Expression, purification and molecular analysis of the human ZNF706 protein

Background: The ZNF706 gene encodes a protein that belongs to the zinc finger family of proteins and was found to be highly expressed in laryngeal cancer, making the structure and function of ZNF706 worthy of investigation. In this study, we expressed and purified recombinant human ZNF706 that was suitable for structural analysis in Escherichia coli BL21(DH3). Findings. ZNF706 mRNA was extracted from a larynx tissue sample, and cDNA was ligated into a cloning vector using the TOPO method. ZNF706 protein was expressed according to the E. coli expression system procedures and was purified using a nickel-affinity column. The structural qualities of recombinant ZNF706 and quantification alpha, beta sheet, and other structures were obtained by spectroscopy of circular dichroism. ZNF706's structural modeling showed that it is composed of α-helices (28.3%), β-strands (19.4%), and turns (20.9%), in agreement with the spectral data from the dichroism analysis. Conclusions: We used circular dichroism and molecular modeling to examine the structure of ZNF706. The results suggest that human recombinant ZNF706 keeps its secondary structures and is appropriate for functional and structural studies. The method of expressing ZNF706 protein used in this study can be used to direct various functional and structural studies that will contribute to the understanding of its function as well as its relationship with other biological molecules and its putative role in carcinogenesis. © 2013 Colombo et al.; licensee BioMed Central Ltd.

Variação sexual, ontogenética e ambiental do veneno de Bothrops jararaca da icro-região de Botucatu-SP: caracterização enzimática, bioquímica e farmacológica

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Análise da expressão e silenciamento de genes do trato digestivo de Anopheles aquasalis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Caracterização estrutural e das interações entre a Proteína G do hRSV e potenciais inibidores

Pós-graduação em Microbiologia - IBILCE

Caracterização do soro de leite de búfala: identificação das proteínas e produção de hidrolisados com médio e alto grau de hidrólise

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Glândulas mandibulares de operárias de formigas Atta sexdens rubropilosa (Forel, 1908): morfologia e expressão gênica (Hymenoptera: Formicidae)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Proteínas do soro de queijo: hidrólise e formulação de suplemento alimentar para ratos Wistar

Pós-graduação em Alimentos e Nutrição - FCFAR

Determination and fractionation of barium in Brazil nuts

Diversas estratégias para preparo de amostra, determinação e fracionamento, tais como espectrometria de absorção atômica com atomização eletrotérmica em forno de grafite (GF AAS) e espectrometria de emissão óptica com plasma acoplado indutivamente com configuração axial (ICP OES), foram empregadas para o fracionamento de bário em Castanha-do-Pará. Esse alimento é amplamente apreciado tanto pelo valor nutricional, quanto pelo sabor agradável. A análise química de Castanha-do-Pará não é trivial devido à matriz complexa. O fracionamento de bário em Castanha-do-Pará foi estudado devido à toxicidade desse elemento e a correlação entre a forma química e a absorção. Os teores totais de bário nas amostras de Castanha-do-Pará variaram entre 860 e 2084 mg kg^-1. Extrações sequenciais foram feitas com base na solubilidade em diferentes meios e composição química envolvendo lipídios, proteínas e compostos de baixa massa molecular (LMW). Teores mais elevados de bário foram determinados nas frações LMW e insolúvel em água que variaram entre 778-1606 e 551-1520 mg kg^-1, respectivamente. Esses resultados indicaram a indisponibilidade de bário presente nesse alimento ao organismo humano. Baseando-se nos teores de bário e enxofre nas diferentes frações e em cálculos estequiométricos para as possíveis reações envolvidas pode-se inferir que bário se encontra principalmente na forma de BaSO₄. Experimentos termogravimétricos também confirmaram essa suposição.

Unravelling the Neospora caninum secretome through the secreted fraction (ESA) and quantification of the discharged tachyzoite using high-resolution mass spectrometry-based proteomics

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

The Identification and Biochemical Properties of the Catalytic Specificity of a Serine Peptidase Secreted by Aspergillus fumigatus Fresenius

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Structure and post-translational modifications of the web silk protein spidroin-1 from Nephila spiders

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Treadmill Training Increases SIRT-1 and PGC-1 alpha Protein Levels and AMPK Phosphorylation in Quadriceps of Middle-Aged Rats in an Intensity-Dependent Manner

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Análise microbiológica e imunologica do fluido gengival e proteoma salivar de individuos com Sindrome de Down com doença periodontal

Pós-graduação em Odontologia - FOAR

A structure-based proposal for a comprehensive myotoxic mechanism of phospholipase A(2)-like proteins from viperid snake venoms

Envenomation via snakebites is an important public health problem in many tropical and subtropical countries that, in addition to mortality, can result in permanent sequelae as a consequence of local tissue damage, which represents a major challenge to antivenom therapy. Venom phospholipases A(2) (PLA(2)s) and PLA(2)-like proteins play a leading role in the complex pathogenesis of skeletal muscle necrosis, nevertheless their precise mechanism of action is only partially understood. Recently, detailed structural information has been obtained for more than twenty different members of the PLA(2)-like myotoxin subfamily. In this review, we integrate the available structural, biochemical and functional data on these toxins and present a comprehensive hypothesis for their myotoxic mechanism. This process involves an allosteric transition and the participation of two independent interaction sites for docking and disruption of the target membrane, respectively, leading to a five-step mechanism of action. Furthermore, recent functional and structural studies of these toxins complexed with ligands reveal diverse neutralization mechanisms that can be classified into at least three different groups. Therefore, the data summarized here for the PLA(2)-like myotoxins could provide a useful molecular basis for the search for novel neutralizing strategies to improve the treatment of envenomation by viperid snakes. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

RPA-1 from Leishmania amazonensis (LaRPA-1) structurally differs from other eukaryote RPA-1 and interacts with telomeric DNA via its N-terminal OB-fold domain

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)