AWSum-Combining Classification with Knowledge Aquisition

Many classifiers achieve high levels of accuracy but have limited applicability in real world situations because they do not lead to a greater understanding or insight into the^way features influence the classification. In areas such as health informatics a classifier that clearly identifies the influences on classification can be used to direct research and formulate interventions. This research investigates the practical applications of Automated Weighted Sum, (AWSum), a classifier that provides accuracy comparable to other techniques whilst providing insight into the data. This is achieved by calculating a weight for each feature value that represents its influence on the class value. The merits of this approach in classification and insight are evaluated on a Cystic Fibrosis and Diabetes datasets with positive results.

Monitoreo de invertebrados marinos en estaciones fijas del Callao, 2008-2012

Se presentan resultados de investigaciones sobre reclutamiento, estructura por tallas y abundancia de Stramonita chocolata, Argopecten purpuratus, Cancer setosus (= Romaleon polyodon) y Glycymeris ovata efectuados en los bancos naturales de Callao durante el 2008-2012, así como del experimento de marcación - recaptura de A. purpuratus en la bahía del Callao el 2011-2012. Con los resultados del monitoreo de invertebrados marinos en estaciones fijas del 2008 al 2012 se establecieron patrones temporales y espaciales del reclutamiento y abundancia que tendrían fuerte impacto en la determinación de medidas alternativas de manejo en la regulación pesquera. Con los resultados de marcación – recaptura de A. purpuratus se determinaron parámetros de crecimiento von Bertalanffy: 100 mm para longitud infinita, 0,891 y 0,931 año-1 para k para los años 2011 y 2012 respectivamente, y -0.04 para t0. También se presentan resultados del monitoreo de Octopus mimus en las islas de la región Lima (Ancón- Asia) los cuales muestran por primera vez índices de abundancia, distribución y aspectos biológicos.

Distal and proximal colon cancers differ in terms of molecular, pathological, and clinical features.

BACKGROUND: Differences exist between the proximal and distal colon in terms of developmental origin, exposure to patterning genes, environmental mutagens, and gut flora. Little is known on how these differences may affect mechanisms of tumorigenesis, side-specific therapy response or prognosis. We explored systematic differences in pathway activation and their clinical implications. MATERIALS AND METHODS: Detailed clinicopathological data for 3045 colon carcinoma patients enrolled in the PETACC3 adjuvant chemotherapy trial were available for analysis. A subset of 1404 samples had molecular data, including gene expression and DNA copy number profiles for 589 and 199 samples, respectively. In addition, 413 colon adenocarcinoma from TCGA collection were also analyzed. Tumor side-effect on anti-epidermal growth factor receptor (EGFR) therapy was assessed in a cohort of 325 metastatic patients. Outcome variables considered were relapse-free survival and survival after relapse (SAR). RESULTS: Proximal carcinomas were more often mucinous, microsatellite instable (MSI)-high, mutated in key tumorigenic pathways, expressed a B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase (BRAF)-like and a serrated pathway signature, regardless of histological type. Distal carcinomas were more often chromosome instable and EGFR or human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) amplified, and more frequently overexpressed epiregulin. While risk of relapse was not different per side, SAR was much poorer for proximal than for distal stage III carcinomas in a multivariable model including BRAF mutation status [N = 285; HR 1.95, 95% CI (1.6-2.4), P < 0.001]. Only patients with metastases from a distal carcinoma responded to anti-EGFR therapy, in line with the predictions of our pathway enrichment analysis. CONCLUSIONS: Colorectal carcinoma side is associated with differences in key molecular features, some immediately druggable, with important prognostic effects which are maintained in metastatic lesions. Although within side significant molecular heterogeneity remains, our findings justify stratification of patients by side for retrospective and prospective analyses of drug efficacy and prognosis.

Flota de arrastre de fondo de menor escala en la Región Tumbes

Los problemas críticos de la pesquería de arrastre de menor escala, son las capturas de ejemplares juveniles, alta presencia de descartes, pesca incidental o accesoria y conflictos con los pescadores artesanales que usan redes de enmalle cortineras. En toda la zona de estudio, los índices de captura por unidad de esfuerzo (CPUE) fue 142,4 kg/h y 477,5 kg/lance, bycatch por unidad de esfuerzo (BPUE) fue 27,2 kg/h y 91,1 kg/lance. Los mayores CPUE fueron en la zona sur dentro de las 5 mn con 199,0 kg/h y 617,8 kg/lance. La composición de la captura relativa al peso estuvo dominada por el falso volador (Prionotus stephanophrys, 24,6%) y carajito (Diplectrum conceptione, 21,4%). Las especies incidentales más importantes fueron espejo (Selene peruviana, 9,8%), bereche (Larimus pacificus, 9,3%), cachema (Cynoscion analis, 4,0%), chiri (Peprilus medius, 2,9%), lenguado de boca chica (Etropus ectenes, 2,5%), doncella (Hemanthias peruanus, 2,1%). El descarte fue 19,1% de la captura, los principales recursos fueron merluza (Merluccius gayi peruanus, 39,1%), lengüeta (Symphurus sechurae, 10,9%), morena (Muraena clepsidra, 4,9%), pez hojita (Chloroscombrus orqueta, 4,8%), otras especies 31,5% (incluyendo restos de peces y equinodermos). El índice de impacto al ecosistema marino fue de 3,7 (1: no favorable al 10: favorable). Por lo que es un arte de pesca no amigable con el ecosistema marino que no debe usarse dentro del área costera

High altitude journeys and flights are associated with an increased risk of flares in inflammatory bowel disease patients.

BACKGROUND AND AIMS: Hypoxia can induce inflammation in the gastrointestinal tract. However, the impact of hypoxia on the course of inflammatory bowel disease (IBD) is poorly understood. We aimed to evaluate whether flights and/or journeys to regions lying at an altitude of >2000 m above the sea level are associated with flare-ups within 4 weeks of the trip. METHODS: IBD patients with at least one flare-up during a 12-month observation period were compared to a group of patients in remission. Both groups completed a questionnaire. RESULTS: A total of 103 IBD patients were included (43 with Crohn's disease (CD): mean age 39.3 ± 14.6 years; 60 with ulcerative colitis (UC): mean age 40.4 ± 15.1 years). Fifty-two patients with flare-ups were matched to 51 patients in remission. IBD patients experiencing flare-ups had more frequently undertaken flights and/or journeys to regions >2000 m above sea level within four weeks of the flare-up when compared to patients in remission (21/52 [40.4%] vs. 8/51 [15.7%], p=0.005). CONCLUSIONS: Journeys to high altitude regions and/or flights are a risk factor for IBD flare-ups occurring within 4 weeks of travel.

L'année 2012 de la perspective de l'interniste hospitalier [What is new in 2012 for the specialist in hospital internal medicine?].

The knowledge in internal medicine is constantly and so rapidly evolving that practices have to be updated and adjusted to recent scientific rules, in order to improve quality and efficiency in the day to day activities. Residents in the Service of internal medicine of the Lausanne University present several relevant papers published in 2012, whose results are susceptible to change the daily hospital practices. From modest impacts to real revolution, a variety of subjects are discussed in the perspective of evidence based medicine.

Pièces relatives à l'histoire de la MAISON D'AUVERGNE (XIIe-XVIIe siècle). II Notes et copies de pièces parmi lesquelles on remarque les suivantes :

Contient : Hommage de Béraud, dauphin d'Auvergne, et de Bertrand de La Tour à l'abbé de Cluny (1376-1394), feuillets d'un registre sur papier de la fin du XIVe siècle ; Mémoire donné au roi, le 15 novembre 1694, sur l'illustration de la famille de Bouillon ; Extraits d'une ancienne généalogie des comtes de Boulogne ; Extrait de la chronique généalogique des seigneurs de Chauvigny ; « Extrait du calendrier des tesmoins vieux et valétudinaires produits par M. le duc de Berry... contre Morinot de Tourzel, seigneur d'Alegre, au mois juillet 1414 » ; Extrait des titres de Turenne ; « Extrait des comptes d'Oliergues, commençant en 1329. » ; Listes de titres communiqués à de Bar par Baluze ; Extraits des titres à l'abbaye du Bouchet (1192-1505) ; Extraits des titres et des obituaires de Brioude ; Lettre de M. d'Anfreville (6 sept. 1708) ; Armoiries diverses envoyées à Baluze et (f. 92) lettre de M. Mantaigue, de Vic-le-Comte (9 octobre 1703) ; Lettre de David, prieur de l'abbaye du Bouchet, s. d ; Copie de lettres de [Gui] Allard relatives à la maison de La Tour du Pin (1698) et de la réponse de Baluze ; Lettre de [Gui] Allard (Grenoble, 10 février 1698) ; Lettre de M. Estienne (14 octobre 1701) ; Comptes de gravures d'armoiries par l'histoire de la maison d'Auvergne

Extraits divers.

Contient : Extraits de chartes et de manuscrits, parmi lesquels on remarque les suivants : ; Chartes de Saint-Crépin de Soissons (VIIIe-IXe siècle) ; Charte de Philippe-Auguste pour l'abbaye de Sarlat, 1181 (Delisle, Actes de Philippe-Auguste, n° 19) ; Lettres de Philippe-Auguste aux nobles de Poitou, pour les mander à l'expédition d'Angleterre, d'après un ms. de l'abbaye du Jard ; Lettres relatives aux affaires d'Avignon (1470-1472) ; Notice de la fondation da l'église de Nogaro, en 1061-1062 (Bréquigny, Table chronologique, t. II, p. 83) ; Acte d'émancipation de Raoul, fils de Raoul de Cournand (1245), d'après un vidimus de 1259 ; Visio Wettini, d'après un ms. de Cl. Dupuy collationné avec un ms. de Besly ; Notes concernant sainte Wilgeforte ; Lettre de M. Boileau, doyen de Sens [à Baluze] (21 juin 1684) ; Extraits de mss. liturgiques du chapitre de Sens ; Lettre de Raban Maur au chorévêque Regimbaldus ; collation d'un ms. d'Ant. Faure ; Extraits des « Constitutiones episcopatus Sutrini », ms. appartenant au cardinal Casanata ; Extrait d'un ms. d'Orléans (aujourd'hui Bibl. nat., nouv. acq. lat. 1632 ; cf. (Delisle, Cat. des fonds Libri et Barrois, p. 111) ; Extraits d'un sacramentaire de l'église de Lyon, faits par Baluze en novembre 1673 ; Extraits d'un pontifical de l'église de Reims ; Extraits d'un pontifical de l'église de Reims, de la main d'Adrien de Valois ; Autres extraits d'un pontifical de Sens ; Formules de serments « ex veteri codice Remensi Nicolai Fabri. » ; Extraits d'un pontifical de l'église de Reims ; Extraits d'un ms. de Saint-Gall (sans doute ms. 446), collationnés par Baluze en 1674 ; Ordo romanus, extraits faits d'après deux mss. de Saint-Gall ; Ordo romanus, extraits faits d'après un ms. de Cahors ; « Benedictiones, » tirées d'un ms. de Saint-Hilaire-en-Carcassès ; Extraits du De confessione verae fidei [Liber precum], de Marcellinus et Faustinus, faits par Baluze en décembre 1673, d'après un ms. de Saint-Gall (ms. 190) ; « Ex homiliis incerti auctoris qui aevo Karoli M. floruit, » d'après un ms. de Saint-Gall ; Homélies tirées d'un ms. de l'église de Lyon ; Poenitentia laicorum, de Fulbert de Chartres (Migne, Patr. lat., t. CXLI, col. 339) ; Extraits d'un pénitentiel, d'après un ms. de Saint-Arnoul de Metz ; Extraits d'un ms. de l'Oratoire de Troyes, contenant un recueil de canons ; Extraits des Decrétales du Pseudo-Isidore, d'après un ms. de Saint-Gall (ms. 670) ; Copie de deux martyrologes, envoyée par Baluze à d'Achery (cf. note au f. 185) ; le second (f. 210), tiré d'un ms. de Saint-Gall (sans doute le ms. 914), de la main de Baluze, en juin 1674 ; Extraits du De miseria humanae conditionis, d'Innocent III ; Dédicace, par Calixte II, de l'église du Ronceray d'Angers (Hist. de France, t. XIV, p. 199) ; Lettre de Charlemagne relative aux travaux de Paul Diacre (Migne, Patr. lat., t. XCV, col. 1159) ; Bulles et actes pontificaux divers : ; Bulles d'Eugène III (24 avril 1146) et d'Anastase IV (25 avril 1154) pour les églises de la province de Bordeaux (Jaffé, Regesta, nos 8910 et 9876) ; Bulle de Benoit XI portant révocation des collations de bénéfices faites par Boniface VIII (6 novembre 1303) ; Bulle d'Innocent VI pour la prédication d'une croisade contre les Grandes Compagnies (1361), d'après un ms. de Saint-Victor ; Bulle de Clément VII pour le monastère de Coiroux (6 juillet 1393) ; Lettres de Julien [de la Rovere], cardinalévêque d'Ostie, pour Antoine Galvan, seigneur de « Chausenejoulx » (15 février 1486) ; Bulle de Pie V pour Hugues de Vermondot, abbé de La Valette (23 avril 1571) ; Signature en cour de Rome pour Jean du Peyron, sacristain du monastère d'Obazine (17 février 1587) ; Bulle de Clément VIII pour Pierre Pandinhe, abbé de Bonneval (4 janvier 1596) ; Bulle du même pour Léger, abbé de Dalon (12 juin 1600) ; Bulles du même pour Jean de Montroux, abbé de Bonaigue (1601) ; Bulle d'Alexandre III pour l'église de Toulouse, 8 juillet 1162 [Jaffé, n° 10739) ; Bref de N. S. P. le pape Alexandre VII, envoyé à M. l'abbé comte de Richelieu, au sujet de son voyage d'Allemagne (23 mars 1664) ; imprimé de 4 pages in-fol ; Lettres de Philippe le Bel portant convocation d'Etats à Tours (25 mars 1307) ; Lettre de Dom Claude Estiennot à Baluze (Rome, 1er mai 1696) ; Lettre de l'empereur Léopold Ier à Charles II, roi d'Espagne (Vienne, 20 janvier 1696) ; Lettres de l'inquisiteur général de Portugal, portant condamnation des Acta sanctorum des Bollandistes (24 janvier 1696) ; Lettres des inquisiteurs d'Aragon portant même condamnation (19 novembre 1695) ; Extraits de la vie de saint Géraud d'Aurillac ; Instructions données à ceux qui visitent des églises ; Extraits d'un évengéliaire donné par la comtesse. Mathilde à l'abbaye de Padolirone ; Extrait du récit de la translation des reliques de saint Thomas d'Aquin à Toulouse, en 1368, par Raimond Hugues (Bibl. hag. lat. n° 8161), d'après un ms. des Dominicains de Toulouse ; Extraits d'un recueil de formules appartenant à Fr. Pithou (cf. Zeumer, Formulae, p. 597) ; Note sur la fuite d'Ant. Muret à Toulouse, en 1554 ; Sommaire des thèses d'Et. Baluze pour le grade de bachelier en droit canon (3 septembre 1665) ; « Harangue de M. Talon, avocat général, au lit de justice du Roy, tenu au Parlement de Paris, le mecredi XVe janvier 1648. » ; Notes sur l'histoire d'Espagne, envoyées à Baluze ; Lettres (1380-1383), relatives à Simon de Cramaud, plus tard évêque de Carcassonne ; Mémoire sur les affaires d'Italie (26 mars 1669), en italien ; Eloge de Louis XIV : paraphrase, en vers latins, du Psaume CXLIII ; Eloge de Colbert, par M. Boyer ; original ; Lettres de Pierre de Saint-Martial, archevêque de Toulouse, pour l'Hôpital Saint-Jacques de ladite ville (1391) ; Extraits d'un bréviaire ms. de Limoges ; Extraits des registres du Parlement de Toulouse ; Notes pour l'établissement du texte des lettres de Pierre de Blois ; Note sur les affaires de Roussillon ; Instructions données par Henri d'Orléans, [marquis de Rothelin], à ses fils ; « Sirventes de Arnaud Maziere, 1283 », et pièces relatives à Frothaire, archevêque de Bourges ; Notes extraites des archives de Carcassonne, envoyées à Baluze par Guillaume Besse ; Anagramme sur le nom de famille [Ruspiliosus] du pape Clément IX ; placard gravé de 1668

L'empire de Soulouque / par Paul d'Hormoys

Collection : Bibliothèque pour tous

Dispersão de Latossolos em resposta à utilização de pré-tratamentos na análise textural

O resultado mais acurado da análise textural depende da completa dispersão da amostra de solo e da manutenção da estabilidade da fase dispersa. Alguns Latossolos podem apresentar problemas de dispersão, graças à presença de microagregados de alta estabilidade. Esses grupamentos, muito argilosos, são parcialmente desagregados pela dispersão química e mecânica, contribuindo, pelo seu tamanho, para superestimar, fundamentalmente, a proporção de silte do solo analisado. Assim, visando minimizar a proporção de pseudocomponentes na análise textural dos Latossolos, realizou-se um experimento de laboratório, para verificar a efetividade da dispersão em resposta à utilização de pré-tratamentos na remoção de agentes cimentantes. Os tratamentos corresponderam a um arranjo fatorial 7 x 2². Os fatores em estudo foram amostras de sete Latossolos dispersos com NaOH 0,01 mol L-1, com presença ou ausência de pré-tratamentos para remoção da matéria orgânica e dos óxidos de ferro e alumínio mal cristalizados. A fração silte foi novamente dispersa, determinando-se a proporção de argila e silte após a segunda dispersão. A remoção de matéria orgânica e a de óxidos de ferro e alumínio mal cristalizados provocaram incremento na proporção de argila, indicando a dispersão de microagregados com tamanhos correspondentes aos de outras frações texturais, em particular da fração silte. A presença do pseudo-silte foi confirmada em todos os solos estudados, sobretudo nos solos mais oxídicos. As frações areia fina e areia grossa também apresentaram microagregados de argilas. Após a segunda dispersão, a fração silte apresentou valores que variaram de 0,199 a 0,537 kg kg-1 de argila. Para reduzir a proporção de pseudo-silte, há necessidade de realizar pré-tratamentos. Como a resposta aos pré-tratamento testados não foi cumulativa, sugere-se utilizar o pré-tratamento para remover óxidos de ferro e alumínio mal cristalizados.

CD4(+) T cell count decreases by ethnicity among untreated patients with HIV infection in South Africa and Switzerland.

BACKGROUND: Estimates of the decrease in CD4(+) cell counts in untreated patients with human immunodeficiency virus (HIV) infection are important for patient care and public health. We analyzed CD4(+) cell count decreases in the Cape Town AIDS Cohort and the Swiss HIV Cohort Study. METHODS: We used mixed-effects models and joint models that allowed for the correlation between CD4(+) cell count decreases and survival and stratified analyses by the initial cell count (50-199, 200-349, 350-499, and 500-750 cells/microL). Results are presented as the mean decrease in CD4(+) cell count with 95% confidence intervals (CIs) during the first year after the initial CD4(+) cell count. RESULTS: A total of 784 South African (629 nonwhite) and 2030 Swiss (218 nonwhite) patients with HIV infection contributed 13,388 CD4(+) cell counts. Decreases in CD4(+) cell count were steeper in white patients, patients with higher initial CD4(+) cell counts, and older patients. Decreases ranged from a mean of 38 cells/microL (95% CI, 24-54 cells/microL) in nonwhite patients from the Swiss HIV Cohort Study 15-39 years of age with an initial CD4(+) cell count of 200-349 cells/microL to a mean of 210 cells/microL (95% CI, 143-268 cells/microL) in white patients in the Cape Town AIDS Cohort > or =40 years of age with an initial CD4(+) cell count of 500-750 cells/microL. CONCLUSIONS: Among both patients from Switzerland and patients from South Africa, CD4(+) cell count decreases were greater in white patients with HIV infection than they were in nonwhite patients with HIV infection.