Prevalência e fatores relacionados à infecção por HPV em mulheres assistidas pela Estratégia Saúde da Família em Juiz de Fora, Minas Gerais.

O câncer do colo do útero ocasiona 7% dos óbitos por câncer na população feminina brasileira, com taxa de incidência estimada em 15,33/100 mil, sendo a infecção pelo papilomavírus humano (HPV) causa necessária. O rastreamento com citologia do esfregaço cervical convencional é ação escolhida no Brasil e em outros países para prevenir e controlar o câncer, através da detecção precoce das lesões pré-neoplásicas. Porém, apresenta falhas na cobertura, com desigualdade de acesso, e na qualidade, devido aos problemas nas etapas operacionais, desde a coleta na unidade até a interpretação dos resultados. O rastreamento é oportunístico, e uma alternativa organizada pode ser a utilização de cadastros populacionais, como os disponíveis pela Estratégia Saúde da Família (ESF). A efetividade do rastreamento pode ser aumentada com a incorporação de novas técnicas, destacando-se aquelas de biologia molecular, que testam o HPV nas mulheres, em acréscimo ao rastreamento com citologia ou a substituindo integralmente. O conhecimento acerca dos fatores relacionados à infecção vem sendo ampliado para compreender por que mulheres que se encontram em risco semelhante de transmissão apresentam infecção e outras, não. A inexistência de um sistema de vigilância dos tipos circulantes de HPV prejudica a avaliação do cenário atual, inclusive no que se refere à recente implantação da vacinação contra o HPV no calendário básico de vacinação. Neste estudo, o objetivo foi estimar a prevalência de infecção pelo HPV no grupo de mulheres estudadas, relacionando estes achados aos fatores relacionados à infecção, que podem auxiliar na identificação de mulheres mais vulneráveis à infecção e à presença de lesões pré-neoplásicas. 2062 mulheres da periferia de Juiz de Fora, após serem convocadas para rastreamento, participaram do estudo, desenvolvido em duas unidades com a ESF, tendo respondido a um questionário padronizado, submetidas ao exame citológico cervical convencional e testadas para o HPV com o teste cobas 4800 (Roche). A adesão das mulheres convocadas foi semelhante àquela observada em estudos de outros delineamentos, os quais podem contribuir para o seu entendimento. Foram calculadas estimativas de prevalência de infecção pelo HPV segundo características selecionadas. A prevalência global de infecção pelo HPV foi 12,61%. A análise multivariada por regressão de Poisson com variância robusta mostrou associação estatisticamente significativa para ser solteira, consumir bebida alcoólica e ter três ou mais parceiros sexuais ao longo da vida, com razões de prevalência ajustadas de 1,40, 1,44 e 1,35, respectivamente. A prevalência de lesões precursoras do câncer do colo do útero foi 7,27%. A qualidade do esfregaço, avaliada pela representatividade dos epitélios coletados, mostrou que há variação da prevalência de lesões pré-neoplásicas mediante qualidade do esfregaço, porém, não há variação nos resultados do teste HPV mediante a representatividade celular, achado que consistente com uma sensibilidade maior e possivelmente um melhor valor preditivo positivo. A testagem do HPV mostrou ser útil, especialmente entre mulheres com resultado de citologia normal.

Estudo de associação entre os níveis de coordenação motora, adiposidade e atividade física de crianças em idade escolar

Há um crescente conjunto de evidências que têm indicado associações significativas entre os níveis de coordenação motora e outros atributos relacionados à saúde, tais como os níveis de adiposidade corporal e atividade física. Entretanto, as associações entre os níveis de coordenação motora, adiposidade e atividade física têm sido analisadas de forma bivariada, sem considerar a influência recíproca que essas variáveis exercem entre si, o que pode ser a causa da produção de dados enviesados. Assim sendo, o objetivo geral do presente estudo foi analisar o inter-relacionamento entre os níveis de coordenação motora, adiposidade e atividade física de crianças entre 12 e 14 anos de idade. Cento e dezenove participantes (51 meninos e 68 meninas) foram recrutados. O questionário Physical Activity Questionnaire for Older Children, o teste de coordenação motora Körperkoordinationstest für Kinder e um plicômetro clínico foram utilizados para estimar, respectivamente, os níveis de atividade física, coordenação motora e adiposidade corporal dos participantes. Coeficientes de Correlação de Pearson foram usados para examinar as associações bivariadas entre níveis de atividade física e coordenação motora e entre níveis de adiposidade corporal e coordenação motora. Correlações parciais foram usadas para analisar as associações entre os níveis de atividade física e coordenação motora, controlando pelos níveis de adiposidade corporal, e entre os níveis de adiposidade corporal e coordenação motora, controlando pelos níveis de atividade física. O teste de Análise de Covariância Multivariada (MANCOVA) foi utilizado para testar diferenças entre os grupos formados de acordo com o status de adiposidade e atividade física com o intuito de examinar a influência combinada dessas variáveis sobre os níveis de coordenação motora. De um modo geral, os resultados deste estudo indicaram que as associações dos níveis de coordenação motora com os níveis de adiposidade corporal e atividade física podem sofrer alterações de acordo com as covariáveis consideradas nas análises em meninos, mas não em meninas. O fato de tal fenômeno não ter sido observado em meninas pode estar relacionado aos baixos níveis de atividade física apresentados por elas. Foram sugeridas pesquisas adicionais nas quais sejam recrutadas meninas com maiores níveis de atividade física com o intuito de testar a hipótese acima aludida. Por fim, embora nesta oportunidade não se tenha estabelecido qualquer relação de causalidade entre as variáveis estudadas, não temos dúvidas de que crianças devem ser encorajadas a desenvolverem adequados níveis de coordenação motora, pois tal variável está associada com atributos relacionados ao estado de saúde.

Análise comparativa do efeito de resposta ao tratamento da Hepatite C entre o interferon peguilado e interferon-alfa associados à ribavirina em pacientes do HSE-RJ

A Hepatite C (HC) é um sério problema mundial de saúde pública. Pelas estimativas da Organização Mundial da Saúde, calcula-se que cerca de 3% da população mundial esteja infectada pelo vírus da hepatite C. O tratamento da HC objetiva deter a progressão da doença hepática pela inibição da replicação viral. O objetivo deste estudo foi comparar o efeito de resposta ao tratamento da Hepatite C entre o interferon peguilado (PEGINF) + ribavirina (RBV) e interferon-alfa (INF) + ribavirina (RBV) além de avaliar a relação de fatores de risco, idade, sexo, genótipo, grau de fibrose hepática, tempo de tratamento e comorbidades associadas. Foi realizado levantamento retrospectivo dos prontuários dos pacientes atendidos no ambulatório de Hepatologia do Hospital dos Servidores do Estado do RJ (HSE), de 2001 a 2009. Modelos de regressão logística bivariadas e multivariadas foram utilizados nas análises. Cerca de 85% dos pacientes que trataram por 48 semanas e 15% dos que trataram por 24 semanas tiveram resposta virológica sustentada (RVS) positiva. Cerca de 65% dos pacientes que receberam PEGINF + RBV e 35% dos que receberam INF + RBV tiveram RVS positiva. Os achados deste estudo apontam que o efeito de resposta do tratamento de hepatite C com PEG-INF + RBV é superior ao tratamento com INF + RBV, e que a maior duração do tempo de tratamento também tem influência positiva na RVS. Em relação à interrupção do tratamento houve associação estatisticamente significativa entre o grau de fibrose hepática e a probabilidade de permanecer no tratamento, o risco de interrupção é seis vezes maior com o grau mais avançado de fibrose (F4) em relação ao menos avançado (F2). Também foi encontrado que o risco de interromper o tratamento após as primeiras 24 semanas para pacientes com genótipo 3 foi 2,5 vezes maior do que àqueles pacientes com genótipo 1.

Teste de sentar-levantar: relação com a mortalidade por todas as causas e com a flexibilidade

Sabe-se que um estilo de vida sedentário e uma condição aeróbica baixa são associados com uma maior chance de desenvolvimento de doenças cardiovasculares e um maior risco de mortalidade por todas as causas. Contudo, é possível que outros indicadores de aptidão física possam ter significado clínico prognóstico. Originalmente proposto em 1999, o teste de sentar-levantar (TSL) é, simples de executar e possui comprovada reprodutibilidade inter e intra-avaliador. O avaliado inicia o teste com o escore máximo de 5 pontos para cada uma das ações de sentar e levantar, sendo subtraído do mesmo, um ponto para cada apoio extra utilizado (mão, braço e joelho) e meio ponto para cada desequilíbrio corporal perceptível. A pontuação do TSL escore, variando de 0 a 10, é realizada pela soma das ações de sentar e levantar. Considerando o potencial papel da flexibilidade para uma execução mais eficiente de gestos motores, não é surpreendente que o desempenho sobre TSL possa ser influenciado por essa valência. O objetivo desta dissertação foi analisar a relação entre o resultado do TSL e a mortalidade por todas as causas e a flexibilidade. No primeiro estudo, 2002 indivíduos entre 51 e 80 anos (68% homens), realizaram o TSL e os resultados foram estratificados em quatro faixas: 0/3; 3,5/5,5, 6/7,5 and 8/10. Baixos resultados no TSL escore foram associados com um maior risco de mortalidade (p<0,001). Uma tendência contínua de maior sobrevivência se refletiu no ajuste multivariado idade, sexo, índice de massa corporal em um razão de risco de 5,44 [95%IC=3,19,5], 3,44 [95%IC=2,05,9] e 1,84 [95%IC=1,13,0] (p<0,001) dos menores para as maiores faixas de resultados do TSL. Cada aumento de um ponto no escore do TSL significou uma melhora de 21% na sobrevivência. Já o segundo estudo, contou com 3927 indivíduos (67,4% homens) que realizaram o TSL e o Flexiteste. O Flexiteste avalia a amplitude máxima passiva de 20 movimentos corporais. Para cada um dos movimentos, existem cinco escores possíveis, 0 a 4 em uma ordem de mobilidade crescente. A soma dos resultados dos 20 movimentos fornece uma pontuação de flexibilidade global denominada de Flexíndice (FLX). Os resultados do FLX foram estratificados em quartis (626, 2735, 3644 and 4577). Os valores do TSL em cada quartil diferiram entre si (p<0,001). Além disso, o escore do TSL e o FLX foram diretamente associados (r=0,296; p<0,001). Os indivíduos com um TSL escore zero são menos flexíveis para todos os 20 movimentos do Flexiteste do que aqueles com escore 10. Portanto, os dados da presente dissertação, indicam que: o resultado do TSL se mostrou um importante preditor de mortalidade por todas as causas para indivíduos entre 51-80 anos de idade e que indivíduos mais flexíveis tendem a ter maiores escores no TSL.

Associations among chlorophyll concentration and climatic variables for Suisun Bay and the Sacramento-San Joaquin Delta [abstract]

EXTRACT (SEE PDF FOR FULL ABSTRACT): The recent changes in phytoplankton production and community composition within the Suisun Bay and Sacramento-San Joaquin Delta may be related to climate. Chlorophyll a concentration, decreased by 42% (spring-summer) and 29% (fall) between 1972 through 1976 and 1977 through 1981. The decrease in biomass was characterized by a shift in phytoplankton community dominance from Skeletonema spp., Cyclotella spp. and Coscinodiscus spp. to Melosira granulata. The possible influence of climate on phytoplankton abundance was suggested by multivariate statistical analyses that demonstrated an association between changes in phytoplankton community composition and abundance between 1975 and 1982 and the climate related variables wind velocity, precipitation, river flow and water temperature.

Application of neural networks to the ranking of perinatal variables influencing birthweight.

In this paper we compare Multi-Layer Perceptrons (a neural network type) with Multivariate Linear Regression in predicting birthweight from nine perinatal variables which are thought to be related. Results show, that seven of the nine variables, i.e., gestational age, mother's body-mass index (BMI), sex of the baby, mother's height, smoking, parity and gravidity, are related to birthweight. We found no significant relationship between birthweight and each of the two variables, i.e., maternal age and social class.

山东山旺中新世气候定量重建的综合研究

新生代以来，全球气候经历了一系列的冷暖交替，呈现总体变冷的趋势。对该时期不同区域气候变化过程的深入研究有助于我们更好地理解现今全球气候变化规律。中新世是新生代古气候与古环境演变的一个重要转折时期，定量重建山东山旺中新世气候是认识和理解中国东部与东亚新近纪气候演变的一个关键环节。 将化石植物作为气候代用指标，用于研究过去全球气候变化，已经广为国际科学界接纳。国际上，定量研究第三纪气候的植物学方法按照不同原理可以划分为两大类，其各自代表分别为基于化石的现存最近亲缘类群生态适应度推演古气候参数值的共存分析法（Coexistence Approch, CA ）和基于叶片形态特征与气候相关关系的叶缘分析（Leaf Margin Analysis, LMA ）与气候叶片多变量程序（Climate Leaf Analysis Multivariate Program, CLAMP）。两大主流方法各有优势，也各有局限性。前人运用两大主流方法对山旺中新世植物群相同地层，同套数据的分析结果表明：LMA 和CLAMP 所估测年均温数值要显著低于CA 所估测的数值。其差异的原因既可能是LMA 和CLAMP 由于埋藏因素的影响造成估测值偏低，也可能由于CA 数据库数据主要来自于欧洲和北美而缺乏东亚的资料所致。 本论文提出了一种新的方法——分布区叠加分析（Overlapping Distribution Analysis, ODA ）对山旺中新世古气候进行定量重建。ODA 采用最近亲缘类群在叠加区间的气候参数来重建化石植物所生活的当时当地的气候。其详细步骤如下：1. 鉴定化石植物和认定它们的最近亲缘类群（尽量到种级水平）。2. 调查这些最近亲缘类群的分布数据（包括经度、纬度和海拔数据）。某些类群可能会有不止一个最近亲缘类群，须将这些最近亲缘类群的分布数据合并。3. 对分布数据分析，得出包含最多类群的最大叠加区间。4. 调查在最大叠加区间中气象站点的气候数据。5. 按照公式（1）和（2）来转换年均温数据TU=T0 - (HU -H0)×Γ (1); TL=T0 - (HL -H0)×Γ (2) 其中HU (m) 是海拔叠加区间的上界; HL (m) 是海拔叠加区间的下界; H0 (m) 气象站的实测海拔; T0 (ºC) 气象站的实测年均温; TU (ºC) 在海拔叠加区间气温的下界; TL (ºC) 在海拔叠加区间气温的上界; 系数Γ 为大气垂直直减率，年均温为0.5ºC/100m，最冷月均温为 0.45ºC/100m，最热月均温为 0.6ºC/100m。同样的方法，在海拔叠加范围内最冷月均温与最热月均温范围也可以确定，而降水量则采用气象台站的原始数据。6. 在这些转换数据的基础上，得出年均温，最冷月均温，最热月均温，年较差和年平均降水量波动范围。 ODA 分析结果表明：山旺中新世时期年均温为10.9-14.5oC，年较差为21.1-22.7oC，最冷月均温为-0.5-3.3oC，最热月均温为21.9-25.0oC，年平均降水量为1107.3-1880.0mm 。同时本论文还定量恢复了山旺硅藻土矿各层的古气候参数，其所估测的古气候参数数值与CLAMP 和LMA 的结果一致，而与CA 不同。对山旺气候参数的恢复表明，虽然其中新世年均温与现在相似，但最冷月均温要高于现在。 本项研究的创新之处是选择同一个研究地点（山东山旺），依据同一套数据（化石植物的类群资料），采用国际上以不同原理为基础的主流方法，同时加入我们自己提出的新方法，进行的古气候重建，对所获得气候参数值进行对比和验证，并对其存在的差异进行分析和探讨。

Deep-sea benthic footprint of the Deepwater Horizon blowout

The Deepwater Horizon (DWH) accident in the northern Gulf of Mexico occurred on April 20, 2010 at a water depth of 1525 meters, and a deep-sea plume was detected within one month. Oil contacted and persisted in parts of the bottom of the deep-sea in the Gulf of Mexico. As part of the response to the accident, monitoring cruises were deployed in fall 2010 to measure potential impacts on the two main soft-bottom benthic invertebrate groups: macrofauna and meiofauna. Sediment was collected using a multicorer so that samples for chemical, physical and biological analyses could be taken simultaneously and analyzed using multivariate methods. The footprint of the oil spill was identified by creating a new variable with principal components analysis where the first factor was indicative of the oil spill impacts and this new variable mapped in a geographic information system to identify the area of the oil spill footprint. The most severe relative reduction of faunal abundance and diversity extended to 3 km from the wellhead in all directions covering an area about 24 km2. Moderate impacts were observed up to 17 km towards the southwest and 8.5 km towards the northeast of the wellhead, covering an area 148 km2. Benthic effects were correlated to total petroleum hydrocarbon, polycyclic aromatic hydrocarbons and barium concentrations, and distance to the wellhead; but not distance to hydrocarbon seeps. Thus, benthic effects are more likely due to the oil spill, and not natural hydrocarbon seepage. Recovery rates in the deep sea are likely to be slow, on the order of decades or longer.

Analyzing and mapping fish assemblages off central California, USA

This study describes fish assemblages and their spatial patterns off the coast of California from Point Arena to Point Sal, by combining the results of the multivariate analyses of several fisheries datasets with a geographic information system. In order to provide comprehensive spatial coverage for the areas of inshore, continental shelf, and continental slope, three fisheries datasets were analyzed: 1) Inshore: the California Department of Fish and Game dataset of fishery-dependent commercial passenger fishing vessel trips that targeted rockfish; 2) Continental Shelf: the National Marine Fisheries Service (NMFS) fishery-independent bottom trawls; and 3) Continental Slope: the NMFS fishery-independent bottom trawls on the continental slope. One-hundred seven species were analyzed. These species represented those captured in at least 5% of the fishing trips or trawls in at least one of the three data sets. We analyzed each of the three datasets separately, and the three sets of results were combined to define 28 species assemblages and 23 site groups. A species assemblage consisted of species caught together, whereas a site group consisted of fishing trips or trawl locations that tended to have the same species assemblages. At the scale of these datasets, 97% of all site groups were significantly segregated by depth.

Influence of hard bottom morphology on fish assemblages of the continental shelf off Georgia, southeastern USA

Various reef types worldwide have inconsistent relationships among fish assemblage parameters and benthic characteristics, thus there is a need to identify factors driving assemblage structure specific to each reef type and locale. Limestone ledges are known to be key habitats for bottom fish on the continental shelf of the southeastern USA, however, the specific factors that link them to fish assemblages have not been quantified. Bottom fishes and habitat characteristics on ledges were surveyed at a study site located centrally in the southeastern USA continental shelf. Species richness, diversity, abundance, and biomass of fish were higher at ledges than on flat bottom. Species richness, abundance, and biomass of fish were well explained by ledge variables including percent cover of sessile invertebrates, total height, and height of undercut recesses. Multivariate analyses based on biomass of individual species at ledges revealed two fish assemblages associated with four ledge types. One assemblage was associated with ledges that were tall, heavily colonized with sessile invertebrates, large in area, and did or did not have undercuts. The other assemblage was associated with ledges that were short, not undercut, smaller in area, and were or were not heavily colonized by invertebrates. Seafloor classification schemes presently used in the region do not adequately capture hard bottom diversity to identify the location and extent of essential fish habitats for ecological and fisheries purposes. Given that ledges cover only ∼1% to 5% of the southeastern USA continental shelf, they merit the highest levels of consideration in regional research, conservation, and management plans.

An environmentally based growth model that uses finite difference calculus with maximum likelihood method: its application to the brackish water bivalve Corbicula japonica in Lake Abashiri, Japan

We present a growth analysis model that combines large amounts of environmental data with limited amounts of biological data and apply it to Corbicula japonica. The model uses the maximum-likelihood method with the Akaike information criterion, which provides an objective criterion for model selection. An adequate distribution for describing a single cohort is selected from available probability density functions, which are expressed by location and scale parameters. Daily relative increase rates of the location parameter are expressed by a multivariate logistic function with environmental factors for each day and categorical variables indicating animal ages as independent variables. Daily relative increase rates of the scale parameter are expressed by an equation describing the relationship with the daily relative increase rate of the location parameter. Corbicula japonica grows to a modal shell length of 0.7 mm during the first year in Lake Abashiri. Compared with the attain-able maximum size of about 30 mm, the growth of juveniles is extremely slow because their growth is less susceptible to environmental factors until the second winter. The extremely slow growth in Lake Abashiri could be a geographical genetic variation within C. japonica.

Elemental signatures in otoliths of larval walleye pollock (Theragra chalcogramma) from the northeast Pacific Ocean

The population structure of walleye pollock (Theragra chalcogramma) in the northeastern Pacific Ocean remains unknown. We examined elemental signatures in the otoliths of larval and juvenile pollock from locations in the Bering Sea and Gulf of Alaska to determine if there were significant geographic variations in otolith composition that may be used as natural tags of population affinities. Otoliths were assayed by using both electron probe microanalysis (EPMA) and laser ablation inductively coupled plasma mass spectrometry (ICP-MS). Elements measured at the nucleus of otoliths by EPMA and laser ablation ICP-MS differed significantly among locations. However, geographic groupings identified by a multivariate statistical approach from EPMA and ICP-MS were dissimilar, indicating that the elements assayed by each technique were controlled by separate depositional processes within the endolymph. Elemental profiles across the pollock otoliths were generally consistent at distances up to 100 μm from the nucleus. At distances beyond 100 μm, profiles varied significantly but were remarkably consistent among individuals collected at each location. These data may indicate that larvae from various spawning locations are encountering water masses with differing physicochemical properties through their larval lives, and at approximately the same time. Although our results are promising, we require a better understanding of the mechanisms controlling otolith chemistry before it will be possible to reconstruct dispersal pathways of larval pollock based on probe-based analyses of otolith geochemistry. Elemental signatures in otoliths of pollock may allow for the delineation of fine-scale population structure in pollock that has yet to be consistently revealed by using population genetic approaches.

Spatial and temporal patterns in the demersal fish community on the shelf and upper slope regions of the Gulf of Alaska

We analyzed data from National Marine Fisheries Service bottom trawl surveys carried out triennially from 1984 to 1996 in the Gulf of Alaska (GOA). The continental shelf and upper slope (0–500 m) of the GOA support a rich demersal fish fauna dominated by arrowtooth flounder (Atheresthes stomias), walleye pollock (Theragra chalcogramma), Pacific cod (Gadus macrocephalus), Pacific halibut (Hippoglossus stenolepis), and Pacific Ocean perch (Sebastes alutus). Average catch per unit of effort (CPUE) of all groundfish species combined increased with depth and had a significant peak near the shelf break at 150–200 m. Species richness and diversity had significant peaks at 200–300 m. The western GOA was characterized by higher CPUEs and lower species richness and diversity than the eastern GOA. Highest CPUEs were observed in Shelikof Strait, along the shelf break and upper slope south of Kodiak Island, and on the banks and in the gullies northeast of Kodiak Island. Significant differences in total CPUE among surveys suggest a 40% increase in total groundfish biomass between 1984 and 1996. A multivariate analysis of the CPUE of 72 groundfish taxa revealed strong gradients in species composition with depth and from east to west, and a weak but significant trend in species composition over time. The trend over time was associated with increases in the frequency of occurrence and CPUE of at least eight taxa, including skates (Rajidae), capelin (Mallotus villosus), three flatfish species, and Pacific Ocean perch, and decreases in frequency of occurrence and CPUE of several sculpin (Myoxocephalus spp.) species. Results are discussed in terms of spatial and temporal patterns in productivity and in the context of their ecological and management implications.

Distribution and co-occurrence of rockfishes (family: Sebastidae) over trawlable shelf and slope habitats of California and southern Oregon

The rockfishes of the sebastid genus Sebastes are a very important fishery resource off the coasts of California and southern Oregon. How-ever, many of the 54 managed stocks of west coast rockfish have recently reached historically low population levels, leading fishery managers to re-examine current management practices. Management of rockfish stocks as multispecies aggregates, as opposed to independent stocks within the ground-fish fishery, can be more desirable when nontargeted bycatch, discard, and management complexity are considered. Rockfish assemblage structure and species co-occurrences were determined by using data from the Alaska Fisheries Science Center triennial continental shelf bottom trawl survey. The weight of rockfish species in trawl catches was expressed as a catch-per-unit-of-effort (CPUE) statistic, from which species spatial distributions, overlaps, diversity, and richness were analyzed. Multidimensional scaling of transformed CPUE data was employed in indirect gradient and multivariate partitioning analyses to quantify assemblage relationships. Results indicated that rockfish distributions closely match the bathymetry of coastal waters. Indirect gradient analysis suggested that depth and latitude are the principal factors in structuring the spatial distributions of rockfish on trawlable habitat. In addition, four assemblages were identified through the joint evaluation of species’ distributions and multivariate partitioning analyses: 1) deep-water slope; 2) northern shelf; 3) southern shelf; and 4) nearshore. The slope, shelf, and near-shore groups are found in depth ranges of 200–500 m, 100–250 m, and 50–150 m, respectively. The division of northern and southern shelf assemblages occurs over a broad area between Cape Mendocino and Monterey Canyon. The results of this analysis are likely to have direct application in the management of rockfish stocks off the coasts of southern Oregon and California.

Generalised Wishart Processes

We introduce a stochastic process with Wishart marginals: the generalised Wishart process (GWP). It is a collection of positive semi-definite random matrices indexed by any arbitrary dependent variable. We use it to model dynamic (e.g. time varying) covariance matrices. Unlike existing models, it can capture a diverse class of covariance structures, it can easily handle missing data, the dependent variable can readily include covariates other than time, and it scales well with dimension; there is no need for free parameters, and optional parameters are easy to interpret. We describe how to construct the GWP, introduce general procedures for inference and predictions, and show that it outperforms its main competitor, multivariate GARCH, even on financial data that especially suits GARCH. We also show how to predict the mean of a multivariate process while accounting for dynamic correlations.