Understanding next generation sequencing in oncology: A guide for oncologists

DNA sequencing is now faster and cheaper than ever before, due to the development of next generation sequencing (NGS) technologies. NGS is now widely used in the research setting and is becoming increasingly utilised in clinical practice. However, due to evolving clinical commitments, increased workload and lack of training opportunities, many oncologists may be unfamiliar with the terminology and technology involved. This can lead to oncologists feeling daunted by issues such as how to interpret the vast amounts of data generated by NGS and the differences between sequencing platforms. This review article explains common concepts and terminology, summarises the process of DNA sequencing (including data analysis) and discusses the main factors to consider when deciding on a sequencing method. This article aims to improve oncologists' understanding of the most commonly used sequencing platforms and the ongoing challenges faced in expanding the use of NGS into routine clinical practice.

Application of Volterra Equations to Solve Unit Commitment Problem of Optimised Energy Storage and Generation

Development of reliable methods for optimised energy storage and generation is one of the most imminent challenges in modern power systems. In this paper an adaptive approach to load leveling problem using novel dynamic models based on the Volterra integral equations of the first kind with piecewise continuous kernels. These integral equations efficiently solve such inverse problem taking into account both the time dependent efficiencies and the availability of generation/storage of each energy storage technology. In this analysis a direct numerical method is employed to find the least-cost dispatch of available storages. The proposed collocation type numerical method has second order accuracy and enjoys self-regularization properties, which is associated with confidence levels of system demand. This adaptive approach is suitable for energy storage optimisation in real time. The efficiency of the proposed methodology is demonstrated on the Single Electricity Market of Republic of Ireland and Northern Ireland.

Experimental Study on Key Generation for Physical Layer Security in Wireless Communications

This paper presents a thorough experimental study on key generation principles, i.e. temporal variation, channel reciprocity, and spatial decorrelation, via a testbed constructed by using wireless open-access research platform (WARP). It is the first comprehensive study through (i) carrying out a number of experiments in different multipath environments, including an anechoic chamber, a reverberation chamber and an indoor office environment, which represents little, rich, and moderate multipath, respectively; (ii) considering static, object moving, and mobile scenarios in these environments, which represents different levels of channel dynamicity; (iii) studying two most popular channel parameters, i.e., channel state information and received signal strength. Through results collected from over a hundred tests, this paper offers insights to the design of a secure and efficient key generation system. We show that multipath is essential and beneficial for key generation as it increases the channel randomness. We also find that the movement of users/objects can help introduce temporal variation/randomness and help users reach an agreement on the keys. This paper complements existing research by experiments constructed by a new hardware platform.

Constant wall heat flux boundary conditions in micro-channels filled with porous material with internal heat generation under local thermal non-equilibrium conditions

Forced convection heat transfer in a micro-channel filled with a porous material saturated with rarefied gas with internal heat generation is studied analytically in this work. The study is performed by analysing the boundary conditions for constant wall heat flux under local thermal non-equilibrium (LTNE) conditions. Invoking the velocity slip and temperature jump, the thermal behaviour of the porous-fluid system is studied by considering thermally and hydrodynamically fully-developed conditions. The flow inside the porous material is modelled by the Darcy–Brinkman equation. Exact solutions are obtained for both the fluid and solid temperature distributions for two primary approaches models A and B using constant wall heat flux boundary conditions. The temperature distributions and Nusselt numbers for models A and B are compared, and the limiting cases resulting in the convergence or divergence of the two models are also discussed. The effects of pertinent parameters such as fluid to solid effective thermal conductivity ratio, Biot number, Darcy number, velocity slip and temperature jump coefficients, and fluid and solid internal heat generations are also discussed. The results indicate that the Nusselt number decreases with the increase of thermal conductivity ratio for both models. This contrasts results from previous studies which for model A reported that the Nusselt number increases with the increase of thermal conductivity ratio. The Biot number and thermal conductivity ratio are found to have substantial effects on the role of temperature jump coefficient in controlling the Nusselt number for models A and B. The Nusselt numbers calculated using model A change drastically with the variation of solid internal heat generation. In contrast, the Nusselt numbers obtained for model B show a weak dependency on the variation of internal heat generation. The velocity slip coefficient has no noticeable effect on the Nusselt numbers for both models. The difference between the Nusselt numbers calculated using the two models decreases with an increase of the temperature jump coefficient.

Impactos sociales y económicos de la hidroeléctrica en Ituango

La hidroeléctrica Ituango es el proyecto de generación de energía más grande de Colombia y que tiene una importancia enorme para los pueblos que están ubicados en el área de influencia de esta obra. Ituango es un municipio ubicado en el norte lejano del departamento de Antioquia, que posee unas características especiales y que ha cambiado considerablemente su forma de vivir por la llegada del proyecto hidroeléctrico, considerando la magnitud de la obra, la llegada de más personas a la zona y el cambio socioeconómico que surge a raíz de esta situación.

Caracterización de residuos de banano (pseudotallo y hojas) mediante análisis termogravimétrico para uso potencial como biocombustible sólido

Una alternativa para la producción de biocombustibles consiste en la transformación de residuos lignocelulósicos, entre los que se encuentran biomasas maderables y no maderables. Colombia al ser un país rico en recursos agrícolas genera grandes cantidades de residuos provenientes de monocultivos como es el café, la caña de azúcar, el banano entre otros. Los residuos de banano se producen en zonas en donde el acceso a la energía es escaso y el tratamiento actual dado a estos residuos se centra en los biológicos buscando un producto que ayude a disminuir la aplicación de fertilizantes a la tierra. Con este proyecto se busca estudiar el potencial aprovechamiento de estos residuos para su implementación como biocombustible para la combustión y obtener energía a partir de los mismos. En este trabajo se realizó una caracterización de los residuos de la planta del banano (pseudotallo y hoja) mediante análisis termogravimétrico con una termobalanza TA Instrument TGA Q500IF, con el fin de definir el contenido de los tres componentes principales (hemicelulosa, celulosa y lignina). Los experimentos fueron realizados bajo condiciones de pirólisis y por medio de un algoritmo implementado con la herramienta Scilab. Además, el objetivo fue desarrollar una herramienta para determinar los contenidos de cenizas, contenido de humedad, contenido de residuo carbonoso y contenidos de hemicelulosa, celulosa y lignina para un reactor de combustión desde un análisis termogravimétrico. Los valores encontrados permiten concluir que tanto el pseudotallo como la hoja de la planta de banano son residuos potenciales de aprovechamiento en el proceso de combustión con fines de generación de energía.

Planificación económica y control democrático del mercado

El cuestionamiento de las relaciones capitalistas de producción debe surgir a partir de su tendencia inherente a los desequilibrios y a la irracionalidad económica y no desde algún pre-juicio ideológico o político. En este contexto, la planificación económica se presenta como necesaria en la medida en que se requiera asegurar una autonomía humana de decisión con respecto a la distribución del ingreso, el acceso al empleo y la protección del medio ambiente. A partir de la constatación de este hecho, la planificación no sustituye a las relaciones mercantiles sino que cumple la función de garantizar una tendencia al equilibrio sobre la base de las relaciones mercantiles, lo que ningún automatismo del mercado puede garantizar. Se propone un principio de delimitación entre la planificación y la autonomía de las empresas (la reproducción de la vida humana), principio ampliable a la delimitación entre el Estado y las actividades de los grupos autónomos y de los mismos sujetos en general. Abstract The questioning of the capitalist relations of production must come from their inherent tendency to irrationality and economic imbalances and not from any ideological or political prejudice. In this context, economic planning is as necessary as it is required to ensure a human decision-making autonomy with respect to income distribution, access to employment and environmental protection. From the observation of this fact, planning is not a substitute for market relations but serves to ensure a tendency to balance on the basis of market relations, so no automatic of the market can guarantee. The article proposes a principle of demarcation between the planning and autonomy for enterprises (the reproduction of human life), expandable to top the demarcation between the state and the activities of autonomous groups and the same subjects in general.

Estudio numérico y experimental de fenómenos hidrodinámicos que ocurren en bombas centrífugas como turbinas

La tendencia mundial de administrar y operar a distancia las centrales hidroeléctricas está obligando a los expertos a replantear los estrategias de monitoreo y diagnóstico de sus máquinas -- Esto ha conducido también, a reducir el personal experto que reside in-situ y que se encarga de operar y mantener los sistemas técnicos, y además de atender cualquier eventualidad que pueda ocurrir -- Por eso, desde hace ya varios años se han venido desarrollando sistemas expertos que puedan suplir las deficiencias del recurso humano -- Pero aunque tales sistemas han alcanzado niveles interesantes de independencia, aún requieren del acompañamiento de un experto que pueda interpretar las evidencias, emitir un diagnóstico y tomar una decisión -- Un ejemplo de los aspectos que aún se deben perfeccionar, es el se las falsas alarmas que llegan a producir el efecto “cry wolf” y que terminan por inactivar el sistema -- Otra forma de enfrentar esta nueva dinámica de operación es la de subcontratar el servicio de diagnóstico técnico, que puede dar resultados aceptables, pero no siempre en el caso de centrales hidroeléctricas -- Las centrales por lo general se encuentran en sitios remotos y en ocasiones blindadas por condiciones geográficas y climatológicas por lo que no es posible reaccionar rápidamente para atender una eventualidad cuando el experto y sus instrumentos no están cerca -- Una solución que resulta conveniente es de hecho, la centralización de la experticia para los servicios de monitoreo y diagnóstico técnico, soportados por una plataforma portátil e idealmente no-invasiva, que permanezca siempre junto a las máquinas y que pueda ser consultada on-line -- De este modo una cantidad reducida de expertos tendrán acceso permanente a las variables o síntomas que definen el estado técnico de la maquinaria; ellos se encargarán de analizar las señales sintomáticas, evaluar los resultados, emitir juicios y elaborar reportes ejecutivos que finalmente llegarán a manos del administrador o persona encargada de la operación -- Esta alternativa aliviará molestias relacionadas con los procesos de monitoreo y diagnóstico: instrumentación/sensórica, cableado, acondicionamiento de señales, adquisición digital de datos, procesamiento de señales, administración y gestión de equipos, reporte de resultados, recomendaciones, etc. -- Este proyecto propone en dos etapas, el diseño de una plataforma tecnológica que pueda soportar la alternativa mencionada -- En detalle, el diseño de un sistema integrado de adquisición de datos que además de ser portátil, modular y escalable, adecuado para monitoreo de las principales variables de diagnóstico de una central hidroeléctrica; que aunque no incorpore un sistema experto, si ofrece las herramientas de análisis, diagnóstico y toma de decisiones del estado del arte

Factores que afectan la capacidad en WCDMA y su influencia en la planificación de sistemas de tercera generación

In this paper we use a model that we have developed for CDMA capacity analysis to see how different conditions like propagation model, number of cells and overlapping affect the estimation of CDMA capacity. We will show that the overlapping is not a direct parameter that affect capacity, and there are other factors to consider.

Análisis de capacidad en sistemas CDMA y WCDMA, usando herramientas de planificación basadas en GIS y dinámica poliédrica

En este momento están entrando en operación los primeros sistemas UMTS en Europa, y están operando en varios países del mundo sistemas CDMA-2000 1xRTT, y aunque existen muchos trabajos publicados sobre la capacidad de estos sistemas, prácticamente todo lo existente se basa en el comportamiento de sistemas ideales que consideran celdas hexagonales o circulares y propagación basada en exponente inverso de la distancia y poco es lo que hay sobre el comportamiento real de dichos sistemas en entornos reales.

Sobre el exponente de pérdidas de propagación, es bien conocido que este afecta la capacidad de los sistemas CDMA; sin embargo hasta ahora no se ha considerado el efecto de los modelos de propagación que tienen en cuenta la difracción y otros fenómenos más cercanos a la realidad, y por lo tanto no se ha considerado el efecto del entorno urbano y el terreno sobre la capacidad real de los sistemas basados en CDMA.

Theorizing masculinities for a new generation

Foregrounding research among 16-21 year-old heterosexual male youth, this article provides an overview of the changing nature of masculinities in Anglo-American cultures. I suggest that cultural homophobia is rapidly decreasing among young men in these cultures, and that this has a profound impact on their gendered performances. I suggest that hegemonic masculinity theory is incapable of explaining these changes. Thus I introduce inclusive masculinity theory—and its principal heuristic concept, homohysteria—to make sense of the changing nature of young men’s masculinities.

Orientacje zawodowe młodzieży akademickiej będącej w okresie tranzycji z edukacji na rynek pracy

The modern world, which is characterized by diversity, uncertainty and ambiguity, affects the functioning of the younger generation. Young people experience a variety of problems associated with entering into adulthood. Being on the stage “between” youth and adulthood requires countless choices. The functioning of youth is still an interesting cognitive topic, worthy of scientific knowledge, therefore, the article seeks to answer the question: What is the professional orientation of contemporary university students? The article thesis consists of two parts. The first part has a theoretical character. It deals with issues of professional orientation. The second part of the article is an empirical analysis and attempt to answer the research question: What are the professional orientations of students?

LA REINVENCIÓN DE LA PRODUCCIÓN EDITORIAL EN LA ERA DIGITAL; DENTRO DEL PROCESO DE GENERACIÓN Y TRANSFERENCIA DEL CONOCIMIENTO

Analiza la producción editorial a la luz de los cambios propuestos por los avances de la tecnología de los sistemas de información y comunicación. Señala impactos de internet en la producción y difusión de contenidos en ambientes y organizaciones de enseñanza e investigación. Enfatiza la responsabilidad compartida de la bibliotecología y ciencias de la información con la industria editorial, en el proceso de transferencia de información y la creación de conocimiento.

La actividad laboral de las familias africanas y latinoamericanas reagrupadas en la España mediterránea

La investigación se basa en los resultados de una encuesta realizada en 2009-2010, por el equipo investigador, a 348 inmigrados reagrupantes africanos y a 457 latinoamericanos que residen en las provincias litorales entre Girona y Almería. La información que se ofrece está referida a los aspectos laborales de estos dos colectivos continentales, tanto a escala del conjunto territorial indicado como para tres subáreas incluidas en él: Cataluña litoral, Comunidad Valenciana y Murcia-Almería; según los temas, se trata por separado a los reagrupantes y a los subgrupos familiares que conviven en España (reagrupantes, cónyuges, hijos). El estudio se centra en las estructuras de empleo por sectores económicos. También se estudian las redes migratorias, tan decisivas en la orientación de estos flujos hacia España, la regulación laboral de estos trabajadores, la repercusión de la crisis actual en los empleos de las familias reagrupadas (paro, número de ocupados por familia e ingresos), la satisfacción laboral de los miembros de las familias (horas de trabajo, problemas laborales y salariales) y la estabilidad laboral (antigüedad en el empleo, cursos de formación profesional, trabajo actual y expectativas del inmigrante). El recorrido por los temas laborales indicados, vinculados a los distintos grupos continentales y familiares y a las diferentes escalas territoriales, concluyen en mostrar situaciones económicas y sociales muy diferentes entre africanos y latinoamericanos, y entre los que residen en Cataluña litoral y en Murcia-Almería, en lo que intervienen, entre otras causas, los distintos «capitales» personales aportados por los dos colectivos continentales para acceder al empleo (formación, idioma, …) y las diferentes estructuras económicas de los territorios estudiados. Los africanos y los que residen en las provincias meridionales son los que presentan peores situaciones socioeconómicas.