Mineralogical Characteristics and Transformations during Long-Term Operation of a Zerovalent Iron Reactive Barrier

Design and operation of Fe⁰ permeable reactive barriers (PRBs) can be improved by understanding the long-term mineralogical transformations that occur within PRBs. Changes in mineral precipitates, cementation, and corrosion of Fe⁰ filings within an in situ pilot-scale PRB were examined after the first 30 months of operation and compared with results of a previous study of the PRB conducted 15 months earlier using X-ray diffraction and scanning electron microscopy employing energy dispersive X-ray and backscatter electron analyses. Iron (oxy)hydroxides, aragonite, and maghemite and/or magnetite occurred throughout the cores collected 30 mo after installation. Goethite, lepidocrocite, mackinawite, aragonite, calcite, and siderite were associated with oxidized and cemented areas, while green rusts were detected in more reduced zones. Basic differences from our last detailed investigation include (i) mackinawite crystallized from amorphous FeS, (ii) aragonite transformed into calcite, (iii) akaganeite transformed to goethite and lepidocrocite, (iv) iron (oxy)hydroxides and calcium and iron carbonate minerals increased, (v) cementation was greater in the more recent study, and (vi) oxidation, corrosion, and disintegration of Fe⁰ filings were greater, especially in cemented areas, in the more recent study. If the degree of corrosion and cementation that was observed from 15 to 30 mo after installation continues, certain portions of the PRB (i.e., up-gradient entrance of the ground water to the Fe⁰ section of the PRB) may last less than five more years, thus reducing the effectiveness of the PRB to mitigate contaminants.

Impact of sample preparation on mineralogical analysis of zero-valent iron reactive barrier materials

Permeable reactive barriers (PRBs) of zero-valent iron (Fe⁰) are increasingly being used to remediate contaminated ground water. Corrosion of Fe⁰ filings and tbe formation of precipitates can occur when the PRB material comes in contact with ground water and may reduce the lifespan and effectiveness of the barrier. At present, there are no routine procedures for preparing and analyzing the mineral precipitates from Fe⁰ PRB material. These procedures are needed because mineralogical composition of corrosion products used to interpret the barrier processes can change with iron oxidation and sample preparation. The objectives of this study were (i) to investigate a method of preparing Fe⁰ reactive barrier material for mineralogical analysis by X-ray diffraction (XRD), and (ii) to identify Fe mineral phases and rates of transformations induced by different mineralogical preparation techniques. Materials from an in situ Fe⁰ PRB were collected by undisturbed coring and processed for XRD analysis after different times since sampling for three size fractions and by various drying treatments. We found that whole-sample preparation for analysis was necessary because mineral precipitates occurred within the PRB material in different size fractions of the samples. Green rusts quickly disappeared from acetone-dried samples and were not present in air-dried and oven-dried samples Maghemite/magnetite content increased over time and in oven-dried samples, especially after heating to 105°C. We conclude that care must be taken during sample preparation of Fe⁰ PRB material, especially for detection of green rusts, to ensure accurate identification of minerals present within the barrier system.

Efficacy of instant hand sanitizers against foodborne pathogens compared to hand washing with soap and water in food preparation settings: a systematic review

Hands can be a vector for transmitting pathogenic microorganisms to foodstuffs and drinks, and to the mouths of susceptible hosts. Hand washing is the primary barrier to prevent transmission of enteric pathogens via cross contamination from infected persons. Conventional hand washing involves the use of warm water, soap and friction to remove dirt and microorganisms. Over recent years there has been an increasing availability of hand sanitizing products for use when water and soap are unavailable. The aim of this systematic review was to collate scientific information on the efficacy of hand sanitizers compared to hand washing with soap and water for the removal of foodborne pathogens from the hands of food handlers. An extensive literature search was carried out using three electronic databases - Web of Science, Scopus and PubMed. Twenty-eight scientific publications were ultimately included in the review. Analysis of the literature showed various limitations in the scientific information due to the absence of a standardized protocol to evaluate efficacy of hand products, and variation in experimental conditions applied in different studies. Despite the existence of conflicting results, scientific evidence seems to support the historical scepticism about the use of water-less hand sanitizers in food preparation settings. Water and soap appear to achieve greater removal of soil and microorganisms than water-less products from hands. None of the hand sanitizers tested in the literature seemed to achieve complete inactivation or removal of all foodborne pathogens tested, and the presence of food debris significantly affected inactivation rates of hand products.

Deglacial mesophotic reef demise on the Great Barrier Reef

Submerged reefs are important recorders of palaeo-environments and sea-level change, and provide a substrate for modern mesophotic (deep-water, light-dependent) coral communities. Mesophotic reefs are rarely, if ever, described from the fossil record and nothing is known of their long-term record on Great Barrier Reef (GBR). Sedimentological and palaeo-ecological analyses coupled with 67 14C AMS and U–Th radiometric dates from dredged coral, algae and bryozoan specimens, recovered from depths of 45 to 130 m, reveal two distinct generations of fossil mesophotic coral community development on the submerged shelf edge reefs of the GBR. They occurred from 13 to 10 ka and 8 ka to present. We identified eleven sedimentary facies representing both autochthonous (in situ) and allochthonous (detrital) genesis, and their palaeo-environmental settings have been interpreted based on their sedimentological characteristics, biological assemblages, and the distribution of similar modern biota within the dredges. Facies on the shelf edge represent deep sedimentary environments, primarily forereef slope and open platform settings in palaeo-water depths of 45–95 m. Two coral–algal assemblages and one non-coral encruster assemblage were identified: 1) Massive and tabular corals including Porites, Montipora and faviids associated with Lithophylloids and minor Mastophoroids, 2) platy and encrusting corals including Porites, Montipora and Pachyseris associated with melobesioids and Sporolithon, and 3) Melobesiods and Sporolithon with acervulinids (foraminifera) and bryozoans. Based on their modern occurrence on the GBR and Coral Sea and modern specimens collected in dredges, these are interpreted as representing palaeo-water depths of < 60 m, < 80–100 m and > 100 m respectively. The first mesophotic generation developed at modern depths of 85–130 m from 13 to 10.2 ka and exhibit a deepening succession of < 60 to > 100 m palaeo-water depth through time. The second generation developed at depths of 45–70 m on the shelf edge from 7.8 ka to present and exhibit stable environmental conditions through time. The apparent hiatus that interrupted the mesophotic coral communities coincided with the timing of modern reef initiation on the GBR as well as a wide-spread flux of siliciclastic sediments from the shelf to the basin. For the first time we have observed the response of mesophotic reef communities to millennial scale environmental perturbations, within the context of global sea-level rise and environmental changes.

High-resolution seismic reflection investigation of gas accumulation and seepage in the tidal channels of the Ria of Aveiro barrier lagoon (Portugal)

O metano é um gás de estufa potente e uma importante fonte de energia. A importância global e impacto em zonas costeiras de acumulações e escape de gás metano são ainda pouco conhecidas. Esta tese investiga acumulações e escape de gás em canais de maré da Ria de Aveiro com dados de cinco campanhas de reflexão sísmica de alta resolução realizadas em 1986, 1999, 2002 e 2003. Estas incluem três campanhas de Chirp (RIAV99, RIAV02 e RIAV02A) e duas campanhas de Boomer (VOUGA86 e RIAV03). O processamento dos dados de navegação incluíram filtros de erros, correcções de sincronização de relógios de sistemas de aquisição de dados, ajuste de “layback” e estimativa da posição de “midpoint”. O processamento do sinal sísmico consistiu na correcção das amplitudes, remoção de ruído do tipo “burst”, correcções estáticas, correcção do “normal move-out”, filtragem passabanda, desconvolução da assinatura e migração Stolt F-K. A análise da regularidade do trajecto de navegação, dos desfasamentos entre horizontes e dos modelos de superfícies foi utilizada para controlo de qualidade, e permitiu a revisão e melhoria dos parâmetros de processamento. A heterogeneidade da cobertura sísmica, da qualidade do sinal, da penetração e da resolução, no seu conjunto constrangeram o uso dos dados a interpretações detalhadas, mas locais, de objectos geológicos da Ria. É apresentado um procedimento para determinar a escolha de escalas adequadas para modelar os objectos geológicos, baseado na resolução sísmica, erros de posicionamento conhecidos e desfasamentos médios entre horizontes. As evidências de acumulação e escape de gás na Ria de Aveiro incluem turbidez acústica, reflexões reforçadas, cortinas acústicas, domas, “pockmarks” e alinhamentos de “pockmarks” enterradas, horizontes perturbados e plumas acústicas na coluna de água (flares). A estratigrafia e a estrutura geológica controlam a distribuição e extensão das acumulações e escape de gás. Ainda assim, nestes sistemas de baixa profundidade de água, as variações da altura de maré têm um impacto significativo na detecção de gás com métodos acústicos, através de alterações nas amplitudes originais de reflexões reforçadas, turbidez acústica e branqueamento acústico em zonas com gás. Os padrões encontrados confirmam que o escape de bolhas de gás é desencadeado pela descida da maré. Há acumulações de gás em sedimentos Holocénicos e no substrato de argilas e calcários do Mesozóico. Evidências directas de escape de gás em sondagens em zonas vizinhas, mostraram gás essencialmente biogénico. A maioria do gás na área deve ter sido gerado em sedimentos lagunares Holocénicos. No entanto, a localização e geometria de estruturas de escape de fluidos em alguns canais de maré, seguem o padrão de fracturas do substrato Mesozóico, indicando uma possível fonte mais profunda de gás e que estas fracturas funcionam como condutas preferenciais de migração dos fluidos e exercem um controlo estrutural na ocorrência de gás na Ria.

Novel materials based on chitosan, its derivatives and cellulose fibres

O presente trabalho tem como principal objectivo o desenvolvimento de novos materiais baseados em quitosano, seus derivados e celulose, na forma de nanofibras ou de papel. Em primeiro lugar procedeu-se à purificação das amostras comerciais de quitosano e à sua caracterização exaustiva em termos morfológicos e físicoquímicos. Devido a valores contraditórios encontrados na literatura relativamente à energia de superfície do quitosano, e tendo em conta a sua utilização como precursor de modificações químicas e a sua aplicação em misturas com outros materiais, realizou-se também um estudo sistemático da determinação da energia de superfície do quitosano, da quitina e seus respectivos homólogos monoméricos, por medição de ângulos de contacto Em todas as amostras comerciais destes polímeros identificaram-se impurezas não polares que estão associadas a erros na determinação da componente polar da energia de superfície. Após a remoção destas impurezas, o valor da energia total de superfície (gs), e em particular da sua componente polar, aumentou consideravelmente. Depois de purificadas e caracterizadas, algumas das amostras de quitosano foram então usadas na preparação de filmes nanocompósitos, nomeadamente dois quitosanos com diferentes graus de polimerização, correspondentes derivados solúveis em água (cloreto de N-(3-(N,N,N-trimetilamónio)-2- hidroxipropilo) de quitosano) e nanofibras de celulose como reforço (celulose nanofibrilada (NFC) e celulose bacteriana (BC). Estes filmes transparentes foram preparados através de um processo simples e com conotação ‘verde’ pela dispersão homogénea de diferentes teores de NFC (até 60%) e BC (até 40%) nas soluções de quitosano (1.5% w/v) seguida da evaporação do solvente. Os filmes obtidos foram depois caracterizados por diversas técnicas, tais como SEM, AFM, difracção de raio-X, TGA, DMA, ensaios de tracção e espectroscopia no visível. Estes filmes são altamente transparentes e apresentam melhores propriedades mecânicas e maior estabilidade térmica do que os correspondentes filmes sem reforço. Outra abordagem deste trabalho envolveu o revestimento de folhas de papel de E. globulus com quitosano e dois derivados, um derivado fluorescente e um derivado solúvel em água, numa máquina de revestimentos (‘máquina de colagem’) à escala piloto. Este estudo envolveu inicialmente a deposição de 1 a 5 camadas do derivado de quitosano fluorescente sobre as folhas de papel de forma a estudar a sua distribuição nas folhas em termos de espalhamento e penetração, através de medições de reflectância e luminescência. Os resultados mostraram que, por um lado, a distribuição do quitosano na superfície era homogénea e que, por outro lado, a sua penetração através dos poros do papel cessou após três deposições. Depois da terceira camada verificou-se a formação de um filme contínuo de quitosano sobre a superfície do papel. Estes resultados mostram que este derivado de quitosano fluorescente pode ser utilizado como marcador na optimização e compreensão de mecanismos de deposição de quitosano em papel e outros substratos. Depois de conhecida a distribuição do quitosano nas folhas de papel, estudou-se o efeito do revestimento de quitosano e do seu derivado solúvel em água nas propriedades finais do papel. As propriedades morfológicas, mecânicas, superficiais, ópticas, assim como a permeabilidade ao ar e ao vapor de água, a aptidão à impressão e o envelhecimento do papel, foram exaustivamente avaliadas. De uma forma geral, os revestimentos com quitosano e com o seu derivado solúvel em água tiveram um impacto positivo nas propriedades finais do papel, que se mostrou ser dependente do número de camadas depositadas. Os resultados também mostraram que os papéis revestidos com o derivado solúvel em água apresentaram melhores propriedades ópticas, aptidão à impressão e melhores resultados em relação ao envelhecimento do que os papéis revestidos com quitosano. Assim, o uso de derivados de quitosano solúveis em água em processos de revestimento de papel representa uma estratégia bastante interessante e sustentável para o desenvolvimento de novos materiais funcionais ou na melhoria das propriedades finais dos papéis. Por fim, tendo como objectivo valorizar os resíduos e fracções menos nobres da quitina e do quitosano provenientes da indústria transformadora, estes polímeros foram convertidos em polióis viscosos através de uma reacção simples de oxipropilação. Este processo tem também conotação "verde" uma vez que não requer solvente, não origina subprodutos e não exige nenhuma operação específica (separação, purificação, etc) para isolar o produto da reacção. As amostras de quitina e quitosano foram pré-activadas com KOH e depois modificadas com um excesso de óxido de propileno (PO) num reactor apropriado. Em todos os casos, o produto da reacção foi um líquido viscoso composto por quitina ou quitosano oxipropilados e homopolímero de PO. Estas duas fracções foram separadas e caracterizadas.

Sequential application of soil vapor extraction and bioremediation processes for the remediation of ethylbenzene-contaminated soils

Soil vapor extraction (SVE) is an efficient, well-known and widely applied soil remediation technology. However, under certain conditions it cannot achieve the defined cleanup goals, requiring further treatment, for example, through bioremediation (BR). The sequential application of these technologies is presented as a valid option but is not yet entirely studied. This work presents the study of the remediation of ethylbenzene (EB)-contaminated soils, with different soil water and natural organic matter (NOMC) contents, using sequential SVE and BR. The obtained results allow the conclusion that: (1) SVE was sufficient to reach the cleanup goals in 63% of the experiments (all the soils with NOMC below 4%), (2) higher NOMCs led to longer SVE remediation times, (3) BR showed to be a possible and cost-effective option when EB concentrations were lower than 335 mg kgsoil −1, and (4) concentrations of EB above 438 mg kgsoil −1 showed to be inhibitory for microbial activity.

Multiple Linear Regression and Artificial Neural Networks to Predict Time and Efficiency of Soil Vapor Extraction

The prediction of the time and the efficiency of the remediation of contaminated soils using soil vapor extraction remain a difficult challenge to the scientific community and consultants. This work reports the development of multiple linear regression and artificial neural network models to predict the remediation time and efficiency of soil vapor extractions performed in soils contaminated separately with benzene, toluene, ethylbenzene, xylene, trichloroethylene, and perchloroethylene. The results demonstrated that the artificial neural network approach presents better performances when compared with multiple linear regression models. The artificial neural network model allowed an accurate prediction of remediation time and efficiency based on only soil and pollutants characteristics, and consequently allowing a simple and quick previous evaluation of the process viability.

Uso Sustentável de Vapor

Em 2006, a IEA (Agência Internacional de Energia), publicou alguns estudos de consumos mundiais de energia. Naquela altura, apontava na fabricação de produtos, um consumo mundial de energia elétrica, de origem fóssil de cerca 86,16 EJ/ano (86,16×018 J) e um consumo de energia nos sistemas de vapor de 32,75 EJ/ano. Evidenciou também nesses estudos que o potencial de poupança de energia nos sistemas de vapor era de 3,27 EJ/ano. Ou seja, quase tanto como a energia consumida nos sistemas de vapor da U.E. Não se encontraram números relativamente a Portugal, mas comparativamente com outros Países publicitados com alguma similaridade, o consumo de energia em vapor rondará 0,2 EJ/ano e por conseguinte um potencial de poupança de cerca 0,02 EJ/ano, ou 5,6 × 106 MWh/ano ou uma potência de 646 MW, mais do que a potência de cinco barragens Crestuma/Lever! Trata-se efetivamente de muita energia; interessa por isso perceber o onde e o porquê deste desperdício. De um modo muito modesto, pretende-se com este trabalho dar algum contributo neste sentido. Procurou-se evidenciar as possibilidades reais de os utilizadores de vapor de água na indústria reduzirem os consumos de energia associados à sua produção. Não estão em causa as diferentes formas de energia para a geração de vapor, sejam de origem fóssil ou renovável; interessou neste trabalho estudar o modo de como é manuseado o vapor na sua função de transporte de energia térmica, e de como este poderá ser melhorado na sua eficiência de cedência de calor, idealmente com menor consumo de energia. Com efeito, de que servirá se se optou por substituir o tipo de queima para uma mais sustentável se a jusante se continuarem a verificarem desperdícios, descarga exagerada nas purgas das caldeiras com perda de calor associada, emissões permanentes de vapor para a atmosfera em tanques de condensado, perdas por válvulas nos vedantes, purgadores avariados abertos, pressão de vapor exageradamente alta atendendo às temperaturas necessárias, “layouts” do sistema de distribuição mal desenhados, inexistência de registos de produção e consumos de vapor, etc. A base de organização deste estudo foi o ciclo de vapor: produção, distribuição, consumo e recuperação de condensado. Pareceu importante incluir também o tratamento de água, atendendo às implicações na transferência de calor das superfícies com incrustações. Na produção de vapor, verifica-se que os maiores problemas de perda de energia têm a ver com a falta de controlo, no excesso de ar e purgas das caldeiras em exagero. Na distribuição de vapor aborda-se o dimensionamento das tubagens, necessidade de purgas a v montante das válvulas de controlo, a redução de pressão com válvulas redutoras tradicionais; será de destacar a experiência americana no uso de micro turbinas para a redução de pressão com produção simultânea de eletricidade. Em Portugal não se conhecem instalações com esta opção. Fabricantes da República Checa e Áustria, têm tido sucesso em algumas dezenas de instalações de redução de pressão em diversos países europeus (UK, Alemanha, R. Checa, França, etc.). Para determinação de consumos de vapor, para projeto ou mesmo para estimativa em máquinas existentes, disponibiliza-se uma série de equações para os casos mais comuns. Dá-se especial relevo ao problema que se verifica numa grande percentagem de permutadores de calor, que é a estagnação de condensado - “stalled conditions”. Tenta-se também evidenciar as vantagens da recuperação de vapor de flash (infelizmente de pouca tradição em Portugal), e a aplicação de termocompressores. Finalmente aborda-se o benchmarking e monitorização, quer dos custos de vapor quer dos consumos específicos dos produtos. Esta abordagem é algo ligeira, por manifesta falta de estudos publicados. Como trabalhos práticos, foram efetuados levantamentos a instalações de vapor em diversos sectores de atividades; 1. ISEP - Laboratório de Química. Porto, 2. Prio Energy - Fábrica de Biocombustíveis. Porto de Aveiro. 3. Inapal Plásticos. Componentes de Automóvel. Leça do Balio, 4. Malhas Sonix. Tinturaria Têxtil. Barcelos, 5. Uma instalação de cartão canelado e uma instalação de alimentos derivados de soja. Também se inclui um estudo comparativo de custos de vapor usado nos hospitais: quando produzido por geradores de vapor com queima de combustível e quando é produzido por pequenos geradores elétricos. Os resultados estão resumidos em tabelas e conclui-se que se o potencial de poupança se aproxima do referido no início deste trabalho.

Survival of multi-drug resistant enteropathogenic Escherichia coli and Salmonella paratyphi in Vembanadu lake as a function of saltwater barrier along southwest coast of India

The objective of the study was to evaluate the survival response of multi-drug resistant enteropathogenic Escherichia coli and Salmonella paratyphi to the salinity fluctuations induced by a saltwater barrier constructed in Vembanadu lake, which separates the lake into a freshwater dominated southern and brackish water dominated northern part. Therefore, microcosms containing freshwater, brackish water and microcosms with different saline concentrations (5, 10, 15, 20, 25 ppt) inoculated with E. coli/S. paratyphi were monitored up to 34 days at 20 and 30 WC. E. coli and S. paratyphi exhibited significantly higher (p <0.05) survival at 20 WC compared to 30 WC in all microcosms. Despite fresh/brackish water, E. coli and S. paratyphi showed prolonged survival up to 34 days at both temperatures. They also demonstrated better survival potential at all tested saline concentrations except 25 ppt where a significantly higher (p<0.0001) decay was observed. Therefore, enhanced survival exhibited by the multi-drug resistant enteropathogenic E. coli and S. paratyphi over a wide range of salinity levels suggest that they are able to remain viable for a very long time at higher densities in all seasons of the year in Vembanadu lake irrespective of saline concentrations, and may pose potential public health risks during recreational activities

Localization of deep water formation: role of atmospheric moisture transport and geometrical constraints on ocean circulation

A series of coupled atmosphere–ocean–ice aquaplanet experiments is described in which topological constraints on ocean circulation are introduced to study the role of ocean circulation on the mean climate of the coupled system. It is imagined that the earth is completely covered by an ocean of uniform depth except for the presence or absence of narrow barriers that extend from the bottom of the ocean to the sea surface. The following four configurations are described: Aqua (no land), Ridge (one barrier extends from pole to pole), Drake (one barrier extends from the North Pole to 35°S), and DDrake (two such barriers are set 90° apart and join at the North Pole, separating the ocean into a large basin and a small basin, connected to the south). On moving from Aqua to Ridge to Drake to DDrake, the energy transports in the equilibrium solutions become increasingly “realistic,” culminating in DDrake, which has an uncanny resemblance to the present climate. Remarkably, the zonal-average climates of Drake and DDrake are strikingly similar, exhibiting almost identical heat and freshwater transports, and meridional overturning circulations. However, Drake and DDrake differ dramatically in their regional climates. The small and large basins of DDrake exhibit distinctive Atlantic-like and Pacific-like characteristics, respectively: the small basin is warmer, saltier, and denser at the surface than the large basin, and is the main site of deep water formation with a deep overturning circulation and strong northward ocean heat transport. A sensitivity experiment with DDrake demonstrates that the salinity contrast between the two basins, and hence the localization of deep convection, results from a deficit of precipitation, rather than an excess of evaporation, over the small basin. It is argued that the width of the small basin relative to the zonal fetch of atmospheric precipitation is the key to understanding this salinity contrast. Finally, it is argued that many gross features of the present climate are consequences of two topological asymmetries that have profound effects on ocean circulation: a meridional asymmetry (circumpolar flow in the Southern Hemisphere; blocked flow in the Northern Hemisphere) and a zonal asymmetry (a small basin and a large basin).

Pre-conditioning the epigenetic response to high vapor pressure deficit increases the drought tolerance of Arabidopsis thaliana

Epigenetic modification of the genome via cytosine methylation is a dynamic process that responds to changes in the growing environment. This modification can also be heritable. The combination of both properties means that there is the potential for the life experiences of the parental generation to modify the methylation profiles of their offspring and so potentially to ‘pre-condition’ them to better accommodate abiotic conditions encountered by their parents. We recently identified high vapor pressure deficit (vpd)-induced DNA methylation at two gene loci in the stomatal development pathway and an associated reduction in leaf stomatal frequency.1 Here, we test whether this epigenetic modification pre-conditioned parents and their offspring to the more severe water stress of periodic drought. We found that three generations of high vpd-grown plants were better able to withstand periodic drought stress over two generations. This resistance was not directly associated with de novo methylation of the target stomata genes, but was associated with the cmt3 mutant’s inability to maintain asymmetric sequence context methylation. If our finding applies widely, it could have significant implications for evolutionary biology and breeding for stressful environments.

The energy and water balance of a Eucalyptus plantation in southeast Brazil

The eddy covariance method was used to measure energy and water balance of a plantation of Eucalyptus (grandis x urophylla) hybrids over a 2 year period. The average daily evaporation rates were 5.4 (+/- 2.0) mm day(-1) in summer, but fell to 1.2 (+/- 0.3) mm day(-1) in winter. In contrast, the sensible heat flux was relatively low in summer but dominated the energy balance in winter. Evaporation accounted for 80% and 26% of the available energy, in summer and winter respectively. The annual evaporation was 82% (1124 mm) and 96% (1235 mm) of the annual rainfall recorded during the first and second year, respectively. Daily average canopy and aerodynamic conductance to water vapour were in the summer 51.9 (+/- 38.4) mm s(-1) 84.1 (+/- 25.6) mm s(-1), respectively; and in the winter 6.0 (+/- 10.5) mm s(-1) and 111.6 (+/- 24.6) mm s(-1), respectively. (C) 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

The land-atmosphere water flux in the tropics

Tropical vegetation is a major source of global land surface evapotranspiration, and can thus play a major role in global hydrological cycles and global atmospheric circulation. Accurate prediction of tropical evapotranspiration is critical to our understanding of these processes under changing climate. We examined the controls on evapotranspiration in tropical vegetation at 21 pan-tropical eddy covariance sites, conducted a comprehensive and systematic evaluation of 13 evapotranspiration models at these sites, and assessed the ability to scale up model estimates of evapotranspiration for the test region of Amazonia. Net radiation was the strongest determinant of evapotranspiration (mean evaporative fraction was 0.72) and explained 87% of the variance in monthly evapotranspiration across the sites. Vapor pressure deficit was the strongest residual predictor (14%), followed by normalized difference vegetation index (9%), precipitation (6%) and wind speed (4%). The radiation-based evapotranspiration models performed best overall for three reasons: (1) the vegetation was largely decoupled from atmospheric turbulent transfer (calculated from X decoupling factor), especially at the wetter sites; (2) the resistance-based models were hindered by difficulty in consistently characterizing canopy (and stomatal) resistance in the highly diverse vegetation; (3) the temperature-based models inadequately captured the variability in tropical evapotranspiration. We evaluated the potential to predict regional evapotranspiration for one test region: Amazonia. We estimated an Amazonia-wide evapotranspiration of 1370 mm yr(-1), but this value is dependent on assumptions about energy balance closure for the tropical eddy covariance sites; a lower value (1096 mm yr(-1)) is considered in discussion on the use of flux data to validate and interpolate models.

Genotyping, physiological features and proteolytic activities of a potentially pathogenic Acanthamoeba sp isolated from tap water in Brazil

Acanthamoeba spp., known to cause keratitis and granulomatous encephalitis in humans, are frequently isolated from a variety of water sources. Here we report for the first time the characterization of an Acanthamoeba sp. (ACC01) isolated from tap water in Brazil. This organism is currently being maintained in an axenic growth medium. Phylogenetic analysis based on SSU rRNA gene sequences positioned the new isolate in genotype T4, closest to the keratitis-causing isolate, A. polyphaga ATCC 30461 (similar to 99% similarity). Acanthamoeba ACC01 and A. polyphaga 30461 both grew at 37 degrees C and were osmotically resistant, multiplying in hyperosmolar medium. Both isolates secreted comparable amounts of proteolytic enzymes, including serine peptidases that were optimally active at a near neutral/alkaline pH and resolved identically in gelatin gels. Incubation of gels at pH 4.0 with 2 mM DTT also indicated the secretion of similar cysteine peptidases. Altogether, the results point to the pathogenic potential of Acanthamoeba ACC01. (C) 2009 Elsevier Inc. All rights reserved.