A homogeneous DNA hybridization system by using a new luminescence terbium chelate

Homogeneous DNA hybridization assay based on the luminescence resonance energy transfer (LRET) from a new luminescence terbium chelate, N,N,N-1,N-1-[2,6-bis(3'-aminomethyl-1'-pyrazolyl)-4-phenylpyridine]tetrakis(acetic acid) (BPTA)-Tb3+ (lambda(ex) = 325 nm and lambda(em) = 545 nm) to an organic dye, Cy3 (A,. = 548 nm and A,. = 565 nm), has been developed. In the system, two DNA probes whose sequences are complementary to the two different consecutive sequences of a target DNA are used; one of the probes is labeled with the Tb3+ chelate at the T-end, and the other is with Cy3 at the 5'-end. Labeling of the Tb3+ chelate is accomplished via the linkage of a biotin-labeled DNA probe with the Tb3+ chelate-labeled streptavidin. Strong sensitized emission of Cy3 was observed upon excitation of the Tb3+ chelate at 325 run, when the two probe DNAs were hybridized with the target DNA. The sensitivity of the assay was very high compared with those of the previous homogeneous-format assays using the conventional organic dyes; the detection limit of the present assay is about 30 pM of the target DNA strand.

Robust, High-Speed Network Design for Large-Scale Multiprocessing

As multiprocessor system size scales upward, two important aspects of multiprocessor systems will generally get worse rather than better: (1) interprocessor communication latency will increase and (2) the probability that some component in the system will fail will increase. These problems can prevent us from realizing the potential benefits of large-scale multiprocessing. In this report we consider the problem of designing networks which simultaneously minimize communication latency while maximizing fault tolerance. Using a synergy of techniques including connection topologies, routing protocols, signalling techniques, and packaging technologies we assemble integrated, system-level solutions to this network design problem.

Quebra de planta de soja no Estado do Paraná.

O presente trabalho, de caráter exploratório, foi motivado pela ocorrência de quebra de plantas, verificado em várias áreas cultivadas com soja, nas últimas safras. A planta, ainda no estádio vegetativo, apresenta uma depressão, que pode evoluir para um anelamento na haste, logo acima do nó cotiledonar, causando, posteriormente, o tombamento ou a quebra da planta. Em avaliações realizadas no Estado do Paraná (2001 a 2006), constatou-se a ocorrência de quebra de planta em 48 municípios, sendo a maior incidência registrada na cultivar CD 206, em 98% das áreas afetadas com o problema, embora casos isolados tenham sido constatados também em outras cultivares (BRS 184, CD 202, CD 205, CD 214), em safras passadas. A análise de diferentes fatores, como sistema de cultivo, localização do sintoma na propriedade, ocorrência e controle de insetos-pragas, controle de plantas daninhas, tratamento de semente e condições climáticas, registrados em levantamentos realizados em 37 propriedades onde houve a quebra de planta de soja, na safra 2005/06, não foi esclarecedora quanto à causa responsável pelo problema. Neste documento, são descritos também os resultados obtidos de pesquisas realizadas com diferentes populações de percevejos, sob distintas metodologias de infestação, em ensaios com plantas de soja submetidas a diferentes situações de alternância de temperatura logo após a emergência, em análises comparativas quanto às condições climáticas, à fertilidade do solo, ao estado nutricional das plantas, à ocorrência de patógenos e os relativos à genealogia de cultivares. Esses resultados também não possibilitaram afirmação conclusiva, mas indicaram que a causa do sintoma de quebra de haste, possivelmente, não deve estar ligada a um único fator, mas, talvez, à combinação de fatores inter-relacionados que afetam a fisiologia da planta. Embora não se tenha ainda a explicação sobre o problema de quebra de planta, verificado em áreas de soja sob determinadas situações, esta publicação foi preparada em função da abrangência da área de ocorrência e dos questionamentos levantados, com o objetivo de registrar as ações até agora realizadas e contribuir em diagnósticos futuros de outras instituições de pesquisa e de extensão rural.

Reação à ferrugem da folha de genótipos de trigo indicados para cultivo no Rio Grande do Sul, em Santa Catarina e no Paraná em 2002.

2006

Relatório de gestão 2005-2009.

O objetivo deste relatório é apresentar o trabalho desenvolvido pela equipe da Embrapa Informática Agropecuária, durante a gestão 205-2009, destacando as principais ações realizadas no âmbito da pesquisa científica, que mais contribuíram para colocar em prática a missão da Unidade.

Integracao lavoura-pecuaria: atividades desenvolvidas pela Embrapa Cerrados.

A regiao do Cerrado com 205 milhoes de hectares, em menos de tres decadas, transformou-se na principal area agricola do Brasil. Essa rapida transformacao foi possivel devido a investimentos expressivos do governo em infra-estrutura e programas de desenvolvimento para ocupar esse ecossistema aliados aos avancos tecnologicos em manejo de solo e selecao de cultivares adaptadas as condicoes edafoclimaticas da regiao. O crescimento da agricultura nessa regiao teve influencia positiva na geracao de riquezas e de empregos. No entanto, tem gerado impactos ambientais negativos como: compactacao, erosao e perda de materia organica do solo nos sistemas de cultivos anuais. Ao mesmo tempo, os problemas de degradacao de pastagens agravaram-se, sendo especialmente severos em mais de 50% dos 49 milhoes de hectares implantados na regiao. Para manter os solos do bioma Cerrado produtivos de forma sustentavel, e necessario desenvolver sistemas agricolas que permitam manter ou melhorar as propriedades fisicas, quimicas e biologicas do solo. A rotacao de culturas anuais com pastagens e indicada como uma das alternativas para atingir esse proposito. A sustentabilidade economica e ecologica dos sistemas de producao agropecuaria, no Cerrado, podera beneficiar-se mais da integracao lavoura-pecuaria do que de qualquer outra inovacao. Desde 1991, a Embrapa Cerrados e o Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT) tem trabalhado com outras instituicoes para desenvolver sistemas agropastoris, baseados em leguminosas forrageiras, adaptadas a diferentes niveis de uso de corretivos e fertilizantes, quantificando, no tempo, os impactos na produtividade e nas propriedades fisicas, quimicas e biologicas do solo. Praticas de manejo como: calagem, adubacao, preparo de solo e manejo animal influenciam na contribuicao das culturas e das pastagens na producao dos sistemas integrados lavoura-pecuaria. Para medir esses efeitos, um experimento de longa duracao foi estabelecido num Latossolo Vermelho-Escuro na Embrapa Cerrados, Planaltina (DF). Esse experimento tem por objetivos avaliar o efeito da integracao lavoura pecuaria na produtividade de graos e carne e identificar parametros-chave fisicos, quimicos e biologicos, relacionados a melhoria ou a degradacao do solo. Os tratamentos foram constituidos pela combinacao de sistemas, niveis de fertilidade e preparo do solo. Os sistemas utilizados são os seguintes: pastagem continua de graminea pura; pastagem consorciada continua; rotacao de lavoura/pastagem consorciada; lavoura continua; cerrado nativo. O experimento foi complementado com prototipos localizados em Uberlandia (MG). Esses prototipos foram estabelecidos em 1992 em solos arenosos e argilosos em dois sistemas de producao: pastagens em processo de degradacao e lavouras continuas. Os resultados obtidos nesses trabalhos demonstram que os sistemas agropastoris tem potencial para aumentar a produtividade e reduzir os riscos de degradacao, melhorando as propriedades quimicas, fisicas e biologicas do solo. O impacto positivo desses sistemas e ainda maior quando se incluem as leguminosas.

Novas variedades de milho recomendadas para o Estado do Acre.

O objetivo deste trabalho é oferecer aos agricultores, comerciantes de insumos agropecuários e extensionistas informações sobre as características das novas variedades de milho (BR 473, Saracura e BR 205) recomendadas para o Acre.

Estimativa da erosividade nas bacias hidrográficas dos rios Guapi-Macacu e Caceribu.

As perdas de solos ocasionadas por eventos de chuvas não dependem somente da resistência que o solo oferece ao impacto das gotas, mas também da energia cinética da chuva e da intensidade e duração. A influência desses fatores na capacidade da chuva em causar erosão é estimada através de índices de erosividade, sendo mais utilizados dois índices na literatura: EI30 e KE > 25. O presente trabalho teve como objetivo estimar os índices de erosividade com base nos dados pluviométricos de 19 estações e mostrar as distribuições espaciais dos mesmos nas bacias hidrográficas dos rios Guapi- Macacu e Caceribu. Os resultados mostraram que os dois índices apresentaram padrão similar em termos de valores relativos e de distribuição na área de estudo. Os índices apresentaram maiores valores mensais no período de novembro a março que corresponde ao verão, quando é característico ocorrerem chuvas de maiores intensidades, devido ao aumento da temperatura e das movimentações de massas de ar. Ao contrário, os menores valores foram observados nos meses de junho a agosto, período no qual ocorrem chuvas com menores intensidades.

Una testimonianza silenziosa.Storia della Chiesa cattolica in Tunisia dal Trattato del Bardo alla ‘rivoluzione dei gelsomini’

The work examines the change involving the Church in Tunisia from the period of the Protectorate to the present through the fundamental moments of independence (1956) and the signing of the ‘Modus vivendi’ (1964). In the first structure of the “modern” Church, a fundamental role was played by the complex figure of the French Cardinal Charles-Allemand Lavigerie who, while giving strong impulse to setting up disinterested charitable social initiatives by the congregations (Pères Blancs, Soeurs Blanches and others), also represented the ideal of the ‘evangelizing’ (as well as colonial) Church which, despite its declared will to avoid proselytism, almost inevitably tended to slip into it. During the French Protectorate (1881-1956) the ecclesiastic institution concentrated strongly on itself, with little heed for the sensitivity of its host population, and developed its activities as if it were in a European country. From the social standpoint, the Church was mostly involved in teaching, which followed the French model, and health facilities. In the Church only the Pères Blancs missionaries were sincerely committed to promoting awareness of the local context and dialogue with the Muslims. The Catholic clergy in the country linked its religious activity close to the policy of the Protectorate, in the hope of succeeding in returning to the ancient “greatness of the African Church”, as the Eucharistic Congress in Carthage in 1930 made quite clear. The Congress itself planted the first seed in the twentyfive- year struggle that led the Tunisian population to independence in 1956 and the founding of the Republic in 1957. The conquest of independence and the ‘Modus vivendi’ marked a profound change in the situation and led to an inversion of roles: the Catholic community was given the right to exist only on the condition that it should not interfere in Tunisian society. The political project of Bourguiba, who led the Republic from 1957 to 1987, aimed to create a strongly egalitarian society, with a separation between political and religious powers. In particular, in referring to the Church, he appeared as a secularist with no hostility towards the Catholics who were, however, considered as “cooperators”, welcome so long as they were willing to place their skills at the service of the construction of the state. So, in the catholic Community was a tension between the will of being on the side of the country and that of conserving a certain distance from it and not being an integral part of it. In this process of reflection, the role of the Second Vatican Council was fundamental: it spread the idea of a Church open to the world and the other religions, in particular to Islam: the teaching of the Council led the congregations present in the country to accept the new condition. This new Church that emerged from the Council saw some important events in the process of “living together”, of “cultural mixing” and the search for a common ground between different realities. The almost contemporary arrival of Arab bishops raised awareness among the Tunisians of the existence of Christian Arabs and, at the same time, the Catholic community began considering their faith in a different way. In the last twenty years the situation has continued to change. Side by side with the priests present for decades or even those born there, some new congregations have begun to operate, albeit in small numbers: they have certainly revitalized the community of the faithful, but they sometimes appear more devoted to service “within” the Church, than to services for the population, and are thus characterized by exterior manifestations of their religion. This sort of presence has made it possible for Bourguiba's successor, Ben Ali (president from 1987 to 2011), to practice forms of tolerance even more clearly, but always limited to formal relations; the Tunisians are still far from having a real understanding of the Catholic reality, with certain exceptions connected to relations on a personal and not structured plane, as was the case in the previous period. The arrival of a good number of young people from sub-Saharan Africa, most of all students, belonging to the JCAT, and personnel of the BAD has “Africanized” the Church in Tunisia and has brought about an increase in Christians' exterior manifestations; but this is a visibility that is not blatant but discreet, with the implicit risk of the Church continuing to be perceived as a sort of exterior body, alien to the country; nor can we say, lacking proper documentation, how it will be possible to build a bridge between different cultures through the “accompaniment” of Christian wives of Tunisians. Today, the Church is living in a country that has less and less need of it; its presence, in the schools and in health facilities, is extremely reduced. And also in other sectors of social commitment, such as care for the disabled, the number of clergymen involved is quite small. The ‘revolution’ in 2011 and the later developments up to the present have brought about another socio-political change, characterized by a climate of greater freedom, but with as yet undefinable contours. This change in the political climate will inevitable have consequences in Tunisia’s approach to religious and cultural minorities, but it is far too soon to discuss this on the historical and scientific planes.

The effect of concentration and duration of normobaric oxygen in reducing caspase-3 and -9 expression in a rat-model of focal cerebral ischaemia.

The aim of this study was to determine the effect of different concentrations of normobaric oxygen (NBO) on neurological function and the expression of caspase-3 and -9 in a rat model of acute cerebral ischaemia. Sprague-Dawley rats (n=120) were randomly divided into four groups (n=30 per group), including 3 groups given NBO at concentrations of 33%, 45% or 61% and one control group given air (21% oxygen). After 2 h of ischaemic occlusion, each group was further subdivided into six subgroups (n=5) during reperfusion according to the duration (3, 6, 12, 24, 48 or 72 h) and concentration of NBO (33%, 45% or 61%) or air treatment. The Fluorescence Quantitative polymerase chain reaction (PCR) and immunohistochemistry were used to detect caspase-3 and -9 mRNA and protein relative expression respectively. The Neurologic Impairment Score (NIS) was significantly lower in rats given 61% NBO ≥3 h after reperfusion when compared to the control group (P<0.05, Mann–Whitney U). NBO significantly reduced caspase-3 and -9 mRNA and protein expression when compared to the control group at all NBO concentrations and time points (P<0.05, ANOVA). The expression of caspase-3 and -9 was lower in the group given 61% NBO compared any other group, and this difference was statistically significant when compared to the group given 33% NBO for ≥48 h and the control group (both P<0.05, ANOVA). These findings indicate that NBO may inhibit the apoptotic pathway by reducing caspase-3 and -9 expression, thereby promoting neurological functional recovery after stroke.

Energy-dependent in-situ small-angle x-ray scattering study of nano-ceramics

R Winter, D Le Messurier, CM Martin; Cryst Rev 12 (2006) 3 Sponsorship: EPSRC, CCLRC, Pilkington

Quaternary palaeogeomorphologic evolution of the Wadi Faynan area, Southern Jordan

McLaren, S. Gilbertson, D. Grattan, J. Hunt, C. Duller, G. Barker, G. Quaternary palaeogeomorphologic evolution of the Wadi Faynan area, Southern Jordan. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology. 2004. 205. pp 131-154