Human white blood cells contain cyclobutyl pyrimidine dimer photolyase.

Although enzymatic photoreactivation of cyclobutyl pyrimidine dimers in DNA is present in almost all organisms, its presence in placental mammals is controversial. We tested human white blood cells for photolyase by using three defined DNAs (supercoiled pET-2, nonsupercoiled bacteriophage lambda, and a defined-sequence 287-bp oligonucleotide), two dimer-specific endonucleases (T4 endonuclease V and UV endonuclease from Micrococcus luteus), and three assay methods. We show that human white blood cells contain photolyase that can photorepair pyrimidine dimers in defined supercoiled and linear DNAs and in a 287-bp oligonucleotide and that human photolyase is active on genomic DNA in intact human cells.

Function of the p86 subunit of eukaryotic initiation factor (iso)4F as a microtubule-associated protein in plant cells.

The isozyme form of eukaryotic initiation factor 4F [eIF-(iso)4F] from wheat germ is composed of a p28 subunit that binds the 7-methylguanine cap of mRNA and a p86 subunit having unknown function. The p86 subunit was found to have limited sequence similarity to a kinesin-like protein encoded by the katA gene of Arabidopsis thaliana. Native wheat germ eIF-(iso)4F and bacterially expressed p86 subunit and p86-p28 complex bound to taxol-stabilized maize microtubules (MTs) in vitro. Binding saturation occurred at 1 mol of p86 per 5-6 mol of polymerized tubulin dimer, demonstrating a substoichiometric interaction of p86 with MTs. No evidence was found for a direct interaction of the p28 subunit with MTs. Unlike kinesin, cosedimentation of eIF-(iso)4F with MTs was neither reduced by MgATP nor enhanced by adenosine 5'-[gamma-imido]triphosphate. Both p86 subunit and p86-p28 complex induced the bundling of MTs in vitro. The p86 subunit was immunolocalized to the cytosol in root maize cells and existed in three forms: fine particles, coarse particles, and linear patches. Many coarse particles and linear patches were colocalized or closely associated with cortical MT bundles in interphase cells. The results indicate that the p86 subunit of eIF-(iso)4F is a MT-associated protein that may simultaneously link the translational machinery to the cytoskeleton and regulate MT disposition in plant cells.

Caracterização da anemia em cadelas com piometra

A piometra é uma condição mórbida caracterizada pela inflamação do útero com acúmulo de exsudatos, resultante de ações hormonais e geralmente associada à presença de bactérias no lúmen uterino. A anemia é a alteração hematológica mais frequentemente observada em cadelas com piometra e está associada à cronicidade da doença, diminuição da eritropoiese, devido ao efeito toxêmico na medula óssea, diminuição da disponibilidade de ferro ou perda de sangue para o útero. Adicionalmente, o efeito das toxinas bacterianas e os radicais livres gerados pelo metabolismo oxidativo dos neutrófilos podem resultar na modificação da estrutura antigênica da membrana do eritrócito, permitindo a ligação de imunoglobulinas em sua superfície e acelerando a destruição eritrocitária. Essa hipótese pode ser comprovada pela detecção de imunocomplexos na superfície eritrocitária de cadelas com piometra. O diagnóstico de piometra foi estabelecido em 33 cadelas atendidas no Serviço de Obstetrícia/Ginecologia do Hospital Veterinário da Universidade de São Paulo com base na anamnese, exame físico e exames subsidiários (ultrassonografia, hemograma e concentrações séricas de ureia e creatinina). As amostras sanguíneas foram coletadas em dois momentos. A primeira anterior a ovariosalpingohisterectomia (OSH) e a segunda, sete a dez dias após a OSH. A quantificação de hemácias com deposição de imunocomplexos IgG e IgM foi realizada utilizando-se anticorpos anti-IgG e anti-IgM (Bethyl®Laboratories) conjugadas a fluoresceína de isotiocianato (FITC), e a leitura realizada com citômetro de fluxo (FACS Calibur; Becton, Dickinson and Company© 2007 BD), sendo os resultados expressos em percentual de hemácias marcadas. Foram utilizados o Teste de Shapiro-Wilk para a avaliação da distribuição de dados e a comparação entre os grupos controle, pré e pós-OSH foi realizada valendo-se do Teste t ou Teste t pareado e Correlação de Pearson, e do Teste U de Mann-Whitney e Correlação de Spearman, para as variáveis com distribuição normal e não-normal, respectivamente. O valor de alfa estipulado foi de 0,05. Analisando os valores hematológicos de cada um dos cães incluídos no estudo, observa-se que 19 (57,6%) apresentavam anemia normocítica normocrômica não regenerativa no momento pré-OSH e cinco (15,2%) no momento pós-OSH. Em cães do grupo controle foram observadas 0,14 - 0,77% (0,43±0,18%) de hemácias marcadas com anticorpos anti-IgG FITC e 0,29 - 9,58% (0,68±0,29%) para anticorpos anti-IgM FITC. Já nos cães com piometra, foram encontradas 0,14 - 4,19% (0,96±0,86%) de hemácias marcadas com anticorpos anti-IgG FITC e 0,29 - 9,58% (1,37±1,71%) com anticorpos anti-IgM FITC, antecedendo a OSH. No momento pós-OSH observou-se 0,18 - 16,2% (2,77±3,67%) de hemácias marcadas para anticorpos anti-IgG FITC e 0,15 - 19,8% (4,01±4,46%) para anticorpos anti-IgM FITC. O percentual de hemácias marcadas com anticorpos anti-IgG FITC diferiu entre os grupos controle e piometra, pré-OSH (p<0,001) e pós-OSH (p<0,001). Em relação a anticorpos anti-IgM FITC, não foram observadas diferenças entre os grupos controle e pré-OSH (p=0,09), porém, após a OSH houve aumento na marcação de hemácias, quando comparado ao grupo controle (p<0,001). Apenas alguns animais apresentaram mais de 5% de hemácias marcadas, e isto ocorreu, principalmente, no momento pós-OSH. Entretanto, não resultou no agravamento da anemia, indicando que a piometra em cadelas está associada à deposição de imunoglobulinas G ou M na superfície das hemácias, sem, no entanto, promover hemólise ou agravamento da anemia

Discovery of "isolated" co-moving T Tauri stars in Cepheus

Context. During the course of a large spectroscopic survey of X-ray active late-type stars in the solar neighbourhood, we discovered four lithium-rich stars packed within just a few degrees on the sky. Although located in a sky area rich in CO molecular regions and dark clouds, the Cepheus-Cassiopeia complex, these very young stars are projected several degrees away from clouds in front of an area void of interstellar matter. As such, they are very good "isolated" T Tauri star candidates. Aims. We present optical observations of these stars conducted with 1-2 m class telescopes. We acquired high-resolution optical spectra as well as photometric data allowing us to investigate in detail their nature and physical parameters with the aim of testing the "runaway" and "in-situ" formation scenarios. Their kinematical properties are also analyzed to investigate their possible connection to already known stellar kinematic groups. Methods. We use the cross-correlation technique and other tools developed by us to derive accurate radial and rotational velocities and perform an automatic spectral classification. The spectral subtraction technique is used to infer chromospheric activity level in the Hα line core and clean the spectra of photospheric lines before measuring the equivalent width of the lithium absorption line. Results. Both physical (lithium content, chromospheric, and coronal activities) and kinematical indicators show that all stars are very young, with ages probably in the range 10-30 Myr. In particular, the spectral energy distribution of TYC4496-780-1 displays a strong near-and far-infrared excess, typical of T Tauri stars still surrounded by an accretion disc. They also share the same Galactic motion, proving that they form a homogeneous moving group of stars with the same origin. Conclusions. The most plausible explanation of how these "isolated" T Tauri stars formed is the "in-situ" model, although accurate distances are needed to clarify their connection with the Cepheus-Cassiopeia complex. The discovery of this loose association of "isolated" T Tauri stars can help to shed light on atypical formation processes of stars and planets in low-mass clouds.

High resolution spectroscopic characterization of the FGK stars in the Solar neighborhood

We present the most recent results of our ongoing long-term high resolution spectroscopic study of nearby (d ≤ 25 pc) FGK stars which aim is to characterize the local properties of the Galaxy, in particular the star-formation history. A through analysis has been carried out for 253 cool stars in the solar neighborhood. This includes radial and rotational velocities determinations, chromospheric activity levels inference, kinematic analysis, and age estimates. This study does not only shed new light on the issue of stellar formation history but also contributes to any present or future mission aiming to detect extra-solar planets. Exo-planets are likely to be found orbiting around nearby cool stars and their detection and characterization is highly dependent on the precise determination of fundamental stellar parameters such as age, activity levels. Therefore, our study is of paramount importance to ensure the success of any such mission.

Casamento de modelos baseado em projeções radiais e circulares invariante a pontos de vista.

Este trabalho aborda o problema de casamento entre duas imagens. Casamento de imagens pode ser do tipo casamento de modelos (template matching) ou casamento de pontos-chaves (keypoint matching). Estes algoritmos localizam uma região da primeira imagem numa segunda imagem. Nosso grupo desenvolveu dois algoritmos de casamento de modelos invariante por rotação, escala e translação denominados Ciratefi (Circula, radial and template matchings filter) e Forapro (Fourier coefficients of radial and circular projection). As características positivas destes algoritmos são a invariância a mudanças de brilho/contraste e robustez a padrões repetitivos. Na primeira parte desta tese, tornamos Ciratefi invariante a transformações afins, obtendo Aciratefi (Affine-ciratefi). Construímos um banco de imagens para comparar este algoritmo com Asift (Affine-scale invariant feature transform) e Aforapro (Affine-forapro). Asift é considerado atualmente o melhor algoritmo de casamento de imagens invariante afim, e Aforapro foi proposto em nossa dissertação de mestrado. Nossos resultados sugerem que Aciratefi supera Asift na presença combinada de padrões repetitivos, mudanças de brilho/contraste e mudanças de pontos de vista. Na segunda parte desta tese, construímos um algoritmo para filtrar casamentos de pontos-chaves, baseado num conceito que denominamos de coerência geométrica. Aplicamos esta filtragem no bem-conhecido algoritmo Sift (scale invariant feature transform), base do Asift. Avaliamos a nossa proposta no banco de imagens de Mikolajczyk. As taxas de erro obtidas são significativamente menores que as do Sift original.

Efeito de fontes de óleos vegetais sobre o desempenho, características de carcaça e qualidade da carne de bovinos Nelore

A inclusão de óleos vegetais na dieta de bovinos tem sido utilizada para aumentar a densidade energética da dieta, melhorar a eficiência alimentar, além de produzir carnes com a composição de ácidos graxos mais favorável à saúde humana. Objetivou-se estudar os efeitos da inclusão de óleos de soja, girassol e linhaça na dieta de bovinos, sobre o desempenho, características quantitativas de carcaça e qualitativas da carne, perfil de ácidos graxos, oxidação lipídica e formação de compostos oxidados do colesterol. Foram confinados 96 bovinos Nelore, castrados, com aproximadamente 380 kg ± 34 kg de peso inicial e idade média de 20 meses. As dietas foram compostas de 79% de concentrado e 21% de volumoso (silagem de milho) e incluídos os óleos de soja, girassol e linhaça. Os animais foram pesados e avaliadas as características de carcaça por ultrassonografia nos dias 0, 28, 56 e 81 de confinamento. Nos dias zero e 81 dias de confinamento foi coletado sangue dos bovinos para avaliação do LDL-colesterol, HDL-colesterol, VLDL-colesterol e triacilgliceróis. Ao final de 81 dias de confinamento, os animais foram abatidos e foi avaliado o pH (uma e 48 horas após o abate) e foram retiradas amostras do músculo longissimus. Foi avaliado a cor, força de cisalhamento (FC) e perdas por cocção (PPC) em carnes não maturadas e maturadas por 14 dias. Duas amostras do longissimus foram expostas por um e três dias em condições semelhantes ao varejo. Nas carnes expostas por um dia foi avaliado a cor e o pH. Nas amostras expostas por três dias foi avaliado além da cor e pH, o perfil de ácidos graxos, TBARS, colesterol e a presença do 7-cetocolesterol. Foi realizada ainda a análise sensorial e determinado a quantidade de lipídios totais das carnes. A estabilidade oxidativa dos óleos utilizados na dieta também foi avaliada. O experimento foi conduzido em delineamento de blocos casualizados, sendo o peso inicial o bloco. O desempenho e as características de carcaça avaliadas por ultrassonografia não foram influenciadas pelas fontes de óleo. Os tratamentos não influenciaram o peso de abate, o peso de carcaça quente, o pH da carcaça uma hora e 48 horas após o abate, o rendimento de carcaça, a cor, as PPC e a FC. O pH foi maior nas carnes maturadas por 14 dias (P=0,01), em relação àquelas sem maturação. As PPC e a FC foram menores (P=0,01) nas carnes maturadas por 14 dias. O óleo de linhaça apresentou menor estabilidade oxidativa seguidos do óleo de girassol e soja. As fontes de óleo não afetaram a concentração dos lipídios do plasma sanguíneo, no entanto, os níveis de VLDL, LDL, HDL, colesterol e triacilgliceróis foram maiores (P<0,01) no final do experimento em relação ao início. Não houve interação entre a espessura de gordura subcutânea (EGS) avaliada no abate e as dietas e efeito das fontes de óleo sobre os valores de TBARS, lipídios e colesterol. Não foi encontrado o 7-cetocolesterol nas carnes. O pH das carnes expostas por um e três dias sob condições de varejo, não foram influenciadas pela dieta nem pela interação da dieta e dos dias de exposição. No entanto, foi observado o efeito de tempo (P<0,01), as carnes expostas por três dias tiveram valores de pH maiores que as carnes expostas por um dia. A cor L*, a* e b* das carnes expostas em gôndola, sob condições de varejo não foi influenciado pela dieta, pelos dias de exposição e nem pela interação dos dias de exposição e dietas. Os ácidos graxos C18:1 n-9, C20:3 n-6 e C20:5 n-3 apresentaram interação entre a EGS e a dieta (P<0,05). O C18:1 cis 6 apresentou maiores concentrações (P<0,05) nas carnes provenientes dos animais alimentados com óleo de linhaça e soja, em comparação com as carnes provenientes da dieta controle. O C18:3 n-3 apresentou maiores concentrações nas carnes de animais alimentados com linhaça (P<0,05), em comparação com os demais tratamentos. O aroma e a textura da carne avaliados em análise sensorial realizada com consumidores não foram alterados pelos tratamentos. A carne dos animais alimentados com óleo de girassol resultou em maiores notas para o sabor (P<0,01), em relação à carne proveniente de animais alimentados com óleo de soja. As dietas controle e girassol resultaram em carnes mais suculentas e com maior aceitabilidade global (P<0,01), em relação ao tratamento soja. Independentemente do tipo de óleo utilizado na dieta dos animais, não houve influência no desempenho e nas características da carcaça. O óleo de linhaça proporcionou carnes com perfil de ácidos graxos mais favorável para a saúde humana, pois apresentou maiores proporções do ácido linolênico e relações ideais de n6:n3 (4,15). O uso de óleos vegetais na dieta, não prejudicou a aparência das carnes e não proporcionaram oxidação lipídica com a formação de compostos de colesterol oxidados nas carnes expostas sob condições de varejo.

Confiabilidade aplicada ao problema de interação estaca-solo.

Este trabalho busca aplicar técnicas de confiabilidade ao problema de grupo de estacas utilizadas como fundação de estruturas correntes. Para isso, lança-se mão de um modelo tridimensional de interação estaca-solo onde estão presentes o Método dos Elementos de Contorno (MEC) e o método dos Elementos Finitos (MEF) que atuam de forma acoplada. O MEC, com as soluções fundamentais de Mindlin (meio semi-infinito, homogêneo, isotrópico e elástico-linear é utiliza), é utilizado para modelar o solo. Já o MEF é utilizado para modelar as estacas. Definido o modelo de funcionamento estrutural das estacas, parte-se para a aplicação de métodos trazidos da confiabilidade estrutural para avaliação da adequabilidade em relação aos estados limite de serviço e estados limites últimos. Os métodos de confiabilidade utilizados foram o Método de Monte Carlo, o método FOSM (First-Order Second-Moment) e o método FORM (First-Order Reliability Method).

New glimpses on convex infinite optimization duality

Given a convex optimization problem (P) in a locally convex topological vector space X with an arbitrary number of constraints, we consider three possible dual problems of (P), namely, the usual Lagrangian dual (D), the perturbational dual (Q), and the surrogate dual (Δ), the last one recently introduced in a previous paper of the authors (Goberna et al., J Convex Anal 21(4), 2014). As shown by simple examples, these dual problems may be all different. This paper provides conditions ensuring that inf(P)=max(D), inf(P)=max(Q), and inf(P)=max(Δ) (dual equality and existence of dual optimal solutions) in terms of the so-called closedness regarding to a set. Sufficient conditions guaranteeing min(P)=sup(Q) (dual equality and existence of primal optimal solutions) are also provided, for the nominal problems and also for their perturbational relatives. The particular cases of convex semi-infinite optimization problems (in which either the number of constraints or the dimension of X, but not both, is finite) and linear infinite optimization problems are analyzed. Finally, some applications to the feasibility of convex inequality systems are described.

Calculus, with analytic geometry.

Includes index.

Numerical simulation of abrupt contraction flows using the Double Convected Pom-Pom model

The Double Convected Pom-Pom model was recently introduced to circumvent some numerical and theological defects found in other formulations of the Pom-Pom concept. It is used here for the simulation of a benchmark problem: the flow in an abrupt planar contraction. The predictions are compared with birefringence measurements and show reasonable quantitative agreement with experimental data. A parametric study is also carried out with the aim of analysing the effect of the branching parameter on vortex dynamics and extrudate swell. The results show that the Double Convected Pom-Pom model (DCPP) model is able to discriminate between branched and linear macromolecular structures in accordance with experimental observations. In that respect, the role of the extensional properties in determining complex flow behaviour is stressed. Also, the ratio of the first normal stress difference to the shear stress appears to play a major role in die swell observation. For the time being, the role of the second normal stress difference appears to be less obvious to evaluate in this complex flow. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

Capillary phenomena in the framework of the two-dimensional density functional theory

We present results of application of the density functional theory (DFT) to adsorption and desorption in finite and infinite cylindrical pores accounting for the density distribution in radial and axial directions. Capillary condensation via formation of bridges is considered using canonical and grand canonical versions of the 2D DFT. The potential barrier of nucleation is determined as a function of the bulk pressure and the pore diameter. In the framework of the conventional assumptions on intermolecular interactions both 1D and 2D DFT versions lead to the same results and confirm the classical scenario of condensation and evaporation: the condensation occurs at the vapor-like spinodal point, and the evaporation corresponds to the equilibrium transition pressure. The analysis of experimental data on argon and nitrogen adsorption on MCM-41 samples seems to not completely corroborate this scenario, with adsorption branch being better described by the equilibrium pressure - diameter dependence. This points to the necessity of the further development of basic representations on the hysteresis phenomena.

Polyethylene multiwalled carbon nanotube composites

Polyethylene (PE) multiwalled carbon nanotubes (MWCNTs) with weight fractions ranging from 0.1 to 10 wt% were prepared by melt blending using a mini-twin screw extruder. The morphology and degree of dispersion of the MWCNTs in the PE matrix at different length scales was investigated using scanning electron microscopy (SEM), transmission electron microscopy (TEM), atomic force microscopy (AFM) and wide-angle X-ray diffraction (WAXD). Both individual and agglomerations of MWCNTs were evident. An up-shift of 17 cm(-1) for the G band and the evolution of a shoulder to this peak were obtained in the Raman spectra of the nanocomposites, probably due to compressive forces exerted on the MWCNTs by PE chains and indicating intercalation of PE into the MWCNT bundles. The electrical conductivity and linear viscoelastic behaviour of these nanocomposites were investigated. A percolation threshold of about 7.5 wt% was obtained and the electrical conductivity of PE was increased significantly, by 16 orders of magnitude, from 10(-20) to 10(-4) S/cm. The storage modulus (G') versus frequency curves approached a plateau above the percolation threshold with the formation of an interconnected nanotube structure, indicative of 'pseudo-solid-like' behaviour. The ultimate tensile strength and elongation at break of the nanocomposites decreased with addition of MWCNTs. The diminution of mechanical proper-ties of the nanocomposites, though concomitant with a significant increase in electrical conductivity, implies the mechanism for mechanical reinforcement for PE/MWCNT composites is filler-matrix interfacial interactions and not filler percolation. The temperature of crystallisation (T.) and fraction of PE that was crystalline (F-c) were modified by incorporating MWCNTs. The thermal decomposition temperature of PE was enhanced by 20 K on addition of 10 wt% MWCNT. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Trauma-induced central diabetes insipidus in a cat

A 1-year-old neutered male domestic shorthair cat presented with a 4-week history of polydipsia that began immediately after an 8 metre fall, Trauma-induced central diabetes insipidus was suspected on the basis of the identification of hyposthenuria, normal haematology and serum biochemistry profile and unremarkable abdominal ultrasound examination. Failure to concentrate urine with water deprivation followed by production of hypersthenuric urine with administration of the synthetic antidiuretic hormone, Deamino-8-D-arginine vasopressin (DDAVP), confirmed the diagnosis of central diabetes insipidus. Treatment via conjunctival administration of DDAVP failed to attenuate the polydipsia, however, resolution of polydipsia was achieved with subcutaneous administration of DDAVP and the cat remains eudipsic with twice daily subcutaneous DDAVP administration 17 months after diagnosis.

Widespread sensory hypersensitivity is a feature of chronic whiplash-associated disorder but not chronic idiopathic neck pain

Objectives: To investigate sensory changes present in patients with chronic whiplash-associated disorders and chronic idiopathic neck pain using a variety of quantitative sensory tests to better understand the pain processing mechanisms underlying persistent symptoms. Methods: A case control study was used with 29 subjects with chronic whiplash-associated disorders, 20 subjects with chronic idiopathic neck pain, and 20 pain-free volunteers. Pressure pain thresholds were measured over the articular pillars of C2-C3, C5-C6, the median, radial, and ulnar nerve trunks in the arm and over a remote site, the muscle belly of tibialis anterior. Heat pain thresholds, cold pain thresholds, and von Frey hair sensibility were measured over the cervical spine, tibialis anterior, and deltoid insertion. Anxiety was measured with the Short-Form of the Spielberger State Anxiety Inventory. Results: Pressure pain thresholds were decreased over cervical spine sites in both subject groups when compared with controls (P < 0.05). In the chronic whiplash-associated disorders group, pressure pain thresholds were also decreased over the tibialis anterior, median, and radial nerve trunks (P < 0.001). Heat pain thresholds were decreased and cold pain thresholds increased at all sites (P < 0.03). No differences in heat pain thresholds or cold pain thresholds were evident in the idiopathic neck pain group at any site compared with the control group (P > 0.27). No abnormalities in von Frey hair sensibility were evident in either neck pain group (P > 0.28). Discussion: Both chronic whiplash-associated disorders and idiopathic neck pain groups were characterized by mechanical hyperalgesia over the cervical spine. Whiplash subjects showed additional widespread hypersensitivity to mechanical pressure and thermal stimuli, which was independent of state anxiety and may represent changes in central pain processing mechanisms. This may have implications for future treatment approaches.