a cargo do usuário, não havendo então limites para as combinações possíveis a serem realizadas na arquitetura. Para validação da funcionalidade e aplicabilidade da arquitetura proposta, alguns dos resultados obtidos foram apresentados e detalhados através do uso de técnicas de obtenção de informação musical.

Die vertikale Verteilung von Heringslarven im Greifswalder Bodden

Kurzfassung Im Rahmen einer Bachelorarbeit wurde untersucht, ob die Larven des frühjahrslaichenden Herings der westlichen Ostsee im Greifswalder Bodden eine inhomogene vertikale Verteilung aufweisen, da in bisherigen Studien aufgrund der niedrigen Gewässertiefe des Boddens von hydrografischer Durchmischung und somit homogener Ichthyoplanktonverteilung ausgegangen wurde. Dazu wurden zwei Nullhypothesen überprüft, eine, die annimmt, dass Heringslarven allgemein im Greifswalder Bodden homogen verteilt sind, eine zweite, nach der auch verschiedenen Längenklassen der Heringe homogen verteilt sind. Die Proben, die Mitte April an drei verschiedenen Stationen im Greifswalder Bodden genommen wurden, zeigten signifikante Unterschiede der Larvenabundanzen allgemein zwischen den beprobten Tiefenstufen als auch der Längenklassen zwischen den Tiefenstufen, sodass beide Nullhypothesen abzulehnen sind. Eine homogene Verteilung der Heringslarven kann ausgeschlossen werden. Abstract Larvae of the Western Baltic Spring Spawning Herring were sampled in the Greifswalder Bodden in the course of a Bachelor Thesis to investigate whether they are inhomogeneously vertically distributed. Previous research assumed homogeneous vertical distribution because of the shallowness of the Greifswalder Bodden due to hydrographical mixing of the water and the ichthyoplankton. Two null hypotheses were tested, one which presumes even vertical distribution of the herring larvae and another which presumes even vertical distribution within different length classes in the Greifswalder Bodden. Sampling took place at three different stations in the Greifswalder Bodden during April and results showed significant differences of the larvae abundances between the sampled depths and also significant differences of the length classes between the sampled depths. Therefore both null hypotheses can be rejected and a homogeneous vertical distribution of the herring larvae in the Greifswalder Bodden can be excluded.

Uma Metodologia para Auxiliar no Processo de Conversão de Bases Cartográficas Utilizando o Padrão da Estrutura de Dados Geoespaciais Vetoriais.

Na década de 80, o surgimento de programas de computadores mais amigáveis para usuários e produtores de informação e a evolução tecnológica fizeram com que as instituições, públicas e privadas, se aperfeiçoassem em estudos sobre sistemas de produção cartográfica apoiados por computador, visando a implementação de Sistemas de Informação Geográfica (SIG). A pouca simultaneidade de forças entre órgãos interessados, resultou em uma grande quantidade de arquivos digitais com a necessidade de padronização. Em 2007, a Comissão Nacional de Cartografia (CONCAR) homologou a Estrutura de Dados Geoespaciais Vetoriais (EDGV) a fim de minimizar o problema da falta de padronização de bases cartográficas. A presente dissertação tem como foco elaborar uma metodologia de trabalho para o processo de conversão de bases cartográficas digitais existentes no padrão da Mapoteca Topográfica Digital (MTD), do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE), para o padrão da EDGV, bem como suas potencialidades e limitações para integração e padronização de bases cartográficas digitais. Será feita uma aplicação da metodologia utilizando a carta topográfica de Saquarema, na escala de 1:50.000, vetorizada na Coordenação de Cartografia (CCAR) do IBGE e disponível na Internet. Como a EDGV foi elaborada segundo técnicas de modelagem orientada a objetos, foi necessário um mapeamento para banco de dados relacional, já que este ainda é utilizado pela maioria dos usuários e produtores de informação geográfica. Um dos objetivos específicos é elaborar um esquema de banco de dados, ou seja, um banco de dados vazio contendo todas as classes de objetos, atributos e seus respectivos domínios existentes na EDGV para que possa ser utilizado no processo de produção cartográfica do IBGE. Este esquema conterá todas as descrições dos objetos e de seus respectivos atributos, além de já permitir que o usuário selecione o domínio de um determinado atributo em uma lista pré definida, evitando que ocorra erro no preenchimento dados. Esta metodologia de trabalho será de grande importância para o processo de conversão das bases cartográficas existentes no IBGE e, com isso, gerar e disponibilizar bases cartográficas no padrão da EDGV.