CleanEx: a database of heterogeneous gene expression data based on a consistent gene nomenclature.

The main goal of CleanEx is to provide access to public gene expression data via unique gene names. A second objective is to represent heterogeneous expression data produced by different technologies in a way that facilitates joint analysis and cross-data set comparisons. A consistent and up-to-date gene nomenclature is achieved by associating each single experiment with a permanent target identifier consisting of a physical description of the targeted RNA population or the hybridization reagent used. These targets are then mapped at regular intervals to the growing and evolving catalogues of human genes and genes from model organisms. The completely automatic mapping procedure relies partly on external genome information resources such as UniGene and RefSeq. The central part of CleanEx is a weekly built gene index containing cross-references to all public expression data already incorporated into the system. In addition, the expression target database of CleanEx provides gene mapping and quality control information for various types of experimental resource, such as cDNA clones or Affymetrix probe sets. The web-based query interfaces offer access to individual entries via text string searches or quantitative expression criteria. CleanEx is accessible at: http://www.cleanex.isb-sib.ch/.

Do protein–protein interaction databases identify moonlighting proteins?

One of the most striking results of the human (and mammalian) genomes is the low number of protein-coding genes. To-date, the main molecular mechanism to increase the number of different protein isoforms and functions is alternative splicing. However, a less-known way to increase the number of protein functions is the existence of multifunctional, multitask, or ‘‘moonlighting’’, proteins. By and large, moonlighting proteins are experimentally disclosed by serendipity. Proteomics is becoming one of the very active areas of biomedical research, which permits researchers to identify previously unseen connections among proteins and pathways. In principle, protein–protein interaction (PPI) databases should contain information on moonlighting proteins and could provide suggestions to further analysis in order to prove the multifunctionality. As far as we know, nobody has verified whether PPI databases actually disclose moonlighting proteins. In the present work we check whether well-established moonlighting proteins present in PPI databases connect with their known partners and, therefore, a careful inspection of these databases could help to suggest their different functions. The results of our research suggest that PPI databases could be a valuable tool to suggest multifunctionality.

Diseño e implementación de una Web dinámica como herramienta para el control de obras en base al coste del proceso de construcción

En la actualidad estamos sufriendo una situación de crisis económica de dimensiones desproporcionadas e inusuales, la cual está obligando a todas las empresas a globalizar en mayor medida el ámbito de actuación de sus negocios, por lo que muchas empresas que trabajaban exclusivamente en el ámbito local o nacional han tenido que expandirse hacia el exterior. Este hecho, añadido a la fortísima competencia existente en el mercado, obligará a todas estas empresas a tener que controlar en mayor medida la actividad productiva, y a hacerlo utilizando tecnologías que faciliten el flujo de la información dentro de la empresa, hagan que la distancia no sea un problema para la transmisión de esa información, y con las que todos los usuarios manejen los mismos datos. El sector de la construcción es uno de los más castigados por la citada crisis, y probablemente uno de los más retrasados en lo que respecta a utilización de Tecnologías de la Información y la Comunicación. El objetivo principal de este trabajo es el diseño e implementación de una web dinámica como herramienta para medir la eficiencia en el control de la actividad productiva de una empresa constructora. La manera de medir esta eficiencia será mediante la comparación mensual de los costes previstos para las diferentes obras que deba ejecutar la empresa (los cuales podemos llamar estándar) y los que se vayan produciendo realmente. La herramienta diseñada podría ir aumentando su utilidad si, añadiendo módulos mediante la ampliación de la base de datos y diseñando las pertinentes nuevas páginas web para el sitio, se usa también para otros menesteres además del control de la actividad productiva por comparación entre costes previstos y reales. Es decir, que se podría llegar a gestionar la información de todas las actividades de la empresa (compras, recursos humanos, contabilidad, gestión de calidad, etc.). Por lo tanto, una web dinámica como la expuesta en el trabajo podría servir como semilla para el desarrollo de un ERP (Enterprise Resource Planning).

Agenda web modular

El proyecto consiste en la realización de una agenda web modular, utilizando para ello las tecnologías de la plataforma J2EE mediante frameworks (Hibernate y Spring) y un patrón de arquitectura (MVC). La agenda se ha realizado para ser gestionada por un servidor Apache Tomcat y sus datos almacenados en MySQL.

Aplicación web para informes de trabajo en grupo

Análisis, diseño e implementación de una aplicación web para informes del trabajo en grupo que queda encuadrada dentro del área de aplicaciones web para el trabajo colaborativo.

Desenvolupament d’una aplicación web per a l’oci nocturn de Girona

Desenvolupament d’ una eina en forma de pàgina web que reculli tota la informació relacionada amb l’oci nocturn de la província de Girona i que permeti als usuaris conèixer tota aquesta activitat de la província en un sol lloc web

Introducció de la web mòbil al Servei de Biblioteca i Documentació de la Universitat de Lleida : Proposta de web adaptada per a dispositius mòbils basada en l'usuari

Aquest treball presenta una proposta de web del Servei de Biblioteca i Documentació (SBD) de la Universitat de Lleida adaptada per a dispositius mòbils.

Disseny i implementació de la base de dades d'un sistema centralitzat de control de despesa pública dels parlaments europeus

La Comunitat Europea ha decidit realitzar una base de dades per controlar la despesa pública parlamentària, tant dels parlaments com dels seus parlamentaris, i que les dades puguin ser consultades on line. L'objectiu del present treball és realitzar la base de dades on es guardarà la informació indicada pel client, així com un seguit de consultes i dades estadístiques que es podran consultar a través d'una plana web.

EsPal: One-stop shopping for Spanish word properties

This article introduces EsPal: a Web-accessible repository containing a comprehensive set of properties of Spanish words. EsPal is based on an extensible set of data sources, beginning with a 300 million token written database and a 460 million token subtitle database. Properties available include word frequency, orthographic structure and neighborhoods, phonological structure and neighborhoods, and subjective ratings such as imageability. Subword structure properties are also available in terms of bigrams and trigrams, bi-phones, and bi-syllables. Lemma and part-of-speech information and their corresponding frequencies are also indexed. The website enables users to either upload a set of words to receive their properties, or to receive a set of words matching constraints on the properties. The properties themselves are easily extensible and will be added over time as they become available. It is freely available from the following website: http://www.bcbl.eu/databases/espal

Indexing strategies for rapid searches of short words in genome sequences.

Searching for matches between large collections of short (14-30 nucleotides) words and sequence databases comprising full genomes or transcriptomes is a common task in biological sequence analysis. We investigated the performance of simple indexing strategies for handling such tasks and developed two programs, fetchGWI and tagger, that index either the database or the query set. Either strategy outperforms megablast for searches with more than 10,000 probes. FetchGWI is shown to be a versatile tool for rapidly searching multiple genomes, whose performance is limited in most cases by the speed of access to the filesystem. We have made publicly available a Web interface for searching the human, mouse, and several other genomes and transcriptomes with oligonucleotide queries.

Proyecto para la creación de una página web que simule una banca online

El objetivo de este proyecto es ir narrando el desarrollo, desde el momento de aceptación, sobre una oferta concreta con un proveedor de una aplicación web que dé servicio a los clientes de una determinada financiera. En este caso, la herramienta, a la que se le ha llamadoCustomer Web Site (CWS), se encargará de ofrecer determinados servicios de consulta y modificación de datos para que los clientes eviten contactar telefónicamente con el call center de la empresa.

Aplicació web per implantar la metodologia Scrum

Projecte final de carrera de l'àrea de .NET. Es tracta d'una aplicació web que permet a l'equip de desenvolupament d'una empresa la implementació de la metodologia Scrum.

Web Services for Bayesian Learning

In this demonstration we present our web services to perform Bayesian learning for classification tasks.

Pàgina web amb gestor de continguts

En aquest informe es detalla l'anàlisi previ i posterior a la implementació del projecte, que consta del disseny i implementació d'una eina per gestionar el contingut d'una pàgina web, concretament una web orientada a músics.

Desarrollo de una aplicación web multiplataforma según el patrón Modelo Vista Controlador

Memoria del desarrollo de una aplicación web siguiendo el patrón de diseño Modelo Vista Controlador, desde la planificación a la implementación. Tecnologías: MySQL, Java2EE, HTML5, Struts2, jQuery, jQueryMobile, JSP, ESAPI, jasypt, XML.